The aim of the present research program was to develop a strain of actinomycetes producing antifungal substance. Soil samples were collected from various sites in Korea and a number of actinomycetes were isolated from the soil samples by applying selective agar for actinomycetes. Among over 440 isolates, a strain (NA-4803) producing antifungal substance against Trichophyton spp. Nannizzia otae and Pyricularia oryzae was selected. The strain NA-4803 was identified as strain similar to Streptoverticillium blastmyceticum with respect to morphological and physiological characteristics, lecithinase and lipolytic activity, degradation of organic compounds, resistance to antibiotics and utilization of carbon and nitrogen sources. But it showed some differences such as positive reaction of nitrate reduction, negative reaction of L-tyrosine degradation, resistance to cephaloridine, and utilization of I -rhamnose and inulin. The strain NA-4803 was named as Streptoverticillium sp. NA-4803.
Two kinds of new lectins, CATL-I and CATL-II, were partially purified from the intestine of Chlorostoma argyrostoma turbunatum by physical saline extraction, salt fractionation, ion exchange chromatography and gel filtration. CATL-I and CATL-II were purified 39.4 and 15.8 fold with a yield of 8.8 and 7.4%, respectively. On polyacrylamide gel electrophoresis, CATL-I demonstrated one major and one minor bands. This lectin agglutinated human and other animal erythrocytes nonspecifically and also agglutinated murine splenic lymphocytes. Carbohydrate specificity of the lectins was determined by inhibition of the agglutinability by methyl-${\alpha}-_D$-galactopyranoside and $_L-rhamnose$ at a final concentration of 6 mM. The lectins contained relatively high amounts of acidic amino acids, but the contents of sulfur containing amino acids were very low or was not estimated. Immunochemical studies were carried out to identify some properties of marine animal lectins.
국내 감자 연작 재배지에서 수집하여 분리동정한 더뎅이병원균인 Streptomyces scabies의 배양적, 형태적, 생리적 특성을 조사한 결과는 다음과 같다. 이병감자에서 분리된 균들은 병원성 균주와 비병원성 균주들로 구분되었고, 이들 간에는 뚜렷한 차이를 보였는데, 전형적인 병징을 나타내는 병원성균주는 비병원성균주와는 달리, 나선형의 포자사슬, 회색 포자, 멜라닌 색소를 생성하고 D-glucose, L-arabinose, D-fructose, D0mannitol, raffinose, rhamnose, sucrose, i-inositol, D-xylose 등의 탄소원을 이용하였으며, 또한 7% NaCl 및 streptomycin sulfate, crystal violet, olean domycin(10$\mu\textrm{g}$/ml, 100$\mu\textrm{g}$/ml)등의 항생물질에 감수성을 나타내었다.
YjiC, a glycosyltransferase from Bacillus licheniformis, is a well-known versatile enzyme for glycosylation of diverse substrates. Although a number of O-glycosylated products have been produced using YjiC, no report has been updated for nucleophilic N-, S-, and C- glycosylation. Here, we report the additional functional capacity of YjiC for nucleophilic N- and S- glycosylation using a broad substrate spectrum including UDP-α-D-glucose, UDP-N-acetyl glucosamine, UDP-N-acetylgalactosamine, UDP-α-D-glucuronic acid, TDP-α-L-rhamnose, TDP-α-D-viosamine, and GDP-α-L-fucose as donor and various amine and thiol groups containing natural products as acceptor substrates. The results revealed YjiC as a promiscuous enzyme for conjugating diverse sugars at amine and thiol functional groups of small molecules applicable for generating glycofunctionalized chemical diversity libraries. The glycosylated products were analyzed using HPLC and LC/MS and compared with previous reports.
Jha, Amit Kumar;Pokhrel, Anaya Raj;Chaudhary, Amit Kumar;Park, Seong-Whan;Cho, Wan Je;Sohng, Jae Kyung
Molecules and Cells
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제37권10호
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pp.727-733
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2014
Spinosyns A and D are potent ingredient for insect control with exceptional safety to non-target organisms. It consists of a 21-carbon tetracyclic lactone with forosamine and tri-Omethylated rhamnose which are derived from S-adenosyl-methionine. Although previous studies have revealed the involvement of metK1 (S-adenosylmethionine synthetase), rmbA (glucose-1-phosphate thymidylyltransferase), and rmbB (TDP-D-glucose-4, 6-dehydratase) in the biosynthesis of spinosad, expression of these genes into rational screened Saccharopolyspora spinosa (S. spinosa MUV) has not been elucidated till date. In the present study, S. spinosa MUV was developed to utilize for metabolic engineering. The yield of spinosyns A and D in S. spinosa MUV was $244mgL^{-1}$ and $129mgL^{-1}$, which was 4.88-fold and 4.77-fold higher than that in the wild-type ($50mgL^{-1}$ and $27mgL^{-1}$), respectively. To achieve the better production; positive regulator metK1-sp, rmbA and rmbB genes from Streptomyces peucetius, were expressed and co-expressed in S. spinosa MUV under the control of strong $ermE^*$ promoter, using an integration vector pSET152 and expression vector pIBR25, respectively. Here-with, the genetically engineered strain of S. spinosa MUV, produce spinosyns A and D up to $372/217mgL^{-1}$ that is 7.44/8.03-fold greater than that of wild type. This result demonstrates the use of metabolic engineering on rationally developed high producing natural variants for the production.
Lactobacillus plantarum is a lactic acid bacterium that promotes animal intestinal health as a probiotic and is found in a wide variety of habitats. Here, we investigated the genomic features of different clusters of L. plantarum strains via pan-genomic analysis. We compared the genomes of 108 L. plantarum strains that were available from the NCBI GenBank database. These genomes were 2.9-3.7 Mbp in size and 44-45% in G+C content. A total of 8,847 orthologs were collected, and 1,709 genes were identified to be shared as core genes by all the strains analyzed. On the basis of SNPs from the core genes, 108 strains were clustered into five major groups (G1-G5) that are different from previous reports and are not clearly associated with habitats. Analysis of group-specific enriched or depleted genes revealed that G1 and G2 were rich in genes for carbohydrate utilization (${\text\tiny{L}}-arabinose$, ${\text\tiny{L}}-rhamnose$, and fructooligosaccharides) and that G3, G4, and G5 possessed more genes for the restriction-modification system and MazEF toxin-antitoxin. These results indicate that there are critical differences in gene content and survival strategies among genetically clustered L. plantarum strains, regardless of habitats.
본 논문은 당뇨병 치료제로 알려진 Miglitol은 ${\alpha}$-glucosidase 저해제로, 산업적으로 포도당과 에탄올아민으로부터 세 단계의 화학 및 생물전환 과정을 거쳐 합성되며. acetic acid bacteria에 속하는 Gluconobactor oxydans (G. oxydans)는 불완전 산화를 통해 1-deoxy-1-(2-hydroxyethylamino)-D-glucitol (P1)을 Miglitol의 전구체인 6-(2-hydroxyetyl) amino-6-deoxy-${\alpha}$-L-sorbofuranose (P2)로 생물 전환시키는 균주이다. 본 연구에서는 토양으로부터 스크리닝하여 선발된 고효율 생물전환 박테리아인 CK-2165의 균주를 동정하고 최적의 발효조건을 탐색하고자 하였다. 16S rDNA 서열과 계통수 분석결과 CK-2165는 G. oxydans에 속하는 미생물임을 결정하였으며, API 20E kits를 사용하여 선발된 균주의 탄소원 이용성을 실험한 결과 glucose, mannose, inositol, sorbitol, rhamnose, sucrose, melibiose, amygdalin, arabinose와 같은 탄소원에 대한 이용성을 가진 균주임을 확인하였다. 또한 산업적 생산을 위하여 배양 조건을 최적화하였고 균체를 이용하여 생물전환 반응에 중요한 요소들을 조사하였다. 생물전환 반응을 위해 사용되는 균체는 균 성장 단계 중 후기 정지기 (late-stationary phase)에 수확한 균체가 가장 높은 활성을 나타내었고 생물전환 반응에는 $MgSO_4$가 필수적임을 확인하였다.
섬유소 분해균 Cellulomonas sp. CS 1-1에 대하여 종 수준으로 분류학적 위치를 규명하기 위하여 7개 type strain 균주와 함께 생리적 및 생화학적 특성을 조사하고 DNA 상등성 및 지방산의 조성 등을 분석하여 비교한 결과, CS 1-1의 콜로니 형태는 circular, entire, smooth, convex하며, 담황색을 띤 $0.3{\sim}0.5{\times}0.8{\sim}1.2{\mu}m$ 크기의 간균이었다. 생리학적 특징으로서 비운동성의 통성혐기성 중온균으로서 Gram양성, catalase양성, oxidase음성, 탄수화물 발효성 등의 표현형은 Cellulomonas 속의 타종과 동일하였으며, 특히 D-ribose, raffinose, rhamnose, xylitol, acetate, L-lactate, propionate, aspartate, proline 등 조사한 모든 탄소원의 이용성이 없었으며, 반면에 sacchrose, arabinose 및 amylose의 이용성은 양성으로 판정되었다. G+C 함량 74.76 mol %, 주요 지방산과 quinone 성분은 전형적인 Cellulomonas의 12-methyltetradecanoic acid (anteiso-$C_{15:1}$)과 MK-$9(H_4)$이었으며, DNA의 상동성 비율은 C. uda ATCC 491과 70%, C. fimi ATCC 15724와 54~59 %, C. gelida 및 C. bibula와도 46~48%의 상동성을 나타내었다. 이상의 결과는 CS1-1이 현재 Cellulomonas 속에 인정된 7개의 type species 중 C. uda ATCC 491 균주와 가장 높은 근연성을 나타냄으로서 C. uda에 속하는 novel species로 분류될 수 있다.
홍삼으로부터 홍삼알콜 추출물을 제조하고 부산물로 생성된 홍삼추출잔사로부터 한외 여과를 이용하여 홍삼산성다당체(RGAP, red ginseng acidic polysaccharide)를 대량으로 분리할 수 있는 방법을 개발하였다. 본 방법으로 홍삼추출잔사로부터 분리된 RGAP의 수율은 20.9%이었고, RGAP로부터 지표성분인 활성성분(GFP)의 분리수율은 39.4%이었다. 분리된 RGAP는 macrophage에 의한 NO(nitric oxide)를 생성하여 암세포를 사멸시키는 것으로 나타났다. RGAP를 BALB/c 마우스에 복강투여한 후 분리된 복강 macrophage를 P815 암세포(mastocytoma)와 함께 배양하였을 때 배지내의 NO 농도는 대조군에서 4.3 $\mu\textrm{m}$이었으나, RGAP 100, 300 mg/kg 투여군에서는 각각 9.8 및 25.3$\mu\textrm{m}$로 증가하는 경향을 나타내었다. 아울러 암세포인 P8l5세포의 사멸율도 정상대조군일 경우 7.3%이었으나 RGAP 100, 300 mg/kg 투여군에서는 각각 22.7 및 31.8%로 증가하는 경향을 나타내었다. RGAP을 2M의 TFA로 10$0^{\circ}C$에서 1시간 가수분해한 후 당 표준품과 TLC로 비교한 결과 당 표준품과 Rf치 및 발색 색깔이 일치하는 4개의 spot, 즉 rhamnose(Rf 0.78, 노란색 ), glucose(Rf 0.61, 녹색), galactose(Rf 0.56, 녹색), glucuronic acid(Rf 0.36, 황갈색)를 관찰할 수 있었다. 가수분해된 RGAP 분해산물을 Gl(glucose)부터 G7(maltoheptaose)까지의 당류와 함께 TLC를 행한 결과 진한 색상을 나타내는 spot은 Rf 0.56~0.61로 G2(maltose, Rf 0.46) 이상의 단당류(monosaccharide)인 것으로 나타났다. RGAP의 일부 이화학적 특성을 조사한 결과 pH는 4.74, 건조감량은 4.72%, 조단백질 함량은 3.30%, 회분은 4.74%이었고 중금속인 Pb는 2.30 ppm이었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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