• 원예과학기술지
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• 제32권5호
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• pp.684-693
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• 2014

저온, 건조, 염과 같은 비생물적 스트레스는 식물의 생리적 형태적 변화와 수확량 감소를 초래한다. 이러한 이유로 식물체는 불리한 환경을 극복하기 위해 다양한 대사과정에 관련된 유전자들간의 복잡한 상호 관계를 조절함으로써 저항성을 획득한다. 본 연구는 배추에서 염 스트레스에 반응하는 유전자를 다각적으로 분석하기 위해 상호발현 네트워크를 구축하였다. 네트워크를 구축하기 위하여 배추를 염스트레스 조건 하에서 시간 경과에 따라 KBGP-24K 마이크로어레이 분석을 실시한 [BrEMD (Brassica rapa EST and Microarray Database)] 실험 결과를 수집하여 분석하였다. 구축된 네트워크 모델은 1,853개 node, 5,740개 edge, 및 142개 connected component(상관계수 > 0.85)로 구성되었다. 구축된 네트워크 분석 결과, ROS 신호 전달을 통한 N$Na^+$ 수송활성화와 proline 축적이 배추의 염 저항성 획득과 밀접한 연관이 있는 것으로 판단하였다.

• 대한공간정보학회지
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• 제1권2호
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• pp.159-166
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• 1993

도시화가 진행되면서 상대적(相對的)으로 삼림면적(森林面積)이 감소(減少)되어 환경(環境)이 파괴(破壞)되고 있다. 사진영상에 있는 대상물을 알아내기 위하여 일반적으로 형상 및 크기, 음영, 색조, 색채, 질감, 모양 등으로 판독한다. 촬영시간대에 따른 다양한 정보를 가지고 있는 항공사진(航空寫眞)의 판독(判讀)에 의한 지형정보(地形情報)를 자료기반화하면 경년(經年)의 자연환경변화(自然環境變化)를 알 수 있다. 본 연구에서는 부산직할시 금정구에 위치한 부산대학교(釜山大學校)를 모형지역으로 선정하였다. 경련(經年)의 삼림감소율(森林減少率)을 알기 위해 1980년과 1990년 10년 간격의 삼림면적(森林面積)을 비교(比較)한 결과 감소율(減少率)이 41%에 달하였으며 건설에 있어 단순한 계획이 아닌 보존적(保存的) 차원(次元)의 고려(考慮)가 있어야 함을 알 수 있었다.

• 대한공간정보학회지
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• 제15권3호
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• pp.59-67
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• 2007

본 논문에서는 도시지역 내 건축물의 지진 안전도를 평가하기 위하여 건축 구조학적인 자료조사와 실험결과를 데이터베이스화하고 여기에 GIS를 연계하여 지진의 위험도를 체계적으로 관리하고 분석할 수 있는 지진재해관리용 정보체계구축의 가능성을 제시하였다. 내진성능 평가를 위하여 건축물 대장과 건축도면, 수치지형도 등을 활용하여 건물의 구조, 주요 구조부재 등 지진내진평가 항목별로 자료를 수집 정리한 후 현장조사를 통해 자료를 보완하였으며, 내진 성능평가를 실시하고 종합평가지수를 산정한 후 지진 위험도를 평가함으로서 지진재해를 효과적으로 대처하고 관리할 수 있는 GIS 기반 정보체계를 구축하였다. 향 후 건물별 지진 위험도를 평가하는 절차와 방법을 모듈화 할 경우 보다 신속하고 정확한 지진재해정보관리체계를 구축할 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2010년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.11-11
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• 2010

The Korean ginseng, Panax ginseng C. A. Meyer is a popular medicinal herb in Araliaceae. Genetic map in crops provides valuable information for breeding, genetic and genomic researches. However, little information is available for construction of genetic map in ginseng. Up to now, we have produced large amounts of expressed sequence tags (ESTs) from four ginseng cultivars (37Mb, 49Mb, 39Mb, 47Mb from Gopoong, Gumpoong, Chunpoong and Yunpoong respectively using pyrosequencing technique and 5Mb from normalized full-length cDNA library of Chunpoong) to obtain comprehensive information of gene expression, and constructed EST database including ESTs from public database. Till now, we designed 261 SSR primer sets using EST sequences and identified 106 intergenic polymorphic markers. And 44 of the 106 showed polymorphisms among panax ginseng cultivars. Among 44 markers, 27 SSR polymorphic markers were inspected to 51 $F_2$ population from Yunpoong x Chunpoong, which showed good at the fitness of Mendellian segregation ratio 1:2:1. To enrich the number of markers, and thus construct high resolution genetic map which can be used as frame map for further genome sequencing. we are planning to develop large scale EST-derived SNP markers which are available in the F2 population. This study provides genetic information as well as foundation for ginseng researches such as genetics, genomics, breeding, and the final goal for whole genome sequencing. This study was supported by Technology Development Program for Agriculture and Forestry, Ministry for Food, Agriculture, Forestry and Fisheries, Republic of Korea (Grant No. 609001-051SB210).

• Spatial Information Research
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• 제11권2호
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• pp.155-170
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• 2003

GIS를 이용한 홍수침수 분석시스템이 공항배수유역의 침수현상을 모의하기 위해 개발되었다. 본 연구에서 개발된 모형은 사용자 인터페이스인 GUI 시스템을 통한 Database 구축 및 입력자료 작성을 위한 전처리 과정과 주처리 해석모형을 통해 계산된 결과를 그래픽으로 처리하는 후처리 과정을 GIS(ArcView/Avenue)와 연계하여 통합적으로 구축·제시되었다. 주처리 해석모형은 노면수의 거동분석 모형과 하수배수체계의 분석모형을 통합하여 상호 연계 현상을 모의함으로써 유역에서의 유출량과 배수시스템과의 실제적인 거동을 해석하여 배수관로의 배수효과 및 압력류에 의한 침수현상을 모의함으로써 배수관로 유입에 따른 실제적인 현상을 모의하였다. 본 연구에서 개발된 홍수침수분석시스템은 향후 공항에서의 침수피해에 대한 시설전반에 대해 합리적인 대책관리방안 및 시설개선방안 수립을 위한 체계적인 의사결정에 크게 기여할 것으로 사료된다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제23권1호
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• pp.171-177
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• 2012

컴퓨터의 발달로 인해 여러 가지 현상들이 수치화되어 데이터로 수집되고 있다. 특히 많은 양의 데이터가 각 분야별로 수집되고 있는데 이는 데이터를 기초로 한 분석과 해석을 통하여 의사 결정의 뒷받침이 되는 정보를 얻기 위해서이다. 데이터의 중요성이 부각되면서 데이터의 관리가 관심사가 되었다. 많은 연구자들이 공유할 수 있도록 서버에 데이터베이스를 구축하고 이를 웹 브라우저를 통하여 조회 및 확인하는 시스템을 구축하는 것이 필요하다. 본 연구에서는 연구자가 가장 많이 사용하는 엑셀 파일을 서버 데이터베이스에 업로드 하였고, 웹기반의 데이터베이스와 연동하여 연구자가 업로드한 데이터를 조회 및 확인할 수 있는 웹기반 프로그램을 개발하였다. 웹을 기반으로 데이터를 업로드 할 DB로 오라클을 사용하였으며 데이터베이스를 조회하기 위하여 웹프로그래밍 언어인 html, JAVA, JSP 등을 사용하여 웹기반 임상데이터 관리 시스템 구축을 위한 프로그램을 개발하였다.

• Spatial Information Research
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• 제19권1호
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• pp.73-82
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• 2011

최근, 지적도 이용에 대한 요구사항이 공공기관과 민간부문에서 높아지고 있는 추세이다. 지적도를 웹 환경 또는 모바일 환경에서 활용하기 위해서는 원 지도자료를 임의 단계의 축척 별로 압축해 놓은 다축척 공간표현 데이터베이스로 구축되어야 할 필요가 있다. 본 연구에서는 기존의 연속지적도를 다축척 공간표현 데이터베이스로 구축하는데 있어서 지형도와의 중첩과 폴리곤 지도 일반화 기법을 적용하는 방안에 대해서 제안하였다. 이 과정은 크게 지형도 네트워크 데이터 재구조화, 네트워크 위계에 따른 필지경계선 병합, 선형 단순화 기법 적용의 세 단계로 이루어져 있다. 본 연구에서 제안된 일반화 기법을 수원지역의 연속지적도에 적용한 결과, 1:5,000, 1:20,000, 1:100,000 세 축척의 연속지적도로 각각 일반화 되었으며, 데이터 압축률은 각각 15%, 8%, 1% 수준으로 나타났다.

• 제어로봇시스템학회논문지
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• 제11권10호
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• pp.851-856
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• 2005

The DNA and protein data of diverse species have been daily discovered and deposited in the public archives according to each established format. Database systems in the public archives provide not only an easy-to-use, flexible interface to the public, but also in silico analysis tools of unidentified sequence data. Of such in silico analysis tools, multiple sequence alignment [1] methods relying on pairwise alignment and Smith-Waterman algorithm [2] enable us to identify unknown DNA, protein sequences or phylogenetic relation among several species. However, in the existing multiple alignment method as the number of sequences increases, the runtime increases exponentially. In order to remedy this problem, we adopted a parallel processing suffix tree algorithm that is able to search for common subsequences at one time without pairwise alignment. Also, the cross-matching subsequences triggering inexact-matching among the searched common subsequences might be produced. So, the cross-matching masking process was suggested in this paper. To identify the function of the clusters generated by suffix tree clustering, BLAST was combined with a clustering tool. Our clustering and annotating tool is summarized as the following steps: (1) construction of suffix tree; (2) masking of cross-matching pairs; (3) clustering of gene sequences and (4) annotating gene clusters by BLAST search. The system was successfully evaluated with 22 gene sequences in the pyrubate pathway of bacteria, clustering 7 clusters and finding out representative common subsequences of each cluster

• 한국지리정보학회지
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• 제14권2호
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• pp.128-137
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• 2011

본 산림항공사진 영상판독시스템 개발은 기존의 아날로그 방식의 제작과정을 개선하기 위해 제작 기반 기술 및 작업공정을 최적화하여 임상도 제작의 정확성과 효율성을 높이는데 그 목적이 있다. 이를 위해 시스템 구축에 필요한 수치임상도, 항공사진, 수치지형도 등의 DB 모델을 설계하고 검색 엔진, 화면제어, 입체 판독 모드 전환, 편집 도구, 출력 레이아웃 자동 설정 등의 기능과 연동될 수 있도록 인터페이스를 간결하게 구성하였다. 이를 바탕으로 표준화된 방법론을 제시함으로서 각종 수치주제도를 제작하는데 응용 및 확장할 수 있으며, 의사 결정 활용 및 신속한 산림자원정보를 전달할 수 있을 것으로 기대된다.

• 천문학회보
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• 제37권2호
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• pp.138.2-138.2
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• 2012

Cave on the Moon is considered as the most appropriate place for human to live during the frontier lunar exploration. While the lava flows, the outer crust gets cooled and solidified. Then, the empty space is remained inside after lava flow stops. Such empty space is called the lava caves. Those lava tubes on the Earth are formed mostly by volcanic activity. However, the lava tubes on satellite like Moon and planet like Mars without volcanic activity are mostly formed by the lava flow inside of the crater made by large meteorite impact. Some part of lava tube with collapsed ceiling appears as the entrance of the cave. Such area looks like a deep crater so called a pit crater. Four large pit craters with diameter of > 60 m and depth of > 40 m are found without difficulty from Kaguya and LRO mission image archives. However, those are too deep to use as easily accessible human frontier base. Therefore, now we are going to identify some smaller lunar caves with accessible entrances using LRO camera images of 0.5 m/pixel resolution. Earth's lava caves and their entrances are well photographed by surface and aerial camera in immense volume. Thus, if the image data are sorted and archived well, those images can be used in comparison with the less distinct lunar cave and entrance images due to its smaller size. Then, we can identify the regions on the Moon where there exist caves with accessible entrances. The database will be also useful in modeling geomorphology for lunar and Martian caves for future artificial intelligence investigation of the caves in any size.