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사양관리를 위한 젖소 목장 시설 통합 네트웍 시스템 (Integrated Network System of Milk Cow Stock-Farming Facilities for Stockbreeding Management)

  • 김지홍;이수영;김용준;한병성;김동원
    • 한국축산시설환경학회지
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    • 제8권3호
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    • pp.199-208
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    • 2002
  • 본 연구에서는 실험을 통해 PLC와 하부장치들 사이에 RS -485 직렬 통신방식의 네트웍을 이용한 정보 교환에 있어 잡음 손실이나 왜곡현상이 매우 낮다는 것을 보였다. 제시한 네트웍 방법과 알고리즘에 의해 동작하는 PLC의 효율과 작업 능력을 기반으로 작업장을 분화하여 필요한 작업을 배치한 방법은 매우 효과적이고 편리하며 유용한 정보를 제공하였다. 보다 정확한 정보의 축척과 높은 효율을 위해 본 실험에서 제시한 알고리즘과 운용방법을 각 목장에 활용할 때에는 사용자나 관리자의 요구에 따라 데이터를 통한 계측장비의 교정과 함께 수정이 필요하겠다. 하지만 무엇보다 PLC를 이용한 축산자동화를 통해 사양관리에 필요한 생체 계측 정보를 착유와 동시에 자동으로 다량 획득하여 데이터 전자 문서파일로 보관함으로서, 긴 시간의 지연 없이 사양관리 감독자에게 제공할 수 있는 방법적 해결에 유용성과 신속성을 보였고 사용자나 관리자가 필요한 작업을 수행할 때에 매일 반복적인 작업에 대한 보조적 역할을 하거나 착유 시설과 급이 시설에 완전한 자동화 무인화를 위한 보조적 장비로서 필요한 시설과 정보를 제공하는 것이 가능함을 확인하였다.

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Duration HMM을 이용한 진핵생물 유전자 예측 프로그램 개발 (A Eukaryotic Gene Structure Prediction Program Using Duration HMM)

  • 태홍석;박기정
    • 미생물학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.207-215
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    • 2003
  • 주어진 염기서열에서 단백질로 코딩되는 영역을 예측하는 유전자 구조 예측은 유전자 annotation의 가장 핵심적인 부분으로 유전자 분석 및 유전체 프로젝트 전체에 큰 영향을 준다. 진핵생물의 유전자가 원핵생물의 유전자에 비해 더 복잡한 구조를 가지기 때문에 진핵생물의 유전자 구조 예측 모델 역시 원핵생물에 비해 다양하고 복잡한 모델로 구성되어 있다. 본 연구팀은 duration hidden markov model을 기본형태로 하여 진핵생물의 유전자 구조 예측 프로그램인 EGSP를 개발하였다. 이 프로그램은 각 생명체의 유전자 구조 예측에 필요한 파라메터를 생성하는 학습기능과, 이를 기반으로 핵산 서열을 입력으로 해서 단백질을 코딩하는 부위를 예측하여 출력하는 기능으로 구성되며, 최근의 프로그램들의 추세대로 복수 개 유전자 예측의 기능을 갖추고 있다. EGSP의 학습과 예측에 사용되는 각 파라메터의 전체 성능에 대한 효과 분석 등을 위해 여러 개 signal에 대한 개별 모델이 주는 효과 등을 분석하였다. 진핵생물의 유전자 구조 예측에 가장 많이 연구되는 human dataset을 이용하여 현재 개발된 유전자 구조 예측 프로그램인 GenScan과 GeneID, Morgan 등 보편적으로 사용되는 프로그램들과의 성능을 여러 가지 기준에서 비교한 결과, 본 프로그램이 실용성 있는 수준을 보여주는 것을 확인하였다. 그리고 진핵 미생물인 Saccharomyces cerevisiae로 성능을 테스트한 결과 만족할 만한 수준의 성능을 나타내는 것을 알 수 있었다.

개인용 SSD를 위한 선반입 및 메모리 관리 정책 (A Prefetching and Memory Management Policy for Personal Solid State Drives)

  • 백승훈
    • 정보처리학회논문지A
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    • 제19A권1호
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    • pp.35-44
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    • 2012
  • 기존의 운영체제에서 하드디스크의 성능을 향상시키기 위해서 사용해왔던 기술들이 SSD(Solid State Drive)에는 부정적 효과를 나타내는 경우가 많다. HDD의 기계적인 요소 때문에 접근 시간과 블록 주소의 순서가 성능에 매우 중요한 요인으로 작용하였지만, SSD는 불록 주소의 순서에 영향을 받지 않는 우수한 랜덤 읽기 성능을 제공한다. 실제 개인용 PC에서 SSD를 사용할 때에 선반입을 끄도록 권고되고 있다. 하지만 이 논문은 SSD의 내부 구조와 낸드 플래시 메모리의 특징을 고려한 선반입 및 메모리관리 정책를 결합한 방법을 제시한다. SSD에는 다수개의 낸드 플래시 메모리로 구성되어 있어 칩을 동시에 구동시키는 것이 중요하며, 낸드 플래시 메모리의 기본 입출력 단위가 계속 증가하는 방향으로 발전하고 있어서 SSD 내부의 동작 단위가 운영체제의 블록 크기보다 훨씬 커지게 되었다. 이 논문은 이러한 SSD의 특징과 경향을 수용하여, 제안하는 선반입 기법은 SSD의 동작 단위로 수행되며, 제안하는 메모리 관리 기법은 그 선반입 기법의 단점을 보완하여, 캐시 히트율과 선반입 히트율의 합이 최대가 되도록, 선반입되었지만 사용되지 않는 데이터를 적응적으로 퇴출한다. 본 기술은 리눅스 커널 모듈로 개발하였으며 실제 SSD를 사용하여 성능 평가를 실시하였다. 주어진 실험에서 제안하는 선반입 기법이 약 26%까지 성능을 향상시켰다.

VMS 실시간 운영전략 구축을 위한 운전자 경로선택모형 (Driver Route Choice Models for Developing Real-Time VMS Operation Strategies)

  • 김숙희;최기주;유정훈
    • 대한토목학회논문집
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    • 제26권3D호
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    • pp.409-416
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    • 2006
  • VMS를 통해 제공되는 실시간 교통정보는 운전자의 통행경로선택에 영향을 주는 것으로 알려져 있으며, 이에 따라 VMS 정보를 이용한 운전자 통행경로 제어를 통해 도로망 전체의 운영효율을 최적화하고자하는 다양한 연구들이 이루어져 왔다. 본 연구에서는 실시간으로 주기별로 최적화된 메시지의 내용을 VMS에 표출할 때 도로망 전체의 총 통행시간을 최소화할 수 있는 운전자 경로선택행태 모형을 개발하였다. 우선 운전자의 경로선택을 현실감 있게 반영하기 위해 Stated Preference(SP) 조사를 바탕으로 하여 개발하였다. VMS를 통해 제공되는 메시지 내용과 표출주기가 주어졌을 때 최적의 VMS 정보제공 조합은 유전자 알고리즘을 이용하여 구했으며, 최적해 산출과정에서 필요한 교통분석은 미시적 교통시뮬레이션인 파라믹스를 이용하였다. 실험결과를 살펴보면 모든 시나리오에서 본 모형이 효과적으로 최적해를 찾아가는 것으로 나타났다. VMS 설치 전후를 비교하면 VMS를 운영하였을 때 도로망의 총 통행시간을 줄일 수 있는 것으로 나타났으며, VMS 정보의 표출주기가 짧을수록 VMS 메시지 내용의 개수가 작은 것이 총 통행시간을 감소시키는데 유리한 것으로 분석되었다.

선진 사례 벤치마킹을 통한 국내 모듈러 건축 시공 프로세스 제안 (Modular Building Construction Process Development by Benchmarking International Best Practices)

  • 신현규;안용한
    • 한국건설관리학회논문집
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    • 제17권6호
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    • pp.3-12
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    • 2016
  • 본 연구의 목적은 모듈러 건축 프로젝트를 수행하는데 발생할 수 있는 위험요인을 도출하고, 해외 선진사례 분석을 통해 도출한 관리요소를 벤치마킹함으로써 국내 적용 가능한 모듈러 건축 시공 프로세스를 제안하는 것이다. 본 연구를 수행하기 위해 해외 대표적인 모듈러 건축 사례인 미국 애틀랜틱 야드 B2 프로젝트를 분석하고 내용분석법을 통해 모듈러 건축 시공 단계에서 발생할 수 있는 위험요인을 도출하였다. 본 연구결과인 모듈러 건축 시공 프로세스를 기반으로 모듈러 건축 설계, 제작 단계부터 시공 단계에 발생되는 위험요인을 고려하여 관리한다면, 시공 과정에서 발생할 수 있는 잠재적인 위험요인을 사전에 방지하고, 시행착오를 줄여 모듈러 건축 시공성도 향상시킬 수 있을 것이다. 또한, 모듈러 건축 프로젝트를 효율적으로 관리함으로써 모듈러 공법의 장점인 공기 단축 및 공사비 절감을 실현하고, 결과적으로 시공품질을 확보하여 모듈러 건축 활성화에 기여할 수 있을 것이다.

ESS (에너지 저장장치) 배터리 화재사례를 통한 감식기법 및 연소 확산방지에 관한 연구 (A Study on the Identification Technique and Prevention of Combustion Diffusion through ESS (Energy Storage System) Battery Fire Case)

  • 이정일
    • 한국재난정보학회 논문집
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    • 제16권2호
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    • pp.383-391
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    • 2020
  • 연구목적 : 에너지 저장실의 외부 화염에 의한 내부자기 점화 및 점화를 식별하고, 과열로 인한 점화와 외부 열원에 의한 점화의 차이를 분석하는 것이다. 연구방법 : 분리막 녹는점 측정, 배터리 외부 수열 실험, 배터리 과충전 실험, 과충전과 외부수열에 의한 연소 시 전극 판 비교분석, 과충전 연소 특징, 외부수열 화재 연소특징, 3.4(전극판 비교)/ 3.5(과충전)/ 3.6(외부수열) 분석 실험을 하였다. 연구결과: 화재 발생 시까지 센서의 위치에 따른 온도 차이가 극심했음으로 기존처럼 한 모듈 당 온도 센서 두 개로는 측정값이 부족해 온도제어를 통한 화재를 사전에 방지할 수 없다고 판단한다. 결론: 단락이 점화원으로 작용하여 혼합가스에 착화돼 가스폭발이 발생하고, 폭발 압력에 의해 전극이 잘게 파손되며, 가루형태의 리튬산화물이 불꽃반응에 의해 폭죽과 유사한 불꽃이 분출되었다.

GEDA: New Knowledge Base of Gene Expression in Drug Addiction

  • Suh, Young-Ju;Yang, Moon-Hee;Yoon, Suk-Joon;Park, Jong-Hoon
    • BMB Reports
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    • 제39권4호
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    • pp.441-447
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    • 2006
  • Abuse of drugs can elicit compulsive drug seeking behaviors upon repeated administration, and ultimately leads to the phenomenon of addiction. We developed a procedure for the standardization of microarray gene expression data of rat brain in drug addiction and stored them in a single integrated database system, focusing on more effective data processing and interpretation. Another characteristic of the present database is that it has a systematic flexibility for statistical analysis and linking with other databases. Basically, we adopt an intelligent SQL querying system, as the foundation of our DB, in order to set up an interactive module which can automatically read the raw gene expression data in the standardized format. We maximize the usability of this DB, helping users study significant gene expression and identify biological function of the genes through integrated up-to-date gene information such as GO annotation and metabolic pathway. For collecting the latest information of selected gene from the database, we also set up the local BLAST search engine and non-redundant sequence database updated by NCBI server on a daily basis. We find that the present database is a useful query interface and data-mining tool, specifically for finding out the genes related to drug addiction. We apply this system to the identification and characterization of methamphetamine-induced genes' behavior in rat brain.

Cloning and Expression of a Novel Chitosanase Gene (choK) from $\beta$-Proteobacterium KNU3 by Double Inverse PCR

  • Yi, Jae-Hyoung;Lee, Keun-Eok;Choi, Shin-Geon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권3호
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    • pp.563-569
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    • 2004
  • The DNA sequence of the chitosanase gene (choK) from $\beta$-Proteobacterium KNU3 showed an 1,158-bp open reading frame that encodes a protein of 386 amino acids with a novel 74 signal peptide. The degenerated primers based on the partial deduced amino acid sequences from MALDI- TOF MS analyses yielded the 820 bp of the PCR product. Based on this information, double inverse PCR cloning experiments, which use the two specific sets of PCR primers rather than single set primers, identified the unknown 1.2 kb of the choK gene. Subsequently, a 1.8 kb of full choK gene was cloned from another PCR cloning experiment and it was then subcloned into pGEM T-easy and pUC18 vectors. The recombinant E. coli clone harboring recombinant pUC18 vector produced a clear halo around the colony in the glycol chitosan plates. The recombinant ChoK protein was secreted into medium in a mature form while the intracellular ChoK was produced without signal peptide cleavage. The activity staining of PAGE showed that the recombinant ChoK protein was identical to the chitosanase of wild-type. The comparison of deduced amino acid sequences of choK revealed that there is 92% identity with that of Sphingobacterium multivorum chitosanase. Judging from the conserved module in other bacterial chitosanases, chitosanase of KNU3 strain (ChoK) belongs to the family 80 of glycoside hydrolases.

Identification of Candidate SNP (Single Nucleotide Polymorphism) for Growth and Carcass Traits Related to QTL on Chromosome 6 in Hanwoo (Korean Cattle)

  • Lee, Y.S.;Lee, J.H.;Lee, J.Y.;Kim, J.J.;Park, H.S.;Yeo, J.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권12호
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    • pp.1703-1709
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    • 2008
  • As genetic markers, single nucleotide polymorphisms (SNP) are very appropriate for the development of genetic tests for economic traits in livestock. Several microsatellite markers have been identified as useful markers for the genetic improvement of Hanwoo. Among those markers, ILSTS035 was recently mapped at a similar position with four SNPs (AH1_11, AH1_9, 31465_446, and 12273_165) in a linkage map of EST-based SNP in BAT6. Among the four SNPs, two SNPs (31465_446 and 12273_165) were analyzed using BLAST at the NCBI web site. The sequences including the 12273_165 SNP were identified at the intron region within the LOC534614 gene on the gene sequence map (Bos taurus NCBI Map view, build 3.1). The LOC534614 gene represents a protein similar to myosin heavy chain, fat skeletal muscle, embryonic isoform 1 in the dog, and myosin_1 (Myosin heavy chain D) in Macaca mulatta. In cattle, the myosin heavy chain was associated with muscle development. The phenotypic data for growth and carcass traits in the 415 animals were analyzed by the mixed ANCOVA (analysis of covariance) linear model using PROC GLM module in SAS v9.1. By the genotyping of Hanwoo individuals (n = 415) to evaluate the association of SNP with growth and carcass traits, it was shown that the 12273_165 SNP region within LOC534614 may be a candidate marker for growth. The results of the statistical analyses suggested that the genotype of the 12273_165 SNP significantly affected birth weight, weight of the cattle at 24 months of age, average daily gain and carcass cold weight (p<0.05). Consequently, the 12273_165 SNP polymorphisms at the LOC534614 gene may be associated with growth in Hanwoo, and functional validation of polymorphisms in LOC534614 should be performed in the future.

Gene Cloning, Expression, and Characterization of a $\beta$-Agarase, AgaB34, from Agarivorans albus YKW-34

  • Fu, Xiao Ting;Pan, Cheol-Ho;Lin, Hong;Kim, Sang-Moo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권3호
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    • pp.257-264
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    • 2009
  • A $\beta$-agarase gene, agaB34, was functionally cloned from the genomic DNA of a marine bacterium, Agarivorans albus YKW-34. The open reading frame of agaB34 consisted of 1,362 bp encoding 453 amino acids. The deduced amino acid sequence, consisting of a typical N-terminal signal peptide followed by a catalytic domain of glycoside hydrolase family 16 (GH-16) and a carbohydrate-binding module (CBM), showed 37-86% identity to those of agarases belonging to family GH-16. The recombinant enzyme (rAgaB34) with a molecular mass of 49 kDa was produced extracellularly using Escherichia coli $DH5{\alpha}$ as a host. The purified rAgaB34 was a $\beta$-agarase yielding neoagarotetraose (NA4) as the main product. It acted on neoagarohexaose to produce NA4 and neoagarobiose, but it could not further degrade NA4. The maximal activity of rAgaB34 was observed at $30^{\circ}C$ and pH 7.0. It was stable over pH 5.0-9.0 and at temperatures up to $50^{\circ}C$. Its specific activity and $k_{cat}/K_m$ value for agarose were 242 U/mg and $1.7{\times}10^6/sM$, respectively. The activity of rAgaB34 was not affected by metal ions commonly existing in seawater. It was resistant to chelating reagents (EDTA, EGTA), reducing reagents (DTT, $\beta$-mercaptoethanol), and denaturing reagents (SDS and urea). The E. coli cell harboring the pUC18-derived agarase expression vector was able to efficiently excrete agarase into the culture medium. Hence, this expression system might be used to express secretory proteins.