• 제목/요약/키워드: Insertional Variation

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Characterization of Insertional Variation of Porcine Endogenous Retroviruses in Six Different Pig Breeds

  • Jung, W.Y.;Yu, S.L.;Seo, D.W.;Jung, K.C.;Cho, I.C.;Lim, H.T.;Jin, D.I.;Lee, Jun-Heon
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제25권10호
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    • pp.1357-1363
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    • 2012
  • Pigs may need to be exploited as xenotransplantation donors due to the shortage of human organs, tissues and cells. Porcine endogenous retroviruses (PERVs) are a significant obstacle to xenotransplantation because they can infect human cells in vitro and have the potential for transmission of unexpected pathogens to humans. In this research, 101 pigs, including four commercial breeds (23 Berkshire, 13 Duroc, 22 Landrace and 14 Yorkshire pigs), one native breed (19 Korean native pigs) and one miniature breed (10 NIH miniature pigs) were used to investigate insertional variations for 11 PERV loci (three PERV-A, six PERV-B and two PERV-C). Over 60% of the pigs harbored one PERV-A (907F8) integration and five PERV-B (B3-3G, B3-7G, 742H1, 1155D9 and 465D1) integrations. However, two PERV-A loci (A1-6C and 1347C1) and one PERV-B locus (B3-7F) were absent in Duroc pigs. Moreover, two PERV-C loci (C2-6C and C4-2G) only existed in Korean native pigs and NIH miniature pigs. The results suggest that PERV insertional variations differ among pig breeds as well as among individuals within a breed. Also, the results presented here can be used for the selection of animals that do not have specific PERV integration for xenotransplantation research.

벼 Ds 삽입변이 계통의 특성변이 및 분자생물학적 특성 (Trait Variation and Molecular Characterization of Ds insertional rice lines)

  • 안병옥;강경호;은무영;전용희;윤도원;지현소;박성한;남민희;서석철;이명철
    • 한국육종학회지
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    • 제40권1호
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    • pp.39-47
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    • 2008
  • 1. Ds 삽입변이체 계통으로부터 제초제 저항성 1,874계통을 선발하고 농업적 주요 특성으로서 출수일수, 간장, 수수, 수장, 엽장 등 5가지 형질에 대하여 조사한 바, 조사된 5가지 형질에 대하여 원품종인 동진벼에 비하여 매우 다양한 변이폭을 보여주었다. 2. 농업적 유용성과 관련된 수장이 길고, 조기출수, 수수가 많은 변이체 뿐만 아니라 형태학적 변이를 보이는 twin seedling, dwarf, early heading, strip albino, liguleless 등 변이체가 다수 발견됨으로서 육종적 이용 및 유전자 기능해석을 위한 유용한 집단으로서 유용성을 보여주었다. 3. 서던분석 결과 벼 게놈상에서 Ds는 평균 2 copy로 전이되었으며 조직부위별로 GUS의 발현을 조사한 결과 잎, 뿌리 및 화기관등에서 약 3.9%가 발현되었다. 이 삽입변이체에서 나타난 다양한 변이형질의 주요 농업적 특성과 GUS 발현의 재현성을 위해 다음 세대의 전개를 통한 후대분석이 필요하다.

Agrobacterium을 이용한 팽이 버섯 주름조직의 형질전환 (Agrobacterium-mediated transformation using gill tissue of Flammulina velutipes)

  • 박순영;;장갑열;신평균;박윤정;유영복;박기문;공원식
    • 한국균학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.48-53
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    • 2010
  • 팽이버섯의 다양한 유전자의 기능을 연구하기 위한 방법으로 팽이 자실체의 주름조직을 사용하여 A. tumefaciens을 매개로 한 형질전환을 수행하였다. Hygromycin 항생제 저항성 유전자를 포함하고 있는 AGL-1 pBGgHg를 팽이버섯의 자실체 조직에 도입시킴으로서 형질전환체들을 얻을 수 있었다. 형질전환체 선발은 첫 번째로 hygromycin 선발 배지에서 선발한 뒤 gpd-FH, hph-R primer를 이용하여 PCR로 확인 할 수 있었다. hygromycin은 30 ug/ml에서 선발 효율이 가장 높았다. 형질전환체 중 일부는 갈색 자실체를 갖는 wild type과는 달리 백색 자실체를 나타내었다. 형질전환체의 southern blot결과 외래유전자가 팽이버섯 내부에 하나 또는 그 이상의 다양한 copy 수로 삽입되어 있음을 알 수 있었다. 또한 삽입된 유전자의 주변 염기서열에 대한 정보는 Inverse PCR을 통해 알 수 있었다.

Gene Tagging System을 이용한 돌연변이 배추의 분석 (Analysis of Mutant Chinese Cabbage Plants Using Gene Tagging System)

  • 유재경;이기호;임기병;황윤정;우은택;김정선;박범석;이윤형;박영두
    • 원예과학기술지
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    • 제28권3호
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    • pp.442-448
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    • 2010
  • 본 연구는 gene tagging system(plasmid rescue와 inverse polymerase chain reaction)을 사용하여 얻은 배추($Brassica$ $rapa$ ssp. $pekinensis$) 형질전환체 계통을 분석하고 이들의 표현형을 관찰하고자 수행되었다. 배추의 기능유전체 연구를 위해 $Agrobacterium$의 전이 DNA(T-DNA)를 사용하여 삽입돌연변이체를 유기하였다. 형질전환체는 '서울' 배추 품종의 pRCV2 vector를 가진 $Agrobacterium$ $tumefaciens$을 접종하여 얻었다. 형질전환 $T_1$ 세대는 비형질전환체와 비교하여, 수술 수의 감소, 크거나 작은 꽃, 직립생장형, 잎에 털이 없는 것, 잎의 황백화 현상, 잎이 좁거나 결각이 깊은 것과 같은 다양한 표현형을 보였다. 형질전환 계통 중에서 발견된 13개의 돌연변이 계통의 표현형 변화는 체세포의 배수성 분석을 통하여 염색체 수의 변화에 기인하지 않은 것을 확인하였다. 배추 genomic DNA에서 T-DNA의 위치 확인을 위해 multiple copy와 single copy 형질전환체에 plasmid rescue와 inverse PCR 방법을 각각 적용하였다. 비형질전환체와 비교하여 뚜렷한 표현형적 차이를 보이고 Southern blot 분석 결과 1 copy의 T-DNA를 가지며 염색체 수가 20(2n)인 돌연변이체를 선발하여, flanking DNA 염기서열을 확인하고 배추 염색체내에서 각각의 유전자좌를 표시하였으며 이들 계통들에 대하여 데이터베이스를 작성 중에 있다.

Sonoanatomic Variation of Pes Anserine Bursa

  • Imani, Farnad;Rahimzadeh, Poupak;Gharehdag, Farid Abolhasan;Faiz, Seyed Hamid Reza
    • The Korean Journal of Pain
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    • 제26권3호
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    • pp.249-254
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    • 2013
  • Background: The pes anserine bursa lies beneath the pes anserine tendon, which is the insertional tendon of the sartorius, gracilis, and semitendinosus muscles on the medial side of the tibia, but it can lie in different sites in the medial knee. Accurate diagnosis of the position of the bursa is critical for diagnostic and therapeutic goals. The aim of this study was to evaluate sonoanatomic variations of the pes anserine bursa in the medial knee. Methods: One hundred seventy asymptomatic volunteers were enrolled in this study. Using ultrasound imaging (transverse approach, 7-13 MHz linear array probe) the sonoanatomic position of the pes anserine bursa and its relation to the pes anserine tendon were evaluated. Additionally, we evaluated the sonoanatomic variation of the saphenous nerve. Results: The position of the pes anserine bursa was between the medial collateral ligament and the pes anserine tendons in 21.2%/18.8% (males/females) of subjects; between the pes anserine tendons and the tibia in 67.1%/64.7% (m/f); and among the pes anserine tendons in 8.2%/12.9% (m/f). No significant differences in the position of the bursa existed between males and females. The saphenous nerve was found within the pes anserine tendons in 77.6%/74.1% (m/f) of subjects, but outside the pes anserine tendons in 18.8%/15.3% (m/f). Visibility of sonoanatomic structures was not related to either gender or BMI. Conclusions: Ultrasound provides very accurate information about variations in the pes anserine bursa and the saphenous nerve. This suggests that our proposed ultrasound method can be a reliable guide to facilitate approaches to the medial knee for diagnostic and therapeutic objectives.

쥐노래미 (Hexagrammos otakii) 성장호르몬 cDNA유전자의 염기서열 변이 및 발현 특성 (Molecular Cloning and Alternative Splicing of Growth Hormone Transcripts in Greenling, Hexagrammos otakii)

  • 남윤권;김동수
    • 한국수산과학회지
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    • 제35권6호
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    • pp.676-681
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    • 2002
  • 우리나라 주요 해산 어종인 쥐노래미 (Hexagrammos otakii)로부터 성장호르몬 유전자 CDNA를 클로닝하고 이의 염기서열과 발현 특성을 분석하였다. 뇌하수체 조직으로부터 CDNA library를 제작하였으며 membrane filter hybridization 및 expressed sequence tag기술을 이용하여 성장호르몬 CDNA transcript들을 대량 발굴하였다. 총 확보된 full-length clone 39개중 31개가 동일한 형태로 나타났으나 나머지 클론들에서는 5'쪽의 염기서열 변이, ORF내의 염기서열 삽입, 3'쪽의 여기서열의 변이 등이 검출되었다. RT-PCR과 RNA dot blot 분석을 수행한 결과 본 연구에서 얻어진 쥐노래미 성장호르몬 transcript들은 뇌하수체 특이적인 전형적인 어류 성장호르몬 발현 특성을 나타내었다.