Sangdon Ryu;Jeong Jae Lee;Daye Mun;Soo Rin Kim;Jeehwan Choe;Minho Song;Younghoon Kim
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.32
no.11
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pp.1454-1461
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2022
Palm kernel expeller (PKE), a by-product of palm oil extraction, contains higher amounts of fiber than corn and soybean meal, but offers low energy density, protein value, and amino acid (AA) composition, limiting its use for swine. Recently however, it was reported that dietary fiber has a positive effect on the gut microbiota of the host, and therefore it is necessary to study the effect of PKE feeding on the intestinal microbiota of swine. In this study, we investigated the effects of supplementation with PKE in lactation diets on the gut microbiota composition of lactating sows and their litters. A total of 12 sows were randomly assigned to two dietary treatment groups in a completely randomized design. The treatments were a diet based on corn-soybean meal (CON) and CON supplemented with 20% of PKE. Sow and piglet fecal samples were collected before farrowing, on days 7 and 28 (weaning) after farrowing, and on days 7 and 28 (weaning) after farrowing, respectively, to verify gut microbiota composition by pyrosequencing analysis. The beta-diversity result showed a significant difference only in weaning-stage piglets, but dietary PKE altered the gut microbiota in sows by increasing the abundance of Lactobacillus compared with CON. In piglets, dietary PKE decreased the abundance of opportunistic pathogen Proteus and increased the abundance of potentially beneficial bacteria, such as Prevotellaceae and Prevotella. Our results can be helpful in developing feeding strategies and support the beneficial effects of dietary PKE to improve the gut health of animals.
Aeromonas hydrophila is a pathogen to fish as well as human. It is a food-borne disease, and causes severe mortality in fish, and sometimes severe septicemia in human. In this study, a rapid detection method using latex agglutination has been developed for A. hydrophila. Polyclonal antibodies were raised against membrane and whole cells of three isolates from rainbow trout. Among these, latex particles coated with antibodies raised against whole cells of isolate No. 2 showed the best sensitivity. With latex particles coated with this antibody, we could detect $5{\times}10^4$ CFU of A. hydrophila in 5 min. The cross-reactivity with bacteria constituting the normal intestinal microflora and other pathogens for rainbow trout was insignificant. This latex agglutination assay method produced positive reaction with all clinical isolates of A. hydrophila which were identified by species-specific PCR for 16S rRNA in A. hydrophila.
Pyrosequencing analysis of intestinal microflora from healthy Thai vegetarians and non-vegetarians exhibited 893 OTUs covering 189 species. The strong species indicators of vegetarians and non-vegetarians were Prevotella copri and Bacteroides vulgatus as well as bacteria close to Escherichia hermanii with % relative abundance of 16.9 and 4.5-4.7, respectively. Core gut microbiota of the vegetarian and non-vegetarian groups consisted of 11 and 20 different bacterial species, respectively, belonging to Actinobacteria, Firmicutes, and Proteobacteria commonly found in both groups. Two species, Faecalibacterium prausnitzii and Gemmiger formicilis, had a prevalence of 100% in both groups. Three species, Clostridium nexile, Eubacterium eligens, and P. copri, showed up in most vegetarians, whereas more diversity of Collinsella aerofaciens, Ruminococcus torques, various species of Bacteroides, Parabacteroides, Escherichia, and different species of Clostridium and Eubacterium were found in most non-vegetarians. Considering the correlation of personal characters, consumption behavior, and microbial groups, the age of non-vegetarians showed a strong positive correlation coefficient of 0.54 (p = 0.001) to Bacteroides uniformis but exhibited a moderate one to Alistipes finegoldii and B. vulgatus. Only a positive moderate correlation of body mass index and Parabacteroides distasonis appeared. Based on the significant abundance of potential pathogens, the microbiota of the non-vegetarian group showed an abundance of potential pathogen varieties of Bilophila wadsworthia, Escherichia coli, and E. hermannii, whereas that of the vegetarian group served for only Klebsiella pneumoniae. These results implied that the microbiota of vegetarians with high abundance of P. copri and low potential pathogen variety would be a way to maintain good health in Thais.
The inhibitory effect of lactobacilli and bifidobacteria on the growth of typical intestinal pathogens, Escherichia coli and Salmonella typhimurium was studied. The degree of inhibition was measured by well disc assay and turbidimetry method. The strains which showed the higher antimicrobial activity were L. acidophilus La-5, L. acidophilus NCFM, L. casei Lc-01 on the average by using two different methods. The associative cultures were performed with selected 3 lactobacilli and 2 enteropathogens E. coli and S. typhimurium, respectively. Inhibition of pathogen began at 9hr after culturing so that viable counts was decreased rapidly. After 30hr incubation, there were no viable pathogens from the mixed culture. Under this experimental condition, the antimicrobial activity of lactic acid bacteria was not due to pH alone and supposed to different to the strains.
Background: The risk of imported infectious diseases has been increasing with the annual rise in the number of international travelers. Objectives: This study aims to analyze the distribution and characteristics of intestinal bacteria isolated in 2019 from residents of Chungcheongnam-do Province with experience of travelling overseas. Methods: Twenty-three former overseas travelers with diarrhea were analyzed to detect viruses and bacteria according to the Manual for Detection of Foodborne Pathogens at Outbreaks. Additionally, antibiotic susceptibility tests and 16s rRNA sequencing were performed. Results: Twenty-five strains of ten pathogens were isolated from 18 samples. Pathogenic E. coli was the most common at 57.7%, followed by Clostridium perfringens (15.4%), Campylobacter spp. (7.7%), and Salmonella spp. (7.7%). The serotype of Salmonella was confirmed as Salmonella Braenderup, II 9,46:g,[m],[s],t:[e,n,x]. Conclusions: It was confirmed that the major enteric bacterial pathogens isolated from overseas travelers in Chungcheongnam-do Province were pathogenic E. coli, as found in other studies. The study on Plesiomonas shigelloides is meaningful in that it is reported as a rare case of infection in Korea. Antibiotic resistance and 16s rRNA analysis were performed, which is expected to provide important basic data for the prevention of traveler's diarrhea.
Kim, Dae-In;Lee, Goo;Shu, Jung-Ill;Lee, Chang-Woo;Kim, Jung-Ran;Ha, Gyoung-Yim;Lee, Kyu-Chun;Nam, Kyung-Soo;Yang, Chang-Heon
Journal of Life Science
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v.10
no.6
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pp.630-639
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2000
The gastric pathogen Helicobacter pylori(H. pylori) establishes long-term chronic infection that can lead to atrophic gastritis, intestinal metaplasia, and gastric cancer. H. pylori, which express cytotoxic genes is now recohnized as a cause of peptic ulcer and is also a major risk factor for the development of gastric adenocarcinoma. We performed this study 1) to assess the detection rate of H. pylori according to direct investigation of bacteria of gastric biopsy specimen and two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system in the symptomatic and non-symptomatic group 2) to evaluate and compare the efficacy of two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system for the diagnosis of H. pylori infection. Forty-nine patients were positive for H pylori infection based on direct investigation of bacteria by histology. The detection rates of H. pylori infection based on direct investigation of bacteria by histology. The detection rates of H. phlori were significantly lower in gastric cancer than in other gastroduodenal disease(p<0.05). The concordance of two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system is poor. There was no statistically significant difference between the expression rate of CagA and VacA in the symptomatic and non-symptomatic group. Although Helico blot 2.0 system may not displace GAP test, it was a very sensitive serologic test for the diagnosis of H. pylori infection and it was used to detect IgG antibodies to H. pylori-specific antigens, including CagA, VacA and the various urease subunit. Our data suggest that further investigation is needed to determine whether or not the serologic expression of cytotoxic gene may be clinical usefulness of diagnostic methods in the gastroduodenal disease.
Kim, Hyuck Joo;Hong, Jong Tae;Yu, Byeong Kee;Kim, Gi Young;Lee, Jin Ju;Kim, Suk
Journal of Biosystems Engineering
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v.37
no.6
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pp.420-428
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2012
Purpose: Porcine proliferative enteropathy(PPE), caused by the obligate intracellular bacterium Lawsonia intracellularis, is a widely distributed disease throughout the world causing substantial economic loss. The bacterial pathogen invades the intestinal epithelial cells which causes hyperplasia of the infected cells and leads to the process of disease pathogenesis. For diagnosing PPE in a pig farm in earlier stage, a rapid diagnosing test equipment is needed for farmers. To test the equipment appropriately, we prepare the samples and antibodies for rapid detecting the Lawsonia intracellularis in pig feces. Methods : To prepare the PPE infected samples, we sampled PPE suspected pig feces in a pig farm. To manufacture a anti-Lawsonia intracellularis antibody for capturing the Lawsonia intracellularis, the rabbit-anti LsaA synthetic peptide polyclonal antibody was inoculated to rabbits. To select the couple of antibodies which is most well sandwiched with the bacteria, ELISA test was done with PPE infected ileum samples. Finally, to verify the PPE infected feces which would be used to test the rapid kit, PCR test was done on the sampled PPE suspected feces Results : The rabbit-anti LsaA synthetic peptide polyclonal antibody is developed, and is verified to capture the bacterial well through the fluorescence antibody test. Also, we found that the monoclonal antibody and the polyclonal antibody could be used as couples for sandwiching the bacteria. Finally, through the PCR test for samples of pig feces, we could prepare the 150 PPE positive samples and 50 PPE negative samples. Conclusions : The manufactured polyclonal antibody and the imported monoclonal antibody could be used to capture the bacteria using the sandwich techniques. Also, the prepared PPE infected negative and positive samples could be used to test the performance of the rapid kit to capture the bacterium Lawsonia intracellularis.
Kim, Youngju;Ko, Seyoung;Yeon, Young Eun;Le, Hoa Thi;Han, Beom Ku;Kim, Hyunil;Oh, Chang-Sik;Kim, Donghyuk
Korean Journal of Microbiology
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v.54
no.2
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pp.149-151
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2018
Clostridium perfringens is a Gram-positive, rod-shaped, anaerobic, spore-forming pathogenic bacterium, which belongs to the Clostridiaceae family. C. perfringens causes diseases including food poisoning in vertebrates and intestinal tract of humans. Bacteriophages that can kill target bacteria specifically have been considered as one of control methods for bacterial pathogens. Here, we report a draft genome sequence of the bacteriophage CP3 effective to C. perfringens. The phage genome comprises 52,068 bp with a G + C content of 34.0%. The draft genome has 74 protein-coding genes, 29 of which have predicted functions from BLASTp analysis. Others are conserved proteins with unknown functions. No RNAs were found in the genome.
Objective: The objective of this study was to evaluate the antimicrobial effects of fermented Maillard reaction products made by milk proteins (FMRPs) on Clostridium perfringens (C. perfringens), and to elucidate antimicrobial modes of FMRPs on the bacteria, using physiological and morphological analyses. Methods: Antimicrobial effects of FMRPs (whey protein plus galactose fermented by Lactobacillus rhamnosus [L. rhamnosus] 4B15 [Gal-4B15] or Lactobacillus gasseri 4M13 [Gal-4M13], and whey protein plus glucose fermented by L. rhamnosus 4B15 [Glc-4B15] or L. gasseri 4M13 [Glc-4M13]) on C. perfringens were tested by examining growth responses of the pathogen. Iron chelation activity analysis, propidium iodide uptake assay, and morphological analysis with field emission scanning electron microscope (FE-SEM) were conducted to elucidate the modes of antimicrobial activities of FMRPs. Results: When C. perfringens were exposed to the FMRPs, C. perfringens cell counts were decreased (p<0.05) by the all tested FMRPs; iron chelation activities by FMRPs, except for Glc-4M13. Propidium iodide uptake assay indicate that bacterial cellular damage increased in all FMRPs-treated C. perfringens, and it was observed by FE-SEM. Conclusion: These results indicate that the FMRPs can destroy C. perfringens by iron chelation and cell membrane damage. Thus, it could be used in dairy products, and controlling intestinal C. perfringens.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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