URP primers that were derived from repetitive DNA sequence of rice weedy rice have been applied for producing PCR polymorphisms in different fungal species. URP-PCR protocol employed stringent PCR with high annealing temperature over $55^{\circ}C$ throughout the thermo-cycling reaction, giving high reproducibility. Under the PCR condition, Each single URP primer produced characteristic fingerprints from diverse genomes of different fungal species, indicating its universal applicability. URP-PCR has been accessed for applicability to various fungal species with 33 genus, 142 species and 1,489 isolates. Numerous related papers have demonstrated that URP-PCR profiles of fungal species are very useful for identifying fungal species at intra and inter species levels. The results were reviewed in this paper.
Park, Myung Soo;Yoo, Shinnam;Cho, Yoonhee;Park, Ki Hyeong;Kim, Nam Kyu;Lee, Hyi-Seung;Lim, Young Woon
Mycobiology
/
v.49
no.6
/
pp.551-558
/
2021
The Federated States of Micronesia (FSM) is an island country in the western Pacific and is a known biodiversity hotspot. However, a relatively small number of fungi (236 species) have been reported till July 2021. Since fungi play major ecological roles in ecosystems, we investigated the fungal diversity of FSM from various sources over 2016 and 2017 and constructed a local fungal inventory, which also included the previously reported species. Fruiting bodies were collected from various host trees and fungal strains were isolated from marine and terrestrial environments. A total of 99 species, of which 78 were newly reported in the FSM, were identified at the species level using a combination of molecular and morphological approaches. Many fungal species were specific to the environment, host, or source. Upon construction of the fungal inventory, 314 species were confirmed to reside in the FSM. This inventory will serve as an important basis for monitoring fungal diversity and identifying novel biological resources in FSM.
Several endophytic fungal strains were isolated from Taxus cuspidata and identified by molecular analysis of the internal transcribed spacer and RNA polymerase II second largest subunit. This study aimed to determine the relative abundance and compare the species diversity of endophytic fungal communities within needle leaves and twigs. We identified a total of 49 endophytic fungal species. Notably, two species, Trichoderma dingleyae and Xylaria cubensis, were discovered to be previously unrecorded in Korea. The fungal communities in both plant tissues demonstrated distinct species composition. Differences were observed in the relative abundance and species diversity index between needle leaves and twigs. Our findings suggest that the host plant tissues influence the species diversity of endophytic fungal communities.
The diversity of arbuscular mycorrhizal fungi (AM) was investigated in cultivated and natural fold sites or chungbuk, Korea. soils were collected from rhizosphere or Sorghum bicolor, Fagopyrum esculentum and Glycine max in cultivated sites, and of Miscanthus sinensis, Glycine soja and Lespedeza cuneata in natural sites. Total 20 species of Glomalean fungi were found in this study. Species richness, species diversity and density of AM fungi were significantly lower in the arable sites. While only AM fungal spores belong to Glomus and Acaulospora were found in arable fold sites, more diverse fungal spores including Gigasporaceae were found in natural grasslands. AM fungal spore composition did not significantly differ among crop plant species. Results suggest that the agricultural practices were significantly influenced on AM fungal community structures and mycorrhizal developments.
Soobin Shin;Hosung Jeon;Sieun Kim;Hyun-Ju Noh;Jong Won Jo;Kyunghun Min;Hokyoung Son
Mycobiology
/
v.51
no.6
/
pp.410-416
/
2023
Fungi are cosmopolitan and they occupy diverse niches as consumers, producers, and decomposers. They play critical roles in the environment by enabling nutrient cycling and generating a plethora of secondary metabolites. This study aimed to identify and characterize fungal strains isolated from diverse sources on Muui Island, Republic of Korea. In 2023, a total of 86 fungal strains were collected and examined. Investigation of the morphological features and phylogenetic analyses of multiple barcode loci identified one putative novel species and two species previously unrecorded in the Republic of Korea: Colletotrichum sp., Colletotrichum guizhouense, and Fusarium brachygibbosum. This study provides a comprehensive description of their molecular phylogenies and morphological characteristics. These findings will contribute to the existing knowledge about fungal species in the Republic of Korea and future research on the fungal diversity on Muui Island.
Mycotoxins are toxic secondary metabolites produced by fungi. They can be present in where agricultural-based commodities are contaminated with toxigenic fungi. These mycotoxins cause various toxicoses in human and livestock when consumed. Small grains including corn, barley, rice or wheat are frequently contaminated with mycotoxins due to infection mainly by toxigenic Fusarium species and/or under environment favorable to fungal growth. One of the most well-known Fusarium toxin groups in cereals is trichothecenes consisting of many toxic compounds. Deoxynivalenol (DON), nivalenol (NIV), T-2 toxin, and various derivatives belong to this group. Zearalenone and fumonisin (FB) are also frequently produced by many species of the same genus. In order to monitor Korean cereals for contamination with Fusarium and other mycotoxigenic fungal species as well, barley, corn, maize, rice grains, and soybean were collected from fields at harvest or during storage for several years. The fungal colonies outgrown from the grain samples were identified based on morphological and molecular characteristics. Trichothecene chemotypes of Fusarium species or presence of FB biosynthetic gene were determined using respective diagnostic PCR to predict possible toxin production. Heavy grain contamination with fungi was detected in barley, rice and wheat. Predominant fungal genus of barley and wheat was Alternaria (up to 90%) while that of rice was Fusarium (~40%). Epicoccum also appeared frequently in barley, rice and wheat. While frequency of Fusarium species in barley and wheat was less than 20%, the genus mainly consisted of Fusarium graminearum species complex (FGSC) which known to be head blight pathogen and mycotoxin producer. Fusarium composition of rice was more diverse as FGSC, Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FIESC), and Fusarium fujikuroi species complex (FFSC) appeared all at considerable frequencies. Prevalent fungal species of corn was FFSC (~50%), followed by FGSC (<30%). Most of FFSC isolates of corn tested appeared to be FB producer. In corn, Fusarium graminearum and DON chemotype dominate within FGSC, which was different from other cereals. Soybeans were contaminated with fungi less than other crops and Cercospora, Cladosporium, Alternaria, Fusarium etc. were detected at low frequencies (up to 14%). Other toxigenic species such as Aspergillus and Penicillium were irregularly detected at very low frequencies. Multi-year survey of small grains revealed dominant fungal species of Korea (barley, rice and wheat) is Fusarium asiaticum having NIV chemotype.
Park, Young-Hwan;Kim, Young-Chang;Park, Sang-Un;Lim, Hyoun-Sub;Kim, Joon-Bum;Cho, Byoung-Kwan;Bae, Han-Hong
Journal of Ginseng Research
/
v.36
no.3
/
pp.327-333
/
2012
Fungal endophytes were isolated from 1-, 2-, 3-, and 4-year-old ginseng roots (Panax ginseng Meyer) cultivated in Korea. The isolated fungal endophytes were identified based on sequence analysis of the internal transcribed spacer and morphological characterization by microscopic observations. A total of 81 fungal endophytes were isolated from 24 ginseng roots. Fungal endophytes were classified into 9 different fungal species and 2 unknown species. Ginseng roots that were 1-, 2-, 3-, and 4-years old were colonized by 2, 6, 8, and 5 species of fungal endophytes, respectively. While Phoma radicina was the most frequent fungal endophyte in 2-, 3-, and 4-year-old ginseng roots, Fusarium solani was the dominant endophyte in 1-year-old ginseng roots. The colonization frequencies (CF) varied with the host age. The CF were 12%, 40%, 31%, and 40% for 1-, 2-, 3-, and 4-year-old ginseng roots, respectively. We found a variety of fungal endophytes that were distributed depending on the age of ginseng plants.
Growth responses of Zea mays and Glycine max to colonization by mixture of combination of three species of arbuscular mycorrhizal (AM) fungi, two species of Glomus and a species of Scutellospora were compared. In Zea mays, plants inoculated with single species of AM fungi showed significantly higher in dry weight than non-mycorrhizal plant for all three AM fungal species. Also, growth of plants inoculated with spores of two species of AM fungi was significantly higher than nonmycorrhizal control except for plants inoculated with two Glomus species. When three species of AM fungi were inoculated, the plants showed the highest growth. In Glycine max, plants with single AM fungal species inoculation were not significantly different in plant growth from nonmycorrhizal plants. When the plants were inoculated with combination of two or more AM fungal species, their growth significantly increased compared to nonmycorrhizal plants. In both plant species, mycorrhizal root colonization by Scutellospora species was significantly lower than by Glomus species.
Rosas-Medina, Miguel;Macia-Vicente, Jose G.;Piepenbring, Meike
Mycobiology
/
v.48
no.1
/
pp.20-28
/
2020
Soil degradation can have an impact on the soil microbiota, but its specific effects on soil fungal communities are poorly understood. In this work, we studied the impact of soil degradation on the richness and diversity of communities of soil fungi, including three different degrees of degradation in Germany and Panama. Soil fungi were isolated monthly using the soil-sprinkling method for 8 months in Germany and 3 months in Panama, and characterized by morphological and molecular data. Soil physico-chemical properties were measured and correlated with the observed values of fungal diversity. We isolated a total of 71 fungal species, 47 from Germany, and 32 from Panama. Soil properties were not associated with fungal richness, diversity, or composition in soils, with the exception of soil compaction in Germany. The geographic location was a strong determinant of the soil fungal species composition although in both countries there was dominance by members of the orders Eurotiales and Hypocreales. In conclusion, the results of this work do not show any evident influence of soil degradation on communities of soil fungi in Germany or Panama.
Ramdial, Hema;Abreu, Kathryn De;Rampersad, Sephra N.
The Plant Pathology Journal
/
v.33
no.2
/
pp.118-124
/
2017
Bell pepper is an economically important crop worldwide; however, production is restricted by a number of fungal diseases that cause significant yield loss. Chemical control is the most common approach adopted by growers to manage a number of these diseases. Monitoring for the development to resistance to fungicides in pathogenic fungal populations is central to devising integrated pest management strategies. Two fungal species, Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FIESC) and Colletotrichum truncatum are important pathogens of bell pepper in Trinidad. This study was carried out to determine the sensitivity of 71 isolates belonging to these two fungal species to fungicides with different modes of action based on in vitro bioassays. There was no significant difference in log effective concentration required to achieve 50% colony growth inhibition ($LogEC_{50}$) values when field location and fungicide were considered for each species separately based on ANOVA analyses. However, the $LogEC_{50}$ value for the Aranguez-Antracol locationfungicide combination was almost twice the value for the Maloney/Macoya-Antracol location-fungicide combination regardless of fungal species. $LogEC_{50}$ values for Benomyl fungicide was also higher for C. truncatum isolates than for FIESC isolates and for any other fungicide. Cropping practices in these locations may explain the fungicide sensitivity data obtained.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.