• Genomics & Informatics
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• 제20권3호
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• pp.33.1-33.17
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• 2022

Nervous necrosis virus (NNV) is a deadly infectious disease that affects several fish species. It has been found that the NNV utilizes grouper heat shock cognate protein 70 (GHSC70) to enter the host cell. Thus, blocking the virus entry by targeting the responsible protein can protect the fishes from disease. The main objective of the study was to evaluate the inhibitory potentiality of 70 compounds of Azadirachta indica (Neem plant) which has been reported to show potential antiviral activity against various pathogens, but activity against the NNV has not yet been reported. The binding affinity of 70 compounds was calculated against the GHSC70 with the docking and molecular dynamics (MD) simulation approaches. Both the docking and MD methods predict 4 (PubChem CID: 14492795, 10134, 5280863, and 11119228) inhibitory compounds that bind strongly with the GHSC70 protein with a binding affinity of -9.7, -9.5, -9.1, and -9.0 kcal/mol, respectively. Also, the ADMET (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity) properties of the compounds confirmed the drug-likeness properties. As a result of the investigation, it may be inferred that Neem plant compounds may act as significant inhibitors of viral entry into the host cell. More in-vitro testing is needed to establish their effectiveness.

• 한국어병학회지
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• 제34권2호
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• pp.123-131
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• 2021

IHNV는 국내 연어 양식업에서 경제적 손실을 발생시켜왔으며, 연어과 어류에 높은 폐사율을 초래한다. 본 연구에서는 강원도의 연어과 어류로부터 분리된 IHNV 분리주의 계통발생적 분류와 병원성을 조사하였다. 계통발생학적 분석은 IHNV의 303bp를 해당하는 mid-G 영역을 염기 분석하여 수행되었다. 바이러스주 모두 J 유전자형으로 RTDH1709, RTJS1709, MSOK1711, RTYK1711, RTCC1801 그리고 RTHC1802는 J-Nagano형이며, RTYK1801는 J-Shizuoka형에 속하는 것으로 확인되었다. 이러한 결과는 이전 연구와 일치하게 강원도에서는 두 가지 유전형이 분포한다는 것을 시사한다. 또한, 6개 분리주를 무지개송어 치어의 복강에 주사하여 병원성을 시험한 결과, J-Nagano형인 RTCC1801와 RTJS1709 바이러스주로 주사된 그룹은 100%의 폐사율을 나타냈다. 그 뒤로, J-Nagano형인 RTHC1802, RTDH1709 그리고 MSOK1711 분리주가 주사된 그룹들은 50%, 30% 그리고 20%의 폐사율을 나타났다. 그러나 J-Shizuoka형인 RTYK1711 분리주와 대조군에서는 폐사가 발생하지 않았다. 이러한 결과는 J-Shizuoka형이 J-Nagano형 바이러스 분리주보다 높다고 보고한 기존의 연구결과와 상반되며 J 유전자형 내에서 유전자형과 병원성간의 상관관계가 없는 것을 시사한다. 하지만 본 연구에서는 1개의 J-Shizuoka형 분리주만이 분석되었기 때문에 J 유전자형 내에서 유전자형과 병원성간의 상관관계를 확실하게 알기 위해서는 J 유전자형의 병원성에 대한 추가 조사가 필요할 것으로 보인다.

• 한국어병학회지
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• 제27권1호
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• pp.35-45
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• 2014

본 연구에서는 1% 마늘 추출액을 사료에 첨가하여 항균력 시험, 혈액학적 분석 및 어류질병 원인체들 (Viral Hemorrhagic Septicemia Virus, Vibrio anguillarum, Streptococcus iniae, Edwardsiella tarda)에 대한 비특이적 면역반응을 조사하였다. 사료에 1% 마늘 추출액을 첨가하여 4주간 넙치에 섭이시킨 후 V. anguillarum, S. iniae, E. tarda을 인위 감염시켜 2주간 누적 폐사율을 관찰하였다. 공격 실험 결과 E. tarda를 제외한 모든 시험구에서 대조구에 비해 낮은 누적 폐사율이 관찰되었다. Hematocrit, glucose, total protein, lysozyme activity 및 macrophage activity에서는 대조구에 비해 유의적으로 높은 수치를 관찰하였다. 3가지 어병세균 (V. anguillarum, S. iniae, E. tarda)을 이용하여 마늘 항균력 및 MIC를 측정한 결과, 이전에 보고된 마늘 분말보다 1% 마늘 추출물에서 더 효과적인 결과를 관찰하였다. 이러한 결과는 마늘 추출물이 넙치의 V. anguillarum, S. iniae, E. tarda에 대한 비특이적 면역반응 및 질병저항력을 증가시키는 것으로 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제15권2호
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• pp.248-252
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• 2005

대하 새우양식장의 대하에 흰반점 증상을 나타내는 원인바이러스는 막대형의 이중막을 가지고 있었으며, 전자 현미경 관찰 결과 평균 크기가 $250\~300\times70\;nm$였고, 조직학적 병변은 위상피 등에서 핵이 비대해지는 것이 관찰되었다. 공격실험에서는 건강체의 새우에 많은 누적 폐사율을 보였다. 원인 바이러스 단백질은 21개의 밴드를 보였으며, 핵산 분석 결과 total 분자량은 114 kb로 나타났다.

• 한국어병학회지
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• 제25권2호
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• pp.117-121
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• 2012

The pathogenicity of viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) from olive flounder Paralichthys olivaceus was investigated with masu salmon Oncorhynchus masou fry. The cumulative mortality of fish challenged with FYeosu05 isolate at $10^{6.5}$ $TCID_{50}$/fish was 60%. No mortality was observed in fish challenged with the isolates at $10^{5.5}$ $TCID_{50}$/fish and in mock-challenged fish. The affected fish showed darkening of the body, expanded abdomen, pale gills and enlarged spleen. VHSV from $10^{6.3}$ to $10^{7.8}$ $TCID_{50}$/g-tissue was re-isolated from the dead fish. These results suggest that the VHSV from olive flounder is pathogenic to masu salmon fry, although with low virulence.

• IMMUNE NETWORK
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• 제23권4호
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• pp.30.1-30.18
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• 2023

About 0.8 million people die because of hepatitis B virus (HBV) infection each year. In around 5% of infected adults, the immune system is ineffective in countering HBV infection, leading to chronic hepatitis B (CHB). CHB is associated with hepatocellular carcinoma, which can lead to patient death. Unfortunately, although current treatments against CHB allow control of HBV infection, they are unable to achieve complete eradication of the virus. Cytokines of the IFN family represent part of the innate immune system and are key players in virus elimination. IFN secretion induces the expression of interferon stimulated genes, producing proteins that have antiviral properties and that are essential to cell-autonomous immunity. IFN-α is commonly used as a therapeutic approach for CHB. In addition, IFN-γ has been identified as the main IFN family member responsible for HBV eradication during acute infection. In this review, we summarize the key evidence gained from cellular or animal models of HBV replication or infection concerning the potential anti-HBV roles of IFN-γ with a particular focus on some IFN-γ-inducible genes.

• 한국어병학회지
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• 제35권2호
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• pp.215-223
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• 2022

Disease including parasite, bacteria and virus cause serious mortality to salmonid fish in the aquaculture. In this study, we investigated the current disease status of the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and coho salmon (Oncorhynchus kisutch) in Yanayang, Pyeongchang, Jeongseon and Yeongwol of Gangwon province in 2021 and performed molecular characterization of those pathogen. For parasites, Ichthyophthirius multifiliis was observed at 2 farms. For bacteria, we identified Aeromonas sobria from kidney of rainbow trout using phylogenetic analysis of gyrB gene. A. salmonicida were isolated from necrosis site of gill cover and fin in coho salmon and necrotic lesion of fin in rainbow trout. Phylogenetic analysis using vap gene indicated that A. salmonicida isolated in this study were clustered with previously reported A. salmonicida subsp. salmonicida isolates. For virus, JRt-Nagano type of infectious haematopoietic necrosis virus was detected in rainbow trout, but infectious pancreatic necrosis virus and Oncorhynchus masou virus were not detected. These results provide useful information for the prevention of disease spread and transmission when cultivating new species such as Atlantic salmon in Korea.

• 한국어병학회지
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• 제23권1호
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• pp.27-35
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• 2010

2006~2008년 (3년간) 남해안 거제, 통영지역의 해상가두리양식장에서 사육된 조피볼락 579 마리에 대한 병원체 감염률을 조사한 결과, 병원체 검출률은 46.0~92.0%로 연중 보균하고 있는 것으로 나타났으며, 수온상승기인 5월에 평균 58.1%로 낮았고, 수온하강기인 10월에 평균 81.5%로 높았다. 병원체 감염은 수온상승기인 5월과 고수온기인 8월에 기생충 단독감염이 대부분이었으나, 수온하강기인 10~11월에는 기생충 단독감염 뿐만 아니라 세균 단독, 세균과 기생충 혼합, 바이러스 단독 감염되고 있는 것으로 조사되었다. 조피볼락의 질병은 기생충성 질병 중에 Microcotyle sp.와 Caligus sp., 세균성 질병에 Vibrio sp.와 Streptococcus sp., 바이러스성 질병에 RSIV와 VNNV가 우점종으로 나타났다. 2006년도에는 바이러스가 검출되지 않았으나, 2007년도에 VNNV, VHSV 및 RSIV가 검출된 것은 2006년에 비해 여름철 수온이 $1.5\sim2.0^{\circ}C$ 높았기 때문으로 추정 되었다. 크기별 병원체 검출률은 11~15 cm에서 50.0~87.1%로 가장 높았으며, 30 cm 이상에서 감소되는 경향이었다. 기생충은 50.0~79.6%로 총 병원체 검출률과 비슷한 경향이었으며, 세균은 1.6~23.8%로 10 cm 이하와 26 cm 이상에서 높았으며, 바이러스는 0~1.5%로 25 cm 이하의 그룹에서 높은 것으로 나타났다.

• 한국어병학회지
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• 제22권1호
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• pp.75-83
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• 2009

우리나라 연안에서 채포되는 자연산 어류를 대상으로 주요 어류 병원체의 검출 유무를 조사하기 위해 2008년 2월부터 10월까지 질병 조사를 실시하였다. 포항, 거제, 여수 및 제주 지역의 정치망, 양망에 채포된 어류 및 공동어시장에서 판매되는 어류를 구매하여 총 401마리를 실험에 사용하였다. 전체 조사 시료 중 152마리에서 17종의 병원체가 분리되었다. 기생충, 세균 및 바이러스의 검출률은 각각 21.4%, 17.0% 및 2.7%로 나타났다. 분리된 기생충류는 Scutica, Trichodina, Cryptocaryon, Dactylogyrus, Microcotyle, Benedenia, Bivagina, Heteraxin, Caligus, Epistylis 및 nematode 이며, 세균류로는 Vibrio, Streptococcus, Photobacterium, Psuedomonas가 우점적으로 분리되었고 바이러스는 조사대상인 6종중에서 red sea bream iridovirus (RSIV) 및 lymphocystis disease virus(LDV)가 검출되었다. 과(科)별로 검사시료가 30개체 이상인 어류 중에서 양볼락과, 쥐치과, 가자미과, 도미과 및 전갱이과의 검출률이 59.2%, 48.4%, 34.2%, 30.6% 및 18.2%로 나타났다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권7호
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• pp.1021-1028
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• 2012

In this study, a reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay was developed for the rapid, sensitive, and inexpensive detection of nervous necrosis virus (NNV) in olive flounder, Paralichthys olivaceus, in Korea. A set of six specific primers was designed to target the RNA 2 gene encoding the coat protein of Korean NNV strains. The RT-LAMP reaction successfully detected NNV after 30 min at $65^{\circ}C$. When the sensitivities among RT-LAMP, RT-PCR, and nested RTPCR were compared, the RT-LAMP was shown to be able to detect the RNA template at $2.58{\times}10^{-2}\;TCID_{50}/ml$, whereas the RT-PCR and nested RT-PCR were only able to detect the RNA template at $2.58{\times}10^2\;TCID_{50}/ml$ and $2.58TCID_{50}/ml$, respectively. Thus, the sensitivity of the RT-LAMP assay was higher than those of the RT-PCR assays. In the specificity test of the RT-LAMP, 2 genotypes of NNVs (SJNNV and RGNNV) were positive; however, no other fish viruses were positive with the primers, indicating that the RT-LAMP assay is only specific to NNV. A total of 102 olive flounder were collected from hatcheries between 2009 and 2011. The occurrence of NNV in olive flounder was determined to be 53.9% (55/102) by the RT-LAMP. On the other hand, the prevalence based on the nested RT-PCR and RT-PCR results was 33.8% (34/102) and 20.6% (21/102), respectively. This result indicates that the RT-LAMP assay developed in this study is suitable for early field diagnosis of NNV with high sensitivity.