• 제목/요약/키워드: Flexible side chain

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단백질 분자에서 변형된 채널 발견을 위한 유효 사이드 체인 배치 알고리즘 (An Algorithm for Computing Valid Side Chain Conformations for Finding Transformed Channels in a Protein Molecule)

  • 최지훈;김병주;김구진
    • 정보처리학회논문지:컴퓨터 및 통신 시스템
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    • 제4권1호
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    • pp.1-4
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    • 2015
  • 본 논문에서는 주어진 채널이 변형될 때, 아미노산들의 유효한 사이드 체인 배치(side chain conformation)를 찾는 알고리즘을 제시한다. 제안된 알고리즘은 아미노산의 유연성에 근거하여 사이드 체인 유연성을 가진 단백질 분자를 구현하고, 채널 변화에 영향을 주는 인접 아미노산(adjacent amino acid)을 추출한다. 인접 아미노산과 이웃(neighbor) 아미노산의 충돌 검사를 수행하여 유효하지 않은 사이드 체인 배치를 제거한 후, 회전각 조합 트리(rotation angle combination Tree)를 구성하여 사이드 체인 배치 중 유효한 것들만을 추출한다.

유연한 곁가지를 가진 디아민으로부터 층상 구조의 폴리이미드 합성 (Synthesis of Polyimides with Layered Structure from Diamines Containing Flexible Side Chains)

  • 한승산;이미혜;최길영;임승순;김용석
    • 폴리머
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    • 제30권1호
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    • pp.56-63
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    • 2006
  • 층상구조의 폴리이미드 제조를 위해 다양한 곁가지 길이를 가지고 있는 두 종류의 디아민 단량체를 합성하였으며, 이를 이용하여 친수성 유연 곁가지와 친유성 유연 곁가지를 가지는 단일 중합 및 공중합 폴리이미드를 합성하였다. 강직한 주사슬의 충간은 유연한 곁가지로 인해 공간이 채워지게 되므로 곁가지의 길이가 특정 길이에 이르게 되면 주사슬과의 반발력으로 인하여 층상구조를 갖는 폴리이미드를 형성하게 된다. 친유성기를 도입한 단일중합체 폴리이미드의 경우 알킬곁가지의 길이가 증가함에 따라 층간거리가 $32.7\~48{\AA}$으로 증가하였고, 친수성기를 곁가지의 길이에 따라 도입한 경우에는 $7\~10.5{\AA}$으로 증가함을 X선 회절을 통해 확인하였다. 친유, 친수성기가 동시에 도입된 공중합체 폴리이미드의 경우에도 서로 다른 성질을 갖는 곁가지의 반발력에 의해 층상구조의 형성이 가능함을 알 수 있었다. 이를 분자모델링을 통한 이론적 구조계산과 비교해 본 결과, 유연한 곁가지의 길이에 따라 층간간격과 몰부피가 증가하는 층상구조의 폴리이미드 형성을 확인하였다.

유연한 곁사슬을 갖는 방향족 Poly(ether-ether-ester)의 합성 및 성질 (Synthesis and Properties of Aromatic Poly(ether-ether-ester)s having Flexible Side Chain)

  • 방문수
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제10권11호
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    • pp.3060-3065
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    • 2009
  • 알콕시 곁사슬을 갖는 유연한 곁사슬을 갖는 전방향족 Poly(ether-ether-ester)가 ether기로 연결된 triad diol과 2,5-dialkoxyterephthalic acid로부터 direct polycondensation에 의하여 합성되었다. 중합체의 구조와 물리적 성질은 1H-NMR, FT-IR, DSC, TGA를 이용하여 조사되었다. 연구결과에 의하면, 용매로서 1,1,2,2-tetrachloroethane(TCE)를 사용하여 측정된 고분자의 고유점성도는 0.45~0.86 이/g의 값을 나타내었으며, 질소 분위기하에서 측정된 초기열분해온도는 378~418 $^{\circ}C$를 나타내었다. 중합체 대부분은 측정에 사용된 유기용매에 용해되었고, 용융전이온도(Tm)는 곁사슬의 길이가 길수록 감소되었으며 홀수-짝수 효과를 나타내었다.

Properties of Cylindrical Brush Polymers

  • Zhang Bin;Fischerl Karl;Grohn Franziska;Pedersen J S.;Schmidt Manfred
    • 한국고분자학회:학술대회논문집
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    • 한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
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    • pp.109-109
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    • 2006
  • Flexible polymers with densely grafted side chains adopt the shape of cylindrical brushes, because the steric repulsion of the side chains overcomes the entropic restoring force of the main chain. Combined light-and neutron scattering measurements elucidate the extend of main chain and side chain stretching as function of side chain length. The application of cylindrical brushes as molecular actuators in response to external stimuli which is discussed.

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알콕시 곁사슬기가 비페닐렌구조를 갖는 전방향족 액정폴리에스터의 물성에 미치는 영향 (Effects of Alkoxy Side Chain on the Properties of Wholly Aromatic Liquid Crystalline Polyesters with Biphenylene Units)

  • 이응재;방문수
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제11권10호
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    • pp.4041-4046
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    • 2010
  • 유연한 알콕시 곁사슬을 갖는 전방향족 폴리에스터가 direct polycondensation에 의하여 합성되었으며, 합성된 중합체들은 $^1H$-NMR, FT-IR, DSC, TGA, 편광현미경 및 X-ray 분석기에 의하여 조사되었다. 1,1,2,2-테트라클로로에탄(TCE)을 용매로 사용하여 측정된 중합체의 고유점성도(${\eta}_{inh}$)는 0.46~2.41 dL/g의 값을 나타내었다. 곁사슬을 갖는 중합체들은 두 개의 용융전이 즉, 고체상-sanidic 액정상으로의 전이 ($T_{m1}$)와 sanidic 액정상-nematic 액정상으로의 전이 ($T_{m2}$)를 나타내었으며, 알콕시 곁사슬의 길이가 증가함에 따라 상전이온도들은 감소하고, 유기용매에 의한 용해도는 증가하는 경향을 나타내었다. X-ray 분석에서, $2{\theta}\;{\simeq}5$$2{\theta}\;{\simeq}20$ 피이크는 각각 중합체 주사슬과 긴 곁사슬의 결정화에 의한 것으로 나타났다.

유연한 곁가지 말단에 이온성 작용기를 가지는 양이온성 수분산 PU의 제조와 물성 (Preparation and Properties of Water-borne PU Having Ionic Center onto Flexible Side Chain)

  • 김동민;방문수;김형중
    • 접착 및 계면
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    • 제7권1호
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    • pp.3-9
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    • 2006
  • 세 개의 isocyanate작용기를 가지는 IP-$75^{(R)}$와 하나의 hydroxyl작용기를 가지는 여러 가지 amino alcohol을 ionomer로 이용하여 수분산에 필요한 ionic center가 측쇄에 위치하는 양이온성 수분산 polyurethane (PU)을 합성하였다. NCO/OH몰 비, ionomer의 종류 및 중화제의 종류에 따라 수분산 PU의 입도, 점도, 분산안정성, 접촉각, 표면에너지, $T_g$, 그리고 접착강도의 변화를 알아보았다. 제조된 수분산 PU는 주쇄에 ionic center를 가지는 양이온 수분산 PU보다 더 작은 입도를 가지며 분산안정성도 우수함을 확인하였다.

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Synthesis and Properties of Side Chain Liquid Crystalline Polymers with Siloxane Flexible Chain

  • Park, Jong-Ryul;Bang, Moon-Soo;Choi, Jae-Kon
    • Elastomers and Composites
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    • 제52권3호
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    • pp.173-179
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    • 2017
  • Side-chain liquid crystalline polymers having polysiloxane skeletons were synthesized by a thiol-ene reaction, using two kinds of mesogenic groups: a cholesteryl group for induction into a cholesteric liquid crystal phase and a triazomesogenic group for imparting light-sensitivity. All the synthesized polymers were crystalline, except the one with a single cholesteryl group. Crystallinity, glass transition temperature, and melt transition temperature increased with increasing content of the azomesogenic group. The polymer (P-C10A0) with a single cholesteryl group has a cholesteric phase, the one (P-C0A10) with a single azomesogenic group has a smectic phase, and those with both types of mesogenic groups showed both smectic and cholesteric phases. The temperature ranges of the two liquid crystalline phases in the co-polymers were independent of the contents of the two types of mesogenic groups. The rate of photoisomerization of the light-sensitive azobenzene group in the polymer decreased with increasing azobenzene content due to steric hindrance between the azomesogenic groups.

Bending and Pressing Tolerance of Flexible Polyoxetane based Liquid Crystalline Polymer/Low Molecular Weight Liquid Crystal Device

  • Jang, Chi-Woong;Lim, Tong-Kun;Kim, Moo-Jong;Kim, Ku-Nam;Kwon, Young-Wan;Jin, Jung-Il;Bae, Jung-Hun;Kim, Han-Sik
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2005년도 International Meeting on Information Displayvol.I
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    • pp.433-435
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    • 2005
  • We have studied the realigning behavior of liquid crystal molecules in liquid crystalline polymer/liquid crystal(LCP/LC) system when they are exposed to external stimulation such as bending and pressing. The birefringence of the LCP/LC in a flexible display device was measured as a function of bending or pressing deformation. The microscopic dynamic behavior of main chain, side chain, and the LC were characterized by FTIR and polarization optical microscopy. When the device is deformed in scattering memory state, liquid crystal(LC) director is found to align from randomly oriented domain state(scattering state) to homeotropic state.

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Progress of Study on Mesogen-Jacketed Liquid Crystalline Polymers at Peking University

  • Fan, Xing-He;Chen, Xiao-Fang;Wan, Xin-Hua;Chen, Er-Qiang;Zhou, Qi-Feng
    • 한국고분자학회:학술대회논문집
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    • 한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
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    • pp.90-90
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    • 2006
  • Mesogen-Jacketed Liquid Crystalline Polymers, MJLCPs, are polymers with mesogenic side groups directly attached to main-chains without using flexible connecting spacers and are able to form liquid crystalline structures. Later work on structure-property of the polymers revealed that the side groups are not necessarily mesogenic for the polymers to form a mesophase so long as that the side groups are directly attached to the backbones and the side groups are large enough. Because of its inherent chain stiffness and that the monomers of MJLCPs are readily polymerizable by "living" free radical polymerizations, MJLCP offered a unique handy tool for making block copolymers. In addition, MJLCP offered also new opportunities for novel functional materials.

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Spiroacetal을 포함하는 신고분자의 합성(2) (Syntheses and Properties of New Polymers Containing Spiroacetal Moiety (2))

  • 이종문;최두진;이광섭;조순채;안종렬
    • 한국염색가공학회지
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    • 제4권3호
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    • pp.97-115
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    • 1992
  • In order to improve the processability of rigid rod-like polyspiroacetals without significant loss of their good nature, in this work a few new ideas for molecular design were adopted: (1) Copolymerization for breaking the regularity of polymer repeating units. (2) Incorporation of flexible methylene linkages or spacers in rigid spiroacetal polymer main chain. (3) Derivatization of long flexible side chains onto rigid polymer backbone. On the basis of these ideas, a series of polyspiroacetals were prepared, using the phase transfer catalyst, BTMAC, by interfacial polymerization reactions of spiroacetal monomer (SAB) and disubstituted aromatic acid chlorides or aliphatic diacid chlorides. Physical properties of these polyspiroacetals are discussed in relation to their chemical structure and are compared with those of polyspiroacetals synthesized by several other researchers.

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