Park, Sol Lee;Cho, Jang Yeon;Kim, Su Hyun;Lee, Hong-Ju;Kim, Sang Hyun;Suh, Min Ju;Ham, Sion;Bhatia, Shashi Kant;Gurav, Ranjit;Park, ee-Hyoung;Park, Kyungmoon;Kim, Yun-Gon;Yang, Yung-Hun
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제32권1호
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pp.27-36
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2022
Ever since bioplastics were globally introduced to a wide range of industries, the disposal of used products made with bioplastics has become an issue inseparable from their application. Unlike petroleum-based plastics, bioplastics can be completely decomposed into water and carbon dioxide by microorganisms in a relatively short time, which is an advantage. However, there is little information on the specific degraders and accelerating factors for biodegradation. To elucidate a new strain for biodegrading poly-3-hydroxybutyrate (PHB), we screened out one PHB-degrading bacterium, Microbulbifer sp. SOL03, which is the first reported strain from the Microbulbifer genus to show PHB degradation activity, although Microbulbifer species are known to be complex carbohydrate degraders found in high-salt environments. In this study, we evaluated its biodegradability using solid- and liquid-based methods in addition to examining the changes in physical properties throughout the biodegradation process. Furthermore, we established the optimal conditions for biodegradation with respect to temperature, salt concentration, and additional carbon and nitrogen sources; accordingly, a temperature of 37℃ with the addition of 3% NaCl without additional carbon sources, was determined to be optimal. In summary, we found that Microbulbifer sp. SOL03 showed a PHB degradation yield of almost 97% after 10 days. To the best of our knowledge, this is the first study to investigate the potent bioplastic degradation activity of Microbulbifer sp., and we believe that it can contribute to the development of bioplastics from application to disposal.
의류 산업의 발전과 함께 다양한 염료를 이용한 염색 기술이 개발되어 왔다. 최근 합성색소의 인체에 대한 유해성으로 인하여 천연색소에 대한 관심이 증가하고 있으며, 이에 미생물 색소의 개발과 활용이 요구되고 있다. 본 연구에서는 해양세균 Microbulbifer sp. PPB12 균주가 생산하는 보라색 천연색소를 이용하여 다섬교직포에서 염색 효과와 생리활성을 평가하였다. 보라색 색소는 Microbulbifer sp. PPB12 균주를 Marine broth 2216을 이용하여 3일 동안 배양 후 에탄올을 이용하여 추출하였다. 20% 에탄올에 녹인 보라색 색소는 다섬교직포의 면, 아세테이트 특히 나일론에 우수한 염착력을 나타내었고, 최적의 염색조건은 염색온도 $80-90^{\circ}C$, 염색시간 1시간 이상, pH 4-6, 욕비 1:25로 나타났다. 매염처리는 $Na_2SO_4$를 사용하여 염색 10분 후 후매염 처리 하는 것이 색상 발현에 더 적합하였으나 매염제를 처리하지 않은 경우와 큰 차이를 보이지 않았다. 또한 보라색 색소는 B. subtilis에서 항균성을 나타내었다. 이러한 결과, 본 해양 세균 색소는 항균성이 부가된 천연 섬유 염색제로 이용 가능성이 확인되었다.
An agar-degrading enzyme-producing strain was isolated from seawater. The isolate was identified as Microbulbifer sp. SD-1 by 16S rRNA sequencing analysis. The optimal pH and temperature for growth were 6.0 and $30^{\circ}C$, respectively, and growth was possible at pH 9.0 and $60^{\circ}C$. The isolate required 5% NaCl for optimal growth and showed 45% growth activity without NaCl. Agar concentrations of 0-0.4% in the medium did not affect growth. Thin-layer chromatography analysis revealed that this strain could degrade agar into a monosaccharide and oligosaccharide, which may have industrial applications.
본 연구에서는 기장 해안의 해수에서 분리한 해양 미생물로부터 해조류의 난소화성 복합다당류를 분해하는 균주를 분리하고 동정하여 Microbulbifer sp. SC092로 명명하였다. Microbulbifer sp. SC092 미생물에 의하여 생성된 조효소의 기질 특이성 분석으로 agar 및 alginic acid를 분해하는 효소활성이 각각 146.2%로 agarase와 alginase 효소활성이 높은 것으로 나타났다. 감태 효소분해산물의 항산화력은 DPPH radical 소거능과 SOD 활성으로 측정하였으며, DPPH radical 소거능과 SOD 활성은 각각 84.1, 89.6%로 나타났다. 감태 효소분해산물의 혈당 강하능은 ${\alpha}$-glucosidase 활성억제 효과를 측정하였으며 ${\alpha}$-glucosidase 활성은 58.7%로 나타났다. 감태 효소분해산물의 항염증 소재로써 이용 가능성은 인체의 위의 pH와 비슷한 조건에서 아질산염소거능 측정으로 확인하였는데, 0.5 mg/ml 농도에서 56.3%를 나타내어 positive control로 사용한 Vit C 보다 높은 활성을 보였다. 알코올분해능은 ADH와 ALDH 활성을 측정한 결과는 각각 123.3, 215.2%로 나타나 감태 효소분해산물의 우수한 숙취해소 효능을 보였다. 감태 효소분해산물의 미백 및 주름개선기능은 tyrosinase 및 elastase 저해효과로 분석하였다. 감태 효소분해산물의 농도가 증가함에 따라 미백 및 주름개선기능은 농도 의존적으로 증가하는 경향을 나타내었으며, 분해산물의 농도 2.5 mg/ml 농도에서 각각 42.2%와 73.1%로 높은 저해 효능을 나타내었다. 이러한 결과는 효소 추출법이 새로운 기능성 소재를 발굴하는데 효과적인 추출법인 것으로 기대된다.
오늘날 해양생물로부터 얻어진 미생물유래의 이차대사물질은 구조적, 생물학적으로 새로운 화합물의 주요한 자원이다. 그 중에서 해면동물과 미생물 관계는 생리활성 물질을 탐색하는데 가장 흥미있는 자원 중 하나로서 주목받아 왔다. 본 연구에서는 서해안 조간대에서 채집된 주황해변해면(Hymeniacidon sinapium)으로부터 분리된 세균 균주(Microbulbifer sp., 127CP-12)를 검토하였다. 배양된 세균은 자주색 색소를 생산하였으며, 색소생산의 최적 배양조건을 조사하였다. 최대 색소생산을 위한 미생물 배양조건은 $25^{\circ}C$, pH 6.0, 3% NaCl임을 알 수 있었다. 추출용매는 에탄올과 메탄올에 비해 아세톤이 더 적절한 것으로 나타났다. 추출된 색소의 주요성분은 HLPC, NMR, MS, 그리고 UV 스펙트럼의 구조 분석을 통해 유용한 생리활성물질인 비올라세인으로 밝혀졌다. 본 연구는 해양미생물이 관여한 대사물질로부터 생리활성물질을 조사하는 연구기법을 서술함과 동시에 오늘날 변화하는 해양환경에서 해면동물과 미생물 관계의 생태학적 의의를 제시하고 있다.
An agar-degrading bacterium was isolated from red seaweed (Gelidium amansii) on a natural seawater agar plate, and identified as Saccharophagus sp. AG21. The ${\beta}$-agarase gene from Saccharophagus sp. AG21 (agy1) was screened by long and accurate (LA)-PCR. The predicted sequence has a 1,908 bp open reading frame encoding 636 amino acids (aa), and includes a glycosyl hydrolase family 16 (GH16) ${\beta}$-agarase module and two carbohydrate binding modules of family 6 (CBM6). The deduced aa sequence showed 93.7% and 84.9% similarity to ${\beta}$-agarase of Saccharophagus degradans and Microbulbifer agarilyticus, respectively. The mature agy1 was cloned and overexpressed as a His-tagged recombinant ${\beta}$-agarase (rAgy1) in Escherichia coli, and had a predicted molecular mass of 69 kDa and an isoelectric point of 4.5. rAgy1 showed optimum activity at $55^{\circ}C$ and pH 7.6, and had a specific activity of 85 U/mg. The rAgy1 activity was enhanced by $FeSO_4$ (40%), KCl (34%), and NaCl (34%), compared with the control. The newly identified rAgy1 is a ${\beta}$-agarase, which acts to degrade agarose to neoagarotetraose (NA4) and neoagarohexaose (NA6) and may be useful for applications in the cosmetics, food, bioethanol, and reagent industries.
Agarase genes of non-marine agarolytic bacterium Cellvibrio sp. were cloned into Escherichia coli and one of the genes obtained using HindIII was sequenced. From nucleotide and putative amino acid sequences (713 aa, molecular mass; 78,771 Da) of the gene, designated as agarase AgaA, the gene was found to have closest homology to the Saccharophagus degradans (formerly, Microbulbifer degradans) 2-40 aga86 gene, belonging to glycoside hydrolase family 86 (GH86). The putative protein appears to be a non-secreted protein because of the absence of a signal sequence. The recombinant protein was purified with anion exchange and gel filtration columns after ammonium sulfate precipitation and the molecular mass (79 kDa) determined by SDS-PAGE and subsequent enzymography agreed with the estimated value, suggesting that the enzyme is monomeric. The optimal pH and temperature for enzymatic hydrolysis of agarose were 6.5 and $42.5^{\circ}C$, and the enzyme was stable under $40^{\circ}C$. LC-MS and NMR analyses revealed production of a neoagarobiose and a neoagarotetraose with a small amount of a neoagarohexaose during hydrolysis of agarose, indicating that the enzyme is a ${\beta}$-agarase.
SC092 strain, producing a polysaccharide degrading enzyme, was isolated from the seawater. This strain was identified as Microbulbifer sp. using the comparative sequence analysis against known 16S rRNA sequence. A polysaccharide degrading enzyme from this strain was used to acquire the enzymatic extracts of Sargassum fulvellum. DPPH radical scavenging and SOD activity of the enzyme extracts of S. fulvellum were about 61.9% and 82.9% at 2 mg/mL, respectively. Nitrite scavenging activities was 52.5% at 2 mg/mL on pH 1.2. In addition, ${\alpha}$-glucosidase inhibitory activity was also increased in a dose-dependent manner and was about 52.7% at 2 mg/mL. To determine the influence of enzyme extracts of S. fulvellum on alcohol metabolism, the generating activity of reduced-nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) by alcohol dehydrogenase (ADH) and aldehyde dehydrogenase (ALDH) were measured. ADH and ALDH activities were 118.0% and 177% at 2 mg/mL, respectively. ${\alpha}$-glucosidase inhibitory activity of enzyme extracts of S. fulvellum was remarkably increased in a dose-dependent manner and was about 52.7% at 2 mg/mL. These results indicate alcoholizing and ${\alpha}$-glucosidase inhibitory activities can be enhanced by the enzymatic extracts of S. fulvellum.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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