• BMB Reports
• /
• 제49권7호
• /
• pp.359-369
• /
• 2016

DNA methylation is emerging as an attractive marker providing investigative leads to solve crimes in forensic genetics. The identification of body fluids that utilizes tissue-specific DNA methylation can contribute to solving crimes by predicting activity related to the evidence material. The age estimation based on DNA methylation is expected to reduce the number of potential suspects, when the DNA profile from the evidence does not match with any known person, including those stored in the forensic database. Moreover, the variation in DNA implicates environmental exposure, such as cigarette smoking and alcohol consumption, thereby suggesting the possibility to be used as a marker for predicting the lifestyle of potential suspect. In this review, we describe recent advances in our understanding of DNA methylation variations and the utility of DNA methylation as a forensic marker for advanced investigative leads from evidence materials.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
• /
• 제5권2호
• /
• pp.71-78
• /
• 2000

The recent progress od DNA technologies including DNA fingerprinting (DFP) and random amplified DNA polymorphism (RAPD) analysis make it possible to identify the specific genetic trits of animals and to analyze the genetic diversity and relatedness between or withinspecies or populations. Using those techniquse, some efforts to identify and develop the specific DNA markers based on DNA polymorphism, which are related with economic traits for Korean native animals, Hanwoo(Korean native cattle),Korean native pig and Korean native chicken, have been made in Korea for recent a few years. The developed specific DNA markers successfully characterize the Korean native animals as the unique Korean genetic sources, distinctively from other imported breeds. Some of these DNA markers have been related to some important economic traits for domestic animals, for example, growth rate and marbling for Honwoo, growth rate and back fat thinkness fornative pig, and growth rate, agg weight and agg productivity for native chicken. This means that those markers can be used in important marker-assised selection (MAS) of Korean native domestic animals and further contribute to genetically improve and breed them.

• 한국잠사곤충학회지
• /
• 제38권1호
• /
• pp.53-56
• /
• 1996

곤충세포주로 널리 이용되고 있는 Sf 세포주와 Bm 세포주의 분자생물학적 표식자를 탐색하기 위하여, 총 세포 단백질의 SDS-PAGE와 genomic DNA를 RAPD(Random Amplification of Polymorphic DNA) 방법으로 분석하였다. 그 결과, 총 세포 단백질 및 genomic DNA, 패턴에서 두 세포주를 뚜렷하게 구별할 수 있는 밴드를 탐색하였으며, 이들은 유용한 분자 생물학적 표식자로 이용될 수 있을 것이다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제31권1호
• /
• pp.33-40
• /
• 2015

Pigeonpea Sterility Mosaic Disease (PSMD) is an important foliar disease caused by Pigeonpea sterility mosaic virus (PPSMV) which is transmitted by eriophyid mites (Aceria cajani Channabasavanna). In present study, a F2 mapping population comprising 325 individuals was developed by crossing PSMD susceptible genotype (Gullyal white) and PSMD resistant genotype (BSMR 736). We identified a set of 32 out of 300 short decamer random DNA markers that showed polymorphism between Gullyal white and BSMR 736 parents. Among them, eleven DNA markers showed polymorphism including coupling and repulsion phase type of polymorphism across the parents. Bulked Segregant Analysis (BSA), revealed that the DNA marker, IABTPPN7, produced a single coupling phase marker (IABTPPN $7_{414}$) and a repulsion phase marker (IABTPPN $7_{983}$) co-segregating with PSMD reaction. Screening of 325 F2 population using IABTPPN7 revealed that the repulsion phase marker, IABTPPN $7_{983}$, was co-segregating with the PSMD responsive SV1 at a distance of 23.9 cM for Bidar PPSMV isolate. On the other hand, the coupling phase marker IABTPPN $7_{414}$ did not show any linkage with PSMD resistance. Additionally, single marker analysis both IABTPPN $7_{983}$ (P<0.0001) and IABTPPN $7_{414}$ (P<0.0001) recorded a significant association with the PSMD resistance and explained a phenotypic variance of 31 and 36% respectively in $F_2$ population. The repulsion phase marker, IABTPPN7983, could be of use in Marker-Assisted Selection (MAS) in the PPSMV resistance breeding programmes of pigeonpea.

• 한국버섯학회지
• /
• 제11권3호
• /
• pp.171-176
• /
• 2013

큰느타리버섯의 저온성적응성 형질에 관련된 SCAR marker를 개발하기 위하여 저온성 계통의 8균주와 대조구 8균주의 genomic DNA를 30 ug/ml의 농도로 bulking한 것을 주형 DNA로 사용하고 operon 사의 OPA(20개), OPB(20개), OPL(20개), OPP(20개), OPR(20개), OPS(20개) 등 총 120개 primer를 random primer(10 mer)로 사용하여 RAPD를 수행하였으며 이중에서 OP-S3 primer를 사용한 PCR 산물들이 대조구와 가장 뚜렷한 차이를 나타내었다. OP-S3 primer를 이용한 RAPD 결과, 약 480 bp 부근에서 저온성 계통에 특이적인 DNA band가 관찰되었으며 이 DNA band의 염기서열을 근거로 SCAR marker로 사용할 specific primer인 OP-S3-1-F와 OP-S3-1-R를 디자인하였다. SCAR marker OP-S3-1 primer를 이용하여 PCR을 수행한 결과에서는 저온성 계통에서만 480 bp 부근에서 대조구와 구별되는 DNA band를 확인할 수 있었으며 random primer인 OP-S3 primer를 이용하여 PCR을 수행했을 때보다 재현성이 높고 진한 DNA band를 확인할 수 있었다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
• /
• 제15권1호
• /
• pp.75-81
• /
• 2004

We selected, in previous research, a major DNA Marker 235bp of ILSTS035 microsatellite locus in progeny test Hanwoo chromosome 6. We apply a major DNA Marker 235bp to perormance valuation Hanwoo chomosome 6. We use bootstrap BCa method and calculate confidence interval. A major DNA Marker 235bp is verified that it does not have environmental effect but affects primely economic trait factor.

• 농업과학연구
• /
• 제33권1호
• /
• pp.1-10
• /
• 2006

본 연구는 개발된 품종 특이적인 DNA 표지인자를 이용하여 한우와 비한우의 고기를 판별하고자 하였다. 한우와 유럽종 고기소들의 유전적 차이를 Random amplified polymorphic DNA(RAPD) 분석으로 조사한 바, 홀스타인, 헤어포드, 에버딘엥거스, 리모진 및 시멘탈과 같은 한우가 아닌 유럽 종들의 RAPD 패턴들은 동일하였으나, 한우는 이들과 다른 패턴을 보였다. 한우는 유럽종들에서 모두 검출된 특정의 밴드가 발견되지 않았다. 1.4Kbp인 밴드는 한우와 수입소 고기를 판별해 낼 수 있는 유용한 DNA 표지인자로 인정되었다. 실제로, 한우 673 마리, 홀스타인 141 마리의 혈액시료 및 수입육 115의 고기시료를 가지고 시행한 실험에서 그 DNA 표지인자는 비한우에서는 256두 중 245두에서 검출되었으나, 한우에서는 673두 중 644두의 시료에서 검출되지 않아서, 비한우의 검출율은 95%, 한우의 비검출율은 96%를 보였다. 이러한 결과는 그 DNA 표지인자를 이용하여 한우와 비한우 고기를 판별할 수 있음을 시사하였다. 그러나 두 품종 사이의 교잡종은 한우나 비한우의 RAPD 패턴 중에서 한 가지를 무원칙하게 선택하여 나타내고 있으므로, 이러한 DNA 표지인자만으로서는 판별하기가 어려웠다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
• /
• 제18권1호
• /
• pp.175-184
• /
• 2007

LOD scores and a permutation test for detecting and locating quantitative trait loci (QTL) from the Hanwoo economic trait have been described and we selected a considerable major BMS1167 locus for further analysis. K-means clustering analysis, for the major DNA marker mining of BMS1167 microsatellite loci in Hanwoo chromosome17, has been tried and three cluster groups divide four traits. The three cluster groups are classified according to eight DNA marker bps. Finally, we employed the bootstrap test method to calculate confidence intervals using the resampling method to find major DNA markers. We conclude that the major marker of BMS1167 locus in Hanwoo chromosome17 is only DNA marker 100bp.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
• /
• 제15권1호
• /
• pp.41-47
• /
• 2004

DNA marker 95bp and 100bp are selected as major DNA markers of the BM4311 microsatellite locus in progeny test Hanwoo chromosome 6 linkage map. This document is tried to know whether DNA marker 95bp and 100bp are also major DNA markers in Hanwoo performance valuation in chromosome 6 linkage map. The bootstrap BCa method will be used to calculate confidence interval for DNA markers.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제22권4호
• /
• pp.301-309
• /
• 2002

본 연구는 AFLP-PCR 유전자 지문분석 기법을 이용하여 우리나라 고유의 동물유전자원으로서 재래흑염소의 품종 및 흑염소육 감별을 위한 품종 특이적 DNA marker를 개발하고자 수행하였다. 흑염소로부터 추출한 genomic DNA를 EcoR I/Hind III 및 Taq I/Hind III 2종류의 제한효소 조합으로 이중 절단한 후 10종류의 two selective primer조합형을 이용하여 분석한 결과 각 printer 조합형당 검출된 AFLP band의 수는 36~74개의 범위로 평균 55.5개였다. 그리고 검출된 총 555개의 band 가운데 polymorphic band의 수는 149 개로 다형성 수준은 약 26.8%로 추정되었다. 재래흑염소 품종 특이적인 AFLP marker를 탐색하고자 육용종 수입흑염소 및 4품종의 유용종 염소와 AFLP 지문양상을 비교 검토한 결과 M13/H13 primer 조합형에서 2.01과 1.26 kb의 2개 band 그리고 E35/H14 primer 조합형에서 1.65 kb의 1개 band가 재래흑염소의 품종 특이적 AFLP marker로 검출되었다. 그리고 E35/H14 primer 조합형에서 수입흑염소의 2.19, 2.03, 0.96 및 0.87 kb band, Saanen종의 2.13 kb band, Nubian종의 2.08 kb band는 각 해당 품종에만 특이적으로 출현하는 품종 특이적 band로 확인되었다. 또한, E35/H13 primer 조합형에서 재래흑염소를 특히, Saanen종과 식별이 가능한 4개의 DNA band가 확인되었다. 따라서, 본 연구에서 AFLP-PCR 기법을 이용하여 검출한 품종 특이적 DNA band들은 우리나라 재래흑염소, 수입흑염소 및 유용종 염소품종들간에 명확히 구별되어 재래종 흑염소 육과 육제품의 품종판별에 매우 유용한 DNA marker로 이용 가능할 것으로 기대된다.