This study was undertaken with packed tofu products to serve as a basic source for sanitary control of tofu production by detecting spoilage bacteria in tofu from which are isolated, investigating heat-resistance and growth characteristics of spoilage bacteria. Isolated strains were confirmed as relevant strains in tofu spoilage, and Strain No. Tl, T2 show 92% probability to be Enterobacter amnigenus, and 96% to be Flavobacterium indologenes according to the result of identifYing strains by using Vitek system. Both strains had high viability at $35^{\circ}C$, pH 6.5. In the heat-resistance test of isolated strains, Enterobacter amnigenus Tl was treated for 2 mins, the number remained 56.3% of the initial number at $60^{\circ}C$, 37.8% at $70^{\circ}C$, 34.0% at $80^{\circ}C$ and 22.2% at $90^{\circ}C$, and Flavobacterium indologenes T2 was treated for 2 mins, the number remained 74.8% of the initial number at $60^{\circ}C$, 65.7% at $70^{\circ}C$, 37.8% at $80^{\circ}C$ and 9.3% at 90^{\circ}C$.
Salt accumulation in soils of greenhouse due to the massive application of nitrogen fertilizers causes salt stress on the various crops, a serious problem in domestic agriculture. Since the majority of the salinity is nitrate, the excess nitrate should be removed; therefore, a bacterial strain having high capacity of nitrate uptake and identified as Enterobacter amnigenus GG0461 was isolated from the soils of greenhouse. Optimum conditions for the bacterial growth and nitrate uptake were investigated. GG0461 was able to grow without nitrate; however, nitrate facilitated the growth. The rate of nitrate uptake increased at alkaline pH and both growth and nitrate uptake were maximal at pH 8-9. When the initial pH of culture medium was increased to pH 8 or 9, it was decreased to neutral upon bacterial growth and nitrate uptake. These results imply that the major factor mediating bacterial nitrate uptake is a nitrate/proton antiporter. The fact was supported by the effect of nitrate addition in the absence of nitrate, since the addition of nitrate greatly increased the nitrate uptake and rapidly decreased pH of media.
Park, Seong-Wan;Yoon, Young-Bae;Wang, Hee-Sung;Kim, Young-Kee
Journal of Applied Biological Chemistry
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v.54
no.4
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pp.252-257
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2011
To remove excess nitrate from the agricultural environments, Enterobacter amnigenus GG0461 has been isolated as a bacterial strain having high capability of nitrate uptake activity. This strain was able to remove nitrate more than 3,000 ppm (50 mM) in the Pseudomonas agar F (PAF) medium. Therefore, it could be a candidate strain for a nitrate scavenger in the various contaminated environments, such as agricultural soils, livestock sewage, and industrial wastewater. In order to develop medium for the large-scale production of the strain GG0461, each component of PAF medium was replaced with the corresponding commercial product and the optimal conditions for bacterial growth and nitrate uptake activity were measured. Glycerol was replaced with the commercially available product and the nitrogen source was substituted with commercial tryptone, yeast extract, soybean meal, and fermented fish extract. Bacterial growth and nitrate uptake activity were maximal in the media containing 2% tryptone, followed by yeast extract, soybean meal, and fermented fish extract. The pH of the growth medium containing 2% tryptone was decreased by the bacterial nitrate uptake, suggesting that the nitrate uptake is mediated by a nitrate/proton antiporter. This result shows that the medium containing commercial tryptone was good enough for the physiological activity of the strain GG0461. Each component of PAF medium was successfully replaced with the corresponding commercial product except peptone. In conclusion, the composition of medium for the cultivation of the strain GG0461 was determined as 2% tryptone, 1% glycerol, plus required salts according to the composition of PAF medium.
Bacterial arylsulfate sulfotransferase (ASST) catalyzes the transfer of sulfate group from a phenyl sulfate ester to a phenolic acceptor. The promoter region and the transcripti on start sites of Enterobacter amnigenus astA have been determined by primer extension analysis. Northern blot analysis resolved two mRNA species with lengths of 3.3 and 2.0 kb, which correspond to the distances between the transcriptional initiation sites and the two inverted repeat sequences (IRSs). By length, the 3.3 kb RNA could comprise the three-gene (astA with dsbA and dsbB) operon. ASST has three highly conserved cysteine residues. Reducing and non-reducing SDS-PAGE and activity staining showed that disulfide bond is needed for the activity of the enzyme. To identify the cysteine residues responsible for the disulfide bond formation, a series of Cys to Ser mutants has been constructed and the enzymatic activity was measured. Based on the results, we assumed that the first cysteine (Cys349) might be involved in disulfide bond mainly with the second cysteine (Cys445) and result in active conformation.
To develop eco-friendly microbial inoculants, siderophore-producing bacteria were isolated and identified, and their production characteristics and plant growth-promoting abilities were investigated. A strain S21 was isolated from rhizosphere of Korean perilla (Perilla frutescens) and identified as Enterobacter amnigenus by phenotypic properties and 16S rRNA gene sequencing. The highest siderophore production was obtained in a medium containing 0.5% fructose, 0.1% urea, 0.5% K2HPO4 and 0.1% succinic acid. By using this improved medium, siderophore production increased by 2.5 times compared to that of basal medium. The strain S21 showed insoluble phosphate solubilizing, ammonification and antifungal activities, and also produced hydrolytic enzymes (protease and lipase), indoleacetic acid and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase. Our data suggest that E. amnigenus S21 is a potential candidate that can be used as eco-friendly biocontrol agent and biofertilizer.
In this study, 50 rump samples of raw beef obtained from local Korean supermarkets were analyzed to survey microbial distributions. As results, mesophilic microorganisms ranged from $(1.4{\pm}0.01){\times}10^2$ to $(1.6{\pm}0.05){\times}10^5\;CFU/g$, and total coliforms ranged from 0 to $(1.3{\pm}0.04){\times}10^4\;CFU/g$. Major foodborne pathogens, including Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7, and Salmonella spp., were not found among the samples. However, Staphylococcus aureus was isolated with 4% frequency. Other isolated microorganisms included Enterobacter amnigenus (4%), Enterobacter cloacae (24%), E. coli (24%), Listeria innocua (8%), Staphylococcus saprophyticus (56%), Staphylococcus xylosus (10%), and Staphylococcus warneri (8%).
Lee In-Hwan;Kim Soo-Kyung;Choi Yun-Hee;Kim Jong-Seol
Korean Journal of Microbiology
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v.42
no.2
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pp.95-102
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2006
To evaluate bacteriological water quality of groundwater in Yeungnam Province, samples were taken from 123 locations during summer and 117 locations during winter. The medians of heterotrophic plate counts.(HPCs) were 30 CFU/mL for the summer samples and 40 CFU/ml for the winter, and more than 25% showed HPCs higher than 100 CFU/ml. Coliform bacteria were detected from 46% of the summer samples and 30% of the winter. In these coliform-positive samples, the medians of coliform counts were 20 CFU/ml for the summer samples and 4 CFU/ml for the winter. Genera such as Citrobacter, Enterobacter, Escherichia, Klebsielia, Pantoea, Rahnellia, and Serratia were identified from the coliform isolates; among them, 48% were members of the genus Enterobacter. While E. cloacae, E. amnigenus, and K. pneumoniae were the most frequently isolated species, E. coli was isolated only from 1 location. The coliform counts were positively correlated with the HPCs, which also positively correlated with water temperature. The results of present study provide further insight on the extent of groundwater contamination with coliform bacteria.
As consumption of kimchi has increased, factories have begun to produce this traditional Korean fermented vegetable dish on a large scale. Following the rise in manufacturing, the hygienic conditions under which commercial kimchi is being made have become an issue. We isolated 17 coliform bacteria from commercial kimchi that had not been fully fermented. These bacteria were partially identified as one of seven different species from three genera by 16S rDNA sequence analysis as follows: Enterobacter intermedius, Ent. cloacae, Ent. amnigenus, Klebsiella terrigena, K. ornithinolytica, K. oxytoca, and Hafnia alvei. Lactobacillus paraplantarum KNUC25 has been isolated from over-fermented Chinese cabbage kimchi and its antimicrobial activity reported in the literature. In our study, the KNUC25 strain showed antibacterial activity against isolated coliform bacteria and some pathogenic coliform bacteria through spot-on-the-lawn tests and viable cell tests. Through development and use of a cell-free supernatant of L. paraplantarum KNUC25, we effectively controlled coliform bacteria in commercial kimchi.
Shin, Yong Kook;Lee, Hyun Ah;Oh, Nam Su;Nam, Myoung Soo
Korean Journal of Agricultural Science
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v.40
no.1
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pp.27-34
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2013
To investigate the distribution of psychrotrophic bacteria, raw milk was collected from farms in nine different regions located around Kyunggi province in South Korea at four different seasons. Psychrotrophic counts were higher in winter than in other seasons as $3.0{\times}10^4$ CFU/mL (p<0.05). Among nine regions, the population in raw milk sampled from B region was in significantly greater numbers and those from C and D province were in significantly lower numbers than any other regions, $2.4{\times}10^5$ CFU/mL and $8.7{\times}10^3$ CFU/mL, respectively (p<0.05). In addition, among 706 bacterial isolates, the predominant class was Gamma-proteobacteria (81.02%) and genus was Pseudomonas (32.34%), especially Pseudomonas fluorescens (39.46%). Compared to the regional predominance, Acinetobacter johnsonii in A region, Pseudomonas fluorescens in B region, Enterobacter amnigenus in C region, Psychrobacter maritimus in D region, Acinetobacter johnsonii in E region, Acinetobacter haemolyticus in F region, Pseudomonas fluorescens in G region, Acinetobacter jounsonii in H region, and Pseudomonas mucidolens in I region were found.
Arylsulfate sulfotransferase (ASST) transfers a sulfate group from a phenolic sulfate ester to a phenolic acceptor substrate. In the present study, the gene encoding ASST was cloned from a genomic library copy of Citrobacter freundii, subcloned into the vector pGEM3Zf(-) and sequenced. Sequencing revealed two contiguous open reading frames (ORF1 and ORF2) on the same strand and based on amino acid sequence homologyl they were designated as astA and dsbA, respectively. The amino acid sequence of astA deduced from C. freundii was highly similar to that of the Salmonella typhimurium, Enterobacter amnigenus, Klebsiella, Pseudomonas putida, and Campylobacter jejuni, encoded by the astA genes. However, the ASST activity assay revealed different acceptor specificities. Using p-nitrophenyl sulfate (PNS) as a donor substrate, $\alpha$-naphthol was found to be the best acceptor substrate, followed by phenol, resorcinol, p-acetaminophen, tyramine and tyrosine.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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