• 제목/요약/키워드: DCE

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The ybcF Gene of Escherichia coli Encodes a Local Orphan Enzyme, Catabolic Carbamate Kinase

  • Nam Yeun Kim;Ok Bin Kim
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제32권12호
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    • pp.1527-1536
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    • 2022
  • Escherichia coli can use allantoin as its sole nitrogen source under anaerobic conditions. The ureidoglycolate produced by double release of ammonia from allantoin can flow into either the glyoxylate shunt or further catabolic transcarbamoylation. Although the former pathway is well studied, the genes of the latter (catabolic) pathway are not known. In the catabolic pathway, ureidoglycolate is finally converted to carbamoyl phosphate (CP) and oxamate, and then CP is dephosphorylated to carbamate by a catabolic carbamate kinase (CK), whereby ATP is formed. We identified the ybcF gene in a gene cluster containing fdrA-ylbE-ylbF-ybcF that is located downstream of the allDCE-operon. Reverse transcription PCR of total mRNA confirmed that the genes fdrA, ylbE, ylbF, and ybcF are co-transcribed. Deletion of ybcF caused only a slight increase in metabolic flow into the glyoxylate pathway, probably because CP was used to de novo synthesize pyrimidine and arginine. The activity of the catabolic CK was analyzed using purified YbcF protein. The Vmax is 1.82 U/mg YbcF for CP and 1.94 U/mg YbcF for ADP, and the KM value is 0.47 mM for CP and 0.43 mM for ADP. With these results, it was experimentally revealed that the ybcF gene of E. coli encodes catabolic CK, which completes anaerobic allantoin degradation through substrate-level phosphorylation. Therefore, we suggest renaming the ybcF gene as allK.

Packet Switching에 의한 공중 Computer 통신망 개발 연구-제3부:KORNET NNP의 X.25 Software 설계 및 구현 (Development of a Packet-Switched Public Computer Network -PART 3:X.25 Software Design and Implementation of the KORNET NNP)

  • 최준균;김낙명;김형순;은종관;임기홍;조영종;조동호
    • 대한전자공학회논문지
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    • 제23권1호
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    • pp.1-9
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    • 1986
  • This is the third part of the four-part paper describing the development of a packet-switched computer communication network named the KORNET. In this paper we describe the design and implementation of the X.25 protocol connecting packet mode data terminal equipments(PDTE's) with data circuit terminating equipments(DCE's). In the KORNET, the X.25 protocol has been implemented on the line processing module-A(LPMA) of the network node processor(NNP). In the implementation of X.25, we have divided the software module according to the service function, and have determined the the rules that interact between the modules. Each layer protocol has been developed using the technique of the finite state machine. Before the actual coding of softwares, we hafve used formal software development tools based on the specification and description language (SDL) and program design languate (PDL) recommended by the CCITT. In addition, for the efficient operation of the X.25 protocol system we have analyzed the system performance and the service scheduling method of each module. The results will also be given.

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Packet Switching에 의한 공중 computer 통신망 개발 연구 -제4부:KORNET NNP의 PAD Protocol 및 Network Management Software의 구현 (Development of a Packet-Switched Public Computer Network -PART 4:PAD Protocol and Network Management Software of the KORNET NNP)

  • 김상룡;금성;김제우;오경애;은종관;이종락;서인수;조동호;최준균
    • 대한전자공학회논문지
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    • 제23권1호
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    • pp.10-19
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    • 1986
  • This is the last part of the four-part describing the development of a packet-switched computer communication network named the KORNET. In this paper we describe the design and implementation of the packet assembler/dissassembler (PAD) protocol for the asynchronous channel service, and of the network management softwares. The line processing module-B(LPMB) system supporting the asynchronous line includes a PAD protocol, a packet mode DTE/DCE protocol converting to the X.25 protocol, and the asynchronous receiver/transmitter(ART) software. The network management software is operated in master central processing module(MCPM) which includes virtual circuit management (VCM) managing the user channel, the routing management and the high level protocol for communication between the network management center (NMC) and the network node processor(NNP). In this paper, the design, implementation and operation of the softwares for the above service functions will be described in detail.

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역동적 유방 자기공명 영상 및 확산 강조영상을 이용한 관상피내암종 저평가 수술전 예측 (Preoperative Prediction of Ductal Carcinoma in situ Underestimation of the Breast using Dynamic Contrast Enhanced and Diffusion-weighted Imaging)

  • 박미나;김은경;김민정;문희정
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • 제17권2호
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    • pp.101-109
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    • 2013
  • 목적: 초음파 유도 하 중심부 침생검으로 진단된 2 cm 이상의 관상피내암종 저평가 수술 전 예측에 역동적 유방 자기공명 영상 및 확산강조영상의 역할을 규명하고자 한다. 대상과 방법: 14 gauge침을 이용한 초음파 유도 하 중심부 침생검을 통해 관상피내암종으로 진단된 22명의 환자를 대상으로 하였다. 환자는 조직병리 결과에 의거하여 관상피내암종 저평가 유무에 따라 두 군으로 나뉘었다. 모든 환자에서 역동적 유방 자기공명 영상 및 확산강조영상을 포함한 3 테슬라 유방 자기공명 영상을 획득하였다. 생검으로 확인된 악성 종괴에 대해, 병변의 형태 (종괴 혹은 비종괴), 조영 증강 형태, 조영 증강 최고점, 및 현성 확산 계수를 CADstream 소프트웨어를 이용하여 획득 하였으며, Fisher's exact test및 Mann Whitney test 이용하여 이 항목을 비교, 분석하였다. 결과: 총 22명의 환자 중 8명의 환자가 저평가 군으로 분류되었다. 병변의 형태 및 조영증강 형태는 두 군의 통계학적 차이가 없었다 (P values = 1.000 및 0.613). 조영 증강 최고점의 중앙값은 저평가 군에서 159.5% 로 저평가 되지 않은 군의 133.5% 보다 높았으나 통계학적 유의한 차이를 보이지 않았다 (P value = 0.413). 저평가 군의 현성 확산 계수는 $1.26{\times}10^{-3}mm^2/sec$로 저평가 되지 않은 군의 $1.35{\times}10^{-3}mm^2/sec$ 보다 낮았다 (P value = 0.094). 결론: 현성 확산 계수는 초음파 유도한 중심부 침생검에 의한 관상피내암종 저평가 수술 전 예측에 도움이 될 가능성 있으며 추후 전향적 연구를 통해 이 연구 결과를 확인하는 것이 필요하겠다.

울산지역 지하수, 하수 및 하천수의 VOCs 오염특성 (Characteristics of Groundwater, Sewage Water and Stream Water Contamination Based on VOCs Concentration Around Ulsan, Korea)

  • 조병욱;윤욱;임현철;성익환;장우석
    • 자원환경지질
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    • 제38권1호
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    • pp.57-65
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    • 2005
  • 울산광역시 일대 지하수내 VOCs 함량을 파악하기 위하여 168개의 지하수, 12개의 하천수, 6개의 하수 시료를 채 취하여 61개 성분의 VOCs를 분석하였다. 분석결과 하천수에서는 VOCs가 검출되지 않았고 도심에 위치한 5개 하수 의 총 VOCs 함량은 ND-22.3 ${\mu}$g/L으로 낮은 편이었다. 168개 지하수 시료에서 분석된 61개 VOCs 성분 중 1성분 이상 검출된 시료 수는 78개이다. 78개 지하수 시료의 총 VOCs 함량은 0.1 ${\mu}$g/L- 387.1${\mu}$g/L의 범위이나, 78개 시료 의 84.6%인 66개 시료의 총 VOCs 함량이 10${\mu}$g/L 이하이고, 음용수기준치를 넘는 시료는 6개에 불과하다. 검출된 VOCs 성분은 분석된 61개 중 42개 성분으로 방향족탄화수소(Aromatic hydrocarbon)가 25개 성분 중 14개 성분이, 염소계지방족탄화수소(Chlorinated aliphatic hydrocarbon)가 35개 성분 중 27개 성분, 그리고 MTBE가 검출되었다. VOCs 성분의 검출빈도로 보면 클로로포름이 전체 시료의 25.6%에 해당하는 43개로서 가장 높다. 그 다음으로는 methylene chloride 21.4%(36개), TCE 15.5%(26개), 1,1-dichloroehane 11.3%(19개), PCE 9.5%(16개), cis-1,2- DCE 8.9%(15개), tolune 8.3%(14개)의 순서로 검출되고 있다. 연구지역 지하수의 VOCs의 함량범위로 볼 때, 아직까 지 VOCs에 의한 지하수 오염은 우려할만한 수준은 아니나, 도시화가 진행되고 있고, 음용수기준치가 강화되는 경향 등을 고려할 때 계속적인 관찰이 요구된다.

도적지유탕이 궤양성 대장염 유발 흰쥐에 미치는 영향 (A Study on the Treatment Effect of Dojeckjiyu-tang for Ulcerative Colitis)

  • 김승욱;임성우
    • 대한한의학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.200-210
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    • 2002
  • Objectives: Dojeckjiyu-tang has been used to treat Hwaseol & Jeokri. The object of this study is examination of the treatment effect of Dojeckjiyu-tang for ulcerative colitis of the mouse descending colon. Methods and Materials : Twenty-one rats were divided into 3 groups and treated as follows: the control group was untreated mice. The UCE group was ulcerative colitis elicited mice. The DJT group was Dojeckjiyu-tang treated mice after ulcerative colitis elicitation. The groups were examined with common morphology, paneth cells in intestinal crypt, absorptive cells and goblet cells in epithelium, cell division in mucose, COX-1 as mucosal protector, COX-2 (which appears to play an important role in inflammation), IL-2R-, ICMA-1-inducing cellular immuno-chainreaction, and the distribution of apoptotic cells. Results: 1. The morphology of colonic mucosa from UCE mice: the disappearance of epithelium and intestinal propria in hemorrhagic erosions were seen, but in the morphology of colonic mucosa from DJT-treated mice, the configuration of epithelium and intestinal propria were the same as normal. 2. The distribution of goblet cells and absorptive cells with microvilli in intestinal propria from UCE mice: a noticeable decrease of goblet cells and absorptive cells with microvilli were seen, but with the distribution of goblet cells and absorptive cells with microvilli in intestinal propria from DJT -treated mice, the configuration of goblet cells and absorptive cells with microvilli were the same as normal. 3. The immunohistochemical stain for BrdD in colonic mucosa and COX-1 in lamina propria from UCE mice: BrdU positive cells and COX-1 positive cells in the region of hemorrhagic erosion disappeared, but in the immunohistochemical stain for BrdU in colonic mucosa and COX-1 in lamina propria from DIT-treated mice, BrdU positive cells and COX-1 positive cells were seen. 4. The immunohistochemical stain for COX-2 in lamina propria, IL-2R-in lamina propria, intestinal propria and submucosa and ICMA-1 in intestinal propria and submucosa from DCE mice: a noticeable increase COX-2, IL-2R-, ICMA-1 positive cells were seen, but in the immunohistochemical stain for COX-2 in lamina propria, IL-2R-in lamina propria, intestinal propria and submucosa and ICMA-1 in intestinal propria and submucosa from DJT-treated mice, a numerical decrease of COX-2, IL-2R-, ICMA-1 positive cells was observed. 5. The distribution of apoptotic cells in epithelium and lamina propria from UCE mice: a noticeable increase of apoptotic cells in region of hemorrhagic erosion was seen, but in the distribution of apoptotic cells in epithelium and lamina propria from DJT-treated mice, a remarkable decrease of apoptotic cells was seen. Conclusions: According to the above results, Dojeckjiyu-tang has a moderate effect on ulcerative colitis in descending colon.

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중심 보로노이 조각화와 아이콘 및 레이블 배치 알고리즘을 이용한 도식화된 지도 생성 시스템 (A Schematic Map Generation System Using Centroidal Voronoi Tessellation and Icon-Label Replacement Algorithm)

  • 류동성;어윤;박동규
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제9권2호
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    • pp.139-150
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    • 2006
  • 도식화된 지도란 일반적인 지도가 가진 복잡한 지리 정보를 특정한 사용 목적에 따라 논리적으로 간략화시킨 다음 중요한 정보들은 부각시켜, 사용자가 인식하기 편하게 제작한 지도이다. 본 논문에서는 도로와 레이블 그리고 그 아이콘이 중요한 의미를 가지는 도식화된 지도를 제작하기 위한 알고리즘을 소개한다. 구조적인 지도의 생성을 위해서는 간략화 된 도로정보와 이에 따른 객체들의 배치 작업이 필요하다. 그러나 원본 지리정보의 복잡성으로 인하여 원본 도로 정보를 중심으로 객체들의 배치작업을 수행할 경우 객체들 간의 중첩이 발생하게 되어, 시각적으로 잘 정돈된 지도 생성이 어렵다. 논문에서 제안한 시스템은 이와 같이 상대적으로 복잡한 경로를 가진 구조적 지도를 효과적으로 시각화하기 위하여 다음과 같은 처리 절차를 수행한다. 1)DEC 기법을 사용하여 다각형으로 구성된 경로 곡선을 이루는 정점들 중에서 중요도가 떨어지는 정점들을 제거한다. 2) 중심 보로노이 조각화와 그리드 스내핑을 적용하여, 원본지도의 구조적 정보를 유지하면서 밀집도가 균일한 도로 정보를 생성한다. 3) 아이콘과 레이블이 서로 겹쳐지지 않도록 적절하게 배치하여 도식화된 지도를 완성한다. 그 결과 원본 지도의 밀집된 정점들을 균일한 간격으로 배치하였으며, 아이콘과 레이블을 배치할 수 있는 공간을 확보하였다. 이를 통해 아이콘과 레이블의 중첩을 최소화 할 수 있었으며, 복잡한 지도 정보로 부터 가독성이 높은 지도를 제작할 수 있었다.

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Streptozotocin유도 당뇨쥐의 단기간 capsaicin 섭취와 운동이 혈중 지질, 항산화 효소 및 Akt량에 미치는 영향 (The Effects of Short-term Exercise and Capsaicin Supplementation on Serum Lipids, Antioxidants and Akt Contents in STZ-induced Diabetic Rats)

  • 서대윤;고정림;백영호
    • 생명과학회지
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    • 제18권12호
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    • pp.1739-1744
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    • 2008
  • 본 연구는 50 mg/kg의 STZ로 유발된 당뇨쥐에서 단기간 운동과 capsaicin 섭취가 혈중지질, 항산화 효소 및 Akt량에 미치는 영향을 알아보고자 31마리의 흰쥐를 대상으로 실험 하였다. 운동 군과 운동과 capsaicin을 병행한 군에서는 당뇨 유발 일주일 후 부터 15 m/min, 0%의 경사도로 25분간 주5회 2주간 트레드밀 운동을 실시하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 혈중 지질 농도는 capsaicin 섭취와 운동을 병행한 군에서 TG는 유의하게 감소하였고, HDL-C는 다른 군에 비해 유의하게 높게 나타났고, ROS는 당뇨군을 제외한 모든 군에서 유의하게 감소하였다. CAT는 capsaicin만 섭취한 군에서 유의하게 증가하였고, SOD은 운동만 처치한 군과 capsaicin만 섭취한 군에서 유의하게 높았으며, GSH는 당뇨군을 제외한 모든 군에서 유의하게 높은 것으로 각각 나타났다. Akt효소는 capsaicin만 섭취한 군, p-Akt는 운동군에서 유의하게 증가하였다.

대한산업보건협회 산업보건연구소의 PAT 정도관리 참여결과 (Performance of Institute of Occupational Health, Korean Industrial Health Association in Proficiency Analytical Testing Program)

  • 이준승;유호겸;오미순;박화미;윤기상;최호춘;정규철
    • 한국산업보건학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.313-321
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    • 1996
  • Our laboratoy has been participated in Proficiency Analytical Testing (PAT) program which is operated by the Americal Industrial Hygiene Association in cooperation with the National Institute for Occupational Safety and Health (NIOSH). The program is designed to assist a laboratory improve its analytical performance by providing samples on a quarterly basis, evaluating the results, and providing reports on how well the laboratory performed. Evaluation of the results reported here covers five rounds of the PAT program (round 121~round 125). The way a laboratory is evaluated by PAT program is as follows: 1) There is no overall proficiency rating given to a laboratory. 2) A proficiency rating is given for each type of analyze (i.e., metals, silica, asbestos, solvents) that a laboratory analyzed. 3) Proficiency is rated acceptable ("A") if Z score lies between -3 and +3, and unacceptable if Z score is either higher than +3 ("H") or lower than -3 ("Lo"). Z score = (reported data - reference value) / standard deviation 4) For a laboratory to be rated proficient it must either have had no outliers over the most recent two rounds or of the samples actually analyzed over the past year (past four rounds), 75 % or more of the analyze sample results must be acceptable. According to the above rating criteria of PAT program, performance of metals including cadmium, lead, chromium and zinc, and asbestos sample analyses were rated acceptable ("A"). For silica analyses, all samples except one out of four samples in round 122 was rated high("H") were acceptable showing 95 % of ing 95 % of acceptance rate (19/20) throughout the rounds. Analyses of organic solvents were done on 52 samples in 9 types including methanol(MOH), 1,1,1-trichloroethane(MCM), tetrachloroethylene(PCE), trichloroethylene(TCE), benzene(BNZ), o-xylene(OXY), toluene(TOL), chloroform(CFM), 1,2-dichloroethane(DCE). All samples analyzed were rated acceptable except 2 samples that were rated high; one out of each four MCM and TCE samples in round 121, and one that was low out of four o-xylene analyses in round 122 indicating 94 % of acceptance rate(49/52) throughout the rounds. According to the laboratory rating criteria, our laboratory is rated proficient so far for all types of contaminants.

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