• 제목/요약/키워드: H-NMR spectroscopy

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The Facile and Efficient Synthesis of 8-Chloroadenosine $3^I,5^I$-cyclic monophosphate by phosphorylative cyclization of 8-chloroadenosine and its characterization by$^1 H and 13^C$ NMR spectroscopy

  • Woo, Nam-Tae;Jin, Sun-Yong;Cho, Dae-Jin;Kim, Nam-Sun;Bae, Eun-Hyung;Jung, Jee-Hyung;Ham, Won-Hun;Jung, Young-Hoon
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제20권2호
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    • pp.176-179
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    • 1997
  • Purine nucleosides were chlorinated by the reaction of acyl chloride in DMF with MCPBA under mild conditions with moderate yields. And, satisfactory method for the synthesis of ribonucleoside-$3^{I},5^{I}$-cyclic phosphates and its characterization by$^{1}H$ and $^{13}C$ nmr spectroscopy is described.

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실리카 나노입자 표면에 결합된 아미노기와 Glycidyl Methacrylate의 반응에 관한 분광학적 연구 (Spectroscopic Studies on the Reaction between Amino Groups on Silica Nanoparticle Surface and Glycidyl Methacrylate)

  • 이상미;하기룡
    • 폴리머
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    • 제37권6호
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    • pp.777-783
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    • 2013
  • 본 연구에서는 실리카 나노입자를 dipodal 형태의 bis[3-(trimethoxysilyl)propyl]amine(BTMA) 실란 커플링제로 실리카 표면을 개질한 후, glycidyl methacrylate(GMA)로 표면 처리를 하여 실리카에 결합된 BTMA의 N-H기와 GMA의 epoxide기의 개환 반응에 의하여 실리카 표면에 중합용 methacrylate기를 도입하는 연구를 수행하였다. 반응시간, 반응온도 및 투입하는 GMA의 농도 변화가 BTMA의 N-H기와 GMA의 epoxide기 사이의 반응에 미치는 영향을 Fourier transform infrared spectroscopy(FTIR), elemental analysis(EA) 및 고체상태 $^{13}C$ cross-polarization magic angle spinning(CP/MAS), nuclear magnetic resonance spectroscopy(NMR)법을 사용하여 분석하였다. BTMA로 개질된 실리카를 GMA로 처리하면 실리카 입자에 결합되어 있는 BTMA의 N-H기와 GMA의 epoxide기가 열리면서 상호 반응이 일어났으며, 실험한 조건에서는 반응시간, 반응온도 및 투입하는 GMA 농도가 증가할수록 실리카 표면에 도입되는 methacrylate기가 증가함을 확인하였다.

Constructing Overhauser Dynamic Nuclear Polarization-Nuclear Magnetic Resonance System Using Benchtop Electron Paramagnetic Resonance Spectrometer

  • Saun, Seung-Bo;Kim, JiWon;Han, Oc Hee
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제22권2호
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    • pp.34-39
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    • 2018
  • The Nuclear Magnetic Resonance (NMR) technique using Dynamic Nuclear Polarization (DNP) procedures is one of the promising techniques that enable overcoming low sensitivity problems in NMR spectroscopy. We constructed an ODNP-NMR system using a commercial benchtop EPR spectrometer. The $^1H$ NMR peak area of water in aqueous solutions of 4-hydroxy-TEMPO was enhanced more than 95 times in the ODNP-NMR experiments. Our signal enhancement results were about 55% of the previously reported result. This could be due to non-uniform microwave power over a sample and unwanted sample heating by microwave. However, this portable ODNP-NMR spectrometer will be eventually useful for site-specific detection with nano-scale spatial resolutions and molecular dynamics studies with significantly improved signal sensitivity.

High-pressure NMR application for α-synuclein

  • Kim, Jin Hae
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제26권2호
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    • pp.21-23
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    • 2022
  • High-pressure (HP) NMR is a powerful method to elucidate various structural features of amyloidogenic proteins. Following the previous mini-review recapitulating the HP-NMR application for amyloid-β peptides of the last issue [J. H. Kim, J. Kor. Mag. Reson. Soc. 26, 17 (2022)], the recent advancements in the HP NMR application for α-synuclein (α-Syn) are briefly summarized and discussed here. Although α-Syn is a well-known intrinsically disordered protein (IDP), several studies have shown that it can also exhibit heterogeneous yet partially folded conformations, which may correlate with its amyloid-forming propensity. HP NMR has been a valuable tool for investigating the dynamic and transient structural features of α-Syn and has provided unique insights to appreciate its aggregation-prone characters.

trans-Dichlorobis(diisopropylaniline) palladium(II), trans-$[Pd(NH_2-C_6H_3-2, 6-i-Pr_2)_2Cl_2]$의 합성 및 구조 (Synthesis and Structure of trans-Dichlorobis(diisopropylaniline) palladium(II), trans-$[Pd(NH_2-C_6H_3-2, 6-i-Pr_2)_2Cl_2]$)

  • Hye Jin Kim;Won Seok Han;Soon Won Lee
    • 한국결정학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.137-140
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    • 2001
  • 화합물 PdCl₂(PhC≡N)₂(1) 와 2.6-diisopropylaniline 이 반응하여 trans-[Pd(NH₂-C/sub 6/-H₃-2, 6-i-Pr₂)₂Cl₂] (2)가 합성하였다. 화합물 2의 구조가 분광학적 방법(¹H-NMR, /sup 13/C-NMR, IR) 및 X-ray 회절법으로 규명되었다. 화합물 2의 결정학 자료: 단사정계 공간군 P2₁/n, a=13.532(3)Å, b=5.749(1)Å, c=17.880(4)Å, β=103.84(2)°, Z=2, R(wR₂)=0.0466(0.1226).

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Bacillus subtilis JW-1 균주가 생산하는 bacilysin의 풋마름병 억제 효과 및 특성 (Isolation and characterization of bacilysin against Ralstonia solanacearum from Bacillus subtilis JW-1)

  • 김신덕
    • 미생물학회지
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    • 제54권2호
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    • pp.136-139
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    • 2018
  • 풋마름병 균에 대해 강한 저해활성을 갖는 활성물질 Compound S와 conversion product인 compound S'이 Bacillus subtilis JW-1 배양액에서 일련의 크로마토그래피 방법으로 분리 정제되었고, $^1H$ NMR, $^{13}C$ NMR, $^1H-^1H$ COSY와 HMBC 등의 spectra 분석에 의해 구조가 alanyl-L-${\beta}$-(2,3-epoxycyclohexyl-4-one)alanine와 alanyl-L-${\beta}$-(2,3-dihydroxycyclohexyl-4-one) alanine로 각각 동정되었다. Compound S는 $G^+$, $G^-$ bacteria, yeast와 Candida albicans 등에 대해 광범위한 antimicrobial activity를 나타내며, conversion product의 활성 상실을 통해 intact oxirane ring이 Compound S의 활성에 필수적임이 밝혀졌다.

NMR structural studies on Human CD99 Type I

  • Kim, Hai-Young;Kim, Young-Mee;Joon Shin;Shin, Young-Kee;Park, Seong-Hoe;Lee, Weontae
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 2003년도 정기총회 및 학술발표회
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    • pp.69-69
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    • 2003
  • Human CD99 is a ubiquitous 32-kDa transmembrane protein encoded by the mic2 gene. The major cellular functions of CD99 protein are related to homotypic cell adhension, apoptosis, vesicular protein transport, and differentiation of thymocytes or T cells. Recently it has been reported that expression of a splice variant of CD99 transmembrane protein (Type I and Type II) increases invasive ability of human breast cancer cells. To understand structural basis for cellular functions of CD99 (Type I), we have initiated studies on hCD99$^{TMcytoI}$ and hCD99$^{cytoI}$ using circular dichroism (CD) and multi-dimensional NMR spectroscopy. CD spectrum of hCD99$^{TMcytoI}$ in the presence of 200mM DPC and CHAPS displayed an existence $\alpha$-helical conformation. The solution structure of hCD99$^{cytoI}$ determined by NMR is composed of one N-terminal $\alpha$-helix, $\alpha$A, two C-terminal short $\alpha$-helix segments, $\alpha$B and $\alpha$C. While $\alpha$A and $\alpha$B are connected by the long flexible loop, $\alpha$B and $\alpha$C connected by type III$\beta$-turn. Although it has been rarely figured out the correlation between structure and functional mechanism of hCD99$^{TMcytoI}$ and hCD99$^{cytoI}$, there is possibility of dimerization or oligomerization. In addition, the feasible mechanism of hCD99$^{cytoI}$ is that it could have intramolecular interaction between the N- and C- terminal domain through large flexible AB loop.

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양이온성 $\eta^{3_}$알릴 팔라듐 촉매를 사용한 노보넨/5-비닐-2-노보넨의 비닐 부가 공중합과 이를 이용한 고분자 후반응 (Vinyl Addition Copolymerization of Norbornene/5-Vinyl-2-norbornene with Cationic $\eta^{3_}$-Allyl Palladium Catalyst and Their Post-Reaction)

  • 안재철;박수현;이광희;박기홍
    • 폴리머
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    • 제27권5호
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    • pp.429-435
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    • 2003
  • 양이온η$^3$-알릴 팔라듐 촉매를 사용하여 환상형 올레핀 단량체인 노보넨 (NB)과 5-비닐-2-노보넨(VNB)을 조성별로 비닐 부가 공중합하였다. 공중합체는 고수율과 고분자량 (M$_{w}$ > 760000)으로 얻을 수 있었다. VNB 함량이 많아질수록 공중합체의 분자량과 수득율은 감소하였으며, 첨가한 공단량체의 양과 공중합한 후 함유된 단량체의 양이 비례함을 FT-IR 분광분석으로 확인하였다. $^1$H-NMR 분석 결과 VNB는 exo, endo 이성체 모두 중합에 참여하는 것을 알 수 있었다. NB-VNB 공중합체의 분해 개시 온도는 약 300 $^{\circ}C$이었고, 열안정성은 VNB 함량과 관계없이 유사한 거동을 나타내었다. 합성된 NB-VNB 공중합체의 곁사슬 비닐기는 m-CPBA를 이용하여 에폭시화 하였고, 또한 9-BBN을 이용하여 수산화기를 도입하였다. 조성별 공중합체에 각각의 치환기가 도입된 것은 FT-IR, $^1$H-NMR 분석으로 확인하였다..

에스테르기를 도입한 술폰화 프탈계 폴리이미드와 나프탈렌계 폴리이미드의 수화안정성에 관한 연구 (Hydrolysis Stability of Sulfonated Phthalic and Naphthalenic Polyimide with Ester Bond)

  • 이영무;이창현;손준용;박호범
    • 멤브레인
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    • 제13권2호
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    • pp.110-117
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    • 2003
  • 술폰화 폴리이미드는 클로로알칼리 전기분해, 양이온교환수지 및 연료전지용 고분자진해질막 등과 같은 많은 응용에 있어 유용한 재료로서 연구되어지고 있다. 그러나, 이러한 응용이 이루어지는 과정에 있어서 시간에 따라 연속적인 탈수공정이나 고분자의 분해에 따른 성능 감소 등이 보고되었다. 술폰화 고분자 분해의 주요 원인 중 하나로서 고분자 분자량의 감소 및 고분자 사슬의 절단으로 이끌어지는 가수분해를 들 수 있다. 따라서, 본 연구의 목적은 수화조건 하에서의 $-SO_3$H와 연결된 이미드 사이클과 부가적인 에스테르 결합의 분해를 조사하는 데 있다. 사슬의 분리에 대해 가능한 정확한 정보를 얻고 이를 확인하기 위해서는 $^1H$$^{13}C$ NMR, FT-IR 분석을 이용했으며, 또한 보다 편리한 분석을 위해서 model compound를 사용하여 실험을 수행하였다. 결과적으로, 술폰화 폴리이미드의 수화안정성을 평가하기 위해서 프탈계 및 나프탈렌계 이미드 고리와 에스테르 결합을 갖는 model compound를 합성하였고, 제조된 model compound를 이용하여 $80^{\circ}C$ 초순수 하에서 aging 실험을 수행하였고, lyophilization technique을 사용하여 반응을 중지시켰다. Aging된 product는 NMR, FT-IR spectroscopy를 이용하여 분석하였다.

Electrochemical and Spectroscopic Studies on the Interaction between DNA and the Product of Enzyme-catalyzed Reaction of OPD-H2O2-HRP

  • Niu, S.Y.;Zhang, S.S.;Ma, L.B.;Jiao, K.
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권6호
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    • pp.829-832
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    • 2004
  • The pure product of 2,3-diaminophenazine was prepared by the enzyme-catalyzed reaction of ophenylenediamine-$H_2O_2$-horseradish peroxidase and characterized by UV/Vis spectroscopy, IR spectroscopy and NMR spectroscopy. The electrochemical behaviour of 2,3-diaminophenazine on the glassy carbon electrode was studied. The interaction between 2,3-diaminophenazine and deoxyribonucleic acid was studied by cyclic voltammetry method and UV/Vis spectroscopy, which indicated that the interaction between them is intercalation. The influence of reacting time was also studied. The binding ratio of the 2,3-diaminophenazine-DNA complex is calculated to be 1 : 2 and the binding constant is to be $5.07{\times} 10^3L{\cdot}mol^{-1}$ at room temperature.