• Title/Summary/Keyword: Event-Sequence Analysis

검색결과 76건 처리시간 0.029초

고 함량 트립토판 생산 GM 벼 개발 및 전사체 분석 (Development of high tryptophan GM rice and its transcriptome analysis)

  • 정유진;;조용구;강권규
    • Journal of Plant Biotechnology
    • /
    • 제42권3호
    • /
    • pp.186-195
    • /
    • 2015
  • Anthranilate synthase (AS)는 트립토판(Trp)과 indole-3-acetic acid, indole alkaloids의 생합성 경로에서 중요한 효소로 작용한다. 트립토판 생합성 상에서 feedback inhibition에 민감하게 반응하는 AS alpha-subunit 관련 OASA2 유전자 영역의 single (F124V) 및 double (S126F/L530D) 점돌연변이로 변형된 유전자의 재조합운반체를 작성하고 이들 유전자들을 Agrobacterium 방법으로 동진벼에 도입하여 형질전환체를 육성하였다. Single 및 double 돌연변이 OsASA2 유전자가 도입된 형질전환 벼 계통들은 nos gene probe를 이용한 TaqMan PCR 방법으로 single copy를 선발하였고, intergenic 계통을 선발하기 위해서 Bfa I 제한효소를 이용하여 RB와 LB 인접서열로부터 IPCR을 통한 FST 분석을 수행하여 4 개의 intergenic 계통을 선발하였다. 도입된 유전자의 발현으로 형질전환 벼는 Trp, IAN 및 IAA가 잎에 가장 많이 축적되었고, 종자의 트립토판 함량도 증가되었다. 후대에서 tryptophan 함량이 높은 S-TG와 D-TG의 두 호모 이벤트 계통을 육성하여 트립토판 함량을 분석한 결과 대조구에 비하여 13~30배 이상 높게 나타났으며, 유리아미노산의 함량도 증가하였다. 이벤트 계통을 이용하여 microarray 분석을 수행한 결과 세포 내 이온 수송, 영양분 공급 등에 영향을 주는 유전자군들이 up-regulation 되었고, 세포 내 기능유전자의 역할을 담당하는 조효소 등이 down-regulation 된 것을 확인 할 수 있었다. 이러한 결과는 선발된 두개의 상동성 이벤트 계통들이 고함량의 유리 트립토판 생산 벼의 육종에 효과적으로 이용될 수 있음을 보여준 결과로 생각된다.

국내 원전 발전정지사례 분석정보 시스템 개발

  • 이정운;박근옥
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한산업공학회/한국경영과학회 1996년도 춘계공동학술대회논문집; 공군사관학교, 청주; 26-27 Apr. 1996
    • /
    • pp.658-661
    • /
    • 1996
  • Information that can be obtained from nuclear power plant trip cases is important for the efforts to reduce the trip occurrences. However, trip case reports, generally printed in documents, have shortcomings in using the contents. A database system called Information System of Trip Event Cases (INSTEC) is being developed to improve the use of trip information. INSTEC will provide the information obtained from the analysis of Korean nuclear power plant trips, such as component failures or human errors that induced the trips, problems contributed to the trips, and the sequence of unit events. In this study, in the process of INSTEC development, information analysis has been performed and a prototype of the system was developed. The prototype of INSTEC with user interface was presented to plant personnel to collect their opinion on INSTEC by using a questioninnaire. As results, it is confirmed that INSTEC would be helpful and useful for plant personnel to review the trip case information.

  • PDF

Double-stranded RNA virus in Korean Isolate IH-2 of Trichomonas vaginalis

  • Kim, Jong-Wook;Chung, Pyung-Rim;Hwang, Myung-Ki;Choi, Eun-Young
    • Parasites, Hosts and Diseases
    • /
    • 제45권2호
    • /
    • pp.87-94
    • /
    • 2007
  • In this study, we describe Korean isolates of Trichomonas vaginalis infected with double-stranded (ds) RNA virus (TVV). One T. vaginalis isolate infected with TVV IH-2 evidenced weak pathogenicity in the mouse assay coupled with the persistent presence of a dsRNA, thereby indicating a hypovirulence effect of dsRNA in T. vaginalis. Cloning and sequence analysis results revealed that the genomic dsRNA of TVV IH-2 was 4,647 bp in length and evidenced a sequence identity of 80% with the previously-described TVV 1-1 and 1-5, but only a 42% identity with TVV 2-1 and 3 isolates. It harbored 2 overlapping open reading frames of the putative capsid protein and dsRNA-dependent RNA polymerase (RdRp). As previously observed in the TVV isolates 1-1 and 1-5, a conserved ribosomal slip-page heptamer (CCUUUUU) and its surrounding sequence context within the consensus 14-nt overlap implied the gene expression of a capsid protein-RdRp fusion protein, occurring as the result of a potential ribosomal frameshift event. The phylogenetic analysis of RdRp showed that the Korean TVV If-2 isolate formed a compact group with TVV 1-1 and 1-5 isolates, which was divergent from TVV 2-1, 3 and other viral isolates classified as members of the Giardiavirus genus.

사무실 환경 내 다중카메라 영상의 이벤트분석을 통한 자연어 기반 동영상 검색시스템 (Natural Language based Video Retrieval System with Event Analysis of Multi-camera Image Sequence in Office Environment)

  • 임수정;홍진혁;조성배
    • 한국HCI학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국HCI학회 2008년도 학술대회 1부
    • /
    • pp.384-389
    • /
    • 2008
  • 최근 동영상을 저장하거나 효과적으로 검색하는 시스템의 필요성이 증가하고 있다. 기존 동영상 검색 시스템은 메뉴나 텍스트 기반의 키워드로 동작하는데, 검색을 위한 정보가 빈약하여 많은 동영상이 동시에 검색되는 경우가 많고, 사용자가 해당 시스템을 사용하기 위한 지식이 필요하다. 본 논문에서는 키워드 기반 질의에 비해 사용자의 의도나 다양한 정보를 포함 할 수 있고 이벤트나 사람 뿐 아니라 인간의 기본적인 행동까지 검색하는 자연어 질의 기반 동영상 검색 시스템을 제안한다. 먼저, 사무실에서 수집된 동영상에 대한 도메인 분석을 통해 메타데이터로 이벤트 데이터베이스를 구축하고, 해당 영역에서의 사용자 질의에 대한 전처리 과정과 분석 작업을 통해 스크립트 데이터베이스를 구축한다. 이렇게 구축된 시스템을 바탕으로 대화형 질의와 답변 쌍 매칭을 통해 동영상을 검색한다. 10명의 사용자를 대상으로 메뉴 기반 검색 시스템과의 성능 평가와 프로세스 평가 비교 검증을 통해, 성능이나 사용자 만족도면에서 제안하는 시스템이 우수함을 보였다.

  • PDF

동적신뢰도 평가모델의 연구 (A Study on A Dynamic Reliability Analysis Model)

  • 제무성
    • 한국신뢰성학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국신뢰성학회 2000년도 춘계학술대회 발표논문집
    • /
    • pp.239-246
    • /
    • 2000
  • 이 논문은 중대사고가 발생하였을때 운전원에 의하여 사고관리 방안을 수행하는 경우 그 실현성(Feasibility)을, 평가하는데 사용할 수 있는 새로운 시간의존적 신뢰도 분석방법을 제시하였다. 이 방법은 성능요구 (Performance Requirement)와 성능성취 (Performance Achievement)의 상관관계의 개념을 이용하는 신뢰도물리(Reliability Physics)와 모든 시간의존적 사고경위를 도출하는 동적사건수목 생성방법에 기초하고있다. 신뢰도물리는 성능요구변수와 성능성취변수의 비교를 이용한 신뢰도분석방법인 반면 동적사건수목 생성방법은 바람직한 해를 얻을 때까지 모든 가능한 사고경위를 도출해 내는 방법이다. 이 방법론을 정전사고시 참조원전의 공동에 비상화재시스템을 이용하여 물을 공급하는 공동범람사고관리 방안에 적용시켰다. Latin Hypercube Sampling 방법은 성능요구변수의 불확실성을 평가하는데 사용되었다. 제시된 방법론은 사고시 필요한 운전원의 방안수행 성공가능성을 평가하는데 사용될 수 있을 뿐만 아니라 궁극적으로 사고관리 절차서 개발에 도움이 될 수 있음을 보여주었다.

  • PDF

Vbox와 PC-Crash를 활용한 EDR 기록정보의 신뢰성 평가 (Reliability Evaluation of EDR Data Using PC-Crash & Vbox)

  • 박종찬;김종혁;오원택;최지훈;박종진
    • 한국자동차공학회논문집
    • /
    • 제25권3호
    • /
    • pp.317-325
    • /
    • 2017
  • The EDR(Event Data Recorder) is a part of the ACU(Airbag Control Unit) functions mounted on a vehicle. EDR data have pre-crash data and post-crash data. Pre-crash data are recorded within 5 sec from time zero(AE) with 0.5 sec resolution, and reveal vehicle speed, engine rotation speed, throttle opening, brake pedal operation, acceleration pedal position and steering angle, etc. Using this EDR data, the investigation of a traffic accident can become more objective and scientific. Crash tests of three vehicles equipped with EDR function had been performed successfully. Evaluation of EDR data reliability had also been performed using Vbox and PC-Crash's sequence table function. Based on the results, we could confirm EDR data's reliability and availability for Traffic Accident Analysis by the series of this process.

Simulation and Analysis of an Automative Assembly Operation at Mercedes-Benz

  • 박영홍
    • 한국시뮬레이션학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국시뮬레이션학회 1999년도 추계학술대회 논문집
    • /
    • pp.217-217
    • /
    • 1999
  • The main objective of this study is to simulate the design and operational policies of the assembly shop of an automotive plant for planning purposes and to find possible improvements. The simulation study was used to answer the following questions: How does the sequence affect the daily throughput\ulcorner What are the bottlenecks to the assembly lines in a given scenario\ulcorner A Simulation model was developed in accordance with the objective of this study. The model incorporates detailed workstation logic to accurately model downtime results through the use of a pull cord system. It is written with SIMAN. The discrete event feature of SIMAN does not adequately model the conveyor systems of the asembly shop. As a result, a few subroutines were added to the SIMAN modeling structures to mimic the operations of the assembly shop. Use of the model uncovered attractive improvement opportunities, such as a tremendous gain in annual volume if four additional spaces were added to a between-line buffer.

  • PDF

트윗의 타임 시퀀스를 활용한 DTM 분석 : 2019 남북미정상회동 이벤트를 중심으로 (Tweets analysis using a Dynamic Topic Modeling : Focusing on the 2019 Koreas-US DMZ Summit)

  • 고은지;최선영
    • 한국정보통신학회논문지
    • /
    • 제25권2호
    • /
    • pp.308-313
    • /
    • 2021
  • 이 연구는 2019년 판문점 남북미 정상 회동 트윗을 타임 시퀀스와 함께 수집하여 시퀀셜 토픽모델링인 DTM으로 분석하였다. 트위터와 같은 마이크로 블로깅 서비스는 단일 이벤트에 뉴스와 오피니언이 혼재된 비정형 데이터가 대규모로 동시에 발생하고, 정보와 반응이 동일 메시지 형식으로 생산된다. 때문에 토픽 트렌드를 파악하려면 시퀀셜 데이터의 특성을 반영하여 패턴 분석을 해야 맥락적 의미를 알 수 있다. 토픽 일관성 점수를 구해 LDA를 평가한 후 DTM을 계산한 결과, 뉴스 보도와 오피니언 관련 토픽 30개가 도출되었고, 각 토픽과 키워드는 시간에 따라 발생 확률이 역동적으로 진화하고 있었다. 결론적으로 DTM은 특정 이벤트에 대한 사회 전반에 나타난 통합적 토픽 추이를 시간에 따라 분석하는데 적합한 모델임을 밝혔다.

고장파급 시나리오에 기초한 광역정전 해석기법 연구 (Analysis of Power System Wide-Area Blackout based on the Fault Cascading Scenarios)

  • 박찬엄;권병국;양원영;이승철
    • 전기학회논문지
    • /
    • 제57권2호
    • /
    • pp.155-163
    • /
    • 2008
  • This paper presents a novel framework for analysis of power system wide-area blackout based on so called fault cascading scenarios. For a given power system operating state, "triggering" faults or a "seed faults" are chosen based on the probabilities estimated from the hazard rates. The fault probabilities reflect both the load and the weather conditions. Effects of hidden failures in protection systems are also reflected in establishing the fault propagation scenarios since they are one of the major causes for the wide-area blackouts. A tree type data structure called a PS-BEST(Power System Blackout Event Scenario Tree) is proposed for construction of the fault cascading scenarios, in which nodes represent various power system operating states and the arcs are the events causing transitions between the states. Arcs can be either probabilistic or deterministic. For a given initial fault, the total probability of leading to wide-area blackout is estimated by aggregating the individual probability of each fault sequence route leading to wide-area blackout. A case study is performed on the IEEE RTS-79(24 bus) system based on the fault data presented by the North American Electrical Reliability Council(NERC). Test results demonstrate the potentials and the effectiveness of the proposed technique for the future wide-area blackout analysis.

Development of a Sequence Characteristic Amplified Region Marker linked to the L4 Locus Conferring Broad Spectrum Resistance to Tobamoviruses in Pepper Plants

  • Kim, Hyun Jung;Han, Jung-Heon;Yoo, Jae Hyoung;Cho, Hwa Jin;Kim, Byung-Dong
    • Molecules and Cells
    • /
    • 제25권2호
    • /
    • pp.205-210
    • /
    • 2008
  • To develop molecular markers linked to the $L^4$ locus conferring resistance to tobamovirus pathotypes in pepper plants, we performed AFLP with 512 primer combinations for susceptible (S pool) and resistant (R pool) DNA bulks against pathotype 1.2 of pepper mild mottle virus. Each bulk was made by pooling the DNA of five homozygous individuals from a T10 population, which was a near-isogenic $BC_4F_2$ generation for the $L^4$ locus. A total of 19 primer pairs produced scorable bands in the R pool. Further screening with these primer pairs was done on DNA bulks from T102, a $BC_{10}F_2$ derived from T10 by back crossing. Three AFLP markers were finally selected and designated L4-a, L4-b and L4-c. L4-a and L4-c each underwent one recombination event, whereas no recombination for L4-b was seen in 20 individuals of each DNA bulk. Linkage analysis of these markers in 112 $F_2$ T102 individuals showed that they were each within 2.5 cM of the $L^4$ locus. L4-b was successfully converted into a simple 340-bp SCAR marker, designated L4SC340, which mapped 1.8 cM from the $L^4$ locus in T102 and 0.9 cM in another $BC_{10}F_2$ population, T101. We believe that this newly characterized marker will improve selection of tobamovirus resistance in pepper plants by reducing breeding cost and time.