• 제목/요약/키워드: L-Arabinose

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지렁이(Eisenia andrei)의 장으로부터 분리한 국내 미기록 야생효모들의 균학적 특성과 탄소원 활성 (Microbiological Characteristics and Carbon source activity of Unrecorded Wild Yeast Strains from gut of the earthworm(Eisenia andrei) in Korea)

  • 한주현;이상은;김명겸
    • 한국균학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.161-167
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    • 2020
  • 국내에 자생하는 지렁이로(붉은줄지렁이)의 장에서 야생효모를 분리, 동정하고자 하였다. 지렁이는 고양시 난지 물 재생 센터에서 분양 받았으며, 지렁이 5마리에서 19개의 야생효모를 분리하였다. 효모의 D1/D2 영역으로 동정하여 국내에 보고되지 않은 효모 3균주를 선별하였다. 국내 미기록종 효모인 Yarrowia deformans YP242 (=KACC48778), Sporidiobolus pararoseus YP66(=KCTC27963), Naganishia liquefaciens YI9 (=KACC48948) 균주는 위상차현미경, API 20C AUX kit를 통해 균학적 특성을 조사하였다. YP242, YI9, YP66 균주의 세포 모양은 타원형이며, 집락은 볼록하고, 부드러운 재질을 가지는 것으로 관찰되었다. 탄소원 활성 측정 결과, YP242는 glycerol, L-arabinose, N-acetyl-D-glucosamine을, YP66는 N-acetyl-D-glucosamine을, liquefaciens YI9는 2-keto-D-gluconate을 탄소원으로 사용할 수 있음을 확인하였다.

반날개과 곤충 장으로부터 야생 효모의 분리 및 국내 미기록 효모들의 균학적 특성 (Separation of Wild Yeast from Intestine of Othius punctulatus and Microbiological Characteristics of Unrecorded Wild Yeast Strains in Korea)

  • 이상은;한주현;김명겸
    • 한국균학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.229-235
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    • 2020
  • 곤충 장으로부터 분리되는 야생 효모들의 종 분포특성을 알아보고자 충북대학교 주변 토양에 서서식하는 반날개과 곤충장 5점의 시료들로부터 16균주의 야생 효모들을 분리, 동정하였다. 야생 효모 16균주는Aureobasidium 속 3균주, Cystofilobasidium 속 4균주, Mrakia 속 1균주, Naganishia 속 3균주, Saitozyma 속 2균주, Sampaiozyma 속 2균주와 Scheffersomyces 속 1균주를 포함한다. 이들 중 Cystofilobasidium capitatum YP53, C. capitatum YP71, C. macerans YS620, C. macerans YS622, Mrakia aquatica YP158 및 Scheffersomyces stipitis YI56균주들을 국내 미기록 효모들로 최종 선별하였다. 선별한 국내 미기록 효모들의 균학적 특성과 탄소원의 자화성 등을 조사하였다. 이들은 모두 타원형의 세포 형태를 가지고 있으며, glycerol, L-arabinose, xylitol, inositol을 탄소원으로 이용할 수없었다.

Arabinoxylo- and Arabino-Oligosaccharides-Specific α-ʟ-Arabinofuranosidase GH51 Isozymes from the Amylolytic Yeast Saccharomycopsis fibuligera

  • Park, Tae Hyeon;Choi, Chang-Yun;Kim, Hyeon Jin;Song, Jeong-Rok;Park, Damee;Kang, Hyun Ah;Kim, Tae-Jip
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권2호
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    • pp.272-279
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    • 2021
  • Two genes encoding probable α-ʟ-arabinofuranosidase (E.C. 3.2.1.55) isozymes (ABFs) with 92.3% amino acid sequence identity, ABF51A and ABF51B, were found from chromosomes 3 and 5 of Saccharomycopsis fibuligera KJJ81, an amylolytic yeast isolated from Korean wheat-based nuruk, respectively. Each open reading frame consists of 1,551 nucleotides and encodes a protein of 517 amino acids with the molecular mass of approximately 59 kDa. These isozymes share approximately 49% amino acid sequence identity with eukaryotic ABFs from filamentous fungi. The corresponding genes were cloned, functionally expressed, and purified from Escherichia coli. SfABF51A and SfABF51B showed the highest activities on p-nitrophenyl arabinofuranoside at 40~45℃ and pH 7.0 in sodium phosphate buffer and at 50℃ and pH 6.0 in sodium acetate buffer, respectively. These exoacting enzymes belonging to the glycoside hydrolase (GH) family 51 could hydrolyze arabinoxylo-oligosaccharides (AXOS) and arabino-oligosaccharides (AOS) to produce only ʟ-arabinose, whereas they could hardly degrade any polymeric substrates including arabinans and arabinoxylans. The detailed product analyses revealed that both SfABF51 isozymes can catalyze the versatile hydrolysis of α-(1,2)- and α-(1,3)-ʟ-arabinofuranosidic linkages of AXOS, and α-(1,2)-, α-(1,3)-, and α-(1,5)-linkages of linear and branched AOS. On the contrary, they have much lower activity against the α-(1,2)- and α-(1,3)-double-substituted substrates than the single-substituted ones. These hydrolases could potentially play important roles in the degradation and utilization of hemicellulosic biomass by S. fibuligera.

대추의 성숙중에 일어나는 연화현상에 관한 연구

  • 손미애;김광수
    • 한국식품저장유통학회:학술대회논문집
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    • 한국식품저장유통학회 1994년도 정기총회 및 제4차 학술발표회
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    • pp.23-24
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    • 1994
  • 본 연구는 성숙과의 저장중에 세포벽분해효소가 세포벽을 분해해서 물성의 변화를 유발함으로 일어나는 과실의 연과가 품질과 저장성의 저하 뿐만 아니라 영양적, 경제적 손실을 초래한다는 점을 고려하여 대추의 성숙중에 일어나는 연화현상을 연구하고자 성숙에 따른 경도, 세포벽분해효소의 활성, 세포벽 다당류 pectin질, 비섬유성 중성당 및 조직의 변화를 조사하였다. 경도는 대추의 숙성에 따라 감소하였고, polygalacturonase와 $\beta$-galactosidase의 활성은 각각 변색기와 완숙기에 나타난 이후 급격히 증가하였다. 세포벽 다당류인 pectin질과 알칼리 지용성 hemicellulose는 완숙기가지 증가햐였으나 cellulose는 완숙기에 산가용성 hemicellulose와 cellulose를 제외한 세포벽 다당류의 함량은 다소 감소하였다. 대추의 세포벽 비섬유성 중성당으로 rhamnose, arabinose, xylose, mannose, galactose, glucose가 동정되었고, 성숙동안에 pectin질에서는 arabinose, mannose, galactose와 총 비섬유성 중성당의 함량이 감소하였고, 산가용성 hemicellulose에서는 xylose와 mannose가 뚜렸하게 증가하였으나 중성당은 변화없었으며, 알칼리 가용성 hemicellulose에서는 성숙에 따른 변화가 거의 없었다. pectin질의 경우 수용성 pectin, EDTA 용해성 pectin 및 총 pectin은 성숙중에 증가하는 경향이있으나 불용성 pectin은 감소하는 경향이였으며 과숙기에는 불용성 psctin EDTA용해성 pectin 및 총 pectin의 함량은 모두 현저히 감소하였다. 대추의 성숙중 조직에서는 pectin질로 구성된 중충의 붕괴현상이 뚜렸하게 나타났다.발이 절실히 필요한 실정이다. 이러한 배경으로 본 강연에서는 효소적갈변 저해제의 개발과 그들의 식품가공에의 적용 현환 및 화장품, 의약품으로의 응용에 대해 설명하고자 한다.L주에 비해 S주는 수정후 용과가 더 심하다. 9) 화분관의 행동은 수정력과 완전히 일치된다. 즉 L-selfing, $L{\times}L$, S-selfing, $S{\times}S$등의 부적법 수분에서는 화분관은 화주의 미중에서 정지되지만 $L{\times}S$, $S{\times}L$,에서는 수분 약 40-50분 후이면 화분관은 자방까지 도달된다. 10) S주는 웅본으로 오인되어 있지만 인위적법수분을 하면 수정력이나 화분관의 행동은 L주에서와 동일하다. 11) S화분은 완전하지만 L화분은 약 70%가 내용공허한 Adortive pollen 이다. 12) L화분중 나머지 30%도 S화분에 비해서 염색도가 낮은것이 많고 S화분 같이 농염되는 것은 극히 소수이다. 13) 본장물은 분화가 고도로 진행된 전형적인 이형예작물이여 마치 Dimorphism 에서 Dioecious 에로 이행되는 수가 있다는 것을 표시하는 증거가 되는 것 같다. 다소 높은 산소농도 3%~5% 이산화탄소 농도 5~8%에서 저장하는 것이 효과적일 것으로 판단되었다.철쭉군목으로 대표되나 군단이 하의 군목들은 다소 차이를 보이는 것으로 나타났다. 중간상인이론의 수정이 필요하다고 본다.가\ulcorner 본 논문에서는 표면적 형태에도 불구하고 [-wh]의미의 겹의문사는 병렬적 관계의 합성어가 아니라 내부구조를 지니지 않은 단순한 단어(minimal $X^{0}$ elements)로 가정한다. 즉, [+wh] 의미의 겹의문사는 동일한 구성요 소를 지닌 병렬적 합성어([

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겨우살이 Lectin의 정제 및 생화학적 특성 (Purification and Biochemical Characterization of Lectin from Viscum album)

  • 장철수;오미정;노광수
    • KSBB Journal
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    • 제14권5호
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    • pp.578-584
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    • 1999
  • 겨우살이가 가지고 있는 lectin의 약리작용의 가능성에 대한 연구의 일환으로, lectin을 분리 . 정제하였으며, 분자량, subunit수, 탄수화물의 조성, 단백질의 아미노산 조성, 적혈구 응집력, 탄수화물 특이성, pH 및 열 안정성등의 생화학적 특성을 연구하였다. Lectin의 분리는 0.15 M NaCl에 의한 추출, $(NH_4)_2SO_4$ 침전, sepharose 4B affinity chromatography 및 sephadex G-150 gel filtration에 의해 11.64배 정제에 0.14%의 수율을 획득하였으며, HPLC와 전기영동을 이용하여 순도를 검정하였다. Gel filtration에 의해 분석된 lectin의 분자량은 124,000 Da이였고, SDS-PAGE에 의해 분자량이 30,000과 32,000 Da인 2개의 band로 나타나서 각각 2개의 subunit를 갖는 tetramer로 확인되었다. 겨우살이 lectin의 탄수화물은 glucose, fructose, arabinose 및 xylose를 함유하고 있다. 또한 phenlylalanine, lysine, tyrosine, aspartic acid가 비교적 풍부하였고 methionine, alanine, arginine은 비교적 적었다. Lectin은 적혈구에 종 특이성을 나타내는데 겨우살이의 혈구응집반응에서는 사람혈액형간의 차이는 없었으며, 쥐에서 가장 높았고 소에서 가장 낮았으므로 동물 종간에 대한 특이성은 뚜렸하였다. Lectin은 당 특이성을 가지는데, D-galactose, D-mannose, D-lactose 및 D-raffinose에 대해 특이성을 나타내었다. 겨우살이 lectin은 pH4~7에서 안정하였으며, 5$0^{\circ}C$까지는 10~30분 열처리해도 활성이 유지되는 열 안정성 단백질이었다.

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Effects of Xylanase Supplementation on Growth Performance, Nutrient Digestibility and Non-starch Polysaccharide Degradation in Different Sections of the Gastrointestinal Tract of Broilers Fed Wheat-based Diets

  • Zhang, L.;Xu, J.;Lei, L.;Jiang, Y.;Gao, F.;Zhou, G.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권6호
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    • pp.855-861
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    • 2014
  • This experiment was performed to investigate the effects of exogenous xylanase supplementation on performance, nutrient digestibility and the degradation of non-starch polysaccharides (NSP) in different sections of the gastrointestinal tract (GIT) of broilers fed wheat-based diets. A total of 120 7-day-old Arbor Acres broiler chicks were randomly allotted to two wheat-based experimental diets supplemented with 0 or 1.0 g/kg xylanase. Each treatment was composed of 6 replicates with 10 birds each. Diets were given to the birds from 7 to 21 days of age. The results showed that xylanase supplementation did not affect feed intake, but increased body weight gain of broiler at 21 day of age by 5.8% (p<0.05) and improved feed-to-gain ratio by 5.0% (p<0.05). Xylanase significantly increased (p<0.05) ileal digestibilities of crude protein (CP) by 3.5%, starch by 9.3%, soluble NSP by 43.9% and insoluble NSP by 42.2% relative to the control group, respectively. Also, compared with the control treatment, xylanase addition increased (p<0.05) total tract digestibilities of dry matter by 5.7%, CP by 4.1%, starch by 6.3%, soluble NSP by 50.8%, and had a tendency to increase (p = 0.093) insoluble NSP by 19.9%, respectively. The addition of xylanase increased the concentrations of arabinose and xylose in the digesta of gizzard, duodenum, jejunum, and ileum (p<0.05), and the order of their concentration was ileum>jejunum>duodenum>>gizzard> caecum. The supplementation of xylanse increased ileal isomaltriose concentration (p<0.05), but did not affect the concentrations of isomaltose, panose and 1-kestose in the digesta of all GIT sections. These results suggest that supplementation of xylanase to wheat-based diets cuts the arabinoxylan backbone into small fragments (mainly arabinose and xylose) in the ileum, jejunum and duodenum, and enhances digestibilites of nutrients by decreasing digesta viscosity. The release of arabinose and xylose in the small intestine may also be the important contributors to the growth-promoting effect of xylanase in broilers fed wheat-based diets.

Production of Vanillin from Ferulic Acid Using Recombinant Strains of Escherichia coli

  • Yoon Sang-Hwal;Li Cui;Lee Young-Mi;Lee Sook-Hee;Kim Sung-Hee;Choi Myung-Suk;Seo Weon-Taek;Yang Jae-Kyung;Kim Jae-Yeon;Kim Seon-Won
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제10권4호
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    • pp.378-384
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    • 2005
  • Vanillin is one of the world's principal flavoring compounds, and is used extensively in the food industry. The potential vanillin production of the bacteria was compared to select and clone genes which were appropriate for highly productive vanillin production by E. coli. The fcs (feruloyl-CoA synthetase) and ech (enoyl-CoA hydratase/aldolase) genes cloned from Amycolatopsis sp. strain HR104 and Delftia acidovorans were introduced to pBAD24 vector with $P_{BAD}$ promoter and were named pDAHEF and pDDAEF, respectively. We observed 160 mg/L vanillin production with E. coli harboring pDAHEF, whereas 10 mg/L of vanillin was observed with pDAHEF. Vanillin production was optimized with E. coli harboring pDAHEF. Induction of the fcs and ech genes from pDAHEF was optimized with the addition of 13.3 mM arabinose at 18 h of culture, from which 450 mg/L of vanillin was produced. The feeding time and concentration of ferulic acid were also optimized by the supplementation of $0.2\%$ ferulic acid at 18 h of culture, from which 500 mg/L of vanillin was obtained. Under the above optimized condition of arabinose induction and ferulic acid supplementation, vanillin production was carried out with four different types of media, M9, LB, 2YT, and TB. The highest vanillin production, 580 mg/L, was obtained with LB medium, a 3.6 fold increase in comparison to the 160 mg/L obtained before the optimization of vanillin production.

Direct Fermentation of D-Xylose to Ethanol by Candida sp. BT001

  • LEE, SANG-HYEOB;WON-GI BANG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제4권1호
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    • pp.56-62
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    • 1994
  • A yeast strain, BT001, which can directly ferment D-xylose to ethanol was isolated from forest soils, and then identified as Candida sp. Cultural conditions for the optimum ethanol production, along with the effects of aeration on cell growth and ethanol production were investigated. Aeration stimulated the cell growth and the volumetric rate of ethanol production, but decreased the ethanol yield. Optimum temperature and initial pH for the ethanol production were $33{\circ}^C$ and 6.0, respectively. In a shake flask culture, this strain produced 52.3 g ethanol per liter from 12%(w/v) D-xylose after incubation for 96 hours. Ethanol yield was 0.436 g per g D-xylose consumed. This corresponds to 85.8% of theoretical yield. Also, this yeast strain produced ethanol from D-galactose, D-glucose and D-mannose, but not from L-arabinose and L-rhamnose. Among these sugars, D-glucose was the fastest in being converted to ethanol sugars.

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Streptomyces turgidiscabies에 의한 감자 더뎅이병 (Potato Common Scab by Streptomyces turgidiscabies)

  • 김전순;박덕환;임춘근;최용철;함영일;조원대
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권5호
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    • pp.551-554
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    • 1998
  • Bacterial specs isolated from common scab lesion on potato (Solanum tuberosum L. c.. Dejima) tuber was identified as Streptomyces turgidiscabies. This organism had flexuous spore chains and grey spore mass color, produced melanin pigment on ISP 7, but did not produce on ISP 6. S. turgidiscabies grew on agar media at pH 4.5, used L-arabinose, D-fructose, D-glucose, D-mannitol, raffinose, rhamnose, sucrose, D-xylose and meso-inositol as carbon sources, and was susceptible to 7% NaCl, thallium acetate (10 $\mu\textrm{g}$/ml, 100$\mu\textrm{g}$/ml), crystal violet (0.5 $\mu\textrm{g}$/ml), phenol (0.1%, wt/vol), oleandomycin (100 $\mu\textrm{g}$/ml), and streptomycin (20 $\mu\textrm{g}$/ml).

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Streptomyces acidiscabies에 의한 감자 더뎅이병 (Potato Scab Caused by Streptomyces acidiscabies)

  • 김점순;박덕환;최용철;임춘근;홍순영;이승돈;함영일;조원대
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.689-692
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    • 1998
  • Bacterial species isolated from common scab lesion on potato (Solanum tuberosum L. cv. Dejima) was identified as Streptomyces acidiscabies. This organism had flexuous spore chains and white spore mass color, produced melanin pigment on tyrosine agar medium but did not produce on peptone agar medium. S. acidiscabies grew on agar medium at pH 4.0, used L-arabinose, D-fructose, D-glucose, D-mannitol, rhamnose, sucrose, D-xylose and meso-inositol except reffinose as carbon sources. It was also susceptible to thallium acetate (10 $\mu\textrm{g}$/ml, 100$\mu\textrm{g}$/ml), phenol (0.1%, wt/vol), streptomycin (20 $\mu\textrm{g}$/ml), and was resistant to 7% NaCl, crystal violet (0.5 $\mu\textrm{g}$/ml), penicillin (10 IU/ml) and oleandomycin (25 $\mu\textrm{g}$/ml, 100 $\mu\textrm{g}$/ml).

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