• 대한화학회지
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• 제54권5호
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• pp.573-578
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• 2010

본 연구에서는 염화제1철을 2,4-디히드록시살로펜과 조합하여 2,4-디히드록시살로펜-염화철을 합성하였다. 이 복합체를 자외선-가시광선 분광법, IR 분광법으로 분석하였고, 천연의 송아지 흉선 DNA (ct-DNA)와 2,4-디히드록시살로펜-염화철의 상호작용을 자외선-가시광선 분광법, 형광분광법, 열변성 분석법, 점성측정법을 이용하여 조사하였다. 분광학적 적정실험으로 밝힌 2,4-디히드록시살로펜-염화철과 ct-DNA 사이의 결합상수는 $(1.6{\pm}0.2){\times}10^3\;M^{-1}$이었다. 형광분광분석을으로 브롬화 에티디움의 DNA 결합이 2,4-디히드록시살로펜-염화철에 의하여 저해되는 것을 관찰하였다. 이 저해효과는 2,4-디히드록시살로펜-염화철의 농도에 따라 선형의 Stern-Volmer 방정식을 따른다. 열변성 실험으로 2,4-디히드록시살로펜-염화철이 DNA의 녹는점을 약 $4.3^{\circ}C$ 증가시킨다는 것을 관찰하였다. 이 결과들은 2,4-디히드록시살로펜-염화철이 대부분 ct-DNA의 큰고랑과 상호작용한다는 모델을 잘 설명하여 준다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제16권11호
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• pp.2557-2562
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• 2012

세포에서 질서를 유지하기 위해서는 유전정보에 대한 지속적인 감시와 회복체계를 필요로 한다. DNA는 염기쌍의 결합으로 이루어지는데, 틀린 염기쌍이 정상적인 염기쌍보다 훨씬 낮은 빈도로 형성되지만, 이것이 수정되지 않고 DNA내에 축적될 경우 세포가 죽기도 한다. 본 연구에서는 DNA 복제 시 발생하는 실수, 손상된 부분을 회복하는 DNA 복구 기능을 모사하여 공학적인 개념을 도입한다. 기존에 발표 되었던 부분을 보완하여 여러 군데에서 발생한 오류 위치를 찾아내고 복구시키는 효율적인 알고리즘을 제시한다.

• 미생물학회지
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• 제37권1호
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• pp.37-41
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• 2001

Pleurotus ostreatus에서는 10.2 kb와 7.2 kb의 미토콘드리아 선상 플라스미드 DNA가 존재함이 발견되었다. 이 플라스미드 DNA의 양쪽 5'말단에는 단백질이 공유 결합되어있다고 알려져 있다. 최근에 P.ostreatus의 10.2 kb 미토콘드리아 선상 플라스미드 DNA를 다른 곰팡이의 선상 플라스미드 DNA에 존재하는 open reading frame(ORF)와 비교 분석하여 Podospora anserina의 플라스미드 pAL2의 DNA polymerase 및 RNA polymerase 암호부위와 유사성이 있음이 확인되었다. 본 연구에서는 7.2 kb선상 DNA를 HindIII잘라서 얻은 2조각의 절편(4.7 kb, 2.3 kb)을 클로닝하고 염기 서열을 분석하였다. 클로닝된 7 kb 절편에는 3개의 ORF,즉 ORF1(2982 bp, 993 amino acids), ORF2(2703 bp, 900 amino acids), ORF3(771 bp, 256 amino acids)가 존재함을 확인하였다 또한, 이들의 ORF를 분석한 결과, DNA polymerase와 RNA polymerase 암호부위와 유사성 이 있음을 확인하였다.

• 한국양식학회지
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• 제11권3호
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• pp.327-335
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• 1998

본 연구는 PCR을 이용하여 brook trout의 성장호르몬 cDNA를 증폭시켰다. 증폭된 brook trout의 성장호르몬 cDNA의 전 염기서열은 1,120bp로 13bp의 5'uncoding region과 477bp의 3'uncoding region 그리고 630bp로 coding되는 210 아미노산 잔기가 open reading frame(ORF)을 구성하고 있음을 알았다, 또한, ORF의 아미노산 배열로부터 22개의 아미노산으로 이루어진 signal peptide 그리고 4개의 cysteine 잔기로부터 2개의 disulfide bond 결합을 하고있었으며, 이는 성장호르몬 단백질이 종을 초월하여 2개의 disulfide bond 결합으로 이루어진 고치구조를 형성하고 있는 것이 시사되었다. 그리고 Atlantic salmon과 97.1%, chum salmon과 94.8%, rainbow trout와 94.3%, coho salmon과 91.9%, tuna와 66.2%, tilapia와 63.5%, yellow tail과 62.9%, carp와 62.3%, flounder와 53.8%, eel과 48.1%의 아미노산 상동성을 나타냈다.

• 생명과학회지
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• 제21권8호
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• pp.1067-1075
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• 2011

CCDC98 단백질은 BRCA1-A 복합체를 DNA 손상 부위로 이동시킴으로써 DNA손상에 의하여 유도되는 G2/M cell cycle checkpoint에 중요한 역할을 한다고 알려져 있다. 하지만 많은 연구에도 불구하고 CCDC98 단백질의 기능에 대해서 알려진 바가 거의 없다. 본 연구는 CCDC98 단백질의 기능을 밝히고자 tandem affinity purification 방법을 수행하였다. 그 결과 Wilms tumor 1-associating protein (WTAP)을 CCDC98의 결합 단백질로 분리 동정하였다. 이들 단백질의 결합을 in vivo and in vitro binding assays를 통하여 확인하였다. 또한, CCDC98 단백질이 cyclin B1의 발현을 억제함을 확인하였는데, 이는 WTAP 단백질의 발현을 조절함으로써 이루어진다는 것을 확인하였다. 이는 CCDC98 단백질이 새로운 세포주기 조절자라는 것을 증명하는 결과이다.

• 생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.26-31
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• 2004

본 연구는 redox regulator로 알려 진 Ref-1 (Redox factor-1)과 결합하는 새로운 단백질을protein-protein interaction의 원리를 이용한 방법인 yeast two-hybrid assay로 검색, 동정하고, 검색된 단백질의 in vitro, in vivo 기능을 규명하는 데 그 목적을 두고, mouse 11-day Embryo cNA library를 prey로, full length REF-1을 bait로 하여 yeast strain 인 HF7C에 cotransformatiom시킨 후 histidine, leucine, tryptophan이 결핍된 SD plate에서 키워 자란 yeast transformants를 $\beta$-galactosidaseassay하여 screening하여 분리한 세 개의 clone중 한 clone이 DNA sequencing으로 확인한 결과 mouse thioredoxin임을 확인하였다.

• Korean Journal of Acupuncture
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• 제19권1호
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• pp.7-13
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• 2002

1. 천궁약침액은 1${\times}$에서 15.1%의 cytochrome P4501A1 저해효과를 나타냈으며 그 억제효과는 약침액의 농도가 높을수록 증가하였다. 2 천궁약침액은 benzo[a]pyrene과 세포의 DNA 결합을 유의성있게 억제시켰다. 이상의 결과를 종합해 볼때 천궁약침액은 효과적으로 cytochrome P4501A1 효소를 저해했으며, 발암물질과 DNA의 결합을 억제시켜 외부 물질 또는 대사물에 의해 일어날 수 있는 돌연변이와 암 발생을 억제할 것으로 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제15권4호
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• pp.542-547
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• 2005

시스플래틴이나 마이토마이신 C (MMC)와 같은 DNA 사슬간 교차결합 (interstrand cross-link ; ICL) 물질에 대해 Brca1 결손세포들이 보이는 높은 감수성은 Brca1 단백질이 세포의 ICL복구반응에 중요한 역할을 담당하고 있음을 암시하고 있다. Brca1 단백질은 재조합 의존성 또는 재조합 비의존성 경로를 통한 DNA 이중사슬 절단(double-strand break ; DSB) 복구에 필수적인 역할을 담당한다. 최근 본인이 속한 연구그룹에서 재조합 의존성 경로를 통한 세포의 ICL복구반응에 Brca1이 관여한다는 것을 밝혀 보고한바 있다. 본 연구에서는 Brca1 단백질의 재조합 비의존성 복구반응에 대한 관여여부를 $p53^{-/-}$와 $p53^{-/-}\;Brcal^{-/-}$ 세포주를 사용하여 연구하였다. 교차결합 복구 실험에서 Brca1 결손 세포주는 Brca1 정상 세포주보다 현저히 낮은 활성을 보였다. 또한, Brca1 결손세포 주의 MMC 에 대한 감수성과 ICL복구능이 Brca1 단백질 발현을 통해 회복되는 것을 확인하였다. 흥미롭게도, Brca1의 11번 엑손 결손세포주 $(Brca1^{\Delta11})$는 높은 MMC저항성과 ICL 복구능을 보였다. 이러한 결과들을 종합하여 볼 때, Brca1 단백질은 ICL복구에 재조합 의존성 경로뿐만 아니라 재조합 비의존성 경로를 통해서도 관여하며, 이러한 활성에는 엑손 11 부분이 아닌 N 말단의 RING 핑거 도메인이나 C 말단의 BRCT도메인이 중요하다는 것을 알 수 있다.

• 대한화학회지
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• 제44권1호
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• pp.45-51
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• 2000

안트라센 유도체-합성DNA의 결합형태를 여러 가지 분광학적인 방법들을 통해서 알아보았다. Methylamine과 methylethylenediamine, 즉, 길이가 다른 곁사슬을 가지는 안트라센 유도체들이 poly[d(A-T)2]와 $poly[d(G-C)_2]$의 이중나선에 결합했을 때의 분광학적인 특성은 흡광, 원편광스펙트럼에서 봉우리의 장파장으로 이동, 흡광도의 감소를 볼 수 있으며, 선편광스펙트럼에서는 DNA흡광 영역에서 강한 음의 봉우리가 나타나는 것으로 요약할 수 있다. 이러한 현상들은 안트라센·유도체들이 위의 두 가지 DNA의 염기쌍 사이에 삽입이 되어있다는 것을 증명한다. 곁사슬의 길이에 따른 분광학적인 특성에는 별 차이가 없는 것으로 보아 곁사슬의 길이는 결합형태에 영향을 미치지 앓는다는 것을 알 수 있다. 또한, 강한 에너지의 전달이 $pdy[d(A-T)_2]$와 $poly[d(I-C)_2]$에는 일어나지만 $poly[d(G-C)_2]$에는 일어나지 않는 것으로 보아 $poly[d(G-C)_2]$의 작은 흠쪽에 돌출해 있는 아민기가 DNA염기로부터의 에너지의 전달을 방해하고 있는 것으로 판단된다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2005년도 가을 학술발표논문집 Vol.32 No.2 (1)
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• pp.967-969
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• 2005

유전자의 발현은 전사인자와 전사인자 결합부위의 결함에 의해 조절된다. 따라서 이러한 결합부위를 예측하는 것은 유전학 분야에서 중요한 이슈이다. 본 논문에서는 접미사 배열을 이용하여 전사인자가 결합할 것으로 예상되는 DNA 서열들의 공통서열을 추출하고, 이를 다시 입력 서열과 부분 정렬을 수행함으로써 전사인자가 결합하는 부위를 예측하는 알고리즘을 제시한다. 그리고 알려진 전사인자 결합부위를 가진 데이터로 실험한 결과를 통해 제시된 추출 방법의 성능에 대하여 논의한다.