• 제목/요약/키워드: ITS1 / 5.8S / ITS2

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Bacillus subtilis WL-8의 Mannanase 유전자 클로닝과 특성분석 (Cloning and Characterization of Mannanase Gene from Bacillus subtilis WL-8)

  • 윤기홍
    • 미생물학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.207-212
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    • 2010
  • 전통 발효식품인 된장으로부터 mannanase의 생산균으로 분리된 WL-8 균주는 형태적 특성, 생화학적 성질 및 16S rRNA의 염기서열에 근거하여 Bacillus subtilis로 동정되었다. B. subtilis WL-8은 locust bean gum 보다는 밀기울이 첨가된 LB 배지에서 mannanase 생산성이 높았으며, 24시간 배양하였을 때 약 20 U/ml에 이르렀다. 분리균 WL-8의 mannanase 유전자를 클로닝하여 그 염기서열을 결정한 결과 mannanase 유전자는 362 아미노산으로 구성된 단백질을 코드하며 1,086 뉴클레오티드로 이루어졌다. 아미노산 잔기배열을 분석한 결과 WL-8의 mannanase는 GH family 26에 속하며 B. subtilis의 mannanases와 매우 상동성이 높았다. B. subtilis WL-8의 mannanase 유전자를 함유한 재조합 대장균의 배양상등액과 균체파쇄상등액을 사용하여 반응특성을 조사한 결과 pH 5.5와 $60^{\circ}C$에서 최대 반응활성을 보였으며, $60^{\circ}C$보다 높은 온도에서 배양상등액보다는 균체파쇄상등액에 존재하는 mannanase가 더 높은 활성을 보였다.

한발조건이 콩식물체의 엽운동, 광합성능, 증산량, 수량 및 관련 형질에 미치는 영향 (Effects of Water Stress on Leaf Orientation, Apparent Photosynthetic Rate, Transpiration Rate, Yield and Its Related Traits in Soybean Plants)

  • 천종은;김진호
    • 한국작물학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.313-319
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    • 1992
  • 토양수분 부족이 콩식물체의 엽운동, 광합성능, 증산량, 수량 및 관련 형질에 미치는 영향을 조사하기 위해서, '단엽콩', '방사콩', '보광콩', '무한콩'을 비닐하우스 내에 폿트 재배에서 2주간 단수처리하여 실험을 하였다. 1. 광합성능은 광량(0.887$^{**}$ ), 기공전도율(0.788$^{**}$ ) 및 엽온(0.744$^{**}$)과 고도의 유의적인 정 상관이 있었다. 2. 1일중 광량과 온도가 증가함에 따라 콩의 복엽중 중앙의 소엽은 측렬의 소엽에 비해 더 빨리 엽운동이 시작되고 광합성능이 높은 반면에 수광량, 엽온은 다소 낮았다. 3. 한발구에 비해 관수구의 광량은 358 umole $m^{-2}$ $s^{-1}$, 기공전도율은 0.2 mole $m^{-2}$ $s^{-1}$, 엽온은 9$^{\circ}C$, 증산량 3.7 mole $m^{-2}$ , 광합성능은 8.5 $CO_2$, $\mu$mole $m^{-2}$ $s^{-1}$이 각각 높았다. 4. 관수구에 비해 한발구의 수량 및 관련 형질이 다양하게 감소되었다 ; 개체당 건물중 8%, 개체당 근류중 7%, 근중 14%, 간장 3%, 분지수 7%, 경태 8%, 개체당 협수 17%, 개체당 립중 17%가 각각 감소되었다.

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Potential valorisation of ferrous slag in the treatment of water and wastewater: A review

  • Anjali, M.S.;Shrihari, S.;Sunil, B.M.
    • Advances in environmental research
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    • 제8권1호
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    • pp.55-69
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    • 2019
  • The generation of ferrous slag, an industrial by-product from the iron ore industry, results in serious environmental problems. The chemical compositions indicate 30-34% SiO2, 30-34% CaO, 18-22% Al2O3 and 0.5-0.6% Fe2O3. The specific gravity, moisture content and pH are in the range of 1.3-1.65, 9.1-10% and 8.5-9.0 respectively. The major part of the slag is composed of sand-size particles. The problems of disposal of slag could be minimized by considering its use in various environmental engineering applications providing additional value to the by-product. This paper mainly focuses on the potential utilization and valorisation of ferrous slag in both water and wastewater treatments. It is effective for the treatment of water and wastewater containing nutrients, heavy metals and polluted river/stormwater.

Morphological and Multigene Sequence Characteristics of Talaromyces variabilis Isolated from Soil in Korea

  • Adhikari, Mahesh;Kim, Sang Woo;Lee, Hyang Burm;Lee, Youn Su
    • 한국균학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.11-19
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    • 2021
  • In 2017, Talaromyces variabilis was isolated during a survey of fungal diversity in field soils in Korea. This isolate was described based on its morphological and molecular characteristics and it was identified molecularly using the partial 18S-ITS1-5.8S-ITS2-28S rDNA region and calmodulin (CaM)-encoding gene sequence data. Thus, this study reported morphological and multigene sequence characterization of T. variabilis.

독도 자생식물의 뿌리로부터 분리된 내생균의 식물생장촉진 활성 (Plant Growth-Promoting Activity of Endophytic Fungi Isolated from the Roots of Native Plants in Dokdo Islands)

  • 유영현;윤혁준;우주리;서영교;김미애;추연식;김종국
    • 생명과학회지
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    • 제21권11호
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    • pp.1619-1624
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    • 2011
  • 독도에 자생하고 있는 6 종류의 식물뿌리로부터 내생균을 분리하였다. 동도에서 갯제비쑥, 명아주, 까마중과 서도에서 도깨비쇠고비, 술패랭이 그리고 번행초를 연구재료로 사용하였다. 총 32 종의 내생균을 분리하였고, universal primers ITS1과 ITS4를 사용하여 ITS 영역을 PCR로 증폭하여 동정하였다. 염기서열 분석결과, 6 종류의 식물의 뿌리에서 모두 32종류의 다양한 내생균류를 분리 및 동정 할 수 있었다. 독도 자생식물인 갯제비쑥 4종, 명아주 8종, 까마중 3종, 도깨비쇠고비 3종, 술패랭이 3종, 번행초 11종의 내생균이 분리되었다. 내생균들의 배양여액은 식물생장촉진활성을 확인하기 위하여 난장이벼의 유묘에 처리되었다. 그 결과, 명아주에서 분리된 Ca-5-2-2 균주가 우수하게 식물생장촉진활성을 나타내었다. 그리고 독도에 자생하는 6종류의 식물에서 Penicillium sp.와 Fusarium sp. 그리고 Aspergillus sp.의 내생균이 가장 많이 존재함을 알 수 있었다.

Crystal Form of Celecoxib: Preparation, Characterization and Dissolution

  • Jin, Mi-Ryung;Sohn, Young-Taek
    • 대한화학회지
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    • 제62권5호
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    • pp.352-357
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    • 2018
  • Celecoxib (4-[5-(4-methylphenyl)-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-1-yl]benzenesulfonamide) is a cyclooxygenase-2 inhibitor used in the treatment of arthritis, acute pain, and dysmenorrhoea. Celecoxib is a Biopharmaceutics Classification System (BCS) class II compound whose oral bioavailability is highly limited owing to its poor aqueous solubility. Several polymorphs of celecoxib have been identified as Form I, Form II, and Form III with melting points of about $162.8^{\circ}C$, $161.5^{\circ}C$, and $160.8^{\circ}C$, respectively. Form IV was generated from the precipitated suspension in the presence of HPMC (Hydroxypropyl methylcellulose) and Polysorbate 80. A rapid rate of dissolution is useful because the rate of dissolution of a drug typically increases its bioavailability. The aim of this study was to investigate the possibility of production of new crystal form of celecoxib that has higher solubility than Form III. New crystal form of celecoxib (Form A) has been isolated by recrystallization and characterized by differential scanning calorimetry (DSC), thermogravimetric (TG) analysis and powder X-ray diffractometry (PXRD). Form A was dissolved faster than Form III. At 30 minutes, the dissolution of Form A was 97.3%, whereas the dissolution of Form III was 82.2% (p < 0.1). After storage of three months at $20^{\circ}C$, in 24% RH (Relative Humidity), the crystal form was not transformed.

Phylogeographic Messages Encoded in the rDNA of the Commercial Mushroom Zhenghonggu@ From Fujian, China

  • Chen, Yu H.;Chen, Peng D.;Chen, Liu Y.;Ma, Li Z.
    • 한국균학회소식:학술대회논문집
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    • 한국균학회 2014년도 춘계학술대회 및 임시총회
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    • pp.45-45
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    • 2014
  • Individualities of precious health mushroom called Zhenghonggu@ from respective protections scattered among all main mountains of Fujian China were collected and recognized locally, then compared with Russula griseocarnosa. Their internal transcribed spacer (ITS) region (ITS1, ITS2 and 5.8S rDNA) of the nuclear rDNA were amplified, AMOVA analyzed, nested clade analyzed and then compared with the ITS sequences of relative Russula species from other regions of China to confirm the taxonomic status of Zhenghonggu$^@$ and its population structure. Total 23 haplotypes from different protections of Fujian can be clustered into three clades similar to the three lineages of Dahongjun$^@$ from southeastern China reported by Li et al. The geographic distribution characteristic of these three phylogeny clades may be closely coupled with the vegetation regionalization and/or the differences of coenosium construction of Fagaceae that is the host of Russula griseocarnosa. The correlation of taxonomy, phylogeny and geographical distribution of Russula are discussed.

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사회자본이 경제적 성과와 비경제적 성과에 미치는 영향: 사회자본 차원들의 인과관계를 고려한 접근 (The Effects of Social Capital on the Economic and Noneconomic Performance: Considering the Causal Relationship of Dimensions of Social Capital)

  • 배상욱;윤한성
    • 한국유통학회지:유통연구
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    • 제15권1호
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    • pp.73-101
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    • 2010
  • 본 연구는 유대강도, 공유된 목표, 신뢰와 같은 사회자본이 경제적 성과와 비경제적 성과인 관계지속의도에 미치는 영향에 대하여 부산지역 프랜차이즈 가맹점을 대상으로 공변량 구조방정식모형을 통하여 실증분석하였다. 그 결과 첫째, 유대강도는 관계지속의도에 직접적인 영향을 미치지는 못하지만 신뢰와 경제적 성과를 매개로 간접적으로 긍정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다. 둘째, 공유된 가치는 관계지속의도에 직접적인 영향은 물론 신뢰를 매개로 간접적으로 긍정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다. 하지만 공유된 목표가 경제적 성과를 매개로 하여 관계지속의도에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 마지막으로 이러한 결과들을 토대로 본 연구의 이론적 실무적 시사점을 제시하였다.

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한국산 괭이밥속(Oxalis) 식물 ITS DNA 염기서열 분석 (Analysis of ITS DNA Sequences of Korean Oxalis Species (Oxalidaceae))

  • 구자춘;채미숙;이종기;황성수
    • 식물분류학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.419-430
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    • 2007
  • 본 연구는 한국산 괭이밥 4분류군과 도입종 1분류군의 9개체를 대상으로 핵 리보솜 DNA인 5.8S, ITS1 그리고 ITS2 지역 염기서열의 분류학적 특정을 알아보기 위해 수행되었다. 군외군으로 GenBank에 축적되어 있는 16분류군의 동일지역 염기서열도 같이 정렬하여 사용하였다. 정렬 된 ITS 구간의 염기서열 길이는 679 bp 이었다. 분류군 별 유사도 및 염기서열 분기와 계통학적 및 통계학적인 분석 등의 결과는 염기서열 특징이 본 속의 분류에 유용한 것으로 나타났다. 유경종간 및 무경종간에 염기서열 유사도는 95%와 89%로 높게 나타나는 반면, 유경종과 무경종 사이는 64~69%로 비교적 낮게 나타난다. 염기서열 분기에서도 유경종과 무경종간에는 0.36~0.42로 높게 나타나며, 유경종과 유경종 또는 무경종과 무경종간에는 0.04~0.06으로 낮게 나타났다. 계통학적으로 유경종과 무경종 집단은 병계원으로 나타났으며, 두 집단은 각각 신빙성이 높은 단일 계통군을 형성한다. 정렬된 염기서열은 통계학적으로 유의성이 있으며, Duncan 사후검정에서 자주괭이밥은 한국산 분류군들에서 분리되었다.

Fungal Endophytes from Three Cultivars of Panax ginseng Meyer Cultivated in Korea

  • Park, Sang-Un;Lim, Hyoun-Sub;Park, Kee-Choon;Park, Young-Hwan;Bae, Han-Hong
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제36권1호
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    • pp.107-113
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    • 2012
  • In order to investigate the diversity of endophytes, fungal endophytes in Panax ginseng Meyer cultivated in Korea were isolated and identified using internal transcribed spacer (ITS) sequences of ribosomal DNA. Three cultivars of 3-year-old ginseng roots (Chunpoong, Yunpoong, and Gumpoong) were used to isolate fungal endophytes. Surface sterilized ginseng roots were placed on potato dextrose agar plates supplemented with ampicilin and streptomycin to inhibit bacterial growth. Overall, 38 fungal endophytes were isolated from 12 ginseng roots. According to the sequence analysis of the ITS1-5.8S-ITS2, 38 fungal isolates were classified into 4 different fungal species, which were Phoma radicina, Fusarium oxysporum, Setophoma terrestris and Ascomycota sp. 2-RNK. The most dominant fungal endophyte was P. radicina in 3 cultivars. The percentage of dominant endophytes of P. radicina was 65.8%. The percentage of colonization frequency of P. radicina was 80%, 52.9%, and 75% in Chunpoong, Yunpoong, and Gumpoong, respectively. The second most dominant fungal endophyte was F. oxysporum. The diversity of the fungal endophytes was low and no ginseng cultivar specificity among endophytes was detected in this study. The identified endophytes can be potential fungi for the production of bioactive compounds and control against ginseng pathogens.