Novel binol-based uryl and guanidinium receptors having higher ring conjugation at the periphery of the hydrogen bonding donor sites have been synthesized and utilized to study the enantioselective recognition of 1,2-aminoalcohols and chirality conversion of natural amino acids via imine bond formation. There is a remarkable decrease in the stereoselectivites as the conjugation increases at the periphery of hydrogen bonding donor sites. The guanidinium-based receptors show more selectivity towards the amino alcohol than that of the uryl based ones due to its charge reinforced hydrogen bonds. The conversion efficiency of L-amino acids to Damino acids by the uryl-based receptors is higher than that of the guanidinium-based ones.
The coupled channel method via the Local Reflection (LORE) matrix is employed to investigate the quantum mechanical behavior of the sticking or adsorption and desorption of hydrogen (H) atom on bilayer graphene via the armchair edge. The sticking and desorption probabilities of H are calculated and are plotted against the initial translational energy of H. The sticking probability plot shows a barrierless reaction indicating that hydrogen is easily adsorbed on the armchair edge of graphene. The desorption probability plot, however, shows that desorption of H from the graphene sheets is an activated process with a barrier height of 4.19 eV suggesting that a strong bond exists between the adsorbed H atom and the edge carbon atom. Thus, temperatures higher than the operating temperatures (300 - 1500 K) of conventional fuel cells are necessary to release the adsorbed H atom from the armchair edge of graphene.
Here we describe the formation of a self-assembled film of thin multiwalled carbon Nanotubes(t-MWNT) modified with hydroxy groups through hydrogen peroxide treatment. Morphologies of t-MWNT films could be controlled by the various coating method, such as filtering, drop casting, spraying method, etc. The results show that on densification of the CNT suspension during drying, multiple hydroxy group-modified MWNTs can be self-assembled through strong surface hydrogen bond interaction while MWNTs usually exist an entangled state in the film. The interaction between t-MWNT was illustrated from Raman spectrum of spray coated films.
Intermolecular interaction between barbiturates and membrane components such as phospholipid and cholesterol were investigated on $^1$H-NMR spectra and infrared spectra. According to previous reports, barbiturates interacted with phospholipid through intermolecular hydrogen bonds. We also investigated thi observation using dipalmitoyl-phosphatidylcholine (DPPC) as phospholipid in deuterochloroform, and characterized quantitatively. Also, the observed drug could interact with cholesterol which is one of the major components of biomembranes through hydrogen bonds. It was the carbonyl groups of barbiturate and the hydroxyl group of cholesterol that formed hydrogen bond complex. In addition to spectroscopic studies, we investigated the direct effect of phenobarbital on lipid multibilayer vesicles, whose compositions were varied, by calorimetric method. Phenobarbital caused a reduction in the temperature of phase transition of vesicles. These studies may provided a basis for interpreting the mode of action of barbiturates.
Although the reversibility of 10,12-pentacosadiynoic amino meta-acid(PCDA-mBzA) against temperature and pH was reported, the modulation of reversibility by ion adsorption at terminal functional group has not been investigated. In this work, we developed a simple method for modulating the reversibility of PCDA-mBzA films upon a thermal stimulus by cadmium ion adsorption inducing the breakage of the outer hydrogen bonding of two hydrogen bonds, which are responsible for the reversible properties of PCDA-mBzA. External reflection-Fourier transform infrared (ER-FTIR) analyses revealed that the hydrogen bonding between the carboxylic acid groups was broken through ion adsorption and only a single hydrogen bond between the amide groups remained in the PCDA-mBzA polymer. In addition, PCDA-mBzA films could recover their original property through cadmium ion desorption. These results present that the transition between reversibility and irreversibility can be modulated artificially simply through the adsorption and desorption of metal ions.
In order to explore structural features of minoxidil analogs with a view of enhancing lysyl hydroxylase (LH) inhibitory activity, molecular holographic QSAR (HQSAR) and CoMSIA (comparative molecular similarity indices analysis) were performed. The results from the atomic contributions with optimized the HQSAR 6-2 model indicated that, in case of pyrimidine-1-N-oxide substituent, C2 atom of pyrimidine ring and C'3-C'4 bond of 4-piperidinol group showed the highest impact on the inhibitory activity towards LH enzyme. It was also evident from the information of the optimized CoMSIA F5 model that the inhibitory activity mainly depended on the hydrophobic field contribution (36%) and the hydrogen bond (H-bond) field contribution (49.2%) of substrate molecule. Particularly, it is predicted that the functional groups which disfavor H-bond acceptors in large space around the piperidinol group and also the functional groups which favor the H-bond acceptors at C'4 (& C'5) atom in $R_5$ group play a role for increased inhibitory activity. With this in mind, it is likely that a novel candidate having more improved inhibitory activity on hair growth could be designed in the future.
$AlPO_4-5$ 분자체의 가교 OH 그룹에 대한 성질을 $AlPO_4-5$ 분자체의 구조 특성인 Al-O(P-O) 결합길이와 Al-O-P 결합각에 대한 관계를 알아보기 위하여 가교 $(OH)_3AlOP(OH)_3$ 와 $(OH)_3AlOHP(OH)_3^+$ 덩어리를 이용하여 반경험적 MNDO 계산 방법으로 연구하였다. 가교 OH 그룹의 O-H 결합해리에너지는 Al-O(P-O) 결합길이가 증가할수록, Al-O-P 결합각이 감소할수록 알 수 있었고, 가교 OH 그룹 생성은 Al-O(P-O) 결합길이가 길고, Al-O-P 결합각이 작은 가교 산소원자에서 형성된다는 것을 알았다. 또한 Al-O-P 결합각이 증가할수록 가교 산소원자의 음의 알짜전하는 증가하나 가교 수소원자의 양의 알짜전하는 감소함을 알았다.
Thiourea derivative인 $N-({\alpha}-dimethyl\;{\beta}-hydroxy)ethyl\;N'-cyclohexyl\;thiourea,\;C_{ll}H_{22}N_2OS)$의 결정 및 분자구조를 X-선 회절법으로 해명하였다. 이 화합물의 결정은 공간군 $P_{bca}$에 속하는 orthorhombic 형으로 a = 10.33(3), b = 11.82(3), c = 22.57(4)${\AA}$ 이고 Z = 8이다. Weissenberg 사진촬영으로 얻은 회절반점의 총수는 1414개이며 중원자법을 이용하여 구조해명을 한 후 최소자승법으로 정밀화하였으며 최종 R값은 0.13이다. Cyclohexane ring은 normal chair conformation을, thiourea 부분은 평면을 이루고 있다. 일차 알코올의 hydroxyl group은 N(2)원자와 분자내 수소결합을 이뤄서 전체분자를 안정화시키고 있다. 분자들은 결정내에서 수소결합과 van der Waals힘으로 서로 결합되어 있다. 분자내 수소결합 N(2)-H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O는 강한 수소결합으로 N${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O 길이는 2.71${\AA}$이고, 분자간 수소결합 O${\cdot}{\cdot}{\cdot}$H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$S의 O${\cdot}{\cdot}{\cdot}$S 길이는 3.02${\AA}$으로 b축에 나란하다.
캘릭스[n]아렌 (1-4)의 다양한 이형체들에 대한 구조들이 DFT B3LYP/6-31+G(d,p) 와 mPW1PW91/ 6-31+G(d,p) (hybrid HF-DF) 계산 방법들에 의하여 최적화 되었다. 모든 캘릭스[n]아렌 (1-4)의 다양한 이형체들 중에서, 수소결합들의 영향으로, cone 이형체가 가장 안정하였다. 그러나, 이형체들의 상대적인 안정성은 다음과 같이 서로 달랐다. 1. t-부틸캘릭스[4]아렌(1): cone > partial-cone > 1,2-alternate > 1,3-alternate. 2. t-부틸캘릭스[5]아렌(2): cone > 1,2-alternate > partial-cone > 1,3-alternate. 3. 탈부틸화된 캘릭스[6]아렌(3): cone(pinched) > partial-cone > cone(winged) ~ 1,2-alternate - 1,2,3-alternate > 1,4-alternate > 1,3-alternate > 1,3,5-alternate. 4. t-부틸캘릭스[6]아렌(4): cone(pinched) > 1,2-alternate > cone(winged) > 1,4-alternate - partial-cone > 1,2,3-alternate > 1,3,5-alternate > 1,3-alternate. 분자 내부의 수소결합의 개수와 강도들이 캘릭스[n]아렌의 다양한 이형체들의 상대적인 안정성에 가장 영향을 많이 미치는 인자들이었다. 두 가지 서로 다른 계산방법들 (B3LYP과 mPW1PW91)에 대한 여러 가지 이형체들에서의 수소결합 길이들이 비교되었다.
알킬알코올의 OH 신축진동 영역에서의 적외선 스펙트라를 $CCl_4$용액내에서 농도를 변화시켜가면서 얻었다. OH신축진동 흡수띠는 수소결합의 형성으로 넓게 낮은 파수영역으로 이동된다. 이러한 띠들을 simplex법을 이용한 컴퓨터프로그램으로 분해하여 3개의 띠를 얻었으며, 각 띠들을 여러가지 형태로 수소결합을 하고 있는 OH기로 구분하였다. 또한 dimer혹은 trimer로 수소결합하고 있는 알코올구조들의 전자구조와 상호작용 에너지를 반경험적 분자궤도 함수법(CNDO/2, INDO)으로 계산하였다. 이들 계산결과는 분해된 적외선 스펙트라의 결과와 잘 일치하였다. 수소결합 형성에 대한 알킬기의 전자구조 효과는 부틸>프로필>에틸>메틸기의 순이었으나, 실험결과에서는 프로필>에틸>부틸>메틸기의 순으로 나타났다. 이것은 부탄올의 벌키성때문인 것으로 생각한다. 제외하고는 모두 증가하였다. 제올라이트에 있는 양이온을 떼어내는데 필요한 에너지는 $H^+\;>\;Li^+\;>\;Na^+$의 순이었으며, 이것은 제올라이트의 골격으로부터 양이온으로 이동되는 전하의 양과 관계가 있다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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