• Reproductive and Developmental Biology
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• 제37권4호
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• pp.205-211
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• 2013

The swine is one of the most widespread mammalian throughout the whole world. Presently, many studies concerning microsatellites in swine, especially domestic pigs, have been carried out in order to investigate general diversity patterns among either populations or breeds. Until now, a lot of time and effort spend into a single PCR method. But simple and more rapid multiplex PCR methods have been developed. The purpose of this study is to develop a robust set of microsatellites markers (MS marker) for traceability and individual identification. Using multiplex-PCR method with 23 MS marker divided 2 set, various alleles occurring to 5 swine breed (Berkshire, Landrace, Yorkshire, Duroc and Korea native pig) used markers to determine allele frequency and heterozygosity. MS marker found 4 alleles at SW403, S0227, SWR414, SW1041 and SW1377. The most were found 10 alleles at SW1920. Heterozygosity represented the lowest value of 0.102 at SWR414 and highest value of 0.861 at SW1920. So, it was recognized appropriate allele frequency for individual identification in swine. Using multiplex-PCR method, MS markers used to determine individual identification biomarker and breed-specific marker for faster, more accurate and lower analysis cost. Based on this result, a scientific basis was established to the existing pedigree data by applying genetics additionally. Swine traceability is expected to be very useful system and be conducted nationwide in future.

• 한국가금학회지
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• 제42권1호
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• pp.1-8
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• 2015

최근, 한국의 소비자들이 건강에 대한 관심이 증가하면서 단일불포화 지방산이 풍부해 건강에 긍정적인 영향을 줄 수 있는 오리고기의 수요가 급격하게 증가하고 있다. 하지만 대부분의 종 오리는 수입에 의존하고 있는 실정이기 때문에, 토종오리의 개발 및 보급이 필요한 실정이며, 이는 종자주권의 확립 및 농가 소득 증대에도 매우 필요한 일이라 할 수 있다. 따라서 본 연구에서는 24개의 microsatellite 마커를 확보하였으며, 이들 마커의 대립유전자수는 1~16개, 이형접합도는 0~0.865, 다형성은 0~0.841로 확인되었다. 이들 마커를 이용하여 임의 집단에서 동일개체 출현빈도를 계산한 결과는 임의 집단 $1.64{\times}10^{-16}$, 전형매 집단 $2.60{\times}10^{-7}$, 반형매 집단 $1.30{\times}10^{-12}$으로 높은 개체식별률과 친자확인도를 확인할 수 있었다. 하지만 이들 마커를 이용한 계통분석 결과, 토종오리와 실용오리 집단을 정확하게 구분하기에는 어려운 것으로 확인되었다. 따라서 추가연구를 통해 토종오리의 순종화 및 더 정확한 토종오리와 실용오리 집단 구분이 가능한 마커 개발이 필요할 것으로 사료된다.

• Reproductive and Developmental Biology
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• 제36권1호
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• pp.65-70
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• 2012

귀중한 한국재래닭의 배반엽세포를 냉동보존하고, 키메라 닭을 통한 재래종의 복원을 도모하는 방법을 실용화하기 위해서, 한국재래종의 배반엽세포에 있어 최적의 동결 방법에 대해 검토했다. 배반엽세포의 동결은 세포를 단리한 후, 항동해제와 소태아혈청(FBS)를 함유하고 있는 동결용액 중에 부유하고 수지성 동결용기 중에 넣고, $-7^{\circ}C$에서 동결시키고 나서 분당 $-1^{\circ}C$에서 $-35^{\circ}C$까지 냉각하고 액체질소 안에 침지시켜서 실험을 진행했다. 동결조작 중에서 (1) 동결 전의 세포의 단리 방법, (2) FBS 농도, (3)동결 시 세포밀도가 동결융해 후의 세포생존율에 미치는 영향을 조사했다. (1) 세포의 단리 방법을 피펫팅으로부터 시험관 믹서에 의한 단시간의 flushing으로 변경하면, 동결융해 후의 세포의 생존율이 29%부터 51%로 향상된다. (2) 동결용액 속 FBS 농도를 20%에서 80%로 증가시키면 동결융해 후의 생존율이 28%에서 35%로 증가한다. 또한, (3) 융해 후, 생존율은 (2개의 배자/0.5 ml) 처리군에서의 동결은 34%인 반면에, (20개의 배자/0.5 ml)에서는 44%였다. 더욱이, 이 세 가지 개선점을 조합함으로써 동결융해 후의 생존율은 60%로, 개선 전의 41%에 비하여 크게 개선이 될 수 있고, 한국재래종의 배반엽세포의 동결보존의 실용화가 보다 더 향상될 수 있는 방법이 될 수 있음을 시사한다.

• 한국가금학회지
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• 제48권3호
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• pp.101-110
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• 2021

본 연구에서는 생산 능력이 뛰어난 새로운 품종의 토종닭을 생산하기 위하여 우수 종계로 선발된 부계 2개 계통과 모계 5개 계통의 종계를 이용하여 교배조합을 조성한 후, 조합별 자손들의 생산 능력을 검정하였다. 검정은 10개의 교배조합으로부터 생산된 자손들과 한협-3호를 대조 구로 하여 암수 총 837수를 대상으로 발생 후부터 12주령까지 모색, 생존율, 체중, 사료 섭취량 및 사료요구율을 조사하였다. 분석 결과, 전체 교배조합 구 모두가 갈색을 기본으로 한 유색종으로 모색에 따른 조합 간의 차이는 거의 없었다. 발생 후 부터 12주령까지 교배조합들의 평균 생존율은 94.9%로서 조합 간 차이는 없었으나, 대조 구인 한협-3호의 75.3%와는 유의한 차이를 보였다(P<0.01). 체중은 모든 주령에서 교배조합 간에 유의한 차이를 보이며(P<0.01), 출하 체중인 10주령 체중에서 FHHY 구가 2,300 g으로 가장 높았고, 한협-3호는 1,922 g이었으며, 암수 간 체중의 차이는 458 g이었다. 일령에 따른 체중의 회귀분석 결과, 1.9kg 도달 일령이 FHFY, FHHY 및 HFFY 조합 구의 개체들은 61일 정도이고, 한협-3호는 70일로써 거의 9일 정도의 차이를 보였다. 전체 교배조합들의 10주령까지 평균 사료요구율은 2.42정도로 조합 간의 차이는 없었으나, 한협-3호의 2.97과는 유의한 차이를 보였다(P<0.01). 결론적으로 생존율, 체중 및 사료요구율을 기준으로 신품종 토종닭을 선발하였을 때 FHHY, FHFY 및 HFFY 구가 삼계 및 토종닭 모두에서 가장 우수한 조합으로 나타났고, 이들을 실용 토종닭으로 이용하였을 때 기존 한협-3호보다 18%의 증체 효과와 19% 정도의 사료효율 개선 효과가 있을 것으로 예측된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권1호
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• pp.121-132
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• 2008

[Landrace×Yorkshire]×Duroc(LYD) 및 [Yorkshire×Berkshire]×Berkshire(YBB) 삼원교잡종과 흑색계 영국 Berkshire(BB; British berkshire), 가고시마 Berkshire(KB; Kagoshima Berkshire), [재래돼지×멧돼지(KNW; Native black pig×Wild boars)] 이원교잡종에서 생산된 돼지 100두를 생체중 110 kg 도달시 도축한 후 등심을 채취하여 분석하였다. 수분 함량은 KW, 조단백질은 YBB와 KW, 콜레스테롤 함량은 YBB가 다른 품종들보다 유의적으로 높았다(p<0.05). 다른 품종들에 비해 YBB는 보수력과 pH는 낮고, 전단가는 높았다(p<0.05). LYD에서 명도(L*)가 유의적으로 높게 나타났으며(p<0.05), 적색도(a*)와 파쇄성에서는 품종들 간에 유의적인 차이가 없었다(p>0.05). UFA/SFA와 EFA/UFA 비율과 EAA은 KW가 높게 나타났으나(p<0.05) SAAA는 유의적으로 낮았다(p<0.05). 총 아미노산 함량은 LYD와 BB가 각각 20.44%, 20.81%로 다른 품종에 비해 유의적으로 많았다(p<0.05). 신선육 상태에서 품종은 육색, 드립로스, 마블링과 전체적인 기호도에 영향을 미쳤지만(p<0.05), 조리육의 경우 풍미를 제외한 관능검사 항목에는 영향을 미치지 않았다(p>0.05).

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제22권7호
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• pp.943-954
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• 2009

Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) is a key enzyme that catalyzes the final and rate-limiting step of triglyceride synthesis. Both DGAT1 and DGAT2 genes code proteins with DGAT activity. Studies have shown DGAT1 polymorphisms associate with intramuscular fat deposition in beef cattle, but fewer associations between DGAT2 and beef cattle economic traits have been reported. The objective of this study was to investigate single nucleotide polymorphism (SNP) in intron3 of bovine DGAT2 and evaluate the associations of that with carcass, meat quality, and fat yield traits. Test animals were 157 commercial feedlot steers belonging to 3 Chinese native breeds (22 for Luxi, 24 for Jinnan, and 23 for Qinchuan), 3 cross populations (20 for Charolais${\times}$Fuzhou, 18 for Limousin ${\times}$Luxi, and 17 for Simmental${\times}$Jinan) and 1 Taurus pure breed population (16 Angus steers). In the current study, 15 SNP were discovered in intron3 and exon4 of DGAT2 at positions 65, 128, 178, 210, 241, 255, 270, 312, 328, 334, 365, 366, 371, 415, and 437 (named as their positions in PCR amplified fragments). Only 7 of them (128, 178, 241, 270, 312, 328, and 371) were analyzed, because SNP in three groups (65-128-255, 178-210-365 and 241-334-366) were in complete linkage disequilibrium within the group, and SNP 415 was a deletion and 437 was a null mutation. Frequencies for rare alleles in the 3 native breed populations were higher than in the 3 cross populations for 178 (p = 0.04), 270 (p = 0.001), 312 (p = 0.03) and 371 (p = 0.002). A general linear model was used to evaluate the associations between either SNP genotypes or allele substitutions and the measured traits. Results showed that SNP 270 had a significant association with the fat yield associated with kidney, pelvic cavity, heart, intestine, and stomach (KPHISY). Animals with genotype CC and CT for 270 had less (CC: -7.71${\pm}$3.3 kg and CT: -5.34${\pm}$2.5 kg) KPHISY than animals with genotype TT (p = 0.02). Allele C for 270 was associated with an increase of -4.26${\pm}$1.52 kg KPHISY (p = 0.006) and $-0.92{\pm}0.45%$ of retail cuts weight percentage (NMP, Retail cuts weight/slaughter body weight) (p = 0.045); allele G for 312 was associated with an increase of -5.45${\pm}$2.41 kg KPHISY (p = 0.026). An initial conclusion was that associations do exist between DGAT2 gene and carcass fat traits. Because of the small sample size of this study, it is proposed that further effort is required to validate these findings in larger populations.

• 한국가금학회지
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• 제32권1호
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• pp.29-34
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• 2005

본 연구는 한국 재래 닭의 유전적 특성을 분자표지를 이용하여 그 차이를 규명하고 초기성장에 미치는 영향을 분석하여 이를 이용한 재래닭의 개량을 목적으로 실시하였다. MHC class II B-LB 유전자 내의 염기변이체가 경제형질에 미치는 영향에 대하여 연구하였다. MHC class II B-LB유전자 내 400 bp 크기의 유전자를 증폭하여 염기서열 분석과 제한효소 처리를 이용한 다형성 분석을 실시하였다. 연구결과 두 개의 제한효소 절단지역이 발견되었으며 427 지역을 Type I 으로 651 지역은 Type II로 정하여 RFLP 분석을 실시하였다. Type I지역의 유전자형은 TT, TC, CC로 나타났으며, TypeII 지역의 유전자형은 MM, Mm, mm으로 나타났다. TC와 Mm 유전자형이 다른 유전자형과 비교하였을 때 한국재래 닭에서 높은 출현빈도를 보였다(0.8, 0.88). 유전자형이 한국 재래 닭의 150일령 체중에 미치는 영향을 분석한 결과 CC와 Mm 유전자형에서 통계적 유의성이 도출되었다 (P<0.05). 따라서 본 연구의 결과를 이용하여 한국 재래 닭의 유전적 특성을 규명할 수 있으며 초기 성장이 높은 성적을 나타내는 CC, Mm 유전자형을 개량에 이용하게 된다면 큰 효과를 얻을 수 있을 것으로 사료되어진다. 본 연구의 결과는 차후 한국 재래 닭의 과학적이고 지속적인 유전자원의 보존과 육종 전략에 있어 매우 유용하게 활용될 것으로 기대된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제32권2호
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• pp.249-256
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• 2019

Objective: The present study aimed at comparing the nutritional composition and color traits between two meat types: Horse meat and pork from Korean native black pigs raised in Jeju Island. Methods: After slaughter 24 h, the longissimus dorsi samples were taken from left side carcasses of the 32-mo-old Jeju female breed horses and the 6-mo-old Korean native black pigs (n = 10 each). The samples were then placed into cool boxes containing ice packs and transported to the Laboratory of Meat Science where all visual fats and connective tissues were trimmed off and then the samples were ground. All the samples were analyzed for nutritional composition (proximate composition, minerals, vitamins, fatty acids, and amino acids) and color traits. Results: The horse meat contained significantly higher collagen, moisture and protein than the pork (p<0.05). The Jeju horse meat showed more desirable fatty acid profiles such as containing significantly lower saturated fatty acids (SFA), higher polyunsaturated fatty acids (PUFA) contents and PUFA/SFA ratios than the pork (p<0.05). Differences in concentrations of ten amino acids existed between the two meat types in which the horse meat had higher values for all these amino acids, total amino acids (20.33 g/100 g) and essential amino acids (10.06 g/100 g) than the pork (p<0.05). Also, the horse meat showed significantly higher concentrations of Fe (34.21 mg/100 g) and Cu (2.47 mg/100 g) than the pork (Fe, 17.42 mg/100 g and Cu, 1.51 mg/100 g) (p<0.05). All the vitamins detected showed statistical differences between the two meat types in which the horse meat had higher concentrations of vitamin B1 (25.19 mg/100 g), B2 (92.32 mg/100 g), B3 (2,115.51 mg/100 g), and B5 (67.13 mg/100 g) than the pork (p<0.05). Conclusion: Based on the results obtained in the study, it is concluded that the two meat types studied are rich in nutrients and the animal species strongly affected the nutritional values and color traits of the muscle tissues.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권3호
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• pp.315-320
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• 2016

Porcine beta-defensin-1 (PBD-1) gene plays an important role in the innate immunity of pigs. The peptide encoded by this gene is an antimicrobial peptide that has direct activity against a wide range of microbes. This peptide is involved in the co-creation of an antimicrobial barrier in the oral cavity of pigs. The objective of the present study was to detect polymorphisms, if any, in exon-1 and exon-2 regions of PBD-1 gene in Large White Yorkshire (LWY) and native Ankamali pigs of Kerala, India. Blood samples were collected from 100 pigs and genomic DNA was isolated using phenol chloroform method. The quantity of DNA was assessed in a spectrophotometer and quality by gel electrophoresis. Exon-1 and exon-2 regions of PBD-1 gene were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the products were subjected to single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Subsequent silver staining of the polyacrylamide gels revealed three unique SSCP banding patterns in each of the two exons. The presence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) was confirmed by nucleotide sequencing of the PCR products. A novel SNP was found in the 5'-UTR region of exon-1 and a SNP was detected in the mature peptide coding region of exon-2. In exon-1, the pooled population frequencies of GG, GT, and TT genotypes were 0.67, 0.30, and 0.03, respectively. GG genotype was predominant in both the breeds whereas TT genotype was not detected in LWY breed. Similarly, in exon-2, the pooled population frequencies of AA, AG, and GG genotypes were 0.50, 0.27, and 0.23, respectively. AA genotype was predominant in LWY pigs whereas GG genotype was predominant in native pigs. These results suggest that there exists a considerable genetic variation at PBD-1 locus and further association studies may help in development of a PCR based genotyping test to select pigs with better immunity.

• Molecules and Cells
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• 제28권6호
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• pp.565-573
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• 2009

The pig could be a useful model to characterize molecular aspects determining several delicate phenotypes because they have been bred for those characteristics. The Korean native pig (KNP) is a regional breed in Korea that was characterized by relatively high intramuscular fat content and reddish meat color compared to other western breeds such as Yorkshire (YS). YS grew faster and contained more lean muscle than KNP. We compared the KNP to Yorksire to find molecular clues determining muscle characteristics. The comparison of skeletal gene expression profiles between these two breeds showed molecular differences in muscle. We found 82 differentially expressed genes (DEGs) defined by fold change (more than 1.5 fold difference) and statistical significance (within 5% of false discovery rate). Functional analyses of these DEGs indicated up-regulation of most genes involved in cell cycle arrest, down-regulation of most genes involved in cellular differentiation and its inhibition, down-regulation of most genes encoding component of muscular-structural system, and up-regulation of most genes involved in diverse metabolism in KNP. Especially, DEGs in above-mentioned categories included a large number of genes encoding proteins directly or indirectly involved in p53 pathway. Our results indicated a possible role of p53 to determine muscle characteristics between these two breeds.