Eun Bi Jang;Hyejin Hyeon;Yoonji Lee;Sung Hye Han;Kwang Yeol Baek;Su Young Jung;Ki Sung Shin;Weon-Jong Yoon
한국자원식물학회:학술대회논문집
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한국자원식물학회 2023년도 임시총회 및 춘계학술대회
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pp.61-61
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2023
Zanthoxylum piperitum has been used as a spice or various folk remedies since ancient times, and studies on antibacterial, anti-inflammatory and analgesic effects have been reported. In this study, a raw material standardization study was conducted for the industrialization of Z. piperitum. First, optimal conditions for drying methods were established for the standardization of raw materials for Z. piperitum, and optimal conditions were established through content analysis using quercitrin, an marker compound, by obtaining samples every month. As for the drying method of Z. piperitum, it was confirmed that cold air drying was the best. It was analyzed that the marker compound content was highest in July. Next, for functional and toxicity evaluation of Z. piperitum, anti-oxidant, anti-inflammatory and immune enhancing efficacy and cytotoxicity were evaluated. Cytotoxicity of Z. piperitum was not observed, and it was confirmed that although it had an antioxidant and anti-inflammatory effect, it had no immuneenhancing effects. In addition, a study was conducted on the change in the efficacy of Z. piperitum using lava seawater, and as a result of the study, it was confirmed that the efficacy was superior when lava seawater was simultaneously treated. In conclusion, this study suggested the standardization of raw materials through the analysis of the marker compounds and the functional evaluation of Z. piperitum, and it can be used as basic data for future industrialization.
개별인정형 건강기능식품 기능성 원료로 개발한 창녕양파추출액의 표준화를 위해 지표성분으로 quercetin을 설정하였으며, HPLC를 이용하여 지표성분 quercetin의 분석법을 확립하며 그에 따른 유효성 검정을 실시하고자 하였다. 유효성 검정 결과, 본 시험법에서 표준용액의 피크유지시간과 창녕양파추출액의 피크유지시간이 일치하였으며 동일한 spectrum을 나타내어 특이성을 확인하였다. 검량선의 상관계수($R^2$)는 0.9986로 높은 직선성을 보여 분석에 적합함을 알 수 있었으며, 검출한계는 0.2 mg/L, 정량한계는 0.5 mg/L 로 설정되었다. Quercetin의 회수율은 0.05 mg/mL에서는 82.36~95.26%, 0.075 mg/mL는 82.70~98.24%, 0.1 mg/mL은 87.91~95.11%의 범위의 회수율을 보였으며, intra-day에서의 정밀도(RSD)는 0.10~3.28%, inter-day에서는 0.96~5.79%의 정밀도를 나타내어 창녕양파추출액의 지표성분인 quercetin의 분석법은 적합한 시험법임이 검증되었다.
An accurate diagnostic marker for detecting early-stage hepatocellular carcinoma (eHCC) is clinically important, since early detection of HCC remarkably improves patient survival. From the integrative analysis of the transcriptome and clinicopathologic data of human multi-stage HCC tissues, we were able to identify barrier-to-autointegration factor 1 (BANF1), procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3 (PLOD3) and splicing factor 3b subunit 4 (SF3B4) as early HCC biomarkers which could be detected in precancerous lesions of HCC, with superior capabilities to diagnose eHCC compared to the currently popular HCC diagnostic biomarkers: GPC3, GS, and HSP70. We then showed that SF3B4 knockdown caused G1/S cell cycle arrest by recovering $p27^{kip1}$ and simultaneously suppressing cyclins, and CDKs in liver cancer cells. Notably, we demonstrated that aberrant SF3B4 overexpression altered the progress of splicing progress of the tumor suppressor gene, kruppel like factor 4 (KLF4), and resulted in non-functional skipped exon transcripts. This contributes to liver tumorigenesis via transcriptional inactivation of $p27^{kip1}$ and simultaneous activation of Slug genes. Our results suggest that SF3B4 indicates early-stage HCC in precancerous lesions, and also functions as an early-stage driver in the development of liver cancer.
Rumex crispus (RC) or Cordyceps militaris (CM) has been used traditionally to treat various diseases and has been also consumed as a functional food made by humanitas medicine concept. We prepared a new herbal mixture, AST2017-01 which is mainly composed of processed (Beopje)-RC (P-RC) and -CM (P-CM). This study aims to validate marker compounds (chrysophanol and cordycepin) in P-RC and P-CM and water extracted-RC and -CM using liquid chromatography-tandem mass spectrometry. In addition, we analyzed contents of chrysophanol and cordycepin in AST2017-01. The linarites of chrysophanol and cordycepin were obtained in calibration curve with a coefficient of correlation of 0.999. The results showed that the concentrations of chrysophanol and cordycepin in P-RC and P-CM were almost 1.70 and 1.23 fold higher than that in RC and CM, respectively. Furthermore, contents of chrysophanol and cordycepin in the AST2017-01 are approximately 0.13% and 0.028%, respectively. In conclusion, these results indicate that chrysophanol and cordycepin were validated as marker compounds in the AST2017-01.
The proteins from functional rice cultivars (Nogwonchalbyeo, Giant embryonic, Arhyangchalbyeo, and Goamibyeo) and general white rice were extracted and separated using two-dimensional (2D) gel electrophoresis. A wide variation in the molecular weight (MW) and pH range of the expressed proteins in rice samples were observed. The green-kerneled rice (Nogwonchalbyeo) exhibited proteins with MW of 9-57 kDa and appeared at a pH range of 4-7. The Giant embryonic contained proteins with MW of 31-63 kDa and a pH range of 5-6. The aromatic glutinous rice (Arhyangchalbyeo) showed proteins with MW of 24-28 and pH of 5.8-6.8. The high-amylose rice (Goamibyeo) exhibited proteins with MW of 3-63 and pH of 5.2-5.6. The identified proteins uniquely found and highly expressed in each cultivar may have a significant role on rice functionality. The results illustrate that the 2D gel electrophoresis is a valuable method in the determination of the protein expression profiles in functional rice grains and may be useful in the identification of specific marker proteins associated with the functional property of rice.
A highly selective molecularly imprinted polymer (MIP) for sarcosine, a cancer marker, was prepared and its use as solid-phase extraction (SPE) sorbent material was demonstrated. The MIP was prepared by a very simple procedure using methacrylic acid as functional monomer and a mixture acetonitrile/water (4/1, v/v) as porogen, overcoming in this way the problems usually related to the imprinting of biological polar compounds. The MIP was tested in batch experiments in order to evaluate its binding properties and then used as SPE sorbent for the selective clean-up and pre-concentration of sarcosine. The extraction protocol was successfully applied to the direct extraction of sarcosine from spiked human urine indicating that the MIP allowed sarcosine to be pre-concentrated while simultaneously interfering compounds were removed from the matrix.
본 연구에서는 관행의 교배육종과 DNA 마커를 이용한 MAS의 접목을 통하여 벼멸구 저항성과 관련된 단점을 보완하고, 효율적으로 도열병, 줄무늬잎마름병, 흰잎마름병, 벼멸구, 끝동매미충 저항성이 집적된 복합내병충성 우량계통을 육성하고자 수행하였다. 교배모본으로는 완전미율이 높고, 끝동매미충에 저항성인 '남평'과 단간이면서 흰잎마름병에 저항성인 '주남'을 반복친으로 사용하였고, 벼멸구저항성 유전자 Bph1을 가지고 있지만 간장이 크고 재배안전성이 미흡한 '밀양220호'를 공여친으로 사용하였다. 벼멸구 저항성 연관마커 RM28493을 이용하여 $BC_1F_1$ 및 $BC_2F_1$ 세대에서 MAS로 저항성 개체 선발과 여교잡을 수행하였으며, 복교잡 $F_1$ 세대에서 MAS를 통한 벼멸구 저항성이 고정된 계통을 선발하였다. 고세대 계통에서 생물검정을 통하여 흰잎마름병, 끝동매미충에 저항성인 계통을 선발하였다. MAS와 생물검정을 통해 도열병, 흰잎마름병, 줄무늬잎마름병, 벼멸구 및 끝동매미충에 저항성인 85개의 복합내병충성계통을 선발하였다. 복합내병충성 계통의 간장, 완전미율 및 수량은 각각 71~88 cm, 51~93%, 449~629 kg/10a 사이에 분포하였다. 복합내충성계통중 간장, 완전미율 및 수량이 남평벼와 비슷한 계통을 선발하여 '밀양265호'로 명명하였다. 최종적으로 본연구에서는 기존의 교배육종과 분자육종의 접목을 통하여 복합내병충성 우량계통을 육성하였으며, 이는 금후 유용교배모본으로 활용될 것으로 기대된다.
분자 마커는 유기체에서 다른 유기체와 분자적 수준에서 식별하는 마커이다. 유전적 분석을 위한 분자 마커의 발달은 식물 유전학, 다양한 구조와 가능을 이해하는데 기여하였다. DNA 마커는 임의유전자 증폭에서 다형성을 탐지하는 기법이나 방법(예를 들면 서든 블로팅, 핵산 교잡법, PCR을 이용한 중합효소 연쇄 증폭 반응, DNA 서열화)으로 RFLP, AFLP, RAPD, SSR, SNP 등을 이용하였고 현재에도 이용하고 있다. 최근 기능성 유전자를 이용한 기능성 마커가 각광을 받고 있다. 기능성 마커는 다형성 서열에서 유래한 것으로 표현형 변이를 내포하고 있다. 이런 개념에서 출발한 기능성 마커는 모든 유전자를 타깃으로 할 수 있으나 식물에서는 P450, 튜블린 형성 유전자의 다형성(TBPs), 전이요소 마커(TEMs), 병원균 저항성 유전자 마커(RGMs), RNA를 기반으로 한 마커(RBMs) 등이 널리 이용되고 있다. 본 연구는 Poczai 등의 총설을 기반으로 구성하였다. 식물에서 이런 분자 마커의 이용은 식물의 분화, 진화, 생리적 기능성 유전자의 변화 등 생물학 전반에 관한 정보 획득에 도움을 될 것이다.
MRI, CT, MRI, PET, SPECT, fMRI 등과 같은 단층의료영상은 병원에서 환자의 진단 및 치료 임상적 연구에서 폭넓게 사용되고 있다. 동일한 대상에 대하여 서로 다른 정보를 얻거나 비교를 하기 위하여 서로 다른 영상양식으로 촬영하거나 시간적 간격을 두고 단층영상을 획득하는 경우가 많다. 3차원 영상정합은 비교하고자 하는 두 영상을 하나의 3차원 좌표 공간으로 지도화하는 것이며, 크게 마커기반 정합과 특징기반 정합으로 분류된다. 뇌 영상의 3차원 정합은 뇌 수술부위 선정, 뇌 기능 연구, 뇌 지도화 연구 등에서 시각적 분석과 정량적 분석에서 중요한 위치를 차지한다. 본 논문에서는 뇌의 단층영상에 대하여 흔히 사용되고 있는 3차원 정합인 마커기반 정합법과 특징기반 정합법에 대하여 소개하고 이에 대한 비교 고찰을 행하고자 한다.
The overall consumption of meat is increasing as the level of national income increases. The end weight is a trait closely associated with dressed meat. Genome-wide association study (GWAS) is an effective method of analyzing genetic variation and gene identification associated with a number of natural alternative traits because it can detect variations. So this paper did a GWAS analysis to identity the location on the genome related to the end weight in purebred landrace pigs and to explore the relevant candidate gene. This study identified a significant single nucleotide poly morphism (SNP) marker in chromosome 6 (ASGA0029422, $p=1.22{\times}10^{-6}$). Adhesion G protein-coupled receptor L2 (ADGRL2) was found to be the candidate gene at the identified SNP marker location. ADGRL2 genes have been found to be associated with cell development in relation to the external and internal environment of a cell. In addition, genotype and statistical analyses were done on nine variations on the exon of ADGRL2. The results show that the SNP marker (ASGA0029422, $p=1.32{\times}10^{-6}$) was significant, but the significance of the nine variations on the ADGRL2 exon was not verified. However, by performing further experiments and functional studies on other SNPs showing possible genetic ADGRL-Exon mutations, objects with high associations of high-end weights can be selected.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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