• 제목/요약/키워드: D typing

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혈액은행 자동화 장비 도입의 유용성 평가 (Evaluation for the Usefulness of Automated Blood Typing Analyzer)

  • 김하나;김희범;박현상;이현임;홍명국;신경숙;서인범
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제19권6호
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    • pp.565-574
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    • 2019
  • 본 연구는 혈액은행 자동화 장비 QWALYS-2 up (Diagast, Loos Cedex, France)의 유용성을 평가하기 위하여 수행되었다. 2013년 10월 1일부터 10월 31말까지 1개월간 강원대학교병원 진단검사의학과에 의뢰된 ABO 및 RhD 혈액형 검사 1,636건, 항체선별검사 1,374건을 대상으로 하였고, ABO 및 RhD 혈액형 검사의 평가는 200건을 대상으로 하였다. 혈액은행 자동화장비의 경제성을 평가하기 위해서는 2018년 12월을 기준으로 장비 도입 전인 2013년 1월부터 장비 도입 후 5개년의 ABO 및 RhD 혈액형 검사와 항체선별검사의 단가를 비교하였다. 본 연구의 주요 결과는 ABO 및 Rh 혈액형 검사 결과, 슬라이드나 시험관을 이용한 수기법의 결과가 100% (200/200) 일치하였고 동종항체 선별검사 결과, 불일치 3검체는 수기법으로 재검을 한 결과, 음성을 보여 QWALYS-2 up에서 위양성의 결과를 나타냈으나, 반응의 정도를 비교한 결과 QWALYS-2 up에서 상대적으로 높게 나타났다. 결론적으로 혈액형자동화 장비 도입 전후의 효과를 평가한 결과, 기존의 수기법과 비교하였을 때 높은 일치율을 보였으며, 정확도 면에서도 신뢰할 만한 것으로 판단되었다. 도입 전후의 시약의 비용은 증가하였지만 인건비의 절감을 감안하면 경제적으로도 유용하다고 평가할 수 있다.

장티푸스균이 Vi-phage형 및 항생제감수성에 관한 연구 (Vi-Phage Type Distribution and Antibiotic Susceptibility of Salmonella typhi in Korean(1982))

  • 이복권;김병훈;정태화
    • 대한미생물학회지
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    • 제18권1호
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    • pp.39-46
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    • 1983
  • We collected three hundred thirty-five strains of Salmonella typhi isolated from human sources during the period January to December 1982 Korea. Most of them were from general hospitals and city health center, the remaining one hundred sixtyone strains were obtained from other 12 provincial health centers among 335 testing strains. We used ninety-nine Vi-phages as distributed from International Center for Enteric phage Typing(ICEPT) in London. We found nine phage types among 335 strains of Salmonella typhi in this study. Additionally, I+IV, degraded Vi-positive and Vi negative strains were presented. This study documented the occurrence of the new $B_2$ type in Korea for the first time. The present basic phage type formula in Korea appeared to be A, $B_2,\;D_1,\;D_2,\;D_4,\;D_6,\;D_8,\;D_{12},\;E_1,\;E_9,\;D_1,\;M_1$, 40 and plus I+IV and degraded vi strains(Table 2). The current phage types of Salmonella typhi isolated in Korea 1982 were A, $B_2,\;D_1,\;D_2,\;D_6,\;D_8,\;E_1,\;M_1$ and 46 $M_1$ type was widely distributed all over the country, and E type was next predominant. Antibiotic susceptibility test were performed by means of Kirby-Bauer disc diffution method using 12 kind of antibiotics such as Ampicillin, Carbenicillin, Cephalosporin, Chloramphenicol, Colistin, Gentamicin, Kanamycin, Nalidix acid, Neomycin, Polymyxin-B, Streptomycin and Tetracycline. The sensitivity pattern to antibiotics of Salmonelia typhi cultures were summarized.

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음성 신호 분류에 따른 장애 음성의 변동률 분석, 비선형 동적 분석, 캡스트럼 분석의 유용성 (The Utility of Perturbation, Non-linear dynamic, and Cepstrum measures of dysphonia according to Signal Typing)

  • 최성희;최철희
    • 말소리와 음성과학
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    • 제6권3호
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    • pp.63-72
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    • 2014
  • The current study assessed the utility of acoustic analyses the most commonly used in routine clinical voice assessment including perturbation, nonlinear dynamic analysis, and Spectral/Cepstrum analysis based on signal typing of dysphonic voices and investigated their applicability of clinical acoustic analysis methods. A total of 70 dysphonic voice samples were classified with signal typing using narrowband spectrogram. Traditional parameters of %jitter, %shimmer, and signal-to-noise ratio were calculated for the signals using TF32 and correlation dimension(D2) of nonlinear dynamic parameter and spectral/cepstral measures including mean CPP, CPP_sd, CPPf0, CPPf0_sd, L/H ratio, and L/H ratio_sd were also calculated with ADSV(Analysis of Dysphonia in Speech and VoiceTM). Auditory perceptual analysis was performed by two blinded speech-language pathologists with GRBAS. The results showed that nearly periodic Type 1 signals were all functional dysphonia and Type 4 signals were comprised of neurogenic and organic voice disorders. Only Type 1 voice signals were reliable for perturbation analysis in this study. Significant signal typing-related differences were found in all acoustic and auditory-perceptual measures. SNR, CPP, L/H ratio values for Type 4 were significantly lower than those of other voice signals and significant higher %jitter, %shimmer were observed in Type 4 voice signals(p<.001). Additionally, with increase of signal type, D2 values significantly increased and more complex and nonlinear patterns were represented. Nevertheless, voice signals with highly noise component associated with breathiness were not able to obtain D2. In particular, CPP, was highly sensitive with voice quality 'G', 'R', 'B' than any other acoustic measures. Thus, Spectral and cepstral analyses may be applied for more severe dysphonic voices such as Type 4 signals and CPP can be more accurate and predictive acoustic marker in measuring voice quality and severity in dysphonia.

ABO 및 RhD 혈액형 검사와 비예기항체 선별검사를 위한 자동화장비 IH-1000의 평가 (Evaluation of IH-1000 for Automated ABO-Rh Typing and Irregular Antibody Screening)

  • 박영춘;임진숙;고영현;권계철;구선회;김지명
    • 대한수혈학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.127-135
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    • 2012
  • 배경: 대부분의 임상검사가 자동화되는 추세이나 혈액은행 검사는 여전히 수작업에 의존하고 있다. 여러 자동화장비가 개발되어 활용되고 있으며 최근 면역혈액검사를 위한 자동화장비인 IH-1000 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA)이 소개되었다. 이번 연구에서는 IH-1000 장비의 ABO 및 Rh 혈액형 검사와 비예기항체 선별검사에 대한 성능을 평가하려고 한다. 방법: 2011년 10월에 의뢰된 373건의 ABO 및 RhD 혈액형 검사와 303건의 비예기항체 선별검사를 대상으로 하였다. ABO 및 RhD 혈액형 검사는 슬라이드법과 시험관법을 사용하였고 비예기항체검사는 미세원주응집법(DiaMed-ID system)을 사용하여 IH-1000의 결과와 비교하였다. 결과: ABO 및 RhD 혈액형 검사에서는 두 방법 간 100%의 높은 일치율을 보였고 비예기항체 선별검사에서는 두 방법에서 모두 양성을 보인 검체가 10건(anti-E+c 4건, anti-E 3건, anti-D 1건, anti-M 1건, anti-Xg 1건)이었고 모두 음성을 보인 검체는 289건으로 98.7%의 일치율을 보였다. IH-1000의 민감도 및 특이도는 각각 90.9%였다. 결론: IH-1000은 기존에 사용하던 수기법과 비교하여 ABO 및 Rh 혈액형 검사와 비예기항체 선별검사에서 높은 일치도를 보였다. 따라서 혈액은행에서의 수혈 전 일상검사에 자동화 장비인 IH-1000을 사용할 수 있을 것으로 생각된다.

분자생물학적 방법을 통한 출토인골의 개인 동정-사천 늑도 출토 인골과 민통선 민묘 출토 인골을 중심으로 (Personal identification of the excavated ancient human bone through molecular-biological methods)

  • 서민석;이규식;정용재;이명희
    • 보존과학연구
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    • 통권22호
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    • pp.27-40
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    • 2001
  • DNA typing is often used to determine identity from human remains. Recently, the molecular biological analysis of ancient deposits has become possible since methods for the recovery of DNA conserved in bones or teeth from archaeological remains have been developed. In the field of archaeology, one of the most promising approaches is to identify the individuals present in a mass burial site. We performed nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing analysis based on PCR from a Korea ancient human remain excavated from Sa-chon Nuk-island and civilian access controlline(CACL). A femur bone were collected and successfully subjected to DNA extraction, quantification, PCR amplification, and subsequently typed for several shot tandem repeat(STR)loci. 4 types of STR systems used in this study were CTT multiplex(CSF1PO, TPOX, TH01), FFv multiplex(F13A01, FESFPS, vWA), Silver STRⅢ multiplex(D16S539, D7S820, D13S317), and amelogenin for sex determination. This studies are primarily concerned with the extraction, amplification, and DNA typing of ancient human bone DNA samples. Also, it is suggestive of importance about closely relationship between both fields of archaeology and molecular biology.

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원주응집법을 이용한 혈액형 검사 판독기의 개발 및 평가 (Development and Evaluation of the Reader for Blood Typing using Column Agglutination Method)

  • 김진;전우람;박승우;이창률;이다현;최인택;김주연;서인범
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제14권3호
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    • pp.346-351
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    • 2014
  • 안전한 수혈을 위한 정확한 혈액형 검사는 필수적이다. 최근에는 혈액은행 검사 분야에 검사의 오류를 줄이고 검사의 효율을 높이기 위해 자동화 장비가 도입되어 사용되고 있으나 중소병원에서 이용하기에는 매우 고가로 도입하기가 어렵다. 이에 본 연구에서는 혈액형 검사결과를 저장 및 재확인 할 수 있고, 이미지 프로세싱에 의해 결과가 판독되는 원주응집법을 이용한 혈액형 검사 판독기를 개발하였다. ABO 및 RhD 혈액형 검사가 의뢰된 148개의 검체와 비예기항체 검사가 의뢰된 154개의 검체를 대상으로 판독 결과를 비교한 결과, 양성과 음성의 판독 및 반응강도의 판독이 100%일치하였다. 본 연구에서 개발된 판독기는 추가적인 검증을 거친다면 중소형 병원에서도 쉽게 도입하여 효율적이며, 경제적으로 이용할 수 있을 것이다.

High Resolution Whole Genome Multilocus Sequence Typing (wgMLST) Schemes for Salmonella enterica Weltevreden Epidemiologic Investigations

  • Tadee, Pakpoom;Tadee, Phacharaporn;Hitchings, Matthew D.;Pascoe, Ben;Sheppard, Samuel K.;Patchanee, Prapas
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.162-170
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    • 2018
  • Non-typhoidal Salmonella is one of the main pathogens causing food-borne illness in humans, with up to 20% of cases resulting from consumption of pork products. Over the gastroenteritis signs, multidrug resistant Salmonella has arisen. In this study, pan-susceptible phenotypic strains of Salmonella enterica serotype Weltevreden recovered from pig production chain in Chiang Mai, Thailand during 2012-2014 were chosen for analysis. The aim of this study was to use whole genome sequencing (WGS) data with an emphasis on antimicrobial resistance gene investigation to assess their pathogenic potential and genetic diversity determination based on whole genome Multilocus Sequence Typing (wgMLST) to expand epidemiological knowledge and to provide additional guidance for disease control. Analyis using ResFinder 3.0 for WGS database tracing found that one of pan-susceptible phenotypic strain carried five classes of resistance genes: aminoglycoside, beta-lactam, phenicol, sulfonamide, and tetracycline associated genes. Twenty four and 36 loci differences were detected by core genome Multilocus Sequence Typing (cgMLST) and pan genome Multilocus Sequence Typing (pgMLST), respectively, in two matching strains (44/13 vs A543057 and A543056 vs 204/13) initially assigned by conventional MLST and Pulsed-field Gel Electrophoresis (PFGE). One hundread percent discriminant ability can be achieved using the wgMLST technique. WGS is currently the ultimate molecular technique for various in-depth studies. As the findings stated above, a new of "gold standard typing method era" for routine works in genome study is being set.

혈액은행 자동화 검사장비 DAYMATE M의 수행능 평가 (Evaluation of the Automated Immunohematology Analyzer DAYMATE M)

  • 유재은;유해인;최현유;이규형;송영선;이승옥;제갈동욱;김용구
    • Laboratory Medicine Online
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    • 제7권4호
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    • pp.163-169
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    • 2017
  • 배경: 혈액은행 자동화 검사장비는 혈액은행 검사 결과의 질 향상에 도움이 될 것이다. 최근 자동화 장비 DAYMATE M이 개발되어, 이에 대한 성능을 검증하였다. 방법: 서울성모병원과 인천성모병원에서 수집한 300개의 혈액 검체를 가지고 ABO와 RhD 검사를 실시하였다. 또한, 336개의 검체를 이용해 항체선별검사(AST)를 진행하였고, 골수 이식을 받은 82명의 환자에 대해서도 동일한 검사를 진행하였다. DAYMATE M와 비교하기 위한 수동검사는 DS-SCREEING II (Bio-Rad Laboratories, Switzerland)와 Selectogen (Ortho-Clinical diagnostics Inc., USA)을 사용하였다. 결과: 전체 300개의 혈액 검체는 A형 87개, B형 73개, O형 79개, 그리고 AB형 61개로 이뤄져 있다. DAYMATE M과의 일치율은 혈구형 검사에서는 99.9%, 혈청형 검사에서는 97.0%였다. 혈구형 검사에서 불일치한 검체 1개는 수기법에서는 AB형으로 나왔지만 DAYMATE M에서는 B형으로 나왔고, 혈청형 검사에서 나온 불일치 결과 6개는 모두 A형 검체가 DAYMATE에서 anti-B가 검출되지 않은 경우였다. 336개의 항체선별검사의 일치율은 93.2%였다. 136개의 양성 검체 중 불일치 결과는 6개였다. 골수 이식을 받은 82명의 환자들을 대상으로 한 검사 결과, ABO 검사결과의 일치율은 92.2%였다. 6개의 불일치 결과 중 4개는 DAYMATE M에서만 공여자형으로 판독되었고, 나머지 2개는 수기법에서만 공여자형으로 판독되었다. 결론: 혈액은행 자동화 검사 장비 DAYMATE M은 ABO, RhD 검사, 항체선별검사에서 기존의 수기법과 높은 일치율을 보였고, 조혈모세포이식을 받은 환자를 대상으로 검사할 때에도 좋은 성능을 나타냈다.

유방염 유즙에서 분리한 포도구균의 분자생물학적 typing과 multiplex PCR을 이용한 장독소의 검출 (Molecular typing and detection of enterotoxin by multiplex PCR of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis)

  • 김신;홍현표;김상윤;권헌일;이희무
    • 한국동물위생학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.275-283
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    • 2002
  • Forty strains of Staphylococcus aureus were isolated from mastitic milk. As a result of antimicrobial susceptibility test, the strains of S aureus revealed 47.5% were resistant to ampicillin and penicillin, and 7.5% to gentamicin. But 45% of isolates were sensitive to antimicrobial agents tested. In case of enterotoxin production, 56.3% of 16 strains produced enterotoxin D. Two strain of enterotoxin D producers produced both enterotoxin B and D. According to isolation date, 15 representative strains were selected. As a results of pulsed field gel eletrophoresis analysis of the 15 representative strains, 14 strains were identical. Therefore we consider the identical strains of S aureus have caused continuously bovine mastitis in this dairy farm. If autogenous vaccine can be made by the strains, it will work well for the prevention of bovine mastitis caused by S aureus.