Kim, Chang-Kug;Jeon, Young-Ah;Cho, Gyu-Taek;Kwon, Soon-Wo;Kim, Yong-Hwan;Hong, Seung-Beom
Genomics & Informatics
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v.7
no.1
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pp.41-45
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2009
The Korean Agricultural Culture Collection (KACC) has developed a web-based system to provide an integrated database with information updates about microbial resources. This integrated database consists of 5 major functions and contains general information, which includes identification numbers, culture media composition, image information, DNA sequences, patent information, and general forms for ordering and depositing microorganisms. In 2008, KACC started providing characterization information. KACC maintains 9,801 cultures of microorganisms, including 3,296 strains of bacteria, 4,734 fungi, 784 actinomycetes, 64 yeasts, and 923 others.
This study, funded by Jeju Special Self-Governing Province, evaluated the bacterial contamination in disposable wet wipes used in restaurants, coffee shops, and bakery shops. The materials used are 55 disposable wet wipes collected from general restaurants. The number of average bacteria found was $4.21{\times}10^3CFU/mL$ in 50 disposable wet wipes; in the other five disposable wet wipes, no bacterial contamination was found. The highest number of bacteria was measured as $16.67{\times}10^3CFU/mL$. Total bacterial count of separated are 71 strains. Among the 71 identified strains, 15 were Staphylococcus aureus and 3 were Pseudomonas aeruginosa. This can be an important problem. This study measured the level of bacterial contamination and identified the strains isolated in wet wipes. This study may be important as it provides the basis for establishing sanitation standars for wet wipes.
Effects of gamma ionizing radiation on recombinant Escherichia coli cells containing stress promoters, recA, fabA, grpE, or katG, fused to luxCDABE originated from Vibrio fischeri were characterized by monitoring transcriptional responses reflected by bioluminescent output. Quantification of gamma-ray intensity may be possible using the recA and fabA promoter fusion since a linear enhancement of bioluminescence emission with increasing gamma-ray intensity was observed. Other strains sensitive to either oxidative stress (DPD2511, katG::luxCDABE) or protein-damaging stress (TV1061, grpE::luxCDABE) were also irradiated by gamma-rays, and resulted in no noticeable bioluminescent output while DPD2794 with recA promoter and DPD2540 with fabA promoter irradiated by the same intensities of gamma-rays gave a significant bioluminescent output. This indicates that the main stresses in the recombinant bacteria caused by ionizing radiation are DNA and membrane-damage, not protein- or oxidative-damage. In addition, in this study, to investigate the relationship between the radiation dose rate and bacterial responses, two recombinant Escherichia coli strains, DPD2794 and GC2, containing lac promoter fused to luxCDABE originating from Photorhapdus luminescences, were used for detecting DNA damage and cellular toxicity under various radiation dose rates. Throughout this study, it was found that these bacteria showed quantitative stress responses to DNA damage and general toxicity caused by gamma rays, depending on the radiation dose rates, indicating that the bacterial stress responses and general toxicity were seriously influenced according to radiation dose rates.
An investigation was carried out on a basis of the bacteriological examination with a view to detecting the degree of bacterial contamination for the 77 samples collected from the locally-sold liquid specialties. It's test period was 50 days from July 10 to August 30, 1971. Specially, the survey has put emphasis on the population of general bacteria and the identification of coli-form group, staphylococcus species, streptococcus species, bacillus species, fungi, and yeast species from liquid samples. The results obtained are summarized as follows; (1) For the 77 samples tested, the contamination of general bacteria was found out as minimun 0, i,e., maximum, $12{\times}10^4$ and the total average $45{\times}10^2$ per milliliter. (2) Although streptococcus species could not be detected with the samples, the contamination of the coli-form and staphylococcus species means the strong suggestion of the possibility of pathogenic bacterial contamination. (3) Specially, the products which stay in the neutral pH range and use suspending agents need to care for the microbial contamination in the manufacturing crocess. (4) It is thought necessary to perform the microbiological quality control in the liquid preparations only at least. (5) As the microbial contamination degree in the liquid decreases according to the elapse of time, the microbiological quality control will have to be carried out immediately after the completion of the manufacturing process in order to know the accurate degree. (6) The author thinks that the main reason of the microbial contamination in the liquid is the contamination during the manufacturing process. (7) For the purpose of prevention of the microbial contamination in liquid, therefore, it is more important to make efforts for the rationalization of manufacturing process, the improvement of equipment and environment, the specific training of workers for hygienic knowledges, etc. rather than the use of preservatives for the preparations.
Streptococcus mutans is the primary causative agent of caries, which is one of the most common human diseases. Thus, rapid and early detection of cariogenic bacteria is critical for its prevention. This study investigated the combination of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and microfluid technology to quantitatively detect S. mutans. A low-cost, rapid microfluidic chip using LAMP technology was developed to amplify and detect bacteria at 2.2-2.2 × 106 colony-forming units (CFU)/ml and its detection limits were compared to those of standard polymerase chain reaction. A visualization system was established to quantitatively determine the experimental results, and a functional relationship between the bacterial concentration and quantitative results was established. The detection limit of S. mutans using this microfluidic chip was 2.2 CFU/ml, which was lower than that of the standard approach. After quantification, the experimental results showed a good linear relationship with the concentration of S. mutans, thereby confirming the effectiveness and accuracy of the custom-made integrated LAMP microfluidic system for the detection of S. mutans. The microfluidic system described herein may represent a promising simple detection method for the specific and rapid testing of individuals at risk of caries.
The HACCP (hazard analysis critical control point) concept becomes an important aspect of Good Manufacturing Practices (GMP) in safe food production. The HACCP plan was developed with food safety objective. The authors already carried out hazards analysis on Changran Jeotgal manufacturing process in a previous report. In this study we developed a HACCP plan on the manufacturing process of Changran Jeotgal. We could decide two CCPs those were salt concentration and eliminations of foreign materials before packaging. Foreign materials should be certainly checked out with laser detector just before packaging. Salt should be maintained more than $8\%$ to inhibit pathogenic bacteria in end product. On the Jeotgal process free water is removed after salting and Jeotgal is seasoned with several subsidiary materials such as com syrup. In result end products have $8\%$ salt with water activity 0.82. Most bacteria are inhibited but some can live in this condition. Materials on the working may be contaminate by pathogens, chemicals or physical hazards. It will be decreased by SSOP (standard sanitary operating program). The SSOP needed in Jeotgal plants is nearly same as other general food manufacturing plants but essential to fulfill HACCP program.
The commercial interests in functional foods containing probiotics are gaining significance in view of increasing studies on their role in digestive tract. Probiotic dairy foods containing health-promoting bacteria are important segment of functional food market. Various health benefits have been attributed to specific strains of lactic acid bacteria or food containing these probiotic cultures. Probiotic-containing foods are considered to improve general gut health and natural defenses of body, and lower blood cholesterol level. Specific probiotic microbes can alleviate or prevent diverse intestinal diarrhea-inducing disorders, cause prophylaxis of intestinal and urogenital infections, inhibit mutagenicity of intestinal contents, and reduce incidence of intestinal tumors. Recent increasing evidences on health effects of probiotics have triggered consumer interest in this category of functional foods. Rational approach needs to be applied in selection of strains for probiotic preparation to achieve required functionality. Present article focuses on some prominent probiotic candidates and criteria for their inclusion in functional food sector. Various health claims of probiotics on gastrointestinal disorders, anticarcinogenic effects, and anti-cholestrimic effects, and possible mechanistic explanations for their functionality are highlighted.
Pig slurry is a good soil amendment not only because of its high organic matter content, but also because of its ability to provide various nutrients. The objective of this study was to estimate the influence of raw and processed pig slurry application on pot soil over chemical fertilizer and non-amended control soil. Change in the chemical parameters (pH, organic matter (OM), organic carbon (OC), macro and micronutrients) and microbial mass of the treated soils were monitored over 30 to 90 days. Pot soil was treated with the recommended dose of pig slurry and chemical fertilizer, and was sampled after 30, 60 and 90 days of incubation. The least significanct difference (p<0.05) was observed on Fe, Cu, Zn, available P and K between treatments. All treatments increased N, P and K content and microbial mass of soil over control soil. Interestingly, no significant effects were detected on OM, OC, total bacteria, actinomycetes and fungi mass in soil irrespective of treatments given. However fungal and bacterial counts, as well as available nutrients, were found to be higher in processed slurry (PS)-treated soil compared to other soils. In general a significant correlation existed between the fungal count and OM, OC, Zn, T Kjeldahl N (TKN), available P and K of soil. A strong negative correlation was observed between pH and Fe in soil. This study clearly demonstrated that the use of processed manure as a fertilizer could be a key for sustainable livestock agriculture.
For the past 5 year 6 months from January 1975 to June 1980, 176 patients with empyema have been treated in Chonnam University Hospital. They were 134 males and 42 females ranging from ] 8 days to 69 years of age. [mean age: 26.1 years] The duration of illness prior to treatment was relatively shorter in pediatric group than in adult group, that is, the duration of less than 1 month was 89.5% in pediatric group and 38.0% in adult group. In bacteria study there were Staphylococcus 26.1%, Streptococcus 17.6%, E. coil 10.8%, Pseudomonas 10.8%, Diplococcus pneumoniae 5.7% and Candidia. And 4 children and 3 adults had infections of two species of bacteria. The underlying pathologic lesions were pyogenic pneumonia 34.7%, tuberculosis 29.5%, paragonimiasis 15.3%, trauma 9.7% and postoperative state. The over-all mortality rate was 1.7% [3 patients]. The causes of death were sepsis In 1 child and sepsis secondary to esophageal fistula in 2 adults. Adequate drainage and obliteration of the pleural space seems to be the most important aspect of treatment and can frequently be achieved by initial tube drainage in acute empyema, especially in the pediatric group. The chronic thick walled or loculated cavities required open window therapy, decortication, resection therapy and sterilization. Modified Eloesser`s operation and 0.3-0.5% potadine irrigation brought good result in the patients who had general weakness, marked pulmonary parenchymal destruction due to pyothorax, and pyothorax with severe bronchopleural fistula.
During the operation, maintenance and decommissioning of nuclear power plant radioactive contaminated waste is produced. This waste is stored in an underground repository 60-100 meters below the surface. The metallic portion of this waste comprises mostly carbon and stainless steel. A long-term field exposure showed high corrosion rates, general corrosion up to 29 ㎛ a-1 and localized corrosion even higher. High corrosion rate is possible if microbes produce corrosive products, or alter the local microenvironment to favor corrosion. The bacterial and archaeal composition of biofilm formed on the surface of carbon steel was studied using 16S rRNA gene targeting sequencing, followed by phylogenetic analyses of the microbial community. The functional potential of the microbial communities in biofilm was studied by functional gene targeting quantitative PCR. The corrosion rate was calculated from weight loss measurements and the deposits on the surfaces were analyzed with SEM/EDS and XRD. Our results demonstrate that microbial diversity on the surface of carbon steel and their functionality is vast. Our results suggest that in these nutrient poor conditions the role of methanogenic archaea in corrosive biofilm, in addition to sulphate reducing bacteria, could be greater than previously suspected.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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