• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제28권12호
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• pp.1696-1702
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• 2015

The objective of this study was to compare the effects of body weight growth adjustment methods on genetic parameters of body growth and tissue among three pig breeds. Data collected on 101,820 Landrace, 281,411 Yorkshire, and 78,068 Duroc pigs, born in Korean swine breeder farms since 2000, were analyzed. Records included body weights on test day and amplitude (A)-mode ultrasound carcass measures of backfat thickness (BF), eye muscle area (EMA), and retail cut percentage (RCP). Days to 90 kg body weight (DAYS90), through an adjustment of the age based on the body weight at the test day, were obtained. Ultrasound measures were also pre-adjusted (ABF, EMA, AEMA, ARCP) based on their test day measures. The (co)variance components were obtained with 3 multi-trait animal models using the REMLF90 software package. Model I included DAYS90 and ultrasound traits, whereas model II and III accounted DAYS90 and pre-adjusted ultrasound traits. Fixed factors were sex (sex) and contemporary groups (herd-year-month of birth) for all traits among the models. Additionally, model I and II considered a linear covariate of final weight on the ultrasound measure traits. Heritability ($h^2$) estimates for DAYS90, BF, EMA, and RCP ranged from 0.36 to 0.42, 0.34 to 0.43, 0.20 to 0.22, and 0.39 to 0.45, respectively, among the models. The $h^2$ estimates of DAYS90 from model II and III were also somewhat similar. The $h^2$ for ABF, AEMA, and ARCP were 0.35 to 0.44, 0.20 to 0.25, and 0.41 to 0.46, respectively. Our heritability estimates varied mostly among the breeds. The genetic correlations ($r_G$) were moderately negative between DAYS90 and BF (-0.29 to -0.38), and between DAYS90 and EMA (-0.16 to -0.26). BF had strong $r_G$ with RCP (-0.87 to -0.93). Moderately positive $r_G$ existed between DAYS90 and RCP (0.20 to 0.28) and between EMA and RCP (0.35 to 0.44) among the breeds. For DAYS90, model II and III, its correlations with ABF, AEMA, and ARCP were mostly low or negligible except the $r_G$ between DAYS90 and AEMA from model III (0.27 to 0.30). The $r_G$ between AEMA and ABF and between AEMA and ARCP were moderate but with negative and positive signs, respectively; also reflected influence of pre-adjustments. However, the $r_G$ between BF and RCP remained non-influential to trait pre-adjustments or covariable fits. Therefore, we conclude that ultrasound measures taken at a body weight of about 90 kg as the test final should be adjusted for body weight growth. Our adjustment formulas, particularly those for BF and EMA, should be revised further to accommodate the added variation due to different performance testing endpoints with regard to differential growth in body composition.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제55권1호
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• pp.13-18
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• 2013

본 연구는 농협 한우개량사업소 후대검정우 552두의 도체중, 배최장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도를 측정한 후 고밀도 SNP 패널(777K)을 사용하여 유전체 혈연 행렬(Genetic Relationship Matrix, GRM)을 추정하고 GBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) 방법으로 GEBV (Genomic Estimated Breeding Value)를 구하여 교차 검증(Cross-validation) 방법으로 그 정확도를 추정함으로써 유전체 선발 기법을 한우 유전평가 체계에 적용하기 위한 기초자료로 이용하고자 수행하였다. 교차 검증 방법으로 각 형질별로 추정된 유전체 육종가의 정확도는 0.915~0.957로 상당히 높게 추정되었다. 대립유전자의 빈도로 계산된 유전체 혈연 행렬을 이용하여 GBLUP 방법으로 추정된 육종가 정확도의 최대 차이는 후대검정우 534두에 대하여 도체중, 배최장근단면적, 등지방 두께 및 근내지방도 순으로 각각 9.56%, 5.78%, 5.78% 및 4.18% 정도의 수준으로 상승했고, 혈통 기록상의 모든 개체 3,674두에 대해서는 형질 별로 최대 13.54%, 6.50%, 6.50% 및 4.31% 정도의 수준으로 증가한 결과가 추정되었다. 이는 한우 보증씨수소의 선발 시스템에서 아직 표현형 자료를 생산할 수 없는 당대검정 후보축 대한 집단을 조성할 때 유전체 정보를 이용한 사전 선발을 활용하면 기존의 상대적으로 낮았던 육종가의 정확도의 상승 효과와 세대 간격의 단축으로 인하여 유전적 개량량을 증대시킬 수 있을 것으로 기대된다. 본 연구에서 genomic breeding value 추정을 위하여 조성된 집단의 경우는 후대 검정우 집단으로서 개체들 간의 혈연관계가 높으며, 이미 전통적인 BLUP 방법으로도 상당히 높은 정확도를 가진 집단을 이용하였다. 그러나, 현재 한우 집단에 대한 유전체 자료 구축 시 이용할 수 있는 정확한 자료는 후대검정우 집단 외에는 참조 집단을 조성할 수 있는 대안이 없으므로, 지속적인 유전체 검정을 위해서는 다양한 유전적 조성이 구축된 참조 집단을 구축해야 할 것으로 사료된다. 또한 유전체 검정을 통한 정확도 상승효과를 기대하기 위해서 지속적으로 참조 집단의 크기를 늘릴 필요성이 있다.

• 대한공간정보학회지
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• 제8권1호
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• pp.51-63
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• 2000

최근 교통문제를 해결하기 위한 방법으로 교통계획분야에 GIS나 ITS를 활용한 다양한 연구가 활발히 진행 중에 있다. 이와 함께 정보환경의 급격한 발달과 더불어 대안 경로의 선정, 또는 교통예보 서비스와 같은 온라인 상에서의 교통정보 제공이 이루어지고 있어 GIS 환경 내에서도 가로망의 교통량을 정확하게 예측할 수 있는 기능이 요구되고 있어 통행배정모형의 중요성이 증가하고 있다. 그런데, 전통적인 정적 통행배정모형은 급변하는 교통상황에 적합하지 않기 때문에 실시간 교통상황에 대한 교통흐름을 예측할 수 있는 동적 통행배정모형의 개발이 요구되고 있다. 그러나, 동적 통행배정모형은 시공간적인 변수들의 복잡성으로 인해서 그 최적해를 찾는데 많은 수학적인 어려움과 제약조건이 존재한다. 따라서, 이를 해결하기 위한 여러 가지 해법이 연구되어왔지만, 기존의 방법은 목적함수나 제약조건이 convex(하지 않은 경우에는 적용이 불가능한 단점을 가지고 있다. 본 연구에서는 인공지능방법(Artificial Intelligence Technique)의 한 분야로 활발히 연구되고 있는 유전자 알고리즘(Genetic Algorithm)을 동적 통행배정 모형에 도입하여 그 해결 방법을 제시하였다. 논문에서 사용한 동적 통행배정모형은 제약조건이 convex(하지 않은 Merchant-Nemhauser모형이고, 새로운 해결기법으로 사용된 유전자 알고리즘은 일반적인 제약조건을 처리할 수 있다고 알려진 GENOCOP III시스템이다. 새로 도입된 방법의 효율성과 유의성을 검증하기 위해 간단한 네트워크에 적용하였다. 그 결과 GENOCOP III 시스템이 계산과정의 효율성에 있어서 기존의 비선형 해법 알고리즘보다 우수한 것으로 입증되었다.연구가 진행되어야 할 것이다. 실질적으로 성감별 수정란의 대량생산이 가능할 것으로 사료되며, 농가차원에서 산업적 실용화가 될 수 있을 것으로 기대한다.twork descrition)를 통해 교통분석후의 제반 교통특성(교통량, 교통량/용량 비(比), 속도 등)을 교통망상에 표시할 수 있음으로서 의사결정에 보다 많은 도움을 줄 수 있을 것이다. 비트율의 증가와 화질 열화는 각각 최대 1.32%와 최대 0.11dB로 무시할 수 있을 정도로 작음을 확인 하였다.을 알 수 있었다. 현지관측에 비해 막대한 비용과 시간을 절약할 수 있는 위성영상해석방법을 이용한 방법은 해양수질파악이 가능할 것으로 판단되며, GIS를 이용하여 다양하고 복잡한 자료를 데이터베이스화함으로써 가시화하고, 이를 기초로 공간분석을 실시함으로써 환경요소별 공간분포에 대한 파악을 통해 수치모형실험을 이용한 각종 환경영향의 평가 및 예측을 위한 기초자료로 이용이 가능할 것으로 사료된다.염총량관리 기본계획 시 구축된 모형 매개변수를 바탕으로 분석을 수행하였다. 일차오차분석을 이용하여 수리매개변수와 수질매개변수의 수질항목별 상대적 기여도를 파악해 본 결과, 수리매개변수는 DO, BOD, 유기질소, 유기인 모든 항목에 일정 정도의 상대적 기여도를 가지고 있는 것을 알 수 있었다. 이로부터 수질 모형의 적용 시 수리 매개변수 또한 수질 매개변수의 추정 시와 같이 보다 세심한 주의를 기울여 추정할 필요가 있을 것으로 판단된다.변화와 기흉 발생과의 인과관계를 확인하고 좀 더 구체화하기 위한 연구가 필요할 것이다.게 이루어질 수 있을 것으로 기대된다.는 초과수익률이 상승하지만, 이후로는 감소하므로, 반전거래전략을 활용하는 경우 주식투자기간은 24개월이하의 중단기가 적합함을

• 한국응용곤충학회지
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• 제16권1호
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• pp.21-31
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• 1977

1975년 수원 잠업시험장 상전에서 뽕나무 세균성위축병균 Psendomonas mori(Boyer et Lambert) Stevens의 형태적으로 다른 Rough colony형(R형) 균주를 분리하였다. 이를 전국 5개 지역에서 채집, 분리한 wild type인 Smooth colony형 (S형) 균주와 병원성 및 세균의 일반적 성질을 비교하고 유전적인 안전성을 검토한 결과는 다음과 같다. 1. R형균주는 S형균주에 비하여 강한 병원성을 보였으나 병징에는 아무런 차이가 없었다. 2. R형균주는 그 길이가 200u 이상에 달하는 사상하며 편모가 없는 비운동성 세균으로, 단간상이고 운동성이 있는 S형균주와 형태적으로 달랐다. 3. 육즙한천배지에서 S형균주와 colony는 백색, 원형, 전록으로 평골한데 비하여, R형균주의 colony는 주변이 불규칙한 파상으로 그 중앙부위에 많은 주름무늬가 있다. 4. 46종의 생리적 성질 및 혈청학적 성질에서는 R형과 S형균주 사이에 아무런 차이가 없었다. 5. R형과 S형균주 모두 100회 이상의 계대배양이나 $1-3\%$의 NaCl 및 유기산의 Sodium 염 5종, 항생물질 4종에 의한 처리에서 유전적인 안정성을 보였다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제16권12호
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• pp.8700-8706
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• 2015

고속철도차량 동력대차의 1차 구동장치는 모터 감속기와 견인전동기로 구성한다. 모터 감속기와 견인전동기는 기계적으로 일체형 결합 구조이지만, 상이한 기술 요구사항으로 인하여 이들의 완전 분해정비 주기는 서로 다르다(모터 감속기의 완전 분해정비 주기: $1.8{\times}10^6km$, 견인전동기의 완전 분해정비 주기: $2.5{\times}10^6km$). 따라서 불필요한 정비 횟수를 감소하기 위하여 신뢰성 중심 유지보수 관점에서 최적의 완전 분해정비 주기의 산정이 중요하다. 본 연구에서는 실제 유지보수 정비이력으로부터 두 구성품들에 대한 고장 결함나무 분석을 수행하고 각 하부부품들의 치명도를 고려한 고장률을 각각 평가하였다. 두 구성품에 대한 최적의 동일한 완전분해 정비주기는 기존의 총 예방정비 비용을 감소하기 위하여 유전자 알고리즘으로 부터 얻었다. 이 알고리즘에서 각 개체를 구성하는 유전자는 최소 예방 정비주기이며, 이의 조합으로 구성된 세대별 개체의 적합도함수는 총 정비비용의 역수로 공식화하여 얻는다. 최소공배수에 의한 방법은 기존 대비 4%만 감소하지만, 유전자 알고리즘에 의한 최적의 동일 완전분해 정비주기는 225만km로서 기존 방법의 총비용과 비교하여 약 14% 감소하였다.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제34권1호
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• pp.21-29
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• 1992

누에 품종육성을 위한 기초자료를 얻기 위해 7개 품종을 이면교잡하여 얻은 F1 세대에 대한 유전자의 분포상태, 우성정도, 분산성분과 성분비 등을 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 8개 형질에서 정방향의 잡종강세를 나타낸 형질은 암견층비율을 제외한 7개 형질이었으며 이 중암전견중, 암용체중은 매우 높은 잡종강세를 나타내었고 부방향의 잡종강세는 암·수견층비율에서 볼 수 있었다. 2. 각 형질에 대한 분산분석의 결과는 세포질의 영향인 모체효과와 정·역간의 효과에서 암견층비율과 암용체중을 제외한 전 형질에서 유의성이 인정되었다. 3. Vr-Wr graph에서 암전견중과 암·수용체중은 초우성을 나타내고 수전견중, 암·수견충중, 암·수견층비율은 불완전우성으로 유전되었다. 4. 유전분산성분에서 수전견중, 암·수견층중, 암·수견층비율은 상가적 효과가 우성효과보다 크게 나타났고, 암전견중은 우성 효과가 상가적 효과보다 크게 표현되었다. 5. 협의의 유전력은 암·수전견중, 암·수견층중, 암·수견층비율에서 0.51 이상으로 높았고, 광의의 유전력은 암용체중을 제외한 전 형질에서 0.77 이상으로 높았다. 6. 우성의 방향은 암견층비율이 부이고, 암·수견층중이 5.22, 6.02로 다소 높았으나 암·수전견중, 수견층비율, 암·수용체중은 정으로 낮았다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권5호
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• pp.581-590
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• 2008

한우암소의 도축형질에 대한 월령별 발육성장경향을 알아보고 종축으로 활용한 한우 암소의 유전평가에 사전 보정을 위한 참고자료를 제공하기 위하여 한우 초음파 성적 27,410기록을 이용하여 분석하였다. 분석에 고려한 형질은 초음파 측정 시 조사된 흉위 및 신체충실지수 및 도축성적으로써 배장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도 등 이었다. 분석결과 번식우로써 활용되는 생후 15개월령 이상부터 약 7년령까지 흉위, 배장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도는 신체충실지수에 대한 곱의 보정을 실시함이 유전분석의 편의성을 배제하여 분석의 정확도를 높일 수 있을 것으로 사료되었으며 월령별 발육특성에서는 흉위의 경우 성 성숙이 완전 이루어지고 번식우로서 공용되는 3세 이전에 99% 이상의 발육이 진행되는 것으로 판단되었으며, 배장근단면적의 경우에는 흉위의 발육곡선보다는 다소 성장이 늦었지만 흉위와 유사한 발육성장특성을 보였다. 반면에 등지방두께의 경우에는 환경요인에 의한 영향이 많았으며 7년령까지 꾸준히 증가하고 있는 경향을 보였고 근내지방도의 경우에 5년생까지 거의 성숙이 완료되었지만 개체간 변이가 상당히 있는 것으로 평가되었다. 본 연구를 통하여 추정된 성장곡선 함수식은 한우 암소의 유전평가를 실시할 때 월령에 대한 환경요인의 사전 선형보정을 위한 함수식으로 사용할 수 있을 것으로 판단된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제56권3호
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• pp.8.1-8.6
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• 2014

Background: Artificial insemination (AI) can serve as a powerful tool to the sheep owners for making rapid genetic progress of their flock. The AI in sheep is mostly performed using fresh semen with two reasons i) lambing rate following trans-cervical AI with frozen semen is limited by the inability of frozen-thawed sperm to transit the cervix and ii) the need of circumventing the cervical barrier through laparoscope aided intrauterine AI. Therefore, AI with frozen-thawed semen is not as widespread in sheep as it is in other domestic species. However, to get maximum benefits through the use of AI, frozen-thawed semen is a prerequisite because instead of high fertility, the short shelf life of fresh semen coupled with a limitation on the number of insemination doses achievable per unit time restricts the widespread use of individual sires. Therefore, in order to enhance lambing rate, a total of 240 trans-cervical artificial inseminations with frozen-thawed semen were performed in Bharat Merino ewes during autumn season either once in the evening (G-I, 10 h after onset of estrus, n = 100) or twice (G-II, 14 h and 22 h after onset of estrus, n = 140) i.e. once in the morning and again in the evening. Results: The pregnancy rate (proportion of pregnant ewes confirmed by ultrasonography at day 40) and lambing rate (proportion of ewes lambed) were higher in G-II as compared to G-I (26.4 vs 20% and 19.3 vs 10%, respectively). The difference in lambing rates was statistically (P < 0.05) significant. The depth of insemination within cervico-uterine tract had no significant effect on pregnancy and lambing rates. Conclusions: The results indicate that lambing rate in sheep following TCAI with frozen-thawed semen was significantly influenced by time of inseminations. Two inseminations after 14 and 22 h of onset of estrus enhanced the lambing rates of Bharat Merino sheep as compare to single insemination after 10 h of onset of estrus. The TCAI technique with frozen-thawed ram semen is promising and may serve as a valuable tool for genetic improvement of sheep breeds. Research efforts are going on worldwide to overcome the poor fertility following TCAI with frozen-thawed semen.

• Molecules and Cells
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• 제24권1호
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• pp.16-26
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• 2007

Wild progenitor species provide potential gene sources for complex traits such as yield and multiple resistances to biotic and abiotic stresses, and thus are expected to contribute to sustainable food supplies. An introgression line 'IR71033-121-15' was derived from a wild species Oryza minuta (2n = 48, BBCC, Acc No. 101141) at IRRI. Introgression analysis using 530 SSR and STS markers revealed that at least 14 chromosomal segments distributed over 12 chromosomes had been introgressed from O. minuta. An $F_{2:3}$ population from the cross between IR71033 and Junambyeo (a Korean japonica cultivar) consisting of 146 lines was used for quantitative trait loci (QTL) analysis of 16 agronomic traits. A total of 36 single-locus QTLs (S-QTLs) and 45 digenic epistasis (E-QTLs) were identified. In spite of it's inferiority of O. minuta for most of the traits studied, its alleles contributed positively to 57% of the QTLs. The other QTLs originated from either parent, IR71033 or Junambyeo. QTLs for phenotypically correlated traits were mostly detected on introgressed segments. Fourteen QTLs corresponded to QTLs reported earlier, indicating that these QTLs are stable across genetic backgrounds. Twenty-two QTLs controlling yield and its components had not been detected in previous QTL studies. Of these, thirteen consisted of potentially novel alleles from O. minuta. QTLs from O. minuta introgression could be new sources of natural variation for the genetic improvement of rice.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권4호
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• pp.1603-1609
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• 2014

Background: The response to treatment and overall survival (OS) of patients with acute myeloid leukemia (AML) is variable, with a median ranging from 6 months to 11.5 years. TP53 is associated with old age, chemotherapy resistance, and worse OS. Using genetic sequencing, we set out to look at our own experience with AML, and hypothesized that both TP53 mutations and SNPs at codon 72 would mimic the literature by occurring in a minority of patients, and conferring a worse OS. Materials and Methods: We performed a pilot study of randomly selected, newly diagnosed AML patients at Mount Sinai Medical Center, diagnosed from 2005-2008 (n=10). TP53 PCR sequencing was performed using DNA from bone marrow smears. Analysis was accomplished using Mutation Surveyor software with confirmation of the variants using the COSMIC and dbSNP databases. Results: Fewer than half of the patients harbored TP53 mutations (40%). There was no significant difference in OS based on gender, AML history, risk-stratified karyotype, or TP53 mutation. There were possible trends toward improved survival among patients less than 60 (11 vs 4 months, p=0.09), Hispanics (8 vs 1 months, p=0.11), and those not harboring SNP P72R (8 vs 2 months, p=0.10). There was a significant improvement in survival among patients with better performance status (28 vs 4 months, p=0.01) and those who did not have a complex karyotype (8 vs 1 months, p=0.03). The most commonly observed TP53 mutation was a missense N310K (40%) and the most commonly observed SNP was P72R (100.0%). Conclusions: Our study confirms previous reports that poor PS and the presence of a complex karyotype are associated with a decreased OS. In our cohort, TP53 mutations were relatively common, occurring more frequently in male patients with an adverse karyotype. Although there was no significant difference in survival between TP53 mutated and un-mutated patients, there was a possible trend toward worse OS among patients with SNP P72R. Larger studies are needed to validate these findings.