The purpose of this study was to isolate Escherichia coli from flies and to assess pathogenic genes and antibiotic resistance of the isolates. A total of 188 flies were captured in agricultural environment including fruits farms (n = 19), fermented soybean farms (n = 9), municipal waste (n = 46), livestock farms (n = 66), slaughterhouses (n = 38), and manure ground (n = 10). E. coli isolates of captured flies were tested for pathogenic gene and antibiotic resistance using PCR methods and VITEK2 systems. As a result, E. coli from 63% (119/188) of the captured flies has been detected, and the detection rate of E. coli was the highest (89%, 31/34) in flies captured at particular slaughterhouse. Of the 34 isolates, 94% (32/34) were pathogenic gene (ST gene) positive. Twenty-six percent (31/119) of the E. coli isolates were observed being resistant to one or more antibiotics. Markedly, one of E. coli isolates from Livestock farms was resistant to 7 antibiotics including ampicillin, ampicillin/sulbactam, cefazolin, cefotaxime, gentamicin, levofloxacin, and trimethoprim/sulfamethoxazole. In addition, it was ESBL positive. The results of the present study may suggest a risk of transmission of pathogenic and antimicrobial resistant bacteria from flies to livestock environment Therefore, it may need to prevent introducing flies into the agricultural production environment for safe food production.
Kim, Dong-Min;Ju, Hong-Guang;Yang, Paul;Han, Seong-Sook;Roh, Jae-Hwan;Ahn, Sang-Nag
Korean Journal of Breeding Science
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v.43
no.1
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pp.42-49
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2011
QTL analysis for blast resistance was carried out using 140 $BC_3F_3$ lines derived from a cross between Ilpum as a recurrent parent and Moroberekan as a donor parent. 140 $BC_3F_3$ lines with the parents were inoculated with nine blast isolates. To identify QTLs for resistance to nine blast isolates, 134 SSR markers showing polymorphisms between the parents were genotyped for the 140 $BC_3F_3$ lines. A total of 17 resistance QTLs to nine isolates were detected on chromosomes 2, 3, 4, 6, 7, 9 and 10. The phenotypic variance explained by each QTL ranged from 8.2% to 26.4%. The Moroberekan alleles contributed the positive effect at these 17 QTL loci. In a previous study, the QTL, Pi45(t) for durable resistance to blast was identified using a sequential planting method. To know the relationship between Pi45(t) and the isolate-specific resistance gene, an $F_2$ population was developed from a cross between Ilpum and an introgression line harboring Pi45(t). $F_3$ lines segregating for the Pi45(t) were inoculated to three isolates. $F_3$ lines from the $F_2$ plants with the Moroberekan segment at the target region showed resistance to two isolates. This result seems to indicate that the Pi45(t) and the isolate-specific resistance gene are tightly linked or the resistance is controlled by the same gene(s). The markers linked to genes controlling blast resistance would be useful in developing blast resistance lines in the breeding program.
Kim, Seung-Hun;Nam, Gae-Won;Kang, Byung-Young;Lee, Hae-Kwang;Moon, Seong-Joon;Chang, Ih-Seop
Journal of the Society of Cosmetic Scientists of Korea
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v.31
no.1
s.49
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pp.97-102
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2005
One of the key molecules involved in skin moisture is hyaluronan (hyaluronic acid, HA) with its associated water of hydration. The predominant component of the ECM (extracellular matrix) of skin is HA. It Is the primordial and the simplest of the GAGs (glycosaminoglycans), a water-sorbed macromolecule In extracellular matrix, Included between the vital cells of epidermis. In the skin, HA was previously thought to derive extlusively from dermis. But, recent studies revealed that HA could be synthesized in epidermis. Flavonoids are polyphenolic compounds that is found mainly in foods of plant origin. Kaempferol was known to increase glutathione synthesis in human keratinocyte. And quercetin blocked PPAR-meidated keratinocyte differentiation as lipoxygenase inhibitors. In this study, we sought to evaluate the effect of flavonid, kaempferol and quercetin on production HA in keratinocyte. We examined the changes of three human hyaluronan synthase genes (HASI, HAS2, HAS3) expression by semi-quantitative RT-PCR when kaempferol or quercetin was added to cultured human keratinocytes. We found that these flavonoids slightly upregulated HAS2, HAS3 mRNA after 24 h. And we investigated the effect on HA production by ELISA. When we evaluated the level of HA in culture medium after 24 h incubation. We found enhanced accumulation of HA in the culture medium. Although the effects of above flavonoids are less than retinoic acid, the data indicate that kaempferol, quercetin can dose-dependently increase the level of HA in epidermis cell line. It suggested that flavonoid, kaempferol, and quercetin increased production of HA in skin and it helped to elevate skin moisture and improve facial wrinkle.
Choi, Hee Ji;Lee, Soo Bin;Kwon, Hye Mi;Choi, Byung-Ok;Chung, Ki Wha
Journal of Life Science
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v.31
no.10
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pp.913-921
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2021
Limb-girdle muscular dystrophy (LGMD) which is characterized by progressive muscle weakening of the hip and shoulder shows both dominant and recessive inheritances with many pathogenic genes including TTN. This study performed to identify genetic causes of a male patient with late onset (45 years old) autosomal recessive LGMD and atrial flutter. By application of the whole exome sequencing, we identified bi-allelic variants of TTN gene in the patient. One allele had a single missense variant of [c.24124G>T (p.V8042F)], while the other allele consisted of three missense variants of [c.29222G>C (p.R9741P) + c.67490A>G (p.H22497R) + c.75376C>T (p.R25126C)]. The p.V8042F allele was transmitted from his mother, while the other haplotype allele was putatively transmitted from his father. His two unaffected sons had only the p.R9741P. These variants have been not reported or rarely reported in the public human genome databases (1,000 Genome, gnomAD, and KRGDB). Most variants were located in the highly conserved immunoglobulin or fibronectin domains and were predicted to be pathogenic by the in silico analyses. The TTN giant protein plays a key role in muscle assembly, force transmission at the Z-line, and maintenance of resting tension in the I-band. In conclusion, we think that these bi-allelic compound heterozygous mutations may play a role as the genetic causes of the LGMD phenotype.
'Manbaek' is a bacterial blight resistant mid-late maturing rice cultivar with high grain quality. 'Manbeak' was derived from anther culture using the backcross combination, $Hopum^*2/SR30075$. 'Hopum' is a mid-late maturing rice cultivar with high grain quality and 'SR30075' is a pyramid line carrying three bacterial blight resistance genes. 'Manbaek' was selected through the pedigree method, yield trials, and local adaptability tests. 'Manbeak' carrying two bacterial blight resistance gene Xa3 and xa5 showed high-level and broad-spectrum resistance against bacterial blight. 'Manbaek' was resistant to K3a, mostly virulent race in Korea, and exhibited resistance reaction against 16 Korean bacterial blight isolates. 'Manbaek' was a mid-late maturing rice. The heading date of 'Manbaek' was August 19th, which was 5 days later than that of 'Nampyeong'. Manbaek' was a lodging-tolerant rice with short culm and dark green leaf. Due to the low viviparous germination, 'Manbaek' could be a useful material to prevent pre-harvest sprouting. 'Mabeak' was resistant to bacterial blight and rice stripe virus, but susceptible to other virus diseases and insect pests. The yield of 'Manbaek' was similar to 'Nampyeong'. 'Manbaek' showed excellent grain appearance and good tastes of cooked rice, so that it could contribute to improving the quality of bacterial blight resistant cultivars. 'Manbaek', bacterial blight resistant cultivar with high grain quality, is suitable for the cultivation at bacterial blight prone area and has been utilized in the breeding programs for enhancing the resistance against bacterial blight (Registration No. 6069).
In this study, the variation of 20 Pinus thunbergii isolates of F. circinatum from 2 damaged sites in Jeju-Island were compared with a known Fusarium circinatum using molecular biological techniques. Two- and four-year-old seedlings of Pinus rigida${\times}$Pinus x rigitaeda and two-, three- and six-year-old seedlings of P. thunbergii were inoculated with one of the most virulent isolates, FT-7, to determine differences in susceptibility. In site 1 (FT), 13 isolates of F. circinatum were isolated from 14 individuals and in site 2 (FS), 7 isolates of F. circinatum were isolated from 9 individuals. No difference was found in the sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region of the ribosomal RNA genes in the FS and FT isolates, and also even in the known isolate of F. circinatum, FE 1-1. However, the ITS sequences of the FS and FT isolates differed from those of a fungus, Botrytis cinerea. Two-year-old seedlings of P. rigida${\times}$P. x rigitaeda showed higher susceptibility (93.3% of mortality) than four-year-old ones. Three-year-old seedlings of P. thunbergii showed the highest susceptibility (66.7% of mortality) compared to those at other ages in the same species. We found a positive correlation between basal diameter and lesion length in the seedlings of P. rigida${\times}$P. x rigitaeda ($R^2=0.66$) and P. thunbergii (p < 0.0001), respectively. There were significant differences in susceptibility by the age of seedlings in each of P. rigida${\times}$P. x rigitaeda (p < 0.0001) and P. thunbergii (p < 0.0001) based on lesion length.
Journal of the Korean Applied Science and Technology
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v.36
no.2
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pp.394-406
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2019
The cellular senescence may be due to damage by the reactive oxygen species (ROS). This study has compared the antioxidant activity in the human cell lines of various origins, including 10S and 50S-derived normal skin fibroblasts, and 10S bone marrow, dental tissue and adipose-derived adult stem cells. After being exposed to $H_2O_2$, half inhibitory concentration ($IC_{50}$) values by cytotoxicity assay was significantly (P<0.05) lower in 50S-derived skin fibroblasts, than in 10S-derived skin fibroblasts and various adult stem cell lines. The cell population doubling time (PDT) and the cell frequency with high senescence associated-${\beta}$-galactose activity were remarkably increased in 50S-derived fibroblasts exposed to 50 ppm $H_2O_2$ for 7 days, than those of 10S-derived fibroblasts and various adult stem cell lines. Further, the expression level of antioxidant-related genes, glutathione peroxidase (GPX) and catalase (CAT), was investigated in 10S and 50S-derived skin fibroblasts, and 10S-derived various adult stem cells by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The expression level of GPX was higher in most of cell lines, compared to CAT, and a significantly (P<0.05) higher expression level of GPX was observed in 10S-derived skin fibroblasts and adult stem cell lines, compared to 50S-derived skin fibroblasts. We concluded that old-aged skin fibroblasts seemed to be less resistant against ROS than young-aged skin fibroblasts and adult stem cells.
Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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v.18
no.2
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pp.43-49
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2018
Maple syrup urine disease (MSUD, OMIM#248600) is a rare and autosomal recessively-inherited metabolic disorder that is caused by mutations in the branched-chain ${\alpha}$-ketoacid dehydrogenase (BCKDH) genes. It prevents the normal breakdown of branched-chain amino acids (BCAAs), such as leucine, isoleucine, and valine, and leads to poor feeding, lethargy, abnormal movements, seizure, and death if untreated. Here, we report the case of a Korean newborn of biochemically- and genetically-confirmed MSUD manifesting lethargy and central apnea, the acute state of which was successfully treated. The molecular genetic investigation revealed two novel heterozygous mutations (p.Ala32Phefs*48 and p.Val 130Phe) in BCKDHB, and both parents were confirmed as carriers. We emphasize the importance of early diagnosis and prompt introduction of specific treatment for MSUD in life saving and prognosis.
The present study investigated the cytotoxicity of particulate matter (PM) derived from car air filter (outdoor PM) and home cleaner filter (indoor PM) in the various human cell lines. Each outdoor and indoor PM were harvested by ethanol extraction method, subsequently sieved with 10 um filter paper, sterilized with autoclave and added to culture media. The half maximal inhibitory concentration ($IC_{50}$) values was significantly (p<0.05) lower in the outdoor PM, compared with indoor PM, and the significantly (p<0.05) higher $IC_{50}$ values were observed in the cancer cell lines (A-549 lung adenocarcinoma and AGS stomach adenocarcinoma), than those of normal MRC-5 fibroblasts and dental papilla tissue derived-mesenchymal stem cells (DSC). After being exposed to $100{\mu}g/ml$ outdoor PM for 7 days, the population doubling time (PDT) was significantly (p<0.05) increased in especially MRC-5 and DSC cell lines, compared with untreated cell lines. Further, the expression of senescence-associated ${\beta}$-galactosidase activity was up-regulated in all the cells exposed to outdoor PM than those of untreated control. Besides, the expression level of inflammation-associated genes, such as cyclooxygenase-2 (COX-2) and interleukin-6 (IL-6) was found to be significantly (p<0.05) increased in the outdoor PM-treated cell lines than those of untreated cell lines. Our results showed that PM induces the cytotoxicity via arrest of cell growth, cell damage and inflammation response.
Species identification for the Korean tribe Desmodieae was conducted using the DNA barcoding genes rbcL, matK (from chloroplast DNA) and ITS (from nuclear ribosomal DNA). A total of 25 taxa (n = 75) in five genera were sequenced, and neighbor-joining trees were constructed using different combinations of DNA barcodes. When comparing these phylogenetic trees, a tree with all loci combined (rbcL + matK + ITS) showed the highest rate of identification success (72%). On this tree, two subtribes and five genera within the tribe were supported as monophyletic. In the Desmodiinae clade, Desmodium and Hylodesmum were more closely related to each other than to Ohwia. In the Hylodesmum clade, H. oldhamii was found to be a sister to H. podocarpum complex, and all taxa within the complex were identified successfully. Subsp. fallax, regarded as a variety of subsp. oxyphyllum, is closely clustered with subsp. podocarpum. Although var. mandshuricum has been regarded as a synonym of var. oxyphyllum, this taxon is supported as a distinct variety. For the Lespedezinae clade, all species of Kummerowia were monophyletic, while nine of 16 Lespedeza taxa were identified successfully. In particular, the resolution of Macrolespedeza (28.5%) was lower than that of Junceae (77.8%). Among the Lespedeza taxa, L. cuneata was distinguishable from L. lichiyuniae, despite morphological similarities. It has been suggested that both L. maritima and L. inschanica are hybrids. The former is thought to be an independent species. While it is difficult to determine whether the latter originated via hybridization, this study showed that it is closely related to L. juncea.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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