Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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2001.08a
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pp.129-137
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2001
We used cDNA microarrays to assess gene expression profiles in 60 human cancer used in a drug discovery screen by the National Cancer Institute. Using these data, we linked bioinformatics and chemoinformatics by correlating gene expression and drug activity pattens in the NCI60 lines. Clustering the cell lines on the basis of gene expression yielded relationships very different from those obtained by clustering the cell lines on the basis of their response to drugs. Gene-drug relationships for the clinical agents 5-fluorouracil and L-asparaginase exemplify how variations in the transcript levels of particular genes relate to mechanisms of drug sensitivity and resistance. This is the first study to intergrate large databases on gene expression and molecular pharmacology.
Park, Il-Dong;Yoo, Hwa-Seung;Lee, Yeon-Weol;Cho, Chong-Kwan
Journal of Korean Traditional Oncology
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v.10
no.1
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pp.47-55
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2005
Objectives: The purpose is to advertise the protocol of Best Case Series Programme of National Cancer Institute of USA to korean oriental medical oncologists and researchers Method: We reviewed the submission packet of NCI and related Website and articles. Result and Conclusion: BCS programme is the first step to evaluate the efficacy of complementary and alternative treatment, and to launch the clinical research funded by NCI.
Background : Anticancer effects of herbal medicine have been reported in various types of cancer, but the systematic approaches to explain molecular mechanism(s) are not established yet. Objective : The purpose of this study is to investigate the apoptotic cell death by Egg White combined Chalcanthite in NCI-H460 human lung cancer cells. Methods : Inhibitory effects were estimated by the MTT-assay. Cancer cells were stained with DAPI and showed condensed and fragmented nuclei. The expression of cleaved caspase-3, bcl-2, and bax was detected by western blotting. To establish a basis of understanding for anti-cancer mechanism, whole proteins have been obtained from NCI-H460 harvested at 24 hrs after the treatment of Egg White combined Chalcanthite, protein expression has been profiled by 2DE-based proteomic approach. Results : NCI-H460 human lung cancer cells were treated by three samples of IS3, IS4 and IS5. IS4 inhibited most effectively the growth of NCI-H460 human lung cancer cells. The expression of cleaved caspase-3 increased in IS4 in a concentration-dependent manner. Various changes of the protein expression have been monitored, and most frequent dysregulation was found in Vimentin, Lamin-A/C. Conclusion : Egg White combined-Chacanthite inhibited the growth of NCI-H460 human lung cancer cells by inducing the apoptotic cell death via caspase-3 activation. Based upon the present findings, the further study will focus on monitoring various cancer survival factors after artificial regulation of the proteins identified, and it would be the basis for the understanding of the Chacabthite anticancer effect(s) at the molecular level.
Gasmelseed, Nagla;Abudris, Daffalla;Elhaj, Ahmed;Eltayeb, Elgaylani A;Elmadani, Ahmed;Elhassan, Moawia M;Mohammed, Khadiga;Elgaili, Elgaili M;Elbalal, Moawia;Schuz, Joachim;Leon, Maria E
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.16
no.15
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pp.6481-6490
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2015
Background: Esophageal cancer (EC) is among the most common malignancies in Eastern Africa, but the occurrence of EC in Sudan has rarely been described in the scientific literature. This paper reports the results of a consecutive case series of all EC patients who visited one of the two public cancer treatment centers in the country in 1999-2012, providing a first description of this disease in a treatment center located in central Sudan. Materials and Methods: Clinical and demographic data for all EC patients who visited the Department of Oncology of the National Cancer Institute at the University of Gezira (NCI-UG) from 1999 to the end of 2012 were abstracted and tabulated by sex, tumor type and other characteristics. Results: A total of 448 EC patients visited NCI-UG in 1999-2012, and the annual number of EC cases increased steadily from 1999. Squamous cell carcinoma (SCC) was the predominant EC tumor type (90%), and adenocarcinoma (ADC) was reported in 9.4% of the EC cases. The overall male-to-female ratio for EC was 1:1.8, but the ratio was tumor type-dependent, being 1:2 for SCC and 2:1 for ADC. Only 20% of EC patients reported having ever used tobacco and/or alcohol, and the vast majority of these patients were male. At the time of EC diagnosis, 47.3% of the patients resided in Gezira State. Some EC patients from Gezira State seek out-of-state treatment in the national capital of Khartoum instead of visiting NCI-UG. Conclusions: The annual number of EC patients visiting NCI-UG has increased in recent years, approximately half of these patients being from Gezira State. Although this consecutive series of EC patients who visited NCI-UG was complete, it did not capture all EC patients from the state. A populationbased cancer registry would provide more complete data required to better understand EC patterns and risk factors.
Nassar, Hanan Ramadan;Zeeneldin, Ahmed A;Helal, Amany Mohamed;Ismail, Yahia Mahmoud;Elsayed, Abeer Mohamed;Elbassuiony, Mohamed A;Moneer, Manar M
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.16
no.16
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pp.7237-7242
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2015
Background: Epithelial ovarian cancer (EOC) is the commonest malignancy involving the ovaries. Maximum surgical cytoreduction (MCR) followed by adjuvant taxane-platinum chemotherapy are the standard of care treatments. Aims: To study treatment outcomes of EOC patients that were maximally cyto-reduced and received adjuvant paclitaxel-carboplatin (PC) chemotherapy. Materials and Methods: This retrospective cohort study included 174 patients with EOC treated at the Egyptian National Cancer Institute between 2006 and 2010. For inclusion, they should have had undergone MCR with no-gross residual followed by adjuvant PC chemotherapy. MCR was total abdominal hysterectomy/bilateral salpingo-oophorectomy [TAH/BSO] or unilateral salpingo-oophorectomy [USO] plus comprehensive staging. Results: The median age was 50 years. Most patients were married (97.1%), had offspring (92.5%), were postmenopausal (53.4%), presented with abdominal/pelvic pain and swelling (93.7%), had tumors involving both ovaries (45.4%) without extra-ovarian extension i.e. stage I (55.2%) of serous histology (79.9%) and grade II (87.4%). TAH/BSO was performed in 97.7% of cases. A total of 1,014 PC chemotherapy cycles were administered and were generally tolerable with 93.7% completing 6 cycles. Alopecia and numbness were the commonest adverse events. The median follow up period was 42 months. The 2-year rates for disease free survival (DFS) and overall survival (OS) were 70.7% and 94.8%, respectively. The respective 5-year rates were 52.6% and 81.3%. Advanced stage and high-grade were significantly associated with poor DFS and OS (p<0.001). Age >65 years was associated with poor OS (p =0.008). Using Cox-regression, stage was independent predictor of poor DFS and OS. Age was an independent predictor of poor OS.
Kim, Chae-Kyun;Chung, June-Key;Lee, Yong-Jin;Hong, Mee-Kyoung;Jeong, Jae-Min;Lee, Dong-Soo;Lee, Myung-Chul
The Korean Journal of Nuclear Medicine
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v.36
no.2
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pp.110-120
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2002
To clarify the difference in glucose uptake between human cancer cells and monocytes, we studied $[^{18}F]$ fluorodeoxyglucose (FDG) uptake in three human colon cancer cell lines (SNU-C2A, SNU-C4, SNU-C5), one human lung cancer cell line (NCI-H522), and human peripheral blood monocytes. The FDG uptake of both cancer cells and monocytes was increased in glucose-free medium, but decreased in the medium containing 16.7 mM glucose (hyperglycemic). The level of Glut1 mRNA decreased in human colon cancer cells and NCI-H522 under hyperglycemic condition. Glut1 protein expression was also decreased in the four human cancer cell lines under hyperglycemic condition, whereas it was consistently undetectable in monocytes. SNU-C2A, SNU-C4 and NCI-H522 showed a similar level of hexokinase activity (7.5 - 10.8 mU/mg), while SNU-C5 and monocytes showed lower range of hexokinase activity (4.3 - 6.5 mU/mg). These data suggest that glucose uptake is regulated by different mechanisms in human cancer cells and monocytes.
Nho, Jong Hyun;Kim, A Hyeon;Jung, Ho Kyung;Lee, Mu Jin;Jang, Ji Hun;Lee, Ki Ho;Lee, Hyun Joo;Park, Ho;Cho, Hyun Woo
Korean Journal of Medicinal Crop Science
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v.26
no.4
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pp.281-290
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2018
Background: Lung cancer, the most common malignant disease worldwide, is the predominant cause of cancer deaths, particularly amongst men. Therefore, various researchers have focused on the growth inhibitory effects of medicinal plants used in traditional Korean medicine. This study aimed to investigate the growth inhibitory effects of ethanol extracts of Rubiae radix, Inulae flos, Nelumbinis receptaculum, Astilbe radix, and Lagerstroemia flos on NCI-H1229 cells. Method and Results: The viability of NCI-H1229 cells was evaluated in vitro using an MTS assay. Treatment with the ethanol extracts of the selected medicinal plants at $500{\mu}g/m{\ell}$ reduced NCI-H1229 cell viability and increased apoptotic cell death and caspase-3 activation. In addition, treatment with ethanol extracts of Inulae flos and Astilbe radix increases DNA fragmentation, as measured by the TUNEL assay. Conclusions: These results indicated that ethanol extracts of Rubiae radix, Inulae flos, Nelumbinis receptaculum, Astilbe radix, and Lagerstroemia flos exhibited growth inhibitory effects, inducing apoptotic cell death, DNA fragmentation and caspase-3 activation in NCI-H1229 cells. Therefore, these medicinal plant extracts may be used in the development of natural medicines to inhibit the growth of lung cancers. However, further study is needed to determine the active ingredients of the ethanol extracts from medicinal plants that are reposible for the inhibitory effect on lung cancer cell grwoth.
Assem, Magda M;Osman, Ahmed;Kandeel, Eman Z;Elshimy, Reham AA;Nassar, Hanan R;Ali, Radwa E
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.17
no.10
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pp.4699-4711
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2016
Background: In the last decade, it has become clear that change of gene expression may alter the hematopoietic cell quiescent state and consequently play a major role in leukemogenesis. WT1 is known to be a player in acute myeloid leukemia (AML) and FOXP3 has a crucial role in regulating the immune response. Objectives: To evaluate the impact of overexpression of WT1and FOXP3 genes on clinical course in adult and pediatric AML patients in Egypt. Patients and methods: Bone marrow and peripheral blood samples were obtained from 97 de novo non M3 AML patients (63 adult and 34 pediatric). Real-time quantitative PCR was used to detect overexpression WT1 and FOXP3 genes. Patient follow up ranged from 0.2 to 39.0 months with a median of 5 months. Results: In the pediatric group; WT1 was significantly expressed with a high total leukocyte count median 50X109/L (p=0.018). In the adult group, WT1 had an adverse impact on complete remission induction, disease-free survival and overall survival (p=0.02, p=0.035, p=0.019 respectively). FOXP3 overexpression was associated with FAB subtypes AML M0 +M1 vs. M2, M4+M5 (p =0.039) and the presence of hepatomegaly (p=0.005). Conclusions: WT1 and FOXP3 overexpression has an adverse impact on clinical presentation, treatment response and survival of pediatric and adult Egyptian AML patients.
Park, Min-Gyeong;Sung, Hye-Ran;Park, Ji-Sung;Kim, Jee-Youn;Han, Sang-Bae;Lee, Chong-Kil;Yun, Byung-Kui;Song, Suk-Gil
YAKHAK HOEJI
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v.55
no.3
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pp.267-272
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2011
Human NK cells, identified 30 years ago based on their ability to spontaneously kill tumor cells, constitute a subset of lymphocytes, which play an important role in the first line of immune defense and the effective function of these cells are enhanced by cytokines. Lung carcinoma has been one of the most commonly diagonosed cancer as well as the leading cause of cancer death in male. Here we provide the evidence that human natural killer cells has inhibitory effects on tumor growth of human lung cancer cell NCI-H460 (non-small cell lung cancer). Enriched NK cell population was obtained by 2 weeks cultivation in interleukin-2(IL-2)-containing medium. The resulting population comprised 26% CD3$^+$ cells, 9% CD3$^+$CD4$^+$ cells, 16% CD3$^+$CD8$^+$ cells, 76% CD56$^+$ cells, 6% CD3$^+$CD56$^+$ cells and 70% CD3$^-$CD56$^+$ cells. Activated NK cells at doese of 2.5, 5, and 10 million cells per mouse inhibited 2%, 12% and 45% of NCI-H460-induced tumor growth in nude mouse xenograft assays, repectively. This result suggests that NK cell-based immunotherapy may be used as an adoptive immunotherapy for lung cancer patients.
Shafik, Nevine F;Rahoma, M;Elshimy, Reham AA;El kasem, Fatma M Abou
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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v.17
no.12
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pp.5179-5183
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2016
Background: Prior series investigated the expression of prepro-gastrin releasing peptide (prepro-GRP) in the peripheral blood of lung cancer patients. Our aim was to assess any prepro-GRP role as a prognostic factor for small cell lung cancer (SCLC) and NSCLC and correlations with clinical presentation and treatment outcome. Methods: A prospective study was conducted during the time period from the beginning of January 2012 till the end of January 2014. Prepro-GRP expression was analysed using a nested RT-PCR assay in peripheral blood of 62 untreated lung cancer patients attending the National Cancer Institute (NCI), Cairo University, and 30 age and sex matched healthy volunteers. Results: Among the 62 lung cancer cases, there were 24 (38.7%) SCLC, and 38 (61.3%) NSCLC (10 squamous cell carcinomas, 12 adenocarcinomas, 11 large cell carcinomas, 4 undifferentiated carcinomas, and 1 adenosquamous carcinoma). Twenty six patients (41.9%) were prepro-GRP positive. Prepro-GRP expression was higher (58.3%) among SCLC patients compared to NSCLC (squamous cell carcinoma (15.4%), large cell carcinoma (36.4%), and adenocarcinoma (25%)). Mean OS among prepro-GRP negative cases was longer than that among preprogastrin positive cases (17.6 vs 14.9 months). The mean PFS durations among preprogastrin negative versus positive cases were 7.7 vs 4.6 months (p= 0.041). No difference in response to chemotherapy was identified between the groups (p=0.983). Conclusion: Prepro-GRP is suggested to be a useful prognostic marker for lung cancer patients, especially with the fast- growing, bad prognostic SCLC type. More studies should aim at detailed understanding of the mechanisms of prepro-GRP action and its use in monitoring the response to treatment in a larger cohort.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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