• 생태와환경
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• 제54권3호
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• pp.229-239
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• 2021

말쥐치는 북서태평양 해역에 분포하는 군집성 어류로 수산식품으로 이용되는 경제적 가치가 높은 어종이다. 본 연구에서는 서남해에 서식하는 국내산 말쥐치(Thamnaconus modestus)와 기존에 보고된 유사종(Thamnaconus septentrionalis)과의 형태적-유전적 특징을 비교-분석하였다. 이를 위해 서남해에서 채집한 말쥐치의 외부 형태와 골격을 관찰하고, 미토콘드리아 DNA의 cytochrome c oxidase subunit I (COI) 유전자 염기서열을 비교하여 유사종 (T. septentrionalis)과의 계통진화적 연관관계를 분석하였다. 서남해안 말쥐치의 외부 형태는 회갈색 바탕에 몸 전체에 흑갈색 무늬가 불규칙하게 산재된 패턴을 가지며 청록빛의 지느러미가 관찰되었다. 채집한 말쥐치에서 추출한 미토콘드리아DNA의 COI 유전자 분석결과 7종류의 염기서열 변이가 나타났으나 상동성이 전체적으로 98.8% 이상으로 유사성이 높게 나타났다. 또한 형태적으로 말쥐치 유사종인 T. septentrionalis COI 염기서열 비교와 계통유전학적 분석 결과, 보고된 시퀀스 중 상동성이 99%로 유전적으로 말쥐치로 보여지는 두 종(JN813099, MW485059)과 상동성 95%로 유사종으로 보이는 두 종(EF607583, KP267619)이 확인되었다. 말쥐치와 유사종은 계통유전적 분석결과 말쥐치와 유사종의 차이를 확인하였으나 형태적 특징으로 종 분류는 어려운 상태이다. 따라서 본 연구는 말쥐치의 외부 형태와 내부 골격 및 계통유전학적 정보를 제공함으로 말쥐치와 유사종(T. septentrionalis)의 분류학적 재검토를 진행하는 데 주요한 정보가 될 것이다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제36권3호
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• pp.193-201
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• 2020

Family Coleophoridae, commonly known as "casebearers", is one of the largest families of Gelechioidea (Lepidoptera), with more than 1,450 described species worldwide, but it has been poorly known in Korea, with only 32 known species of the genus Coleophora Hübner, 1822. Here we present Coleophora fasciella Koo & Baldizzone, sp. nov., a new species to science, and C. mayrella (Hübner, [1813]), an unrecorded species in Korea. Diagnostic characteristics with descriptions of the genitalia are provided with photos of adults, wing venations, and genitalia of both sexes for the species. Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I(COI) barcode sequences for the two species are also provided.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제35권2호
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• pp.63-72
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• 2019

Four feather mites, Alloptes(Apodalloptes) orthogramme Gaud and Mouchet, 1957, Alloptes(Conuralloptes) limosae Dubinin, 1951, Alloptes (C.) procerus Gaud, 1972 and Alloptes (Sternalloptes) fauri Gaud, 1957 are reported for the first time in South Korea. These specimens were collected from four charadriiform bird species: Actitis hypoleucos, Larus crassirostris, Limosa limosa, and Numenius phaeopus. The family Alloptidae Gaud, 1957 and a genus Alloptes Canestrini, 1879 are newly added to the invertebrate fauna of South Korea as well. Here, we provide the morphological description and illustrations based on the present specimens. Additionally, partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I(COI) were newly-generated for using as DNA barcodes.

• 생태와환경
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• 제53권3호
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• pp.286-294
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• 2020

깔따구(Diptera: Chironomidae)는 저서성 대형무척추동물로 환경오염 및 수질 모니터링에 이용되는 중요한 지표생물이다. 본 연구에서는 인천 수돗물 정수장에서 발견된 깔따구류의 정밀한 종 동정을 위해 형태적 분류와 미토콘드리아 DNA에서 cytochrome c oxidase subunit I (COI) 유전자의 염기서열을 이용하여 분석하였다. 정수장 6곳의 20개체는 안개무늬날개깔따구(Chironomus kiiensis) 12개체, 노랑털깔따구(Chironomus flaviplumus) 6개체, 등깔따구(Chironomus dorsalis) 1개체, 용산무늬깔따구(Polypedilum yongsanensis) 1개체 등 4종으로 확인되었다. 각 깔따구 종의 형태적 특징은 두부, 하순기절, 대악, 안테나, 발톱의 형태적 특징을 살펴보았다. NCBI Genbank에 등록된 깔따구 17종 21개체의 COI 염기서열을 바탕으로 본 연구에서 조사된 20개체의 계통진화적 분석한 결과 각 4종의 깔따구 COI 염기서열은 등록된 동인 종과 높은 상동성을 보이며 (99~100%) 같은 계통군(clade)으로 나타났다. 이러한 결과는 국내 깔따구의 종 동정을 위한 형태적- 유전적 정보를 통합적으로 제공함으로 담수생태계의 모니터링을 위한 주요한 정보로 활용될 것이다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제36권4호
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• pp.331-341
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• 2021

본 연구에서는 DNA barcode 시험법을 이용하여 시중 유통 중인 도미와 옥돔 수산가공식품의 위변조현황을 분석하였다. 참돔 12건, 돌돔 4건, 황돔 7건, 감성돔 2건, 나일틸라피아 7건, 옥돔 6건, 옥두어 8건 총 46건의 시료에 대해 실험을 진행하였다. 생물 종 판별에 주로 이용되는 mitochondrial DNA의 COX I (cytochrome C oxidase subunit I) 유전자 영역을 분석하여 원재료의 종을 판정하였다. NCBI에서 제공하는 BLAST Search 프로그램을 이용하여 분석된 염기서열과 NCBI에 등록된 각각 어류의 유전자 염기서열을 비교하였다. 분석 결과 염기서열 상동성(identity)이 97% 이상인 종을 원재료 종으로 판별하였다. DNA barcode 시험법을 이용해 시중 유통되는 참돔, 돌돔, 황돔, 감성돔, 나일틸라피아, 옥돔, 옥두 수산가공품 46건에 대해 조사한 결과 위변조 사례는 나타나지 않았다. 그러나 시장에서 통용되는 일반명칭과 식품공전에 기술된 표준명칭이 상이하여 소비자의 혼란을 야기할 수 있어 수산물 가공식품 표기에 일반명칭과 더불어 표준명칭 또는 학명을 같이 기술하여야 할 것으로 판단되었다.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제9권3호
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• pp.101-106
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• 2006

The cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene region of mitochondrial DNA (mtDNA) was examined in four abalone species to estimate its utility as a genetic marker using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. The utility was evaluated in terms of genetic divergence and relationships among Haliotis discus hannai, H. rufescens, H. rubra, and H. midae in both hemispheres of the world. There was clear genetic divergence in the mtDNA COI region between all pairs of the four species. Moreover, relationships among the abalone species were reflected in their geographical distributions and morphological characteristics. Therefore, RFLP analysis of the mtDNA COI region is a suitable genetic marker for the estimation of genetic divergence and relationships among abalone species. However, it is not effective for the evaluation of genetic differences within abalone species.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제18권3호
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• pp.311-316
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• 2015

Ten specimens of Brama dussumieri (family Bramidae) were collected from waters off Jeju Island, Busan, and Gangneung, Korea, during 2013-2014. The specimens were characterized by having 58-64 lateral line scales and 13-15 gill rakers. An analysis of 567 base pair sequences of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I showed that sequences in our ten specimens are concordant with those of B. dussumieri from the USA, India, and Japan, although with slight differences (genetic distance = 0.000-0.018). Brama dussumieri was distinguished from the most similar species, Brama japonica, by the number of lateral line scales (57-65 in B. dussumieri vs. 65-75 in B. japonica) and the number of gill rakers (13-15 in B. dussumieri vs. 17-20 in B. japonica). We propose the new Korean name "Wae-sae-da-rae" for B. dussumieri in Korea.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제30권2호
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• pp.124-131
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• 2014

The Korean nudibranch faunal study has been conducted since 2011 and five species including Dermatobranchus otome Baba, 1992, Mexichromis festiva (Angas, 1864), Noumea nivalis Baba, 1937, Hoplodoris armata (Baba, 1993), and Okenia hiroi (Baba, 1938) were newly reported with re-descriptions and figures. Also, Noumea purpurea Baba, 1949 was re-described with illustrations because previous records for this species were given without a description. Two congeneric species in the genus Noumea could be distinguished by ground color, dorsal markings, color of the mantle edge and gills, and mantle and dorsal marking. In addition, mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) sequences of five species were provided for further molecular identification study. Consequently, a total of 43 species have been reported for the Korean nudibranch fauna.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제36권1호
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• pp.7-9
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• 2020

In the present study, the first mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene (COI) sequence of Sterkiella multicirrata Li et al., 2018 is presented. To begin with, this species has been also morphologically recorded from South Korea, and this study was performed using genomic DNA of the Korean population. The newly obtained COI sequences of S. multicirrata were identical. And the inter-specific variation between S. multicirrata and S. histriomuscorum was noted at 14.3%. These values correspond well with the results of previous studies. However, because there are very few available COI sequences of stichotrichian in GenBank, it is concluded that continuous accumulation of data is needed for further study.

• 한국수산과학회지
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• 제47권1호
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• pp.79-83
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• 2014

Thirty five juveniles belonging to the genus Collichthys were collected using a bag net at Gang-wha-do, in the eastern Yellow Sea, between July and September, 2012, and identified using combined genetic and morphological methods. We sequenced 316 base pairs of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I of 35 individuals, of which 22 individuals were identified as Collichthys niveatus (12.9-47.6 mm in SL) and 13 as Collichthys lucidus (13.4-40.3 mm SL). Morphologically, the number of occipital crests, an important taxonomic character during the adult stage, could not distinguish the two species during the juvenile stage, but the shape of the first anal fin spine clearly distinguished the two species even among juveniles.