• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제18권5호
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• pp.510-514
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• 1997

We studied the interaction of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) with single stranded poly(dA) using optical spectroscopic methods, including absorption, circular dichroism (CD), and fluorescence spectroscopy. The temperature-dependent conformation of poly(dA) was also investigated. The conformation of poly(dA) varied with temperature, which is explained by the stacking-destacking process of the adenine bases, resulting from the sugar conformation. The hypochromicity and red-shift in the absorption spectroscopy, the lack of CD change in the drag absorption region, and the fluorescence behavior, especially a great accessibility of the I2 quencher to the poly(dA)-bound DAPI, suggest that DAPI binds to the outside of poly(dA). The Job plot for the DAPI-poly(dA) mixture demonstrated that a stoichiometry of one DAPI molecule binds to the one phosphate of poly(dA).

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제26권4호
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• pp.537-542
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• 2005

It was proposed that Ru(II)[(1,10-phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine ([Ru(phen)$_2$DPPZ]$^{2+}$)complexes and 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) simultaneously bind to poly[d(A-T)$_2$] (Biophysics. J. 2003, 85, 3865). Förster type resonance energy transfer from excited DAPI to [Ru(phen)2DPPZ]$^{2+}$ complexes was observed. In this study, we synthesized $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2’3’c]6-azaphenazine] ([Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$) at which the DNA intercalating ligand DPPZ was replaced and we studied its binding properties to poly[d(A-T)$_2$] in the presence and absence of DAPI using polarized spectroscopy and fluorescence techniques. All the spectroscopic properties of the [Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$-poly[d(A-T)$_2$] complex were the same in the presence and absence of DAPI that blocks the minor groove of polynucleotide, suggesting both $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$ complexes are located at the major groove of poly[d(A-T)2]. On the other hand, in contrast with [Ru(phen)$_2$DPPZ]$^{2+}$, both $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$ exhibited almost twice the efficiency in the fluorescence quenching of DAPI that binds at the minor groove of poly[d(A-T)$_2$]. This observation indicates that the efficiency of the Förster type resonance energy transfer can be controlled by a small change in the chemical structure of the intercalated ligand.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권10호
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• pp.2895-2899
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• 2013

Direction of intercalation to DNA of the planar dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine ligands (dppz) of a bis-Ru(II) complex namely, $[Ru(1,10-phenanthroline)_2dipyrido[3,2-a:2^{\prime},3^{\prime}-c]phenazine]^{2+}$ linkered by a 1,3-bis(4-pyridyl)propane, was investigated by probing the behavior of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) that bound deep in the minor groove. Bis-intercalation of DPPZ resulted in a little blue shift and hyperchromism in DAPI absorption band, and a large decrease in DAPI fluorescence intensity which accompined by an increase in the dppz emission intensity. Diminishing the intenisty of the positive induced circular dichroism (CD) and linear dichroism (LD) were also observed. These spectral changes indicated that insertion of dppz ligand caused the change of the binding mode of DAPI, which probably moved to the exterior of DNA from the minor groove and interacted with the phospghate groups of DNA by electrostatic interaction. At the surface of DNA, DAPI binds at the phosphate groups of DNA by electrostatic attraction. Consequently, this observation indicated that the dppz ligand intercalated from the minor groove.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권2호
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• pp.529-534
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• 2012

The fluorescence of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) bound to DNA at a [DAPI]/[DNA base] ratio of 0.005 was quenched by meso-tetrakis(N-methylpyridinium-4-yl)porphyrin (TMPyP) or cis-bis(N-methylpyridinium-4-yl)porphyrin (BMPyP) when both DAPI and either porphyrin spontaneously bound to the same DNA strand. The quenching was investigated using the "one-dimensional inner sphere" and the "F$\ddot{o}$rster resonance energy transfer" (FRET) models. Total quenching occurred when DAPI and TMPyP were up to 19.3 base pairs or $66\AA$ apart. BMPyP could quench the fluorescence up to 13.9 base pairs or $47\AA$. TMPyP, which intercalated between the DNA base-pairs, appeared to be a better acceptor than BMPyP, which stacked along the DNA stem. The higher quenching and higher resonance energy transfer efficiency of TMPyP was due to the larger overlap integral between its absorption spectrum and the emission spectrum of DNA-bound DAPI.

• 미생물학회지
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• 제37권1호
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• pp.61-65
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• 2001

식물잎권의 잎표면세균에 대한 직접관찰과 이들을 분리시킨 용액 내 세균에 대한 간접관찰을 위하여 형광염료인 4', 6-diamidino-2-phenylindole(DAPI)와 acridine orange(AO)로 염색한 후 형광현미경을 사용하였다. AO로 염색한 잎표면은 배경형광이 진한 주홍색 이나 적색을 띠어 잎표면세균의 관잘 및 계수가 극히 힘들었으나 DAPI로 염색된 잎권세균은 뚜렷한 형광 영상을 나타내었다. 반면 잎표면세균 분리용액의 여과지에 대한 형광염색 결과는 DAPI와 AO 모두가 관찰이 가능하였다. 다만 DAPI가 AO에 비하여 형광 영상이 좀 더 뚜렷하였고 AO 염색과정에서는 염색된 여과지에 대한 세척과정이 필수적이었다. 최적의 DAPI 염색법은 잎과 여과지 모두가 5 $\mu$g/ml의 농도에서 5분 동안 염색하는 것이었다. 잎권의 형광현미경 관찰에 있어서 핵심적인 요소는 잎에서 나오는 수분을 최소화하는 것으로서 염색된 잎 시료를 거름종이 위에 올려놓고 공기 중에서 말리는 대신 $70^{\circ}C$를 유지한 건조기에서 2분 동안 말린 다음 바로 현미경으로 관찰하는 것이 가장 종은 방법인 것으로 확인되었다. 이렇게 확립된 형광현미경 관찰법을 떡갈나무의 잎권세균을 성공적으로 관찰하고 계수할 수 있었다.

• 한국산림과학회지
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• 제67권1호
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• pp.28-30
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• 1984

형광색소(蛍光色素) DAPI(4'-6-diamidino-2-phenylindole, 2HCI)와 형광원미경(蛍光願微鏡)을 이용(利用)한 조직화학적(組織化學的) 기법(技法)으로 빗자루병(病)에 걸린 대추나무 조직내(組織內)의 마이코플라스마 분포(分布)를 조사(調査)한 결과(結果), 빗자루병징(病徵)이 나타나 있는 가지에서는 외관상(外觀上) 건전엽(健全葉)을 포함(包含)하여 모든 잎과 줄기에서 마이코 플라스마가 검출(檢出)되었으나 병징(病徵)이 나타나 있지 않은 가지의 잎과 줄기에서는 마이코플라스마가 검출(檢出)되지 않았다. 또한 감염(感染)된 나무의 뿌리조직(組織)에서도 뚜렷한 형광반응(蛍光反應)이 나타남으로써 마이코플라스마가 뿌리조직(組織)에도 많이 존재하고 있음을 알 수 있다.

• 한국식물병리학회지
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• 제1권1호
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• pp.12-16
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• 1985

마이코플라스마에 감염된 대추나무, 뽕나무 및 일일초의 조직절편을 형광염색소인 DAPI(4'-6-diamidino-2-phenylindole$\cdot$2HCl), aniline blue 그리고 quinacrine(quinacrine mustard dihydrochloride)으로 염색하여 형광현미경하에서 관찰함으로서 이들 형광염색소의 마이코프라스마 감염진단에의 효용가치를 비교 조사하였다. 이병식물의 줄기절편의 절부에서 특이형광반응이 나타났으나 건전식물의 조직절편에서는 특이형광반응이 관찰되지 않음으로써, DAPI, anilinc blue 및 quinacrine 등의 형광염색소에 의한 조직염색법은 대추나무, 뽕나무 및 일일초의 마이코플라스마 감염을 식속 정확하게 진단하는 데 매우 유용한 방법임을 보여주었다. 한펀, 이들 형광염색소 중에서는 DAPI가 가장 효과적이었다.

• 미생물학회지
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• 제39권1호
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• pp.27-35
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• 2003

환경수 중 크립토스포리디움 및 지아디아 분석방법은 현재 어떤 방법도 만족할만한 민감도, 특이도, 재현성을 인정 받지 못하고 있어, 다양한 형태의 정도관리 및 수행도 평가가 요구되고 있다. 본 연구는 1623방법(USEPA :Method 1623)을 사용해 한강 지표수에 대한 크립토스포리디움 및 지아디아 접종시험과 현장시료 동시분석시험에 기초하여, 환경수 중 이들의 존재여부와 농도를 측정함에 있어 분석결과의 정확도 및 신뢰도, 그리고 회수율에 미치는 영향요인을 검토하였다. 1623방법에 의한 결과, 평균적으로 한강 지표수시료에 존재하는 크립토스포 리디움의 46%와 지아디아의 60%를 검출할 수 있는 것으로 나타났으나, 각각의 회수율 범위가 13-73% 및 28-84%로 변이가 매우 커서 실제 환경 중 두 원생동물의 농도를 결정하기 위해서는 반복측정 및 통계학적 인 접 근이 수반되어 야 할 것으로 나타났다. 또한 IMS (immunomagnetic separation)중 산첨가에 의한 해체·분리과정을 1 회 더 반복함으로써 지표수시료에서의 총회수율의 약 10%를 향상시킬 수 있었으며, flow cytometry로 계수·준비된 (오)시스트((oo)cysts)를 정도관리에 사용할 경우 보다 신뢰할만한 결과를 얻을 수 있었다. 형광항체 및 DAPI염색은 현장시료특성 이나 전 처리과정에 따라 동일하지 않은 형광특징을 보인 바, 접종 된 현장시료 정제액에 대한 염색결과도 참조되어야 하며, 환경시료에는 다양한 비특이물질이 함유되어 있어 DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole) 염색 및 DIC(Differential Interference Contrast)에 의한 내부구조 관찰이 최종 동정기준이 되어야할 것으로 나타났다.

• 대한수의학회지
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• 제64권1호
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• pp.2.1-2.8
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• 2024

This study was performed to assess the antiapoptotic effect of canine platelet-rich plasma (PRP) treated on the canine adipose-derived mesenchymal stem cells (cMSCs) under cold ischemic conditions. The effect of preventing apoptosis of cMSCs was evaluated in the apoptotic condition induced by cold ischemic injury in vitro. To determine the progression of apoptosis, the changes in cell nucleus were observed using 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorescence staining. In addition, we examined the mitochondrial membrane potential (MMP) and caspase-3 activity. When the cold hypoxic injury was applied to cMSCs, the apoptotic change was observed by DAPI staining, mitochondrial staining for MMP, and caspase-3 assay. PRP significantly decreased the number of apoptotic cells. Nuclear shrinkage and fragmentation of apoptotic cells in control groups were observed by DAPI staining. The MMP was recovered by the treatment of PRP. In addition, when the luminescence intensity was measured for caspase-3 activity, the value was significantly higher in the PRP treated groups than the control groups. The results of this study showed that the PRP may have a beneficial effect on apoptosis induced by cold ischemic injury.

• Journal of Acupuncture Research
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• 제20권3호
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• pp.63-74
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• 2003

목적 : 한의학에서 관절염이나 진통치료에 사용되어 왔던 봉독약침액이 인간 골육종 세포주인 MG-63 세포에서 항종양효과가 있는지 연구하고자 한다. 특히 본 실험에서는 이러한 봉독의 종양발생 억제작용이 세포사멸과 관련이 있는지, 그리고 프로스타글란딘 합성 효소인 cyclooxygenase(COX)-2의 억제와 관련이 있는지를 연구하고자 한다. 방법 : 인간 골육종 세포주에서 세포사멸의 변화를 관찰하기 위해서 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium brimide(MTT) assay, 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI), DNA fragmentation assay 및 reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR) 방법을 이용하였다. 결과 : 세포독성 검사에서 봉독은 MG-63 세포에서 농도-의존적으로 세포독성을 나타내었다. 이러한 봉독의 세포독성이 세포사멸로 인한 것인지를 여러 가지 형태로 검사한 결과 봉독에 의한 세포독성은 TUNEL 검사와 DAPI 염색시 세포사멸의 특징적인 소견들을 나타내었고, flow cytometric 분석에서도 세포사멸을 의미하는 세포주기의 변화들을 나타내었다. 봉독이 COX-2의 발현에 미치는 영향을 RT-PCR로 실험한 결과 봉독은 COX-2 mRNA의 발현을 선택적으로 억제하였다. 결론 : 본 실험의 결과 봉독은 COX-2 mRNA의 발현을 억제함으로써 골육종 세포에서 세포사멸을 유발하고 그 결과 항종양효과를 나타내는 것으로 보여진다.