• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제10권6호
• /
• pp.823-828
• /
• 2000

The complete nucleotide sequence of hepatitis B virus DNA isolated from Korean patient serum was determined and characterized, and its phylogenetic relation was then investigated. The viral genome was 3,215 base pairs long and included four well known open reading frames (i.e. surface antigens, core antigens, X protein and DNA polymerase). The sequence of the surface antigen showed that the HBV genome under investigation, designated HBV 315, was characteristic of subtype adr. A phylogenetic analysis using the total genome sequence revealed that HBV315 was grouped into genomic group C together with isolates from Japan, China, Thailand, Polynesia, and New Caledonia. The mean percent similarity between HBV315 and other HBV isolates in genomic group C was 97.25%, and that with other genomic groups ranged from 86.16% to 91.25%. The predicted amino acid sequences of HBV315 were compared with two closely related subtype adr isolates, M38636 and D12980. The results showed that the X gene product was identical in the three strains, while there were significant amino acid sequence differences between HBV315 and M38636 in the Pre-S1 and Pre-S2 regions.

• Biomolecules & Therapeutics
• /
• 제6권2호
• /
• pp.139-144
• /
• 1998

Abstract -Phyllanthus ussuriensis which belongs to Euphorbiaceae has been used as a component of Korean traditional remedy against hepatitis and jaundice. Aqueous methanolic extract of P. ussuriensis was tested for antiviral activity of hepatitis B virus (HBV) in HepG2 2.2.15 cells which were derived through transfection of cloned HBV DNA into HepG2 human hrpatoblastoma cells. P. ussuriensis extract decreased the levels of extracellular HBV virion DNA and inhibited HBV replication at concentrations ranging from 50 to 500$\mu$g/ml. Partitioning of water suspension of the extract revealed that the activity mainly resides in the EtOAc fraction. Consecutive purification of the EtOAc fraction by silica-gel column chromatography resulted in the two active anti-HBV fractions. Southern blot analysis shows that the action mechanisms or active site of the two fractions seems to be different in terms of their inhibition of HBV replication steps.

• 한국동물학회지
• /
• 제28권3호
• /
• pp.166-178
• /
• 1985

한국형 B형 간염바이러스(HBV) DNA의 표면항원 유전자를 포유동물 세포에서 발현시켜 항원의 검출과 유전자의 분자유전학적인 연구를 하기 위하여 pre-surface antigen 지역과 표면항원 유전자 그리고 poly(A) addition site가 포함된 DNA 조각을 simian virus 40(SV 40)의 DNA 복제 원점과 promoter가 포함된 유전자 운반체에 재조함 시켰다. 우선, HBV DNA가 들어있는 pHBV 107을 Bam HI으로 부분절단한뒤 self-ligation시켜 두 HBV DNA가 같은 방향으로 들어간 pHBVD 107을 만들었다. 이 plasmid를 Bgl II로 절단하였을때 pre-surface지역과 표면항원 유전자 그리고 poly(A) addition site가 함께 포함된 2.7 kb의 insert DNA 조각을 얻었다. 유전자 운반체로는 포유동물세포에서 복제할 수 있도록 하기 위하여 SV40의 DNA 복제 원점부위와 72 bp repeats(enhancer)가 포함된 pSVOE를 만든다음 이 vector의 Pvu II 절단자리에 Bam HI linker를 붙여 insert DNA가 vector의 SV40 late promoter지역 가까이에 들어갈 수 있도록 변형시킨 pSVOB를 만들었다. 이상과 같이 만들어진 pre-surface 지역-표면항원유전자-poly(A)-addition site가 포함된 2.7 kb DNA 절편을 pSVOB promoter 뒤의 Bam HI site에 삽입하여 재조합된 plasmid pSVBS를 얻었다. 예비실험으로 pSVBS를 T-antigen이 생산되는 COS cell에 이주시켰더니 $HB_sAg$가 발현됨을 보았다.

• Animal cells and systems
• /
• 제5권3호
• /
• pp.195-198
• /
• 2001

Hepatitis B virus (HBV) polymerase, which possesses the activities of terminal binding, DNA polymerase, reverse transcriptase and RNaseH, has been shown to accomplish viral DNA replication through a pregenomic intermediate. Because the HBV polymerase has not been purified, the expression of HBV polymerase was examined in an E. coli expression system that is under the regulation of arabinose operon. The expressed individual domain containing terminal binding protein, polymerase, or RNaseH turned out to be insoluble. The activities of those domains were not able to be recovered by denaturation and renaturation using urea or guanidine-HCI. The expressed reverse transcriptase containing the polymerase and RNaseH domains became extensively degraded, whereas the proteolysis was reduced in a Ion- mutant. These results indicate that Lon protease proteolyzes the HBV reverse transcriptase expressed in E. coli.

• 약학회지
• /
• 제43권4호
• /
• pp.458-463
• /
• 1999

This study was undertaken to test for antiviral activity of the aqueous extracts prepared from 4 medicinal plants of Korea (Terminalia chebula, Sanguisorba officinalia, Rubus coreanus, Rheum palmatum). Aqueous extracts were assayed for the inhibition of hepatitis B virus (HBV) replication by measurement of HBV DNA and surface antigen (HBsAg) levels in the extracellular medium of HepG2 2.2.15 cells. All extracts decreased the levels of extracellular HBV virion DNA at concentrations ranging from 64 to $128{\;}\mu\textrm{g}/ml$ and inhibited the production of HBsAg dose-dependently. Among the 4 tested plants, Terminalia chebula exhibits the most prominent anti-HBV activities. Our findings suggest that these 4 medicinal plants may have potential to develop as specific anti-HBV drugs in the future.

• BMB Reports
• /
• 제33권2호
• /
• pp.126-132
• /
• 2000

The hepadnaviruses replicate their nucleic acid through a reverse transcription step. The MBP-fused HBV polymerase was expressed in E. coli and purified by using amylase affinity column chromatography. The purified protein represented DNA-dependent DNA polymerase activity. In this report, the MBP-HBV polymerase was shown to lack 3'$\rightarrow$5' exonuclease activity, like other retroviral RTs. The ratio of the insertion efficiency for the wrong versus right vase pairs indicates the misinsertion frequency (f). The nucleotide insertion fidelity (1/f), observed with the MBP-HBV polymerase and HIV-1 RT, was between 60 and 54,000, and between 50 and 73,000, respectively, showing that they are in close range. A relatively efficient nucleotide incorporation by the MBP-HBV polymerase was observed with a specificity of three groups: (1) A : T, T : A>C : G, G : C (matched pairs), (2) A : C, C : A>G: T, T : G (purine-pyrimidine and pyrimidine-purine mispairs), and (3) C : C, A : A, G : G, T : T>T : C, C : T>A : G, G : A (purine-purine or pyrimidine-pyrimidine mispairs), and their order is (1)>(2)>(3). The data from the nucleotide insertion fidelity by the MBP-HBV polymerase suggest that the HBV polymerase may be as error-prone as HIV-1 RT.

• BMB Reports
• /
• 제37권5호
• /
• pp.546-551
• /
• 2004

The increasing pace of development in molecular biology during the last decade has had a direct effect on mass testing and diagnostic applications, including blood screening. We report the model Microarray that has been developed for Hepatitis B virus (HBV) and Hepatitis D virus (HDV) detection. The specific primer pairs of PCR were designed using the Primer Premier 5.00 program according to the conserved regions of HBV and HDV. PCR fragments were purified and cloned into pMD18-T vectors. The recombinant plasmids were extracted from positive clones and the target gene fragments were sequenced. The DNA microarray was prepared by robotically spotting PCR products onto the surface of glass slides. Sequences were aligned, and the results obtained showed that the products of PCR amplification were the required specific gene fragments of HBV, and HDV. Samples were labeled by Restriction Display PCR (RD-PCR). Gene chip hybridizing signals showed that the specificity and sensitivity required for HBV and HDV detection were satisfied. Using PCR amplified products to construct gene chips for the simultaneous clinical diagnosis of HBV and HDV resulted in a quick, simple, and effective method. We conclude that the DNA microarray assay system might be useful as a diagnostic technique in the clinical laboratory. Further applications of RD-PCR for the sample labeling could speed up microarray multi-virus detection.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
• /
• 제6권2호
• /
• pp.140-151
• /
• 2003

목 적: 소아 만성 B형간염의 치료제로 interferonalpha(IFN)가 널리 이용되어 왔으며 약 30~40%에서 치료효과가 나타나는 것으로 보고되어 왔다. 그러나 우리나라에서 소아를 대상으로 IFN 치료를 시행한 후 장기 추적관찰을 통한 연구는 충분히 이루어지지 않은 상태로, 본 연구에서는 소아 만성 B형간염에서의 IFN 치료 효과와 그에 영향을 미치는 요인들을 장기 추적하여 분석하고자 하였다. 방 법: 1982년 5월부터 2002년 7월까지 약 20년 동안 연세의대 세브란스병원 소아과에 내원하여 HBsAg, HBeAg 및 HBV-DNA가 6개월 이상 양성 소견을 보여 만성 B형간염으로 진단받은 환아 378 명 중 IFN 치료를 시행받은 113명을 대상으로 하였으며, 남녀 비는 2.3 : 1이었고, 진단 당시의 평균 연령은 $11.1{\pm}4.1$세이었다. IFN은 300만 unit를 주 3회 근육 주사하였으며, 주기적으로 외래에서 B형 간염 표지자와 간기능검사를 시행하였다. 치료받은 환아는 4~114개월($48.1{\pm}33.4$개월) 동안 추적 관찰하였으며, IFN 치료 후 재발한 경우는 lamivudine 또는 IFN 재치료를 시행하였다. 결 과: IFN 치료에 대한 반응은 HBeAg과 HBV-DNA의 음전 및 ALT값의 정상화로 정의하였으며 반응군은 82례(72.6%), 비반응군은 32례(28.3%)로 두 군 간에 임상적으로 유의한 차이는 없었다. IFN 치료 후 HBeAg은 총 113례 중 87례(77%)에서 음전 되었고, anti-HBe는 79례(70%)에서 양전, HBV-DNA는 84례(74.3%)에서 음전되었다. HBeAg, HBV-DNA 모두 음전 된 환아는 82례(72.6%), HBV-DNA 만 음전된 환아는 2례(1.8%)였으며, HBeAg만 음전된 환아는 5례(4.4%)였다. HBsAg은 6례(5.3%)에서 음전, anti-HBs는 11례(9.7%)에서 양전되었다. ALT 값은 91례(80.5)에서 정상화되었다. IFN 치료 후 HBeAg 및 anti-HBe, HBV-DNA, HBsAg 및 anti-HBs의 음전 및 양전이 일어나는 기간을 생명표를 이용하여 통계 분석한 결과 HBeAg의 5년 음전율은 78%, 10년 음전율은 90%로 최고조를 보였으며, anti-HBe는 5년 양전율이 77%, 10년 양전율이 84%로 최고조를 보였다. 또한 치료 후 HBV-DNA의 5년 음전율은 80%였고, 10년 음전율은 88%로 최고조를 이루었다. 또한 HBsAg의 음전율과 anti-HBs 의 양전율은 5년 후 각각 6.7% 및 13%로 최고조를 이룬 후 계속 추적 관찰하는 동안 변화가 없었다. IFN 치료 후 HBeAg의 음전 및 anti-HBe의 양전은 각각 평균 $14.1{\pm}17.0$개월 및 $16.1{\pm}17.7$개월 걸렸고, HBV-DNA의 음전은 평균 $14.2{\pm}14.1$개월이 소요되었다. HBsAg은 단지 5%의 환아에서만 음전되었으며 평균 $14.2{\pm}12.1$개월이 걸렸다. 치료 후 혈청 ALT값이 정상화 되는 데는 평균 $11.1{\pm}14.4$개월이 걸렸다. 시간의 경과에 따른 치료 전 혈청 ALT값, HBV-DNA값, 치료 전 환아의 연령이 B형 간염 표지자의 반응에 미치는 영향을 Cox model로 분석한 결과, 치료 전 ALT값이 높을수록 HBV-DNA가 통계학적으로 가장 의미 있게 음전되었다(p=0.027). HBeAg과 anti-HBe는 통계학적으로 의미는 없었으나 치료 전 혈청 ALT값이 높을수록 음전(p=0.18) 및 양전(p=0.079)이 증가되는 경향을 보였다. 기타 치료 전 혈청 HBV-DNA값과 연령은 B형간염 표지자의 반응에 미치는 영향은 통계학적으로 의미가 없었다. IFN 치료 후 총 82례의 반응군 중 11례(13.4%)에서 재발하였다. 이중 3례에서 lamivudine 치료를 시행하였으며, 2례에서 치료에 반응하였다. 3례에서는 IFN를 재치료하여 이 중 1례에서 치료 효과가 있었으며, 나머지 3례는 특별한 치료 없이 표지자들이 혈청변환(seroconversion)되었다. IFN 치료에 반응을 보이지 않거나 재발된 총 9례에서 lamivudine 치료를 시행하였으며, 이 중 3례(33%)에서 혈청변환이 있었다. 결 론: 소아 만성 B형간염에 대한 IFN의 치료효과를 10년간 장기 추적한 결과 B형간염 표지자의 혈청 변환율이 72.6%로 높은 치료 반응률을 보이고, 또한 재발률이 13.4%로 비교적 낮은 훌륭한 치료제로 확인되었다. 그러나 HBsAg 음전율은 5.3%에 불과하기 때문에 향후 IFN 치료가 소아 만성 B형간염의 간질환 합병증, 간세포암 발생률 및 생존율에 미치는 영향에 대한 장기적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

• 동의생리병리학회지
• /
• 제25권4호
• /
• pp.743-747
• /
• 2011

Here we describe a case of lamivudine and entecavir resistant chronic hepatitis B, treated with western medicine plus traditional korean medicine combination therapy. We administered Injinchunggan-Tang(茵蔯淸肝湯), a traditional Korean herb remedy, with entecavir to a 45-year-old chronic hepatitis B patient who didn't have achieved HBV-DNA suppression, in spite of 18 month lamivudine mono therapy and 14 month entecavir mono therapy. HBV-DNA decreased more than one thousandth from 98,100 IU/mL to 53 IU/mL just in 23 days, and resultingly it seems that the combination therapy could be very potent, at least to some chronic hepatitis B patients.

• 대한임상검사과학회지
• /
• 제38권3호
• /
• pp.196-202
• /
• 2006

최근 만성 B형간염의 치료에 B형간염 바이러스 복제를 저해하여 감염력을 약화시키는 lamivudine이 많이 사용되고 있다. 그러나 이 약제를 장기간 복용할 경우 B형간염 바이러스 DNA polymerase 유전자의 YMDD motif에 아미노산 치환을 일으켜 lamivudine 저항성 B형간염 바이러스가 나타나는 점이 문제시 되고 있다. 본 연구의 목적은 lamivudine 치료를 받은 만성 B형간염 환자에서 PCR-direct sequencing 법을 이용하여 B형간염 바이러스 DNA 중합효소 유전자의 YMDD motif(codon 552)와 codon 528에서 돌연변이 출현빈도를 구하고, HBeAg과의 관련성을 보고자 하였다. 방법은 만성 B형간염 환자의 혈청에서 DNA를 추출하고 DNA 중합효소 유전자의 codon 552와 528을 포함하는 부위에서 선택한 두 쌍의 primer를 이용하여 nested PCR을 실시하였다. 증폭된 PCR 산물은 2% agarose gel에서 전기영동을 한 후, 자동염기서열분석기를 이용하여 sequencing을 실시하였다. 총 207명 중에서 돌연변이는 124명(60%)에서 발견되었으며, 남, 녀에서 차이는 발견되지 않았고, 돌연변이군에서 비돌연변이군에 비해 평균나이가 약간 높게 나타났으나 유의성은 없었다. Codon 552에서 단일돌연변이로는 M552I(50.8%)가 가장 높게 나타났고, 다음으로 M552V(43.5%), M552I/V(5.7%)의 순서로 나타났다. Codon 528에서는 67.0%의 L528M 돌연변이가 발견되었다. Codon 552와 codon 528에서 동시에 발생한 중복돌연변이로는 M552V/L528M(43.6%)이 가장 높게 나타났고, 다음으로 M552I/L528(33.1%) 그리고 M552I/L528M(17.7%)의 순으로 나타났다. Codon 552에서 serine 돌연변이(M528S)는 발견되지 않았으며, L528M은 M552V 돌연변이와 거의 동시에 검출되었다. 본 연구에서 만성 B형간염환자에서 HBeAg의 유무와 lamivudine 돌연변이율과의 상관성은 발견되지 않았으며, PCR-direct sequencing법은 고가의 자동염기서열분석 장비와 숙련된 기술자가 필요하다는 문제점은 있으나, 검체 수가 많은 큰 임상검사실에서는 활용성이 클 것으로 판단된다. 향 후 lamivudine으로 인한 HBV 돌연변이형과 환자의 임상결과의 관련성에 대한 연구가 추가적으로 실시되면, lamivudine을 복용하는 만성 HBV 환자의 치료와 예후에 유용할 것으로 사료된다.