• 제목/요약/키워드: Genus identification

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Universal-, Genus-specific, Species-specific Probes and Primers Design for Microbial Identification

  • Park, Jun-Hyung;Park, Hee-Kyung;Song, Eunsil;Jang, Hyun-Jung;Kang, Byeong-Chul;Lee, Seung-Won;Kim, Hyun-Jin;Kim, Cheol-Min
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
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    • pp.399-401
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    • 2005
  • MIPROBE is a web-based tool for design of universal, genus-specific, and species-specific primers and probes. The main functions of MIPROBE are collection of target gene sequences, construction of consensus sequences, collection of candidate primers and probes, and evaluation of candidates by BLAST. Biologists with little computer skills can easily use MIPROBE to design large-scale universal, genus-, and species-specific primers and probes. This software is available at http://www.miprobe.com. Also detailed descriptions of how to use the program are found at this site.

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The Genus Philanthus (Hymenoptera: Sphecidae: Philanthinae) in Korea

  • Kim, Jeong-Kyu;Kim, Dong-Eon;Lee, Heung-Sik
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제36권1호
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    • pp.41-45
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    • 2020
  • The genus Philanthus Fabricius, 1790 in Korea are reviewed, and two species, Philanthus triangulum and P. coronata, are treated. The former is new to Korea. This species is easily separated from congeners by dense punctures in propodral enclosure and tri-forked marking in lower face. DNA barcoding test is supportive in our identification as well as conspecitficity of Korean materials showing variation in size and coloration. The observed data on flower associations of this species specified with domestic localites and date are separately provided. The current status of Philanthus coronatus that has been the only representative of the genus but forgotten for a lengthy time in Korea is discussed.

Taxonomic Revision of the Genus Paromius Fieber from Korea

  • Hwang, Jong Seok;Kwon, Jin Hyung;Suh, Sang Jae;Kwon, Yong Jung
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제32권1호
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    • pp.24-29
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    • 2014
  • The true bug genus Paromius from Korea is revised taxonomically. It comprises the following three species: P. exiguus (Distant, 1883), P. jejunus (Distant, 1883) and P. gracilis (Rambur, 1839). Among them, P. jejunus (Distant, 1883) is recorded for the first time in Korea. The pest bug injurious to rice culture, known as P. exiguus (Distant,1883), has been recorded erroneously by the previous authors from Korea due to the misidentification, which is rectified here with the support of morphological evidence. All the species of this genus are classified with proper redescriptions, and an identification key to species is provided with illustrations.

A Newly Recorded Sea Star of the Genus Marginaster (Asteroidea: Valvatida: Poraniidae) from the Korea Strait, Korea

  • Lee, Taekjun;Bae, Sungjun;Kim, Dae-Jin;Shin, Sook
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제33권4호
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    • pp.274-277
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    • 2017
  • A sea star was collected from the Korea Strait in the waters adjacent to eastern Jeju Island, Korea ($33^{\circ}39^{\prime}86^{{\prime}{\prime}}N$, $127^{\circ}33^{\prime}12^{{\prime}{\prime}}E$) at a depth of 92 m on November 5, 2016. This specimen was identified as Marginaster paucispinus Fisher, 1913, from the family Poraniidae of the order Valvatida, based on morphological characteristics. The genus Marginaster Perrier, 1881 and M. paucispinus, which were first reported in the South China Sea, are new to the Korean fauna. Partial sequences of mitochondrial COI and 16S ribosomal RNA of M. paucispinus were have been determined for the first time and were deposited in GenBank. They are the first molecular records for the genus Marginaster.

New Record of Ptecticus sinchangensis Ôuchi, 1938 (Diptera, Stratiomyidae, Sarginae) in Korea

  • Han, Taeman;Kang, Tae Hwa;Kim, Seung-Hyun;Park, In Gyun;Park, Haechul
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제37권2호
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    • pp.33-35
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    • 2018
  • In Korea, species of the genus Ptecticus Loew, 1855 (Family Stratiomyidae) have been known as three species, P. aurifer (Walker, 1854), P. matsumurae Lindner, 1936 and P. japonicus (Thunberg, 1789) (= P. tenebrifer (Walker, 1849)). Additionally, an unrecorded species, P. sinchangensis ${\hat{O}}uchi$, 1938, was found in Korea. We therefore report the species for the first time in Korea with morphological diagnosis and key for the identification of the Korean species of the genus. In total, the members of the genus Ptecticus are officially recognized as four species in Korea.

한국산 미기록 고치벌 Rhogadopsis obliqua (벌목: 고치벌과: 꽃파리고치벌아과)에 대한 보고 (A New Record of Parasitic Wasp, Rhogadopsis obliqua (Hymenoptera: Braconidae: Opiinae), from South Korea)

  • 한윤종;김효중
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제62권1호
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    • pp.1-4
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    • 2023
  • Rhogadopsis속은 주로 굴파리에 기생하는 고치벌로 Opius속의 아속으로 여겨져왔다. 그러나 시맥의 형태와 단계통 분기군을 형성함에 따라 Rhogadopsis속은 속으로 격상되었다. 전라남도 여서도에서의 동물상 조사 결과, Rhogadopsis obliqua의 수컷 표본을 쓸어 잡기로 채집되었다. Rhogadopsis obliqua의 기술과 진단 형질 도판을 수록한다.

Identification of Sculptolumina japonica (Physciaceae) in South Korea

  • Joshi, Yogesh;Lokos, Laszlo;Wang, Xin Yu;Nguyen, Thi Thuy;Koh, Young-Jin;Hur, Jae-Seoun
    • Mycobiology
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    • 제38권1호
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    • pp.62-64
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    • 2010
  • The paper describes identification of new microlichen (Sculptolumina japonica) in South Korea. A detailed taxonomic description and comments are presented for the taxa studied. Lichen genus Sculptolumina is reported for the first time for this country.

한국산 Rhizobium 속의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of the Genus Rhizobium)

  • 하남주;안태근;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.73-76
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    • 1984
  • From the root nodules of legumes distributed in South Korea, 74 strains of Rhizobium were isolated. The strains isolated were identified based on Bergey's Manual and Vincent's identification key. Following 5 species of Rhizobium were confirmed. R. leguminosarum, R. meliloti, R. phaseoli, R. trifolii, and R. japonicum

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ITS 서열에 의한 한국 왕대속 식물종의 계통분류학적 연구 (Phylogenic Study of Genus Phyllostachys (Phyllostachys) in Korea by Internal Transcribed Spacer Sequence (ITS))

  • 이송진;허만규;허홍욱;이병룡
    • 생명과학회지
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    • 제21권9호
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    • pp.1281-1287
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    • 2011
  • 왕대속은 벼과 또는 화본과에 속하는 다년생 목본성 초본이며 아시아의 인도와 중국에 많은 종이 주로 분포한다. 식물에서 속간 속내 계통관계 추론을 위해 널리 이용되고 있는 ITS 부위가 있다. 이 속에 속하는 우리나라 자생 식물 왕대 속내 네 식물종 간 계통 관계를 평가하기 위해 핵 게놈의 ITS 부위로 평가하였다. DNA 서열 배당은 많은 갭(gaps)을 가지고 있었다. 이 속 내 서열 변이는 일부 삽입과 결실이 발견되었고 속내 종간 변이는 자연도태에 의한 것으로 밝혀졌다. 이 속의 오죽과 분죽은 세 계통도(MP, ML, and NJ)에서 모두 같은 분지군을 형성하여 가장 근연관계에 있었다. 기존의 형태학적 특성과 단순 반복 서열(ISSR)의 결과와 유사한 계통 관계를 나타내어 왕대속에서 ITS의 서열이 이들 분류군에 매우 유익한 정보를 제공하고 있음을 시사하였다.

우리나라 미꾸리속(genus Misgurnus) 알비노 개체의 미토콘드리아 및 핵 유전자 염기서열 분석에 의한 유전적 동정 (Genetic Species Identification by Sequencing Analysis of Nuclear and Mitochondrial Genes for Albino Misgurnus Species from Korea)

  • 송하윤;문신주;김근식;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.139-145
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    • 2017
  • 최근 우리나라에서 자연발생적인 미꾸리속 알비노 개체들이 낮은 빈도로 출현하고 있으나, 색소 결핍으로 인해 형태적종 동정이 어렵다. 따라서 본 연구에서는 핵 유전자인 recombination activating gene 1 (rag1) 영역 및 미토콘드리아 유전자 cytochrome b (cytb) 영역을 이용한 분자계통학적 분석을 이용해 미꾸리속 알비노 개체의 분자동정을 수행하였다. 그 결과 rag1과 cytb의 분자계통도에서 미꾸라지, 미꾸리, 그리고 M. mohoity로 3개의 clade가 확인되었다. 확보된 M. mohoity의 염기서열을 유전자은행의 BLAST를 이용해 유사성을 검색한 결과 M. mohoity와 가장 유사하였다. 분자계통도를 기준으로 25마리의 알비노 미꾸리속 개체의 종 동정을 수행한 결과 빨간 눈 타입은 미꾸리 16마리, 미꾸라지 1마리로 판별되었고, 나머지 3개체는 미꾸라지♀${\times}$미꾸리♂ 잡종 1마리와 M. mohoity ♀${\times}$미꾸리♂ 잡종이 2마리 판별되었다. 또한 검은 눈타입 5마리는 미꾸리 1마리와 미꾸라지 3마리 및 M. mohoity 1마리로 판별되었다. 따라서 본 연구에 이용한 분자마커를 활용함으로써 미꾸리속 어류의 정확한 종 또는 잡종을 동정하기 위한 유용한 방법으로 이용될 수 있을 것이다.