• 제목/요약/키워드: DFREML

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Animal Model Versus Conventional Methods of Sire Evaluation in Sahiwal Cattle

  • Banik, S.;Gandhi, R.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권9호
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    • pp.1225-1228
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    • 2006
  • A total of 1,367 first lactation records of daughters of 81 sires, having 5 or more progeny were used to evaluate sires by 3 different methods viz., least squares (LS), best linear unbiased prediction (BLUP) and derivative free restricted maximum likelihood (DFREML) method. The highest and lowest overall average breeding value of sires for first lactation 305 days or less milk yield was obtained by BLUP (1,520.72 kg) and LS method (1,502.22 kg), respectively. The accuracy, efficiency and stability of different sire evaluation methods were compared to judge their effectiveness. The error variance of DFREML method was lowest ($191,112kg^2$) and its coefficient of determination of fitting the model was highest (33.39%) revealing that this method of sire evaluation was most efficient and accurate as compared to other methods. However, the BLUP method was most stable amongst all the methods having coefficient of variation (%) very near to unadjusted data (18.72% versus 19.89%). The higher rank correlations (0.7979 to 0.9568) between different sire evaluation methods indicated that there was higher degree of similarity of ranking sires by different methods ranging from about 80 to 96 percent. However, the DFREML method seemed to be the most effective sire evaluation method as compared to other methods for the present set of data.

Estimation of Genetic Parameters for Economic Traits in Korean Native Chickens

  • Sang, Byung Don;Kong, Hong Sik;Kim, Hak Kyu;Choi, Chul Hwan;Kim, Si Dong;Cho, Yong Min;Sang, Byung Chan;Lee, Jun Heon;Jeon, Gwang Joo;Lee, Hak Kyo
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권3호
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    • pp.319-323
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    • 2006
  • Heritabilities and genetic correlations of economic traits were estimated with a multiple-trait animal model on 5 different strains of Korea Native Chickens (KNC): Red Brown (RB), Yellow Brown (YB), Gray Brown (GB), Black (B) and White (W). The data used for this study were collected from the Daejeon branch of the National Livestock Research Institute and included 11,233 performance records and 12,729 individual animals. DFREML and SAS BASE/STAT packages were used to estimate genetic parameters and descriptive statistics. The estimated heritabilities for strain RB, YB, GB, B and W, respectively, for age at 1st egg were 0.24, 0.27, 0.12, 0.32 and 0.18; for body weight at first egg were 0.39, 0.43, 0.38, 0.52 and 0.57; for body weight at age of 270 days were 0.43, 0.51, 0.30, 0.52 and 0.67; for egg weight at first egg were 0.08, 0.13, 0.07, 0.06 and 0.07; for egg weight at age of 270 days were 0.37, 0.43, 0.22, 0.34 and 0.41; and for number of eggs laid by age of 270 days were 0.24, 0.25, 0.37, 0.36 and 0.30. The genetic and phenotypic correlations were also estimated.

한우 당대검정우와 후대검정우의 성장형질에 관한 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for The Growth Traits of Performance and Progeny Test in Hanwoo(Bos taurus Coreanae))

  • 기근서;최태정;김시동;최호성;백동훈
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권6호
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    • pp.699-710
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    • 2007
  • 본 연구는 1989년 8월부터 2005년 9월까지 농협중앙회 가축개량사업소에서 당대 검정을 실시한 비거세우 3,904두의 검정 자료와 1996년 8월부터 2004년 6월까지 축산연구소 한우시험장(대관령지소), 유전자원시험장(남원지소), 농협중앙회 가축개량사업소에서 출생한 후대검정 거세우 2,424두의 검정 자료를 조사 분석하였다. 분석 형질은 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령, 12개월령 체중 및 12개월령 일당증체량과 후대검정 거세우의 6, 12, 24개월령 체중 및 12개월령 일당증체량으로 DFREML 패키지를 이용하여 분석하였다. 측정된 당대검정우의 6개월령, 12개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 181.72±30.22kg, 351.48±40.24kg 그리고 998.07±153.84g으로 나타났으며 후대검정우의 6개월령, 12개월령, 24개월령 체중 그리고 일당증체량은 각각 169.18±32.82kg, 229.37±44.57kg, 570.45±64.36kg 그리고 739.41±172.14g으로 나타났다. 당대검정 비거세우(후보우)의 6개월령 체중, 12개월령 체중 및 일당증체의 유전력은 각각 0.54±0.06, 0.60±0.06 및 0.23±0.04 추정되었다. 후대검정 거세우의 6개월령, 12개월령 및 24개월령 체중에 대한 유전력은 0.80±0.08, 0.50±0.07 및 0.46±0.07로 나타났으며 일당증체에 대한 유전력은 0.07±0.03으로 추정되었다. 한우의 당대 검정에 있어서도 기존의 초기성장형질에 대한 조사뿐만 아니라 12개월 이후의 체중에 대한 조사도 고려해봐야 할 것이며 차후 후대 검정우의 체중과 도체형질간의 유전모수 추정 연구 또한 필요하다고 생각된다. 이는 곧 당대와 후대간 체중의 간접적인 비교와 후대의 체중과 도체형질간의 간접적인 비교를 가져올 것이라 사료된다.

Effects of Maternal Factors on Day-old Chick Body Weight and Its Relationship with Weight at Six Weeks of Age in a Commercial Broiler Line

  • Jahanian, Rahman;Goudarzi, Farshad
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제23권3호
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    • pp.302-307
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    • 2010
  • The present study aimed to investigate the effects of maternal factors on body weight at hatching (day-old) and at six weeks of age in a commercial broiler line. A total of 6,765 records on body weight at day-old (BWTDO) and 115,421 records on body weight at six weeks of age (BWT6W), originated from a commercial broiler line during 14 generations, were used to estimate genetic parameters related to the effects of maternal traits on body weight of chicks immediately after hatch or six weeks thereafter. The data were analyzed using restricted maximum likelihood procedure (REML) and an animal model with DFREML software. Direct heritability ($h^{2}{_a}$), maternal heritability ($h^{2}{_m}$), and maternal environmental variance as the proportions of phenotypic variance ($c^{2}$) for body weight at day-old were estimated to be 0.050, 0.351, and 0.173, respectively. The respective estimated values for body weight at six weeks of age were 0.340, 0.022, and 0.030. The correlation coefficient between direct and maternal genetic effects for six-week-old body weight was found to be -0.335. Covariance components and genetic correlations were estimated using a bivariate analysis based on the best model determined by a univariate analysis. Between weights at hatching and at six week-old, the values of -0.07, 0.53 and 0.47 were found for the direct additive genetic variance, maternal additive genetic variance and permanent maternal environmental variance, respectively. The estimated correlation between direct additive genetic effect influencing weight at hatch and direct additive maternal effect affecting weight at six weeks of age was -0.21, whereas the correlation value of 0.15 was estimated between direct additive maternal effect influencing weight at hatch and direct additive genetic effect affecting weight at six-week-old. From the present findings, it can be concluded that the maternal additive genetic effect observed for weight at six weeks of age might be a factor transferred from genes influencing weight at hatch to weight at six-week-old.

Genetic (Co)variance Components for Body Weight and Body Measurements in Makooei Sheep

  • Abbasi, Mokhtar-Ali;Ghafouri-Kesbi, Farhad
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제24권6호
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    • pp.739-743
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    • 2011
  • The aim of this paper was to estimate genetic parameters for body weight and five body measurements for an experimental population of Iranian Makooei sheep maintained at the Makooei Sheep Breeding Station at Makoo, Iran. To do this, yearling live weight (YW), and five body measurements, i.e., body length (BL), heart girth (HG), height at withers (HW), height at back (HB) and scrotal circumference (SC), were analyzed in a multi-trait animal model using the DXMUX program of DFREML software package. Heritability estimates were $0.22{\pm}0.08$, $0.11{\pm}0.06$, $0.21{\pm}0.07$, $0.17{\pm}0.06$, $0.17{\pm}0.06$ and $0.32{\pm}0.10$ for YW, BL, HG, HW, HB and SC, respectively. These estimates indicate that selection in Makooei sheep would generate moderate genetic progress in body weight and body measurements. Scrotal circumference, as an indicator of reproductive potential, exhibited the highest heritability. This trait, therefore, could successfully be used to increase productivity of males and, indirectly, female fertility. Genetic correlations between traits studied were all positive and ranged from 0.15 (YW/HB) to 0.99 (HW/HB). Phenotypic correlations were also positive and ranged from moderate (0.32, HW/SC) to high (0.94, HW/HB). Positive genetic and phenotypic correlations indicate that improvement in body measurements both at the genetic and phenotypic levels is expected through selection on body weight and vice versa.

Estimates of Parameters for Genetic Relationship between Reproductive Performances and Body Condition Score of Hanwoo Cows

  • Choi, S.B.;Lee, J.W.;Choy, Y.H.;Na, K.J.;Kim, N.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권7호
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    • pp.909-914
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    • 2005
  • This study was conducted to estimate phenotypic and genetic parameters of body condition score (BCS) and reproductive traits in Hanwoo cows. DFREML procedures were applied to obtain variance-covariance components and heritability estimates with single or two-trait models. Estimates of phenotypic correlations of BCS at service with BCS at calving was 0.16 and 0.26 with calving interval, 0.08 with gestation length, and 0.06 with number of services per conception, respectively. Estimates of phenotypic correlation of BCS at calving was 0.10 with calving interval, 0.13 with gestation length, and 0.10 with number of services per conception, respectively. Estimates of phenotypic correlation were low and negative, -0.11 between calving interval and gestation length and -0.13 between gestation length and number of services per conception. Estimates of direct genetic correlation were -0.06, between BCS at service and BCS at calving, 0.37 between BCS at service and BCS at weaning, and -0.18 between BCS at calving and BCS at weaning. Estimates of direct genetic correlation of days from calving to the 1st service were 0.17 with number of services per conception and -0.21 with BCS at service. Estimates of direct genetic correlation for BCS at calving were -0.02 with number of services per conception and -0.08 with BCS at service. Estimates of direct genetic correlation for BCS at weaning were 0.02 with number of services per conception and -0.07 with BCS at service. Estimates of direct heritability from single trait analyses were 0.13 for BCS at service, 0.20 for BCS at calving, 0.02 for BCS at weaning, and 0.20 for number of service per conception, respectively. Estimates of direct heritability were 0.20 for birth weight and 0.10 for weaning weight.

Holstein종 젖소의 선형심사형질에 대한 유전모수추정 (Estimation of Genetic Parameter for Linear Type Traits in Holstein Dairy Cattle in Korea)

  • 이기환;상병찬;남명수;도창희;최재관;조광현
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제51권5호
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    • pp.345-352
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    • 2009
  • 본 연구는 1998부터 2007년도까지 수집된 국내 홀스타인종 22,175두의 15개 형질에 대한 332,625개의 선형심사 점수, 22,175개의 최종점수와 84,612개의 혈통정보를 이용하여 유전모수를 추정하기 위해 실시하였다. 유전 및 오차 분산-공분산은 16개 형질에서 2개 형질씩 짝을 지어 총 225개 형질조합에 대하여 이형질(二形質) 모형을 이용하여 DFREML 패키지로 추정하였다. 키(ST), 강건성(STR), 체심(BD), 예각성(DF), 엉덩이 기울기(RA), 엉덩이 너비(TW), 옆에서 본 뒷다리(RLSV), 발굽기울기(FA), 앞유방의 붙음성(FUA), 뒷유방의 부착높이(RUH), 뒷유방의 너비(RUW), 정중제인대(UC), 유방의 깊이(UD), 뒤에서 본 앞유두의 배열위치(FTP), 앞유두의 길이(FTL) 그리고 최종점수(FS)에 대한 유전력은 각각 0.31, 0.21, 0.25, 0.10, 0.29, 0.19, 0.09, 0.06, 0.1, 0.293, 0.1, 0.20, 0.196 0.190, 0.28 그리고 0.15로 추정되었다. 키는 강건성과 0.9 의 가장 높은 정(+)의 상관을 나타냈다. 반면, 옆에서 본 뒷다리는 발굽기울기와 -0.56의 가장 높은 부(-)의 상관을 나타냈다. 엉덩이 기울기는 정중제인대를 제외한 유방형질과 -0.17에서 -0.02의 부 (-)의 상관을 보였다. 특히 뒷유방의 너비는 강건성(0.60), 체심(0.62), 엉덩이 너비(0.49)와 높은 정(+)의 유전상관을 나타냈다. 반면, 유방 깊이는 강건성(-0.4), 체심(-0.4)과 높은 부(-)의 유전상관을 보였다. 앞유두의 길이는 앞유방의 붙음성, 뒷유방의 부착높이, 뒷유방의 너비, 정중제인대 그리고 유방의 깊이와 모두 부(-)의 유전상관을 나타냈다. 최종점수는 정중제인대(0.12), 유방의 깊이(0.18), 그리고 뒤에서 본 앞유두의 배열위치(0.2)와 정(+)의 유전상관을 보였다. 하지만 유전 및 잔차 분산-공분산 행렬이 양정치 행렬이 아닌 것으로 나타났기 때문에 유전능력평가에 이용하기위해서는 주의가 필요하며, 모든 형질에 대한 유전상관을 동시에 추정하는 등의 추가적인 연구가 필요할 것으로 사료되었다.

한우의 이유시 체중과 도체형질과의 유전적 관계 (Genetic Relationship Between Weaning Weight and Carcass Traits in Hanwoo)

  • 황정미;최재관;김형철;최연호;이채영;양부근;신종서;김종복
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권2호
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    • pp.177-182
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    • 2007
  • 본 연구는 한우에서 이유시 체중과 도체형질들 간의 상관관계를 구명하고자 실시하였다. 조사된 도체 형질은 배최장근 단면적, 등지방두께, 21단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 I)와 7단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 II), 그리고 7단계로 구분하여 평가한 육색 등이었다. 유전모수의 추정은 DFREML 방법을 적용하여 실시하였는데 이유시 체중에 대한 통계모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 이유시 송아지 일령 및 어미소 일령의 1차식 효과와 2차식 효과를 고정효과로 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 도체형질에 대한 통계 모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 도축시 일령의 일차식 효과를 고정효과에 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 조사된 형질별 유전력 추정치는 이유시 체중이 0.25, 배최장근 단면적이 0.20, 등지방두께가 0.20, 근내지방도Ⅰ이 0.32, 근내지방도 Ⅱ가 0.32 그리고 육색이 0.22였다. 이유시 체중과 배최장근 단면적, 등지방두께, 근내지방도 I, 근내지방도 II 및 육색 간의 유전(표현형) 상관계수는 각각 0.75(0.16), 0.18(0.05), -0.41(-0.09), -0.40(0.11) 및 -0.07(0.05)였다. 본 연구 결과는 이유시 체중이 무거운 방향으로 단형질 선발을 진행할 경우 등심단면적이 넓어지고, 등지방두께가 두꺼워지며 근내지방도가 감소하는 도체를 생산하는 후손집단이 형성될 가능성이 있음을 시사하고 있다.

닭에서 생식세포 발달에 관여하는 유전자 검색 (Screening of Chicken Genes Related to Germ Cell Development)

  • 이지영;김희발;김덕경;송기덕;임정묵;한재용
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권2호
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    • pp.183-194
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    • 2007
  • 본 연구는 한우에서 이유시 체중과 도체형질들 간의 상관관계를 구명하고자 실시하였다. 조사된 도체 형질은 배최장근 단면적, 등지방두께, 21단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 I)와 7단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 II), 그리고 7단계로 구분하여 평가한 육색 등이었다. 유전모수의 추정은 DFREML 방법을 적용하여 실시하였는데 이유시 체중에 대한 통계모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 이유시 송아지 일령 및 어미소 일령의 1차식 효과와 2차식 효과를 고정효과로 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 도체형질에 대한 통계 모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 도축시 일령의 일차식 효과를 고정효과에 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 조사된 형질별 유전력 추정치는 이유시 체중이 0.25, 배최장근 단면적이 0.20, 등지방두께가 0.20, 근내지방도Ⅰ이 0.32, 근내지방도 Ⅱ가 0.32 그리고 육색이 0.22였다. 이유시 체중과 배최장근 단면적, 등지방두께, 근내지방도 I, 근내지방도 II 및 육색 간의 유전(표현형) 상관계수는 각각 0.75(0.16), 0.18(0.05), -0.41(-0.09), -0.40(0.11) 및 -0.07(0.05)였다. 본 연구 결과는 이유시 체중이 무거운 방향으로 단형질 선발을 진행할 경우 등심단면적이 넓어지고, 등지방두께가 두꺼워지며 근내지방도가 감소하는 도체를 생산하는 후손집단이 형성될 가능성이 있음을 시사하고 있다.