• KSBB Journal
• /
• 제25권6호
• /
• pp.513-519
• /
• 2010

Marine bacterium producing pigment was isolated from the solar saltern of Mijo-myeon, Namhae, Korea. Based on phenotypic characteristics and 16S rRNA sequence analysis, the strain was identified as Kocuria sp., which produced a yellow pigment. The pigment showed UV absorption maximum at 469nm. The bacterial strain grew well on Marine broth 2216 culture medium. Productivity of the pigment reached the maximum value after 44 hours at $30^{\circ}C$, 2% NaCl and pH 6.0. The pigment was produced best when supplied by 1% lactose as a carbon source and 1% beef extract as a nitrogen source. The result of the color stability study showed that pigment extracted from the strain by ethanol was stable at $-20-25^{\circ}C$ and also showed higher stability over 70% for 14 days in light conditions at $25^{\circ}C$. The pigment extract was also stable for all metal ions tested, except for $FeCl_2$.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제45권3호
• /
• pp.226-235
• /
• 2017

Phytoene, lycopene, ${\beta}-carotene$과 같은 카로티노이드는 식품의 착색제나 영양보조제, 사료첨가제, 화장품의 원료로 사용된다. 이전 연구에서 본 연구진은 분홍색의 색소를 생산하는 새로운 해양 세균인 K. gwangalliensis를 분리 동정하였다. Phytoene desaturase (CrtI) 효소는 crtI 유전자에 암호화되어 있으며, phytoene을 lycopene으로 전환하며, 카로티노이드 합성 초기 단계에 있어서 필수적이다. CrtI는 카로티노이드 생합성 조절의 주요 효소 중 하나이며, 다양한 카로티노이드를 생합성하는 생물들의 카로티노이드 생합성 경로에 있어서 속도 조절 단계에 관련이 있다. 본 논문에서는 K. gwangalliensis로부터 lycopene 생합성을 담당하는 crtI 유전자를 클로닝 하였으며, 이 유전자는 1,584개의 염기서열을 가지며, 527개의 아미노산을 암호화하고 있다. crtI 유전자의 염기 서열을 Kocuria rhizophila와 Myxococcus xanthus를 포함한 다른 종의 염기 서열과 비교한 결과, 진화 과정에서 잘 보존되어 있음을 확인하였다. crtI 유전자를 포함하는 발현 플라스미드를 구축하여 발현시킨 결과, 이 플라스미드를 함유하는 대장균은 약 57 kDa의 재조합 단백질을 생산화였으며, 이는 phytoene desaturase의 분자량에 해당한다. lycopene의 생합성은 lycopene 생합성에 필요한 crtE, crtB 유전자를 포함한 pRScrtEB plasmid를 E. coli에 형질전환 했을 때, Escherichia coli에서 합성되는 것을 확인하였다. 이 연구의 결과는 분자 수준에서 K. gwangalliensis CrtI의 1차 구조에 대한 폭 넓은 지식 기반을 제공할 것이다.

• 디지털융복합연구
• /
• 제15권6호
• /
• pp.339-344
• /
• 2017

본 연구에서는, 생화학 및 기술학 융합 연구의 일환으로, 병원내 환경으로부터 미생물이 추출되고 생화학적 분석으로 통하여 동정되었다. 미생물은 평택 소재 평원 중환자실에서 수집되었다 (2014년 11월 28일부터 2014년 11월 30일). 생화학장비인 VITEK2를 이용하여 11개의 미생물, Micrococcus luteus (or M. lylae), Granulicatella adiacens (M. luteus or M. lylae), Staphylococcus caprae, Sphingomonas paucimobilis, Kocuria kristinae, G elegans, Aerococcus viridans (or Staphylococcus arlettae), Methylobacterium spp., Dermacoccus nishinomiyaensis (or Kytococcus sedentarius), Kocuria kristinae (or M. luteus, M. lylae), Pseudomonas oryzihabitans이 동정되었다. 이후 이산화염소가스를 배출하는 팜이톡이라고 하는 플라스틱 막대와 함께 두고 측정해본 결과, 약 99.9% 이상의 매우 강한 미생물 성장억제가 분석되었다. 팜이톡과 함께 배양된 미생물 플레이트에는 어떠한 세균 집락도 발견되지 않았다. 종합해볼 때, 이산화염소가스를 배출하는 팜이톡은 병원내 감염을 유발하는 미생물에 대한 매우 강한 성장 억제효과를 가지는 것으로 확인되었다.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제42권2호
• /
• pp.252-265
• /
• 2022

Kocuria salsicia can survive in extreme environments and cause infections, including catheter-related bacteremia, in humans. Here, we investigated and evaluated the characteristics of nine K. salsicia strains (KS1-KS9) isolated from cheese brine from a farmstead cheese-manufacturing plant in Korea from June to December, 2020. Staphylococcus aureus American Type Culture Collection (ATCC) 29213 was used as a positive control in the growth curve analysis and biofilm-formation assays. All K. salsicia isolates showed growth at 15% salt concentration and temperatures of 15℃, 25℃, 30℃, 37℃, and 42℃. KS6 and KS8 showed growth at 5℃, suggesting that they are potential psychrotrophs. In the biofilm-formation analysis via crystal violet staining, KS6 exhibited the highest biofilm-forming ability at various temperatures and media [phosphate buffered saline, nutrient broth (NB), and NB containing 15% sodium chloride]. At 25℃ and 30℃, KS3, KS6, and KS8 showed higher biofilm-forming ability than S. aureus ATCC 29213. The antimicrobial resistance of the isolates was evaluated using the VITEK^® 2 system; most isolates were resistant to marbofloxacin and nitrofurantoin (both 9/9, 100%), followed by enrofloxacin (7/9, 77.8%). Five of the nine isolates (5/9, 55.6%) showed multidrug resistance. Our study reports the abilities of K. salsicia to grow in the presence of high salt concentrations and at relatively low temperatures, along with its multidrug resistance and tendency to form biofilms.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제44권3호
• /
• pp.293-302
• /
• 2016

6종류의 배지를 이용한 135일 동안 8번의 박테리아상 분석을 통하여 새우젓갈 숙성 관련 우점종을 결정하였다. Marine agar를 배양에 사용하였을 경우, 가장 많은 수의 박테리아가 검출되었고, 숙성 65일차에 그 수가 2.51 × 10⁷ CFU/g에 달하였다. 순수분 리된 총 467균주는 42속 87종으로 동정되었고, 16균주는 기존의 알려진 박테리아와 상동성을 나타내지 않았다. 1일차 분석에서 39종이 검출되었던 박테리아는 135일차에 13종으로 감소하여 우점화가 진행됨을 학인하였다. 속 수준에서의 우점은 Staphylococcus, Salimicrobium, Kocuria, Psychrobacter 순으로 나타났고, 1일차 분리균주의 2% 수준을 차지하던 Staphylococcus, Salimicrobium 속 균주는 135일차에 각각 39%와 36%에 달하였다. 우점종으로 확인된 Staphylococcus equorum, Salimicrobium salexigens, Kocuria palustris는 각각 전체 분리균주의 23.6%, 16.1%, 10.9%을 차지하였다. St. equorum와 Sm. salexigens는 21% (w/v) NaCl 농도에서의 생육이 확인되어 새우젓갈 숙성에 중요한 역할을 할 것으로 추정된다.

• 생명과학회지
• /
• 제22권8호
• /
• pp.1024-1033
• /
• 2012

Kocuria gwangalliensis로부터 카로티노이드 생합성 경로의 첫 번째 단계 기질인 geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP)를 생합성하는 GGPP synthase (CrtE)를 암호화하고 있는 crtE를 클로닝 하여 이를 KgGGPP로 명명하였다. 기존 세균에서 밝혀진 GGPP synthase의 아미노산 서열을 NCBI에서 검색하여 KgGGPP synthase의 아미노산 서열과 비교한 결과 Kocuria rhizophila와 59.6%의 상동성을 가지는 것을 확인하였다. crtE 유전자를 대장균에서 발현 시키기 위하여 pCcrtE 재조합 DNA를 구축하였고, 이를 대장균에서 발현시킨 결과 약 41 kDa의 재조합 단백질이 과발현 됨을 확인 할 수 있었으며, 이 단백질은 기존 세균에서 밝혀진 GGPP synthase와 유사한 분자량을 가지고 있다는 것을 알 수 있었다. CrtE 재조합 단백질의 활성을 분석하기 위하여 대장균 내에서 라이코펜의 생합성을 유도 하였다. 대장균의 경우 메발론산 경로를 통하여 FPP와 IPP를 생합성 하지만 crtE, crtB, crtI 유전자가 없기 때문에 라이코펜을 생합성 하지는 못한다. 대장균 내에서 라이코펜의 생합성을 위해서는 crtE, crtB, crtI 유전자의 발현이 필수적으로 요구되기 때문에 crtB, crtI 유전자의 경우는 P. haeundaensis에서 유래한 유전자를 이용하여 pRScrtBI 재조합 DNA를 구축하여 그 발현을 유도하였다. 상기 두 재조합 DNA를 대장균에서 공발현 시켰으며, HPLC 분석법을 이용하여 대장균 내에서 라이코펜의 생산 유무에 따른 KgGGPP synthase의 활성을 분석하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제22권2호
• /
• pp.244-247
• /
• 2012

To remediate lead (Pb)-contaminated soils, it is proposed that microbially induced calcite precipitation (MICP) would provide the best alternative to other remediation technologies. In this study, Pb bioremediation in soils was investigated using the calcite-precipitating bacterium Kocuria flava. Results indicate that the Pb is primarily associated with the carbonate fraction in bioremediated soil samples. The bioavailability of Pb in contaminated soil was reduced so that the potential stress of Pb was alleviated. This research provides insight into the geochemistry occurring in the MICP-based Pb-remediated soils, which will help in remediation decisions.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제25권11호
• /
• pp.1801-1809
• /
• 2015

A phytoene synthase gene, crtB, was isolated from Kocuria gwangalliensis. The crtB with 1,092 bp full-length has a coding sequence of 948 bp and encodes a 316-amino-acids protein. The deduced amino acid sequence showed a 70.9% identity with a putative phytoene synthase from K. rhizophila. An expression plasmid, pCcrtB, containing the crtB gene was constructed, and E. coli cells containing this plasmid produced the recombinant protein of approximately 34kDa , corresponding to the molecular mass of phytoene synthase. Biosynthesis of lycopene was confirmed when the plasmid pCcrtB was co-transformed into E. coli containing pRScrtEI carrying the crtE and crtI genes encoding lycopene biosynthetic pathway enzymes. The results obtained from this study will provide a base of knowledge about the phytoene synthase of K. gwangalliensis and can be applied to the production of carotenoids in a non-carotenoidproducing host.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제19권9호
• /
• pp.873-880
• /
• 2009

A novel xylanase gene, Kxyn, was cloned from Kocuria sp. Mn22, a bacteria isolated from the deep sea of the east Pacific. Kxyn consists of 1,170 bp and encodes a protein of 390 amino acids that shows the highest identity (63%) with a xylanase from Thermohifida fusca YX. The mature protein with a molecular mass of approximately 40 kDa was expressed in Escherichia coli BL21 (DE3). The recombinant Kxyn displayed its maximum activity at $55^{\circ}C$ and at pH 8.5. The $K_m,\;V_{max}$, and $k_{cat}$ values of Kxyn for birchwood xylan were 5.4 mg/ml, $272{\mu}mol/min{\cdot}mg$, and 185.1/s, respectively. Kxyn hydrolyzed birchwood xylan to produce xylobiose and xylotriose as the predominant products. The activity of Kxyn was not affected by $Ca^{2+},\;Mg^{2+},\;Na^+,\;K^+$, ${\beta}$-mercaptoethanol, DTT, or SDS, but was strongly inhibited by $Hg^{2+},\;Cu^{2+},Zn^{2+}$, and $Pb^{2+}$. It was stable over a wide pH range, retaining more than 80% activity after overnight incubation at pH 7.5-12. Kxyn is a cellulase-free xylanase. Therefore, these properties make it a candidate for various industrial applications.

• 한국토양비료학회지
• /
• 제42권4호
• /
• pp.257-265
• /
• 2009

토양미생물 군락에 대한 유기물 및 비료의 장기 연용 효과를 평가하고자 동일비료연용 논토양을 대상으로 미생물상, 미생물체량 및 세균 군락의 상호관계에 대해 조사하였다. 유기태 탄소함량은 비료를 연용한 곳 보다 볏짚 퇴비를 시용한 처리구에서 높았다. 토양 세균수는 무비구와 화학비료 시용구에 비해 퇴비, 석회, 규산을 병용한 처리구에서 비교적 높았다. 영년동일 논토양에서 Dactylosporangium, Ewingella, Geobacillus, Kocuria, Kurthia, Kytococcus, Lechevalieria, Micrococcus, Micromonospora, Paenibacillus, Pedobacter, Pseudomonas, Pseudoxanthomonas, Rhodococcus, Rothia, Sphingopyxis, Stenotrophomonas, Variovorax 등의 세균이 분리되었으며, Arthrobacter, Kocuria, Kurhtia 및 Bacillus 등의 세균이 우점하였다. 미생물체량 및 탈수소효소 활성은 볏짚퇴비 시용구에서 가장 높았다.