• 제목/요약/키워드: Kappa Value

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풀무치 유래 항균 펩타이드 locustacin의 항염증 활성 (Anti-inflammatory Activities of Antimicrobial Peptide Locustacin Derived from Locusta migratoria in LPS-stimulated RAW264.7 Cells)

  • 최라영;이준하;서민철;김인우;황재삼;김미애
    • 생명과학회지
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    • 제31권10호
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    • pp.898-904
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    • 2021
  • 본 연구는 lipopolysaccharide (LPS)로 자극된 RAW264.7 세포에 대한 풀무치 유래 항균 펩타이드 locustacin의 항염증 메커니즘을 조사하였다. Locustacin (50, 100, 200 ㎍/ml)은 세포 독성 없이 LPS로 자극된 대식세포의 nitric oxide (NO) 생성을 유의하게 감소시켰고, 단백질과 mRNA 수준에서 inducible NO synthase (iNOS), cyclooxygenase-2 (COX-2)와 같은 전염증 매개체의 발현을 억제하였다. Locustacin은 LPS 처리로 증가된 염증성 사이토카인인 interleukin (IL)-6 및 IL-1β 함량과 이들의 유전자 발현을 모든 처리 농도에서 농도의존적으로 감소시켰다. 한편, LPS에 의해 인산화된 extracellular signal regulated kinase (ERK), p38 및 c-Jun N-terminal kinase (JNK)는 locustacin (100, 200 ㎍/ml) 처리로 억제되었다. 또한, LPS에 의해 유도된 inhibitory kappa B alpha (IκB-α)의 분해를 locustacin이 단백질 수준에서 억제한다는 것을 발견했다. 결론적으로, locustacin은 LPS 처리된 대식세포에서 mitogen-activated protein kinases (MAPKs) 인산화, nuclear factor kappa B (NF-κB) 활성화 및 하위 염증 매개체를 억제함으로써 항염증 효과를 가지고 있음을 확인하였다. 이러한 결과들은 풀무치 전사체 분석을 통해 확인된 locustacin이 항염증제 후보물질로서 개발 가능성이 있음을 제시한다.

식생 활력도를 고려한 드론 기반의 식생지수 분석 (Drone-based Vegetation Index Analysis Considering Vegetation Vitality)

  • 조상호;이근상;황지욱
    • 한국지리정보학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.21-35
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    • 2020
  • 식생정보는 도시계획, 조경, 수자원, 환경 등 다양한 분야에서 활용되는 매우 중요한 인자이다. 식생은 수관밀도 혹은 엽록소 함량에 따라 식생의 활력도에 차이가 발생하나 기존 연구에서는 식생지역을 분류시 식생 활력도를 고려하지 않았다. 본 연구에서는 다양한 응용연구를 충족시키기 위해 식생 활력도를 고려한 식생지수 경계값을 설정하는 연구를 수행하였다. 먼저 eBee 고정익 드론에 다중분광 카메라를 탑재하여 광학 및 근적외선 정사영상을 구축하였으며, 그리고 각 정사영상에 대해 GIS 연산을 수행하여 NDVI, GNDVI, SAVI, MSAVI 식생지수를 계산하였다. 또한 대상지에 대한 식생위치를 VRS 측량을 통해 조사하였으며 이를 이용하여 식생 활력도를 고려한 식생지수별 정확도를 평가하였다. 그 결과 식생 활력도가 좋은 지점을 식생지역으로 선정한 시나리오가 식생 활력도가 다소 부족한 지점도 식생지역으로 선정한 시나리오에 비해 식생지수의 분류 정확도가 높게 나타났다. 또한 각 현장 조사 지점과의 중첩을 통해 계산한 식생지수별 Kappa 계수를 통해 시나리오별로 식생을 분류하기에 가장 적합한 식생지수 경계값을 선정할 수 있었다. 따라서 본 연구에서 제시한 식생 활력도를 고려한 식생지수 정확도 평가는 향후 도시계획 등 다양한 업무 분야에서 의사결정 지원을 위한 유용한 정보를 제공해 줄 수 있을 것으로 판단된다.

재조합 Xylanase와 Cellulase의 연속처리에 의한 침엽수 Kraft 펄프의 Biobleaching (Biobleaching of Softwood Kraft Pulp Using Recombinant Xylanase and Cellulase)

  • 김현주;위승곤;배현종
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제35권6호
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    • pp.166-174
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    • 2007
  • 효소 전처리에 의한 침엽수 Kraft 펄프의 표백 효율을 살펴보고자 Trichoderma reesei에서 2종류의 xylanase를 cloning하였다. Cloning된 xylanasel과 xylanaseII 유전자를 E. coli에서 발현시켜 29kDa의 재조합 단백질인 XYNI과 29.5 kDa의 XYNII를 생한하여 정제하였고, Rumicoccus albus로부터 cloning되어 변형된 50kDa의 EGIV-CBDII를 동일한 방법으로 cellulase를 생산 정제하였다. 정제된 효소들을 각각 xylan과 CMC를 기질로하여 효소 활성도를 측정한 결과 XYNI이 XYNII보다 효소활성이 더 높았으며, EFIV-CBDII 또한 높은 활성을 나타내었다. 이렇게 생산 정제된 xylanase와 cellulase를 이용하여 침엽수 Kraft 펄프를 대상으로 연속처리에 의한 biobleaching test를 실시하였다. XYNI을 처리하였을 때 백색도는 29.9% 증가하였고, XYNI를 1차 처리한 후 2차로 EGIV-CBDII를 처리하였을 때 백색도는 1차 처리구에 비해 9.1% 증가하였다. 그 후 3차 XYNI를 처리 하였을 때 2차에 비해 7.3%의 bleaching의 효과를 볼 수 있었다. 또한 Kappa No.는 처리단계에 따라 8.1, 4.6 그리고 3.2% 각각 지속적으로 감소하였다. 이 실험결과를 통해 재조합 효소 XYNI과 EGIV-CBDII를 함께 이용하여 Karft 펄프에 대한 biobleaching의 상승효과를 확인하였다.

췌담관질환에서 담관 솔질세포검사의 유용성 - 통상도말과 $MonoPrep2^{TM}$ 액상세포검사의 전향적 비교연구 - (Utility of Bile Duct Brush Cytology in Pancreaticobiliary Diseases - Prospective Comparative Study of Conventional Smear and $MonoPrep2^{TM}$ Liquid Based Cytology -)

  • 이동화;김미선;조영덕;천영국;최민성;김동원;진소영
    • 대한세포병리학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.38-45
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    • 2006
  • Bile duct brush cytology has been employed as a diagnostic tool for the evaluation of pancreatic and biliary tract strictures. The specificity of this method is high however, its sensitivity is quite low. A recent study employing liquid based cytology (LBC) reported results comparable to those achieved via conventional cytology. Therefore, we have attempted to prospectively evaluate the diagnostic utility of bile duct brush cytology in pancreaticobiliary diseases. A total of 46 cases with bile duct stricture were enrolled including 11 cases of benign stricture, 29 cases of bile duct carcinoma, 3 cases of gallbladder cancer, and 3 cases of pancreatic cancer. Both conventional smear and LBC using $MonoPrep2^{TM}$ system were conducted in each case. The cytological diagnosis of each case was classed into the following categories; benign, suspicious for malignancy, and malignancy. The diagnostic accuracy of both cytologic methods was investigated. LBC evidenced a high rate of material insufficiency (13/46), which was attributed to low cellularity. The kappa index of both cytological methods was 0.508. Cytological and tissue diagnoses were correlated in 25 cases conducted from biopsy or operation. The sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value were 41.2% (7/17), 100% (8/8), 100% (7/7), and 44.4% (10/18) in conventional smear; 58.8% (10/17), 87.5% (7/8), 90.9% (10/11), and 50.0% (7/14) in LBC; and 94.1% (16/17), 87.5% (7/8), 94.1% (16/17), and 87.5% (7/8) in any one of both cytological methods, respectively. Based on these results, the sensitivity of LBC was found to be superior to that of conventional smear and we were able to obtain higher positive predictive value upto 94.1% by simultaneously conducting both cytologic methods.

유방 초음파 검사 시 S-detect 방법을 활용한 인자 분석 (Factor analysis using S-detect Method in Breast Ultrasound)

  • 천혜리;장현철;조평곤
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제13권1호
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    • pp.9-14
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    • 2019
  • 본 연구는 유방 초음파 검사 시 S-detect 성능에 관한 내용을 알아보고 이에 따라 조직 검사와 비교하여 불필요한 조직 검사를 줄일 수 있는 방안을 알아보고자 하였다. 2018년 8월에서 10월까지 유방초음파 검사를 시행한 환자 중 유방결절이 발견되어 조직 검사가 계획된 30명의 환자를 대상으로 후향적으로 분석하였다. S-detect 방법에서의 악성 감별과 Biopsy에서의 악성감별에 유의한 차이가 있는지 알아보기 위해 Mc Nemar test 분석을 실시하였다. S-detector 방법의 분석 결과 민감도는 90.9 %, 특이도 84.21 %, 정확도 86.66%, 양성예측도 76.92%, 음성예측도 94.11 %로 나타났다. S-detect 방법과 Biopsy 방법 간에 일치도 분석 결과 kappa 값이 0.724(p<0.05)로 높게 나타났으며, 두 방법 간에 좋은 일치도를 보였다. 유방초음파 검사 시 S-detect를 활용한 검사 방법에 있어서 유방 종괴에 악성과 양성 감별 진단에 있어서 진단적으로 가치가 있었으며, 유방조직 검사 실시 전 적절히 활용한다면 불필요한 조직 검사를 줄일 수 있는데 도음을 줄 것이다.

Should Cut-Off Values of the Risk of Malignancy Index be Changed for Evaluation of Adnexal Masses in Asian and Pacific Populations?

  • Yavuzcan, Ali;Caglar, Mete;Ozgu, Emre;Ustun, Yusuf;Dilbaz, Serdar;Ozdemir, Ismail;Yildiz, Elif;Gungor, Tayfun;Kumru, Selahattin
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권9호
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    • pp.5455-5459
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    • 2013
  • Background: The risk of malignancy index (RMI) for the evaluation of adnexal masses is a sensitive tool in certain populations. The best cut off value for RMI 1, 2 and 3 is 200. The cut off value of RMI-4 to differentiate benign from malignant lesions is 450. Our aim was to evaluate the efficiency of four different malignancy indexes (RMI1-4) in a homogeneous population. Materials and Methods: We evaluated a total of 153 non-pregnant women with adnexal masses who did not have a history of malignancy and who were above 18 years of age. Results: A cut-off value of 250 for RMI-1 provided 95.9% inter-observer agreement, yielding 95.9% specificity, 93.5% negative predictive value, 75.0% sensitivity and 82.8% positive predictive value. A cut-off value of 250 for RMI-1 showed high performance in preoperative diagnosis of invasive malignant lesions than cut-off value of 200 in our population. A cut-off value of 350 for RMI-2 provided 94.5% inter-observed agreement, yielding 94.2% specificity, 93.4% negative predictive value, 75.0% sensitivity and 77.4% positive predictive value. RMI-2 showed the higher performance when the cut-off value was set at 350 in our population. A cut-off value of 250 provided 95.2% inter-observer agreement, yielding 95.0% specificity, 93.2% negative predictive value, 75.0% sensitivity, and 88.0% positive predictive value. RMI-3 showed the highest performance to diagnose malignant adnexal masses when the cut-off value was set at 250. In our study, RMI-4 showed similar statistical performance when the cut-off value was set at 400 [(Kappa: 0.684/p=0.000), yielding 93.8% inter-observer agreement, 93.4% specificity, 93.4% negative predictive value, 75.0% sensitivity, and 75.0% negative predictive value]. Conclusions: We showed successful utilization of RMIs in preoperative differentiation of benign from malignant masses. Many studies conducted in Asian and Pacific countries have reported different cut-off values as was the case in our study. We think that it is difficult to determine universally accepted cut-off values for RMIs for common use around the globe.

비소세포폐암 환자의 국소 림프절 전이 발견을 위한 FDG PET의 이용 (The Use of FDG PET for Nodal Staging of Non-Small-Cell Lung Cancer)

  • 백희종;박종호;최창운;임상무;최두환;조경자;원경준;조재일
    • Journal of Chest Surgery
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    • 제32권10호
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    • pp.910-915
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    • 1999
  • Background: Positron emission tomography(PEFT) using fluorine-18 deoxyglucose(FDG), showing increased FDG uptake and retention in malignant cells, has been proven to be useful in differentiating malignant from benign tissues. We indertook the prospective study to compare the accuracy of the whole-body FDG PET with that of the conventional chest computed tomography(CT) for nodal staging of non-small-cell lung cancers(NSCLC). Material and Method: FDG PET and contrast enhanced CT were performed in 36 patients with potentially resectable NSCLC. Each Imaging study was evaluated independently, and nodal stations were localized according to the AJCC regional lymph nodes mapping system. Extensive lymph node dissection(1101 nodes) of ipsi- and contralateral mediastinal nodal stations was performed at thoracotomy and/or mediastinoscopy. Image findings were compared with the histopathologic staging results and were analyzed with the McNema test(p) and Kappa value(k). Result: The sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of CT for ipsilateral mediastinal nodal staging were 38%, 68%, 25%, 79%, and 61%, and those of PET were 88%, 71%, 47%, 95%, and 75%(p>0.05, K=0.29). When analyzed by individual nodal group(superior, aortopulmonary window, and inferior), the sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of CT were 27%, 82%, 22%, 85%, and 73%, and those of PET were 60%, 87%, 92%, and 82%(p<0.05, k=0.27). Conclusion: FDG PET in addition to CT appears to be superior to CT alone for mediastinal staging of non-small cell lung cancers.

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균일유동에 수직인 2차원 스크린 후류의 점성유동에 관한 수치적 연구 (Numerical Study on Viscous Wakes of Two-Dimensional Screens Normal to the Uniform Stream)

  • 강신형;전우평
    • 대한기계학회논문집
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    • 제12권3호
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    • pp.590-598
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    • 1988
  • 본 연구에서는 난류유동이론을 적용하여 2차원 스크린의 후류에 관한 유동특 성을 연구하였다. 이를 위해 적합한 난류모델 및 스크린의 존재를 고려한 수치해석 방법을 연구하였다. 스크린의 저항이 커서 스크린 하류유동이 역류가 되는 경우도 포함하였다.

심실세동 심전도 파형 추출 파라미터를 이용한 관상동맥 관류압 예측 (A Prediction of Coronary Perfusion Pressure Using the Extracted Parameter From Ventricular Fibrillation ECG Wave)

  • 장승진;황성오;윤영로;이현숙
    • 대한전기학회논문지:시스템및제어부문D
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    • 제54권4호
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    • pp.274-283
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    • 2005
  • Coronary Perfusion Pressure(CPP) is known for the most important parameter related to the Return of Spontaneous Circulation (ROSC), however, clinically measuring CPP is difficult either invasive or non-invaisive method. En this paper, we analyze the correlation between the extracted parameter from VF ECG wave and the CPP with the statistical method, and predict CPP value using the extracted parameters within significance level. the extracted parameters are median frequency(MF), peak frequency(PF), average segment amplitude(ASA), MSA(maximum segment amplitude), Two parameters, MF, and ASA are selected in order to predict CPP value with general regression neural network, and then we evaluated the agreement statistics between the simulated CPP and the measured CPP. In conclusion, the mean and variance of the difference between the simulated CPP and the measured CPP are 8.9716±1.3526 mmHg, and standard deviation 6.4815 mmHg with one hundred-times training and test results. the simulated CPP and the measured CPP are agreed with the overall accuracy $90.68\%$ and kappa coefficient $81.14\%$ as a discriminant parameter of ROSC.

Anti-osteoporotic and Antioxidant Activities by Rhizomes of Kaempferia parviflora Wall. ex Baker

  • Nguyen, Phuong Thao;Bui, Thi Thuy Luyen;Lee, Sang Hyun;Jang, Hae Dong;Kim, Young Ho
    • Natural Product Sciences
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    • 제22권1호
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    • pp.13-19
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    • 2016
  • In this report, we investigated the antioxidant (peroxyl radical-scavenging and reducing capacities) and anti-osteoporotic activities of extracts and isolated constituents (1 - 16) from the rhizomes of Kaempferia parviflora Wall. ex Baker on pre-osteoclastic RAW 264.7 cells. Compound 5 exhibited significant peroxyl radical-scavenging capacity, with TE value of $8.47{\pm}0.52{\mu}M$, while compound 13 showed significant reducing capacity, with CUPRAC value of $5.66{\pm}0.26{\mu}M$, at $10.0{\mu}M$. In addition, flavonoid compounds 2, 4, 6, 8, 10, 12, and terpene compound 15 showed significant inhibition of tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP) in NF-${\kappa}B$ ligand-induced osteoclastic RAW 264.7 cells, with values ranging from $16.97{\pm}1.02$ to $64.67{\pm}2.76%$. These results indicated that K. parviflora could be excellent sources for the antioxidant and anti-osteoporotic traditional medicinal plants.