Nicotinic acid 결핍시 메추리는 심각한 체중의 감소를 보였으며, 심장 및 간의 무게도 약간 감소하였다. 포도당의 농도는 현저하게 증가하였으나 콜레스테롤, 알부민 그리고 총 단백질 양의 변화는 없었다. Glutamic oxaloacetate iransaminase 와 glutamic pyruvate transaminase의 활성은 증가하였으나 alkaline phosphatase와 LDH의 활성은 변화가 없었다. 혈청속의 아미노산중 tryptophan, tyrosine, aspartic acid, glutamic acid 등의 농도는 감소하였으나, arginine, histidine, lysine 등은 변화가 없었다.
산업용 균주인 Pichia pastoris에서 재조합 발현된 당화된 인간유래 MINPP (multiple inositol polyphosphate phosphatase) 효소는 기질 피틴태인(InsP6)에 대한 파이테이즈 효소활성을 나타내었고 탈당화시 그 효소활성이 30% 감소되었다. 그 효소의 기질 $InsP_6$에 대한 최적 pH 활성은 중성범위인 pH 7.4였다. 기질특이성 측면에서 인간 MINPP 효소는 para-nitrophenylphosphate (pNPP), ATP, ribose-1-phosphate (R-1-P)와 같은 유기인산화합물(organic phosphate conjugates)의 분해활성은 매우 낮은 대신, 기질 $InsP_6$를 효과적으로 분해하였고 특히 화학적 자극제인(chemical stimulator)인 1 mM 2-phosphoglycolate (2-PG)의 첨가에 따른 기질 2,3-bisphosphoglycerate (2,3-BPG)에 대한 효소활성이 2-PG를 첨가하지 않을때 보다 1.2배 증가되었지만 기질 $InsP_6$에 대한 효소활성에는 영향을 주지 않았다. 또한 2 mM $Mg^{2+}$ 이온과 100 mM $Cl^-$ 이온의 첨가는 MINPP 효소의 기질 2,3-BPG에 대한 효소활성에 역시 영향을 주지 않았다.
솔잎혹파리 (Thecodiplosis japonensis Uchi. et Inouye)의 충영속 유충과 충영을 탈출하여 낙하한 토중의 유충을 대상으로 체액을 분석, 측정코저 종이 크로마토그라피법, micro-Kjeldahl법, 박층 크로카토그라피 법, 왈부르그 검압계법, Bessey-Lowry법과 Reitman-Frankel법으로 측정 또는 분석하였다. 충영과 유충과 토중의 유충에 따라 유리 아미노산, 총 질소함량의 변화, 탄수화물의 변화, 지질의 종류와 변화, 호흡능, phosphatase, GOT, ?의 활성도가 측정되었다. 유리 아미노산, 총 질소함량, 지질함량, 호흡능, acid phosphatase의 황성, GPT의 활성은 충영속의 유충에서 토중의 유충으로 진행함에 따라 감소하는 경향을 나타냈다. 그러나 trehalose의 함량과 alkaline phosphatase의 활성은 증가하는 경향을 나타냈다.
진핵세포 유전자의 기초대사발현의 조절계를 밝히기 위한 일환으로, 효모의 histidine생합성계 효소의 구조유전자 HIS5를 이용하였다. HIS5 유전자는 충분한 아미노산 조건하에서는 발현이 억제되어 비교적 높은 기초발현만을 하나, 어떤 아미노산이 결핍되면 탈억제되어 높은 발현량을 보이며 탈억제는 cis의 작용인자인 promoter상의 5'-TGACTC-3' 및 trans 작용인자 GCN4와 GCD17 GCN2등이 관여한다. trans 작용인자들에 의한 HIS5 유전자의 발현량의 변화를 간단하게 측정하기 위하여, HIS5 promoter와 repressible acid phoshates(APase)의 구조유전자중 promoter를 제거한 DNA단편을 연결시켜 HIS5-PHO5 융합유전자를 이용하였다. gcn2 및 gcn4 변이주의 APase 활성은 야생주와 비교하여 3내지 4배 낮았으며, gcn2변이주와 gcn2 gcn4 이중변이주의 APase 활성은 유사하였다.
Shao, Na;Huang, Huoqing;Meng, Kun;Luo, Huiying;Wang, Yaru;Yang, Peilong;Yao, Bin
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제18권7호
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pp.1221-1226
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2008
The soft rot bacterium Pectobacterium wasabiae is an economically important pathogen of many crops. A new phytase gene, appA, was cloned from P. wasabiae by degenerate PCR and TAIL-PCR. The open reading frame of appA consisted of 1,302 bp encoding 433 amino acid residues, including 27 residues of a putative signal peptide. The mature protein had a molecular mass of 45 kDa and a theoretical pI of 5.5. The amino acid sequence contained the conserved active site residues RHGXRXP and HDTN of typical histidine acid phosphatases, and showed the highest identity of 48.5% to PhyM from Pseudomonas syringae. The gene fragment encoding the mature phytase was expressed in Escherichia coli BL21 (DE3), and the purified recombinant phytase had a specific activity of 1,072$\pm$47 U/mg for phytate substrate. The optimum pH and temperature for the purified phytase were pH 5.0 and 50$^{\circ}C$, respectively. The $K_m$ value was 0.17 mM, with a $V_{max}$ of 1,714 $\mu$mol/min/mg. This is the first report of the identification and isolation of phytase from Pectobacterium.
A phytase gene was identified in a publicly available metagenome derived from subsurface groundwater, which was deduced to encode for a protein of the histidine acid phosphatase (HAP) family. The nucleotide sequence of the phytase gene was chemically synthesized and cloned, in order to further overexpress the phytase in Escherichia coli. Purified protein of the recombinant phytase demonstrated an activity for phytic acid of 298 ± 17 µmol P/min/mg, at the pH optimum of 2.0 with the temperature of 37℃. Interestingly, the pH optimum of this phytase is much lower in comparison with most HAP phytases known to date. It suggests that the phytase could possess improved adaptability to the low pH condition caused by the gastric acid in livestock and poultry stomachs.
Phytases are enzymes that can hydrolyze phytate and its salts into inositol and phosphoric acid, and have been utilized to increase the availability of nutrients in animal feed and mitigate environmental pollution. However, the enzymes' low thermostability has limited their application during the feed palletization process. In this study, a combination of B-value calculation and protein surface engineering was applied to rationally evolve the heat stability of Escherichia coli phytase. After systematic alignment and mining for homologs of the original phytase from the histidine acid phosphatase family, the two models 1DKL and 1DKQ were chosen and used to identify the B-values and spatial distribution of key amino acid residues. Consequently, thirteen potential amino acid mutation sites were obtained and categorized into six domains to construct mutant libraries. After five rounds of iterative mutation screening, the thermophilic phytase mutant P56214 was finally yielded. Compared with the wild-type, the residual enzyme activity of the mutant increased from 20% to 75% after incubation at $90^{\circ}C$ for 5 min. Compared with traditional methods, the rational engineering approach used in this study reduces the screening workload and provides a reference for future applications of phytases as green catalysts.
토양으로부터 phytate 분해능이 뛰어난 phytate를 생산하는 균주를 분리 동정한 결과 Escherichia coli로 동정되었고, E. coli WC7으로 명명하였다. 이 균주가 생산하는 phytase를 ammonium sulfate 침전, Phenyl-Sepharose, DEAE-Sepharose, CM-Sepharose, Resoure S, Mono S 컬럼 크로마토그래피를 이용한 분리정제를 수행하여 정제도 1,250 배, 수율 30%로 정제하였고 640 Unit/mg의 비활성을 얻었다. 또한 정제된 phytase는 SDS-PAGE에서 분자량 45kDa인 단일 subunit로 이루어진 단일효소임을 확인하였다. E. coli WC7 phytase의 최적 pH는 5.0, 최적 온도는 $60^{\circ}C$였으며, pH 2.0-12까지 안정하였다. 열안정성에서는 $60^{\circ}C$이상에서 급격한 활성의 감소를 보여 초기 활성의 20% 활성만을 나타내었다. Phytase의 N-말단 아미노산 서열은 Ser-Glu-Pro-Clu-Leu-Lys-Leu-Glu-Ser-Val-Val이었으며 이는 E. coli 유래의 pH 2.5 acid phosphatase와 아주 큰 유사성을 보였다. S. coli WC7 phytase의 유전자를 확보하기 위해 E. coli acid phosphatase의 DNA sequence를 바탕으로 한 primer들을 이용하여 PCR 클로닝을 수행하였으며 증폭된 PCR fragment를 pUC19 벡터에 클로닝 하고 DNA 염기서열을 결정하였다. 그 결과 1.2 kbp의 WC7 phytase 유전자의 ORF를 확인하였으며 432개의 아미노산으로 이루어진 분자량 44,716 Da의 단백질을 확인 할 수 있었다. 대부분의 acid phosphatase 효소들의 active site라고 추정되는 active site motif인 RHGXRXP가 N-terminal 쪽에 존재하고 있었다. pUEP를 이용하여 E. coli XL1-Blue에서 phytase를 발현시켰을 때 효소의 생산량이 17.5 U/ml로서 원균주의 23배 활성을 가졌으며,효소의 비활성 및 pH 안정성 측면에서 높은 산업적 이용가능성을 볼 때 사료첨가제 효소로의 개발을 기대할 수 있을 것이라 판단된다.
Environmental microorganisms are emerging as an important source of new enzymes for wide-scale industrial application. In this study, novel phytase genes were identified from a soil microbial community. For this, a function-based screening approach was utilized for the identification of phytase activity in a metagenomic library derived from an agricultural soil. Two novel phytases were identified. Interestingly, one of these phytases is an unusual histidine acid phosphatase family phytase, as the conserved motif of the active site of PhyX possesses an additional amino acid residue. The second phytase belongs to a new type, which is encoded by multiple open reading frames (ORFs) and is different to all phytases known to date, which are encoded by a single ORF.
The pyruvate dehydrogenase complex (PDC) catalyzes the oxidative decarboxylation of pyruvate with the formation of $CO_2$, acetyl-CoA, NADH, and H+. This complex contains multiple copies of three catalytic components including pyruvate dehydrogenase(E1), dihydrolipoamide acetyltransferase(E2), and dihydrolipoamide dehydrogenase (E3). Two regulatory components (E1-kinase and phospho-E1 phosphatase) and functionally less-understood protein (protein X, E3BP) are also involved in the formation of the complex. In this study, cloning and characterization of a gene for human E3BP have been carried out. A cDNA encoding the human E3BP was isolated by database search and cDNA library screening. The primary structure of E3BP has some similar characteristics with that of E2 in the lipoyl domain and the carboxyl-terminal domain, based on the nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence. However, the conserved amino acid moiety including the histidine residue for acetyltransferase activity in E2 is not conserved in the case of human E3BP. The human E3BP was expressed and purified in E. coli. The molecular weight of the protein, excluding the mitochondrial target sequence, was about 50 kDa as determined by SDS-PAGE. Cloning of human E3BP and expression of the recombinant E3BP will facilitate the understanding of the role(s) of E3BP in mammalian PDC.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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