• BMB Reports
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• 제29권6호
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• pp.569-573
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• 1996

Clinical strains of Mycobacterium tuberculosis, M. terrae complex, M. gordonae, M. avium-intracellulae complex, and M. fortuitum from Korean patients were isolated and analyzed by comparing large restriction fragment (LRF) patterns produced by digestion of genomic DNA with infrequent-cutting endonucleases like AsnI and XbaI. and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Three M. tuberculosis, two M. terrae complex, two M. gordonae, two M. avium-intracellulae complex, and two M. fortuitum strains were compared by using AsnI and XbaI. and this allowed easy visual separation of all epidemiologically unrelated strains. PFGE exhibits different DNA restriction patterns which are easy to compare. Genome size of the strains roughly ranged from 3020 to 3335 kb. The LRF patterns are useful for epidemiologic studies of tuberculosis with regard to drug resistance.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제54권4호
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• pp.459-466
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• 2003

M. kansasii는 M. avium complex에 이어 NTM 폐질환의 원인균 중 두 번째로 흔하다고 외국에서는 보고되었다. M. kansasii는 M. avium complex와 마찬가지로 과거부터 잘 알려진 상엽공동형의 형태와 함께 기관지확장증에 다발성 결절이 동반된 형태가 새롭게 알려지고 있다. 다른 NTM 폐질환과 달리 M. kansasii 폐질환은 INH, RFP, EMB 등 항결핵제에 치료반응이 매우 좋기 때문에 정확한 진단과 함께 적절한 약제와 치료기간의 선택이 중요하다. 국내에서는 임상검체에서 M. kansasii가 분리되는 빈도가 매우 낮으며, 아직까지 정상면역을 가진 성인에서 M. kansasii 폐질환으로 진단된 증례가 보고되지 않았다. 저자들은 1997년 미국흉부학회의 NTM 폐질환 진단기준에 따라 M. kansasii 폐질환을 진단하고 치료한 3명의 환자를 경험하여 이를 보고하는 바이다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제47권6호
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• pp.747-756
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• 1999

연구배경: 폐결핵을 확진하는 방법은 결핵균의 증명이며 결핵균 동정을 하는 고전적인 방법인 항산균 도말 검사와 결핵균 배양 검사에 대해 상호 보완적으로 폐결핵의 보다 신속한 진단을 하는데 있어서 MTD의 유용성을 알아보고자 하였다. 방 법: 1997년 11월부터 1998년 5월까지 부산대학교 병원에 내원하여 폐결핵이 의심된 187명의 환자로부터 얻은 호흡기검체 267건(객담 187건, 기관지 세척액 94건)에 대해 각각 항산균 도말, 결핵균 배양 검사, MTD를 시행한 결과를 임상 소견과 연관지어 비교 분석하였다. 결 과: 1) 객담 검체에서 항산균 도말 검사, 결핵균 배양 결과와 비교하였을 때 항산균 도말 양성인 경우 결핵균 배양 검사와 비교한 MTD의 민감도는 75.6%, 도말 음성인 경우 결핵균 배양 검사와 비교한 MTD의 민감도는 61.9%, 특이도는 85.6%였다. 2) 기관지 세척액에서 항산균 도말 검사, 결핵균 배양 결과와 비교하였을 때 항산균 도말 양성인 경우 결핵균 배양 검사와 비교한 MTD의 민감도는 89.5%, 특이도는 28.6%, 도말 음성인 경우 결핵균 배양 검사와 비교한 MTD의 민감도는 89.5%, 특이도는 67.3%였다. 3) 객담과 기관지 세척액을 합한 경우 항산균 도말검사, 결핵균 배양 결과와 비교하였을 때 항산균 도말 양성인 경우에서 결핵균 배양 검사와 비교한 MTD의 민감도는 79.7%, 특이도는 20.0%를 보였으며, 항산균 도말 음성인 경우 결핵균 배양 검 사와 비교한 MTD의 민감도는 75.0%, 특이도는 80.3%를 보였다. 4) 결핵균 배양 결과와 비하여 MTD의 결과가 일치하지 않는 경우 MTD의 민감도는 67.5%, 특이도는 84.3%였으나 불일치 해결후에 MTD의 민감도는 79.2%, 특이 도는 84.4%를 보여 향상된 결과를 보였다. 5) 항산균 도말 음성, 결핵균 배양 음성이며 MTD만 양성인 31예에서 임상 경과 추적 및 항결핵제 치료 반응 웅의 분석에서 14예에서만 최종 폐결핵으로 진단되었으며 이 경우 MTD의 민감도는 45.2%였으며 진성 양성을 확인할 수 있었다. 6) 항산균 도말 음성, MTD 음성에서 mycobacterium species로 자란 13 건의 검체에서 Mycobacterium tuberculosis와 nontuberculous mycobacteria를 분리하기 위해 accuprobe M.tuberculosis complex culture kit를 이용하여 11건에서 M.tuberculosis로 배양되었으며 2건(17.3%)에서 비결핵 항산균이 배양되었다. 결 론: 이상의 결과로 볼 때 MTD는 빠르고 정확한 결핵균 진단에 유용한 것으로 생각되며, 폐결핵 진단에 있어서 MTD는 항산균 도말 검사 및 배양 검사와 병행함으로써 유용성이 높으며, 고전적인 진단 방법을 대체하기 보다는 상호 보완적인 방법으로 판단된다.

• Annals of Laboratory Medicine
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• 제38권6호
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• pp.569-577
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• 2018

Background: The increasing prevalence of drug-resistant tuberculosis (TB) infection represents a global public health emergency. We evaluated the usefulness of a newly developed multiplexed, bead-based bioassay (Quantamatrix Multiplexed Assay Platform [QMAP], QuantaMatrix, Seoul, Korea) to rapidly identify the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) and detect rifampicin (RIF) and isoniazid (INH) resistance-associated mutations. Methods: A total of 200 clinical isolates from respiratory samples were used. Phenotypic anti-TB drug susceptibility testing (DST) results were compared with those of the QMAP system, reverse blot hybridization (REBA) MTB-MDR assay, and gene sequencing analysis. Results: Compared with the phenotypic DST results, the sensitivity and specificity of the QMAP system were 96.4% (106/110; 95% confidence interval [CI] 0.9072-0.9888) and 80.0% (72/90; 95% CI 0.7052-0.8705), respectively, for RIF resistance and 75.0% (108/144; 95% CI 0.6731-0.8139) and 96.4% (54/56; 95% CI 0.8718-0.9972), respectively, for INH resistance. The agreement rates between the QMAP system and REBA MTB-MDR assay for RIF and INH resistance detection were 97.6% (121/124; 95% CI 0.9282-0.9949) and 99.1% (109/110; 95% CI 0.9453-1.0000), respectively. Comparison between the QMAP system and gene sequencing analysis showed an overall agreement of 100% for RIF resistance (110/110; 95% CI 0.9711-1.0000) and INH resistance (124/124; 95% CI 0.9743-1.0000). Conclusions: The QMAP system may serve as a useful screening method for identifying and accurately discriminating MTBC from non-tuberculous mycobacteria, as well as determining RIF- and INH-resistant MTB strains.

• 한국동물위생학회지
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• 제34권4호
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• pp.321-331
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• 2011

Mycobacterium bovis, a member of the M. tuberculosis complex (MTC), is the causative agent of bovine tuberculosis. Detection of M. bovis and M. tuberculosis using conventional culture- and biochemical-based assays is time-consuming. Therefore, a simple and sensitive molecular assay for rapid detection would be of great help in specific situations such as faster diagnosis of bovine tuberculosis (bTB) infection in the abattoirs. We developed a novel multiplex real-time PCR assay which was applied directly to biological samples with evidence of bTB and it was allowed to differentiate between M. bovis and M. tuberculosis. The primers and TaqMan probes were designed to target the IS1081 gene, the multi-copy insertion element in the MTC and the 12.7-kb fragment which presents in M. tuberculosis, not in the M. bovis genome. The assay was optimized and validated by testing 10 species of mycobacteria including M. bovis and M. tuberculosis, and 10 other bacterial species such as Escherichia coli, and cattle lymph nodes (n=113). The tests identified 96.4% (27/28) as M. bovis from the MTC-positive bTB samples using conventional PCR for specific insertion elements IS1081. And MTC-negative bTB samples (n=85) were tested using conventional PCR and the real-time PCR. When comparative analyses were conducted on all bovine samples, using conventional PCR as the gold standard, the relative accuracy of real-time PCR was 99.1%, the relative specificity was 100%, and the agreement quotient (kappa) was 0.976. The detection limits of the real-time PCR assays for M. bovis and M. tuberculosis genomic DNA were 10 fg and 0.1 pg per PCR reaction, respectively. Consequently, this multiplex real-time PCR assay is a useful diagnotic tool for the identification of MTC and differentiation of M. bovis and M. tuberculosis, as well as the epidemiologic surveillance of animals slaughtered in abattoir.

• 대한임상검사과학회지
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• 제52권4호
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• pp.349-355
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• 2020

최근 호흡기 검체에서 결핵균(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC) 검출은 감소하고 비결핵 항산균(nontuberculous mycobacteria, NTM)은 증가하고 있다. 본 연구는 2010년부터 2019년까지 광주 2차 병원에 의뢰된 호흡기검체 132,359예를 대상으로 NTM 검출 증가 대비 NTM 폐질환 환자의 증가와 연령 및 성별 분포를 조사하였다. 그리고 NTM양성환자의 폐결핵 감염 여부를 확인하고자 하였다. 항산균배양 양성률은 2010년 21.9% (1,624/7,403), 2019년 17.4% (1,937/11,161)였다. NTM 분리 비율은 2010년 38.0% (617/1,624)에서 2019년에 72.4% (1,403/1,937)로 증가하였다. NTM 양성환자의 NTM 폐질환 진단률은 평균 27.1%였다. 이 중 현재 폐결핵에 감염된 사례는 2010년 44.4%에서 2019년 23.5%로 감소하고 과거 진단 또는 치료 사례도 15.6%에서 10.6%로 감소하였다. 전체 NTM 폐질환 중 69.0%가 60대 이상이었으며 남자보다 여자 환자가 더 많았다. 향후 고령화와 결핵 관리 정책에 따라 NTM 검출은 증가하는 반면 MTBC는 감소할 것으로 예상되며, 실험실에서는 이 현상에 세심한 주의를 기울이고 지속적으로 검사 결과를 감시해야 할 것이다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제82권1호
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• pp.15-26
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• 2019

The pathogen Mycobacterium avium complex (MAC) is the most common cause of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease worldwide. The decision to initiate long-term antibiotic treatment is difficult for the physician due to inconsistent disease progression and adverse effects associated with the antibiotic treatment. The prognostic factors for the progression of MAC pulmonary disease are low body mass index, poor nutritional status, presence of cavitary lesion(s), extensive disease, and a positive acid-fast bacilli smear. A regimen consisting of macrolides (clarithromycin or azithromycin) with rifampin and ethambutol has been recommended; this regimen significantly improves the treatment of MAC pulmonary disease and should be maintained for at least 12 months after negative sputum culture conversion. However, the rates of default and disease recurrence after treatment completion are still high. Moreover, treatment failure or macrolide resistance can occur, although in some refractory cases, surgical lung resection can improve treatment outcomes. However, surgical resection should be carefully performed in a well-equipped center and be based on a rigorous risk-benefit analysis in a multidisciplinary setting. New therapies, including clofazimine, inhaled amikacin, and bedaquiline, have shown promising results for the treatment of MAC pulmonary disease, especially in patients with treatment failure or macrolide-resistant MAC pulmonary disease. However, further evidence of the efficacy and safety of these new treatment regimens is needed. Also, a new consensus is needed for treatment outcome definitions as widespread use of these definitions could increase the quality of evidence for the treatment of MAC pulmonary disease.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제86권1호
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• pp.47-56
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• 2023

Background: There is a global increase in isolation of nontuberculous mycobacteria (NTM). The aim of the study was to analyze longitudinal trends of NTM identification and pattern of antimicrobial susceptibility testing. Methods: NTM recovery rates, distribution of NTM species identification, and antimicrobial susceptibility pattern of NTM at Pusan National University Yangsan Hospital between January 2016 and December 2020 were retrospectively analyzed. Results: A total of 52,456 specimens from 21,264 patients were submitted for mycobacterial culture, of which 2,521 from 1,410 patients were NTM positive over five years (January 2016 to December 2020). NTM isolation showed an increasing trend from 2016 to 2020 (p<0.001, test for trend) mainly caused by Mycobacterium avium complex. The vast majority of M. avium complex were susceptible to key agents clarithromycin and amikacin. For Mycobacterium kansasii, resistance to rifampin and clarithromycin is rare. Amikacin was the most effective drug against Mycobacterium abscessus subspecies abscessus and Mycobacterium subspecies massiliense. Most of M. subspecies massiliense were susceptible to clarithromycin, while the majority of M. abscessus subspecies abscessus were resistant to clarithromycin (p<0.001). Conclusion: There was an increasing trend of NTM isolation in our hospital. Resistance to key drugs was uncommon for most NTM species except for M. abscessus subspecies abscessus against clarithromycin.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제1권1호
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• pp.49-58
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• 1984

폐결핵 환자의 객담으로 부터 비정형항산균의 배균여부를 규명하기 위하여 세균학적 시험 및 임상적 조사를 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 객담 334예에서 항산균 103주 (30.8%)를 분리 배양하였다. 2. 분리배양된 항산균주에서 비정형항산균으로 감별된 균주는 10주(9.7%)이며 인형결핵균주는 93주(90.3%)이였다. 3. 감별된 비저형항산균주는 Runyon군별로는 암착색균군, 광비발색균군이 각각 3주 (30.0%)씩이며 신속발육균군이 4주(40.0%)였으며 광발색균군은 분리되지 않았다. 4. 생물학석 성상 및 생화학적 특성시험 양상에 의해 암착색균군 3주 중 2주는 Mycobacterium scrofulaceum, 1주는 Mycobacterium szulgai로, 광비발색균 3주 중 2주는 Mycobacterium avium complex, 1주는 Mycobacterium terrae로 동정되였으며, 신속발육균주 4주중 3주는 Mycobacterium fortuitum, 1주는 Mycobacterium chelonei로 등정되었다. 5. 항결핵제에 대한 시험관내 약제감수성검사에서 INH, SM에서는 10주가 전부 내성을 나타내었으며, EB, TH, 및 CS의 저농도인 10mcg, 50mcg, 및 40mcg에서 완전내성을 나타내었다. 그리고 EB, TH, 및 RFP의 고농도인 20mcg, 및 100mcg,에서 감수성을 나타내었다. 6. 비정형항산균이 배균된 환자의 X-선소견 및 임상적 소견 조사에서는 인형결핵균 감성으로 인한 폐결핵 환자의 증상에 비해 경하지 않는 것으로 사료되었으며 장기간 항결핵제의 투여치로 되어 왔으나 대부분 호전되지 않았다.

• 한국동물위생학회지
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• 제36권2호
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• pp.79-86
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• 2013

Mycobacterium (M.) bovis, a member of the M. tuberculosis complex (MTC), is a re-emerging, zoonotic agent of bovine tuberculosis whose prevalence probably depends on variations in direct exposure to cattle and ingestion of raw milk. Accurate species differentiation of M. bovis and M. tuberculosis is needed to distinguish between human and zoonotic tuberculosis. This study successfully developed a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for rapid detection and differentiation of M. bovis and M. tuberculosis, however showed negative reactions in eight non-tuberculous mycobacteria (NTM) samples and ten other bacterial species. Sensitivity of this assay for detection of genomic M. bovis DNA was 10 $fg/{\mu}l$. And this assay successfully detected M. bovis in bovine clinical specimens. In conclusion, the LAMP assay is a simple and powerful tool for rapid detection of M. bovis in both pure bacterial culture and in clinical samples.