• 제목/요약/키워드: Expression Mapping

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Analysis of allele-specific expression using RNA-seq of the Korean native pig and Landrace reciprocal cross

  • Ahn, Byeongyong;Choi, Min-Kyeung;Yum, Joori;Cho, In-Cheol;Kim, Jin-Hoi;Park, Chankyu
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제32권12호
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    • pp.1816-1825
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    • 2019
  • Objective: We tried to analyze allele-specific expression in the pig neocortex using bioinformatic analysis of high-throughput sequencing results from the parental genomes and offspring transcriptomes from reciprocal crosses between Korean Native and Landrace pigs. Methods: We carried out sequencing of parental genomes and offspring transcriptomes using next generation sequencing. We subsequently carried out genome scale identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in two different ways using either individual genome mapping or joint genome mapping of the same breed parents that were used for the reciprocal crosses. Using parent-specific SNPs, allele-specifically expressed genes were analyzed. Results: Because of the low genome coverage (${\sim}4{\times}$) of the sequencing results, most SNPs were non-informative for parental lineage determination of the expressed alleles in the offspring and were thus excluded from our analysis. Consequently, 436 SNPs covering 336 genes were applicable to measure the imbalanced expression of paternal alleles in the offspring. By calculating the read ratios of parental alleles in the offspring, we identified seven genes showing allele-biased expression (p<0.05) including three previously reported and four newly identified genes in this study. Conclusion: The newly identified allele-specifically expressing genes in the neocortex of pigs should contribute to improving our knowledge on genomic imprinting in pigs. To our knowledge, this is the first study of allelic imbalance using high throughput analysis of both parental genomes and offspring transcriptomes of the reciprocal cross in outbred animals. Our study also showed the effect of the number of informative animals on the genome level investigation of allele-specific expression using RNA-seq analysis in livestock species.

의복패턴을 위한 2.5D 맵핑 시스템의 설계 및 구현 (Design and Implementation of 2.5D Mapping System for Cloth Pattern)

  • 김주리;정석태;정성태
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제12권4호
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    • pp.611-619
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    • 2008
  • 본 논문에서 구현한 2.5D 맵핑(mapping) 시스템은 다양한 질감과 패턴에 따른 패션 의상의 모델 사진 이미지를 그대로 살려 외각선 영역 위에 드레이핑(draping)함으로써 새로운 디자인을 창출할 수 있고, 직접 샘플이나 시제품을 제작하지 않고도 시뮬레이션만으로 의상 작품을 확인할 수 있다. 또한 원단 디자인과 최종 제품의 상태를 정확하게 예측할 수 있는 기능을 제공하며, 원단과 모델 사진 이미지의 데이터베이스 구축으로 쉽고 빠르게 드레이핑함으로써 패션 업계의 경쟁력 향상과 비용 절감 효과를 가져 올 수 있다. 2.5D 맵핑 시스템은 보다 자연스러운 드레이핑을 위하여 메쉬 워프 알고리즘 모듈, 명암 추출과 적용 모듈, 맵핑 영역 추출 모듈, 메쉬 생성과 변형 모듈, 2.5D 맵핑 모듈로 구성하여 구현하였다. 향후 연구과제는 2.5D 맵핑 시스템의 구현 기술을 기반으로 하여 3D 의복 기술과 3D 인체 구현 기술을 접목한 3D 패션 디자인 시스템을 연구하여 2.5D 맵핑 기술의 표현 한계를 극복할 계획이다.

Facial Expression Recognition Method Based on Residual Masking Reconstruction Network

  • Jianing Shen;Hongmei Li
    • Journal of Information Processing Systems
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    • 제19권3호
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    • pp.323-333
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    • 2023
  • Facial expression recognition can aid in the development of fatigue driving detection, teaching quality evaluation, and other fields. In this study, a facial expression recognition method was proposed with a residual masking reconstruction network as its backbone to achieve more efficient expression recognition and classification. The residual layer was used to acquire and capture the information features of the input image, and the masking layer was used for the weight coefficients corresponding to different information features to achieve accurate and effective image analysis for images of different sizes. To further improve the performance of expression analysis, the loss function of the model is optimized from two aspects, feature dimension and data dimension, to enhance the accurate mapping relationship between facial features and emotional labels. The simulation results show that the ROC of the proposed method was maintained above 0.9995, which can accurately distinguish different expressions. The precision was 75.98%, indicating excellent performance of the facial expression recognition model.

얼굴 표정 데이터의 최적의 가시화를 위한 선형 및 비선형 투영 기법의 비교 분석 (Comparative Analysis of Linear and Nonlinear Projection Techniques for the Best Visualization of Facial Expression Data)

  • 김성호
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제9권9호
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    • pp.97-104
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    • 2009
  • 본 논문은 고차원 얼굴 모션 캡처 데이터를 선형 및 비선형 투영 기법에 각각 적용하고, 이를 2차원 평면으로 투영하기 위한 최적의 방법론에 대한 것이다. 본 방법의 핵심 요소는 프레임 단위의 고차원 얼굴 표정 데이터를 선형 투영 기법인 PCA와 비선형 투영 기법인 Isomap, MDS, CCA, Sammon's Mapping, LLE 등에 적용하고 이를 저차원 공간에 분포시키는 방법론 및 그 결과를 비교 분석하는 것이다. 이를 위해서는 먼저 기존의 고차원 얼굴 표정 프레임 데이터들 사이의 거리를 구하고, 선형 및 비선형 투영 기법들을 적용한 상태에서 기존의 데이터들 사이의 거리 관계를 유지하면서 저차원인 2차원 평면 공간에 분포시키는 것이다. 그리고 2차원 공간에 분포된 얼굴 표정 데이터가 원형 데이터와 비교 했을 때, 최적의 상태로 프레임 데이터들 사이의 거리 관계를 유지하고 있는 투영 기법을 찾는다. 결국 본 논문에서는 고차원 얼굴 표정 데이터를 저차원 공간에 투영하기 위한 선형 및 비선형 투영 기법들을 비교 분석하고, 각각에서 최적의 투영 기법을 찾아낸다.

프로젝션 매핑 콘텐츠의 카메라 움직임 유형에 관한 연구 (A Study on the Types of Camera Working of Projection Mapping Contents)

  • 송민지;박진완
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제14권8호
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    • pp.1-12
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    • 2014
  • 프로젝션 매핑 기법은 현재 거의 모든 장르의 공연예술에서 다각적으로 활용되고 있으며, 이에 따라 다양한 분야의 예술가들이 이를 활용한 콘텐츠 제작에 참여하고 있는 상황이다. 프로젝션 매핑 콘텐츠의 다양화는 제작자들로 하여금 더욱 참신한 시각 효과에 대한 시도를 하는 계기가 되었고, 이는 곧 기존에는 프로젝션 매핑 콘텐츠 제작에서 사용되지 않았던 카메라 움직임을 활용한 시점의 변화로 이어졌다. 프로젝션 매핑 영상에 있어서 카메라 움직임의 활용은 시각적 촉각성을 극대화시켜 관객이 콘텐츠에 더욱 몰입할 수 있도록 도와주는 것으로 분석된다. 본 논문에서는 이러한 프로젝션 매핑의 새로운 시각적 표현법인 '카메라 움직임'에 대한 이론적 고찰과 이를 적용한 프로젝션 매핑 작품 사례 분석을 진행하였다. 이를 통해 영화적 영상 문법으로만 적용되었던 카메라 움직임을 프로젝션 매핑 환경에 적합하게 재구성하고 최적의 시각 효과를 창출하기 위한 가이드라인을 제시하고자 한다.

사실적인 3D 얼굴 모델링 시스템 (Realistic individual 3D face modeling)

  • 김상훈
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제8권8호
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    • pp.1187-1193
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    • 2013
  • 본 논문은 사실적인 3D 얼굴 모델링과 얼굴 표정 생성 시스템을 제안한다. 사실적인 3D 얼굴 모델링 기법에서 개별적인 3D 얼굴 모양과 텍스쳐 맵을 만들기 위해 Generic Model Fitting 기법을 적용하였다. Generic Model Fitting에서 Deformation Function을 계산하기 위해 개별적인 얼굴과 Generic Model 사이의 대응점을 결정하였다. 그 후, Calibrated Stereo Camera로부터 캡쳐 된 영상들로부터 특징점을 3D로 복원하였다. 텍스쳐 매핑을 위해 Fitted된 Generic Model을 영상으로 Projection하였고 사전에 정의된 Triangle Mesh에서 텍스쳐를 Generic Model에 매핑 하였다. 잘못된 텍스쳐 매핑을 방지하기 위해, Modified Interpolation Function을 사용한 간단한 방법을 제안하였다. 3D 얼굴 표정을 생성하기 위해 Vector Muscle기반 알고리즘을 사용하고, 보다 사실적인 표정 생성을 위해 Deformation 과 vector muscle 기반의 턱 rotation을 적용하였다.

Subcloning of Nodulin 26 Wild Type(S262) and Phosphorylation Site Mutant(S262D) into the Yeast Expression Vector pYES2

  • Cha, Youn-Soo
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제2권1호
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    • pp.61-65
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    • 1997
  • Wild type nodulin 26(nod 26) cDNA(S262) and phodphorylation aite mutant(S262D) were constructed by a yeast expression system using pYES2 plasmids(pTES2-D262 and pTES2-S262D) were sc-reened by restriction mapping with BamHI of KpnI. S262 nod 26 contained a sreine residue at position 262 and S262D nod 26 contained the substitution mutation of serine to aspartic acid residue at position 262 were verified by automated floursent DNA sequencing.

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ShEx Schema Generator for RDF Graphs Created by Direct Mapping

  • Choi, Ji-Woong
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제23권10호
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    • pp.33-43
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    • 2018
  • In this paper, we propose a method to automatically generate the description of an RDF graph structure. The description is expressed in Shape Expression Language (ShEx), which is developed by W3C and provides the syntax for describing the structure of RDF data. The RDF graphs to which this method can be applied are limited to those generated by the direct mapping, which is an algorithm for transforming relational data into RDF by W3C. A relational database consists of its schema including integrity constraints and its instance data. While the instance data can have been published in RDF by some standard methods such as the direct mapping, the translation of the schema has been missing so far. Unlike the users on relational databases, the ones on RDF datasets were forced to write repeated vague SPARQL queries over the datasets to acquire the exact results. This is because the schema for RDF data has not been provided to the users. The ShEx documents generated by our method can be referred as the schema on writing SPARQL queries. They also can validate data on RDF graph update operations with ShEx validators. In other words, they can work as the integrity constraints in relational databases.

해부학 기반의 3차원 얼굴 모델링을 이용한 얼굴 표정 애니메이션 (facial Expression Animation Using 3D Face Modelling of Anatomy Base)

  • 김형균;오무송
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제7권2호
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    • pp.328-333
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    • 2003
  • 본 논문에서는 얼굴의 표정 변화에 영향을 주는 해부학에 기반한 18개의 근육군쌍을 바탕으로 하여 얼굴 표정 애니메이션을 위한 근육의 움직임을 조합할 수 있도록 하였다. 개인의 이미지에 맞춰 메쉬를 변형하여 표준 모델을 만든 다음, 사실감을 높이기 위해 개인 얼굴의 정면과 측면 2장의 이미지를 이용하여 메쉬에 매핑하였다. 얼굴의 표정 생성을 애니메이션 할 수 있는 원동력이 되는 근육 모델은 Waters의 근육모델을 수정하여 사용하였다. 이러한 방법을 사용하여 텍스처가 입혀진 변형된 얼굴을 생성하였다. 또한, Ekman이 제안한 6가지 얼굴 표정을 애니메이션 하였다.

초상화로봇을 위한 표정 변환 및 드로잉규칙 생성 (Facial Expression Transformation and Drawing Rule Generation for the Drawing Robot)

  • 김문상;민선규;최창석
    • 대한기계학회논문집
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    • 제18권9호
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    • pp.2349-2357
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    • 1994
  • This paper presents a facial expression transformation algorithm and drawing rule generation algolithm for a portrait drawing robot which was developed for the '93 Taejeon EXPO. The developed algorithm was mainly focused on the robust automatic generation of robot programs with the consideration that the drawing robot should work without any limitation of the age, sex or race for the persons. In order to give more demonstratin effects, the facial expression change of the pictured person was performed.