• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
• /
• 제8권4호
• /
• pp.221-226
• /
• 2003

With the current rapid development of nanotechnology and synthesis technology for designed oligonucleotides or oligonucleotide-modified nanoparticle conjugates, the combined strategies have become one of the most valuable methods in detection technology for DNA analysis. Using the uniquely recognizable interactions of pre-designed DNA molecules in assembling nanoparticles, various novel approaches have been recently developed towards detecting specific DNA sequences. Here we describe the key fundamentals and issues of this promising strategies ranging from the initial findings of rationally designed DNA-based assembly of nanoparticles to the extended chip-based detection system. Some limitations of these new strategies and possible approaches will be also discussed for the practical application in the area of DNA microarray detection.

• 한국고분자학회:학술대회논문집
• /
• 한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
• /
• pp.353-353
• /
• 2006

Deoxyribonucelic acid (DNA) molecules have a huge molecular weight so that DNA was reported to be a promising natural polymer to give durable films. Among many applications of DNA, the authors focused their attention on separation membranes derived from DNA because membranes will play an important role in environmental and energy related processes. DNA-polyion complex membranes were prepared from DNA and corresponding polycations. The DNA-polyion complex membranes showed chiral separation ability toward racemic amino acid mixtures.

• JSTS:Journal of Semiconductor Technology and Science
• /
• 제1권4호
• /
• pp.232-238
• /
• 2001

A new DNA purification chip is proposed and fabricated for the sample preparation of Nucleic Acid (NA) probe assay. The proposed DNA purification chip is fabricated using photosensitive glass substrate and polydimethylsiloxane (PDMS) cover fixture. We have successfully captured and eluted the DNA using the fabricated photosensitive glass chip. The fabricated DNA purification chip showed a binding capacity of $15ng/\textrm{cm}^2$and a minimum extractable input concentration of $100copies/200\muL$. The proposed DNA purification chip can be applied for low-cost, disposable sample preparation of NA probe assays.

• 한국식품과학회지
• /
• 제19권4호
• /
• pp.311-316
• /
• 1987

지질산화에 의한 DNA손상작용기구를 구명하기 위하여 linoleic acid와 DNA의 반응계에 각종(各種)의 활성산소소거제(活性酸素消去劑)를 첨가하여 $37^{\circ}C$에서 반응시키고 linoleic acid산화에 의하여 생성하는 활성산소종(活性酸素種)의 DNA손상작용을 조사하였는데 다음과 같은 결과를 얻었다. 첨가한 활성산소소거제중(活性酸素消去劑中) ${\alpha}-tocopherol$과 SOD가 DNA손상을 크게 억제하여 linoleic acid산화에 의한 DNA손상작용에는 일중항산소와 superoxide anion이 크게 영향을 미쳤으며 그중에서도 일중항산소가 더욱 크게 영향을 미친 것으로 나타났다. 반면에, 수산(水酸) radical과 과산화수소는 DNA손상에 크게 영향을 미치지 않았다. 또한, linoleic acid와 DNA가 공존(共存)하는 경우에만 DNA의 손상이 일어나는 것을 알 수 있었다. 활성산소소거제(活性酸消去劑)를 첨가한 반응계에서 linoleic acid만의 대조구에 비하여 POV와 공액diene의 증가를 크게 억제하였으며 그중에서도 SOD와 ${\alpha}$-tocopherol의 항산화능이 가장 큰 것으로 나타나 지질산화과정에서의 활성산소종(活性酸素種)의 관여는 각각 다른 형태로 이루어지는 것을 알 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제28권4호
• /
• pp.527-533
• /
• 2018

This study compared the radioprotective effects of high-molecular-weight poly-gamma-glutamate (${\gamma}-PGA$, average molecular mass 3,000 kDa) and a reduced form of glutathione (GSH, a known radioprotector) on calf thymus DNA damage. The radiation-induced DNA damage was measured on the basis of the decreased fluorescence intensity after binding the DNA with ethidium bromide. All the experiments used $^{60}Co$ gamma radiation at 1,252 Gy, representing 50% DNA damage. When increasing the concentration of ${\gamma}-PGA$ from 0.33 to $1.65{\mu}M$, the DNA protection from radiation-induced damage also increased, with a maximum of 87% protection. Meanwhile, the maximal DNA protection when increasing the concentration of GSH was only 70%. Therefore, ${\gamma}-PGA$ exhibited significant radioprotective effects against gamma irradiation.

• 한국전기전자재료학회논문지
• /
• 제17권7호
• /
• pp.729-737
• /
• 2004

In this paper, a DNA chip with a microelectrode array was fabricated using microfabrication technology. Several probe DNAs consisting of mercaptohexyl moiety at their 5 end were immobilized on the gold electrodes by DNA arrayer. Then target DNAs were hybridized and reacted with Hoechst 33258, which is a DNA minor groove binder and electrochemically active dye. Linear sweep voltammetry or cyclic voltammetry showed a difference between target DNA and control DNA in the anodic peak current values. It was derived from Hoechst 33258 concentrated at the electrode surface through association with formed hybrid. It suggested that this DNA chip could recognize the sequence specific genes.

• 한국수산과학회지
• /
• 제20권3호
• /
• pp.213-218
• /
• 1987

고도불포화지방산함량이 많은 적색육어류지질의 산화에 의한 DNA 손상작용기구를 조사하기 위하여 고등어를 시료로 하여 추출한 지질을 plasmid pBR 322DNA와 $37^{\circ}C$에서 반응시켜 경시적인 DNA 손상정도를 조사하였으며 이와 함께 지질과 DNA의 반응계에 각종 활성산소소거제를 일정농도씩 첨가하고 지질산화로 일어나는 DNA 손상에 대한 활성산소종의 영향을 비교${\cdot}$ 검토하였다. 고등어 지질의 농도가 클수록 DNA 손상작용이 컸으며 이러한 작용은 고등어 지질의 POV가$100millieq{\cdot}/kg$이하에서 진행된 것으로 나타났다. 또한 활성산소종중 일중항산소$(^1O_2)$와 superoxide anion$({\cdot}O_2^-)$ DNA 손상작용이 가장 컸으며 수산 radical과 과산화 수소는 반응1일이후 거의 영향을 미치지 않아 반응초기의 DNA 손상작용에 관여할 것으로 생각된다. 또한, 고등어 지질의 산화에 대한 활성산소종의 영향을 살펴 본 결과, DNA 손상에 대한 결과와 마찬가지로 일중항산소와 superoxide anion의 영향이 큰 것으로 보아 고등어 지질의 산화반응이나 DNA 손상작용에 있어서 활성산소종이 밀접한 관계가 있는 것으로 나타났다.

• 대한의생명과학회지
• /
• 제28권3호
• /
• pp.157-169
• /
• 2022

DNA typing is the typical technology in the forensic science and plays a significant role in the personal identification of victims and suspects. Short tandem repeat (STR) is the short tandemly repeated DNA sequence consisting of 2~7 bp DNA units in specific loci. It is disseminated across the human genome and represents polymorphism among individuals. Because polymorphism is a key feature of the application of DNA typing STR analysis, STR analysis becomes the standard technology in forensics. Therefore, the DNA database (DNA-DB) was first introduced with 4 essential STR markers for the application of forensic science; however, the number of STR markers was expanded from 4 to 13 and 13 to 20 later to counteract the continuously increased DNA profile and other needed situations. After applying expanded STR markers to the South Korean DNA-DB system, it positively affected to low copy number analysis that had a high possibility of partial DNA profiles, and especially contributed to the theft cases due to the high portion of touch DNA evidence in the theft case. Furthermore, STR marker expansion not only contributed to the resolution of cold cases but also increased kinship index indicating the potential for improved kinship test accuracy using extended STR markers. Collectively, the expansion of the STR locus was considered to be necessary to keep pace with the continuously increasing DNA profile, and to improve the data integrity of the DNA-DB.

• 한국수산과학회지
• /
• 제20권4호
• /
• pp.300-307
• /
• 1987

어유의 산화에 의한 DNA 손상작용기구를 밝히는 연구의 일환으로 고등어에서 추출한 지질을 다시 극성 및 비극성지질로 분획하여 이들을 각각 plasmid DNA와 $37^{\circ}C$에서 반응시키면서 이들 지질의 산화에 의한 DNA 손상작용을 $1\%$ agarose gel 전기영동을 통하여 조사하였는데 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 극성지질을 DNA와 반응시킨 경우에는 가장 적은 농도에서도 DNA 손상작용이 크게 나타나 반응 l일째에 Form I DNA가 완전히 절단되어 Form II 및 Form III DNA로서 검출되었다. 극성지질의 산화에 의하여 그 농도가 증가함에 따라 POV의 증가가 빠르게 이루어졌으나 반응 4일동안 POV가 100 millieq./kg 이하에서 DNA 손상작용이 일어나는 것을 알 수 있었고, 한편, 극성지질의 산화에 의한 DNA 손상작용에 대한 활성산소종의 영향에서는 총지질의 경우처럼 일중항산소 $^1O_2$와 superoxide anion ${\cdot}O_2^1$의 영향이 가장 컸으며 수산 radical${\cdot}OH$과 과산화수소$(H_2O_2)$는 그다지 뚜렷한 영향을 나타내지 않았다. 비극성지질의 경우에서도 극성지질과 마찬가지로 농도에 따라 DNA 손상능이 커졌으나 극성지질과 총지질에 비하여 그 정도가 훨씬 떨어지는 것을 알 수 있었으며, 이상의 DNA 손상작용에 대한 활성산소종의 영향에 있어서도 극성지질과 동일한 경향을 나타내었다.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
• /
• 제31권4호
• /
• pp.387-393
• /
• 2004

DNA 컴퓨팅은 생체 분자들의 막대한 병렬성을 정보 처리 기술에 적용한 기술로, Np-complete문제를 해결하기 위하여 사용되고 있다. 하지만 DNA 컴퓨팅 기술만으로 NP-complete 문제를 해결할 경우에는 해를 찾지 못하거나 많은 시간이 걸리는 문제점이 있다. 본 논문에서는 DNA 코딩 방법을 적용하여 DNA 서열을 효율적으로 표현하고, 반응횟수 만큼 합성과 분리 과정을 거쳐 코드를 생성하는 ACO(Algorithm for Code Optimization)를 제안했다. 그리고 ACO를 NP-complete 문제 중의 하나인 Hamiltonian Path Problem에 적용하였다. 그 결과 ACO는 Adleman의 DNA 컴퓨팅 알고리즘 보다 가변길이의 DNA 코드를 효율적으로 표현할 수 있다는 것을 확인하였다. 또 한 ACO는 Adleman의 DNA 컴퓨팅 알고리즘 보다 탐색 시간과 생물학적 오류율을 50%정도 줄일 수 있었으며, 빠른 시간 내에 정확한 경로를 탐색할 수 있었다.