• Title/Summary/Keyword: Commercial species

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Genetic information analysis for the development of an event-specific PCR marker for herbicide tolerance LM crops

  • Do Yu, Kang;Myung Ho, Lim;Soo In, Sohn;Hyun Jung, Kang;Tae Sung, Park
    • 농업과학연구
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    • 제48권4호
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    • pp.1051-1065
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    • 2021
  • Recent times have seen sustained increases in genetically modified (GM) crops not only for cultivation but also for the utility of food and feed worldwide. Domestically, commercial planting and the accidental or unintentional release of living modified (LM) crops into the environment are not approved. Many detection methods had been devised in an effort to realize effective management of the safety of agricultural genetic resources. In order to develop event-specific polymerase chain reaction (PCR) markers for LM crops, we analyzed the genetic information of LM crops. Genetic components introduced into crops are of key importance to provide a basis for the development of detection methods for LM crops. To this end, a total of 18 varieties from four major LM crop species (maize, canola, cotton, and soybeans) were subjected to an analysis. The genetic components included introduced genes, promoters, terminators and selection markers. Thus, if proper monitoring techniques and single or multiplex PCR strategies that rely on selection markers can be established, such an accomplishment can be regarded as a feasible solution for the safe management of staple crop resources.

한국산 곤충병원성 선충과 Steinernema 속의 검색표 (Entomopathogenic Nematodes(Steinernematidae and Heterohabditidae) from Korea with a Key to Steinernema)

  • 추호렬;김준범;이동운
    • 한국토양동물학회지
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    • 제1권1호
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    • pp.28-36
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    • 1996
  • A survey for entomopathogenic nematodes was conducted throughout the nine provinvrd and within three city limits during the summer of 1990 and 1991. Six of the nine provinces and one of the three cities were positive for entomopathogenic nematodes. Out of the total 499 soil samples, 23(4.6%) were positive for entomopathogenic nematodes with 19(3.8%) containing Steinernema and 4(0.8%) containing Heterorhabditis. Heterorhabditis bacteriopora and three distinct groups of Steinernema species were idintified. One groups was indentified as S. carpocapsae, another S. glaseri and the other S. monticola based on cross breeding studies. Positive sample sites in each habitat includes 15 of the 415(3.6%) from forests including regrowth areas with shrubs, 1 of the 27(3.7%) from turfgrass including golf courses and parks, 3 of the 24(12.5%) from agricultural fields, 2 of the 16(12.5%) along riparian areas, and of the 17(11.8%) near the seashore. We advocate that more surveys be conducted for entomopathogenic nematodes before commercial sources of nematodes are widely applied which may obscure the naturally-occurring nematodes. A key to Steinernema is provided for the identification.

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Optimization of Ceramide Analysis Method Using LC-MS in Cosmetics

  • Su-Jin Park;Hee-Jin Yoo;Duck-Hyun Kim;Ji-Won Park;Eunji Jeon;Abhik Mojumdar;Kun Cho
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제15권1호
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    • pp.49-53
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    • 2024
  • Ceramide is a lipid in which sphingoid bases and fatty acids are linked by amide bonds. As a marker of skin disease in the human stratum corneum, its disease-causing and therapeutic effects have been partially confirmed, and it is therefore an important element in commercially available cosmetic formulations. However, structural diversity caused by differences in the chain length, number, and location of hydroxyl groups makes quality control difficult. In this study, a method was established to separate different ceramide species using reversed-phase LC-MS/MS and thus enable qualitative evaluation. Separation of four standards was achieved within a short retention time, and the accuracy and sensitivity of the method were demonstrated by the low limit of detection (LOD) calculated based on the calibration curve showing linearity, with R2 > 0.994. After verification of reproducibility and reliability through intra- and inter-day analyses, the efficiency of the method was confirmed through analysis of commercial cosmetic raw materials.

An Inexpensive System for Rapid and Accurate On-site Detection of Garlic-Infected Viruses by Agarose Gel Electrophoresis Followed by Array Assay

  • Kazuyoshi Furuta;Shusuke Kawakubo;Jun Sasaki;Chikara Masuta
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제40권1호
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    • pp.40-47
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    • 2024
  • Garlic can be infected by a variety of viruses, but mixed infections with leek yellow stripe virus, onion yellow dwarf virus, and allexiviruses are the most damaging, so an easy, inexpensive on-site method to simultaneously detect at least these three viruses with a certain degree of accuracy is needed to produce virus-free plants. The most common laboratory method for diagnosis is multiplex reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). However, allexiviruses are highly diverse even within the same species, making it difficult to design universal PCR primers for all garlic-growing regions in the world. To solve this problem, we developed an inexpensive on-site detection system for the three garlic viruses that uses a commercial mobile PCR device and a compact electrophoresis system with a blue light. In this system, virus-specific bands generated by electrophoresis can be identified by eye in real time because the PCR products are labeled with a fluorescent dye, FITC. Because the electrophoresis step might eventually be replaced with a lateral flow assay (LFA), we also demonstrated that a uniplex LFA can be used for virus detection; however, multiplexing and a significant cost reduction are needed before it can be used for on-site detection.

한국 해역에서 어획된 참조기(Larimichthys polyactis)의 연령과 성장 연구 (Age and Growth of Small Yellow Croaker Larimichthys polyactis Using Otoliths in the Waters of Korea)

  • 김한주;김정년;손호선;오택윤;이정훈
    • 한국수산과학회지
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    • 제57권4호
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    • pp.372-379
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    • 2024
  • The small yellow croaker Larimichthys polyactis is an important ecological and commercial species in the waters of Korea. Based on samples purchased monthly from a market from 2019 to 2021, except during the closed season, we analyzed the age and growth of the small yellow croaker using 894 otoliths. The total lengths of the small yellow croaker ranged from 12.0 to 38.9 cm, which is a sufficient length range for analyzing age structure and growth parameters. The translucent zone, formed during the spawning season in June, was counted as the annual mark. The estimated ages were 0-10 years, and the 38.9 cm individuals were 7 years old, while the 34.2 cm individuals were 10 years old. The highest proportion in this study (86.8%) was 0-3 years. The von Bertalanffy growth model was obtained as Lt=41.2(1-exp-0.20(t+1.50)).

GloBallast 선박평형수 위해도평가 방법의 개선방안에 관한 연구 (Study on the Improvement of Ballast Water Risk Assessment of GloBallast)

  • 이승국;강원수;김은찬;신경순
    • 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.224-229
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    • 2011
  • 최근 선박평형수에 의한 외래 유입 해양생물체에 대한 관리가 시급한 과제로 대두되고 있다. 이는 외래 유입 유해 생물이 해양생태계를 교란시키고 있기 때문이다. 또한 연안의 수산물 어획 및 상업적 활동 및 자원에 악영향을 미치고 있다. 이와 관련하여 IMO에서는 선박평형수에 의한 해양생물체 유입을 관리하기 위해 선박평형수 위해도 평가 시스템인 GloBallast를 운영한 바 있다. GloBallast는 선박평형수 배출량, 선박평형수 배출횟수, 항만 간 환경 유사도, 유해생물종의 수량을 주요 인자로 사용하여 국가 간 선박평형수의 이동에 의한 상대적인 위해도를 평가하도록 구성되어 있는데, GloBallast를 시범 운영해 본 결과에 의하면 주요 인자 중 환경유사도 인자가 다른 인자들에 비해 위해도 평가 결과에 미치는 영향이 상대적으로 큰 것으로 파악되었다. 이에 본 논문에서는 GloBallast 위해도 평가에 사용되고 있는 주요 인자들 간의 상관관계에 대해 살펴보고, 이들 주요 인자들이 보다 합리적으로 위해도 평가에 반영될 수 있는 방안에 대해 검토하였다.

동해안 울진해역 원통형 고둥 통발의 재질별 어획 성능 (Catching efficiency of the whelk pot in accordance with the pot materials in the Uljin waters, East sea)

  • 안희춘;배재현;박창두;박종명;홍성익;윤병선;김병관;김성훈
    • 수산해양기술연구
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    • 제53권1호
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    • pp.1-11
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    • 2017
  • Fishing pots are one of the important fishing gears in our coastal and offshore fisheries. In terms of a sustainable use of marine resources, there are concerns about the ghost fishing by lost pots. It is reported that 10 to 70% of the pots are abandoned or lost annually. This study is to compare the catching efficiency of drum type whelk pots that are made of biodegradable nets to those made of the ordinary nets, in the eastern coast of Korea. Five types of drum pots were used with combination of biodegradable nets and ordinary (PA, PE) nets applied to the main and funnel parts of the pots: pots with biodegradable nets (Bio+Bio); pots with PE net (PE+PE); pots with body and funnel made of biodegradable nets and PE nets respectively (Bio+PE); pots with body and funnel made of PE nets and PA nets respectively (PE+PA); pots with body and funnel made of PE nets and biodegradable net respectively (PE+Bio). Field experiments were conducted from June $18^{th}$, 2015 to August $7^{th}$, 2015 using a commercial fishing vessel in the Uljin waters on the eastern coast of Korea. Two fleets of pots with one hundred in each, 20 pots of each type, were casted for 8 to 15 days to analyze their catching efficiency. The catch of target species, whelks, was 202,563.0 g with catch rate of 38.7% of the total catch, while the bycatch was 320,709.7 g with the rate of 61.3% of the total catch. The catch of whelks was the highest in the Bio+PE pots (46,020.3 g), followed by the Bio+Bio pots (42,027.5 g), the PE+Bio pots (41,849.9 g) and the lowest being PE+PE pots (38,054.2 g). Compared to the conventional pots, the pots with biodegradable nets on the body or entrance part had slightly higher catch rate for both the target species and the bycatch. The PE+PE had the lowest catch rate. There is no significant difference in catch between the pots with biodegradable nets and the ordinary nets for the target species such as Buccinum opisthoplectum, Neptunea eulimata, Buccinum striatissimum. Consequently, using biodegradable nets for the conventional whelk pots can reduce ghost fishing by lost gears while keeping the performance of the pots.

멸치 액젓 중에 존재하는 미분해 펩티드의 특성과 이용 1. 미분해 펩티드를 이용한 멸치 액젓의 품질 지표 설정 (Properties and Utilization of Undigested Peptides in Anchovy Sauces 1. Use of Undigested Peptides as a Quality Parameter of Anchovy Sauces)

  • 최영준;김세환;임영선;김인수;김동수;조영제
    • 한국수산과학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.386-392
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    • 1998
  • 액젓의 객관적인 품질평가 기준을 설정하기 위하여, 전통적인 방법에 따라 발효 숙성시킨 멸치 액젓과 시판 멸치 액젓의 일반성분, 총질소량, 아미노산 함량, SDS-PAG전기영동을 통한 특정 펩티드의 면적을 측정하였고, 아울러 액젓 원료어의 판정을 위해 등전점 전기영동을 시도하였다. 멸치 액젓의 수분 함량은 대조구가 가장 낮은 $60.5\%$였으며, 시판 제품은 $65.5\%\~69.2\%$로 큰 차이가 없었으나, 총질소 함량은 시판 제품간에 비교적 큰 차이를 보이고 있었다. 액젓에 잔존하는 단백질의 함량은 Y사의 제품이 비교적 높은 $0.353mg/m{\ell}$ 였으며, 나머지 시판 제품은 $0.093mg/m{\ell}\~0.293mg/m{\ell}$의 범위였다 한편 SDS-PAG 전기영동상에서는 J사를 제외한 모든 액젓 제품에서 분자량 55,600 및 46,900 dalton의 band가 검출되었으며, 전기영동상에 나타난 단백질 band는 제조회사에 관계없이 거의 비슷한 형태를 나타내고 있었다. 그리고 등전점 전기영동에서 멸치 액젓은 등전점 5.6에 해당하는 펩티드가 공통적으로 존재하며, 특징적인 band임을 확인하였다. 따라서 아미노산 및 저분자 질소 화합물의 첨가 여부가 정량적인 값에 영향을 미치지 않는 전기영동 상의 특정 band의 면적비를 측정함으로서 인위적인 질소화합물의 첨가, 액젓 희석 여부 판정이 가능 할 것으로 판단되었다. 그리고 전 질소 함량, 아미노산 함량 및 SDS-PAG 전기영동 상에 있는 특징적인 55,600 dalton에 해당하는 펩티드 면적비의 상관관계는 멸치 액젓의 품질판정을 위한 기준으로 활용 가능함을 제시하고 있다.

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오존처리에 의한 폐양액내 Phytophthora spp. 멸균 (Disinfection of Phytophthora spp. in Recycling Nursery Irrigation Water by Ozone Treatment)

  • 이중섭;한경숙;박종한;정승룡;장한익
    • 식물병연구
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    • 제12권3호
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    • pp.272-277
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    • 2006
  • 수경재배지 폐양액 내 Phytophthora spp.는 일차적인 전염원이며 배양액 재사용 시 전염이 더욱 확산될 수 있다. 오존은 농업용수 및 지하수 살균을 위해 산업적으로 이용하여 왔으나 수경 재배지에서 폐양액 살균 후 재활용 목적으로 충분한 연구는 수행되지 못하였다. 본 연구에서는 폐양액 내 존재하는 4종의 Phytophthora spp.에 대하여 살균 목적으로 오존 처리 시간을 $1{\sim}9$분까지 구분하여 처리하였다. 폐양액 내 오존 7분 이상(농도 1.4 mg/l) 처리에서는 처리 시간에 관계없이 시험균주 4종 모두에서 매우 높은 살균력을 나타낸 반면 5분(농도 1.2mg/l) 이하의 저농도 처리는 충분한 살균력을 나타내지 못하였다. 한편, 7분 이상 고농도($1.4{\sim}1.7mg/l$)로 살균 처리된 폐양액을 P. nicotianae가 생장중인 배양접시에 처리한 결과 일부 배지 속 깊게 생장중인 균사체까지 살균력이 미치지 못하였다. 따라서, 본 연구 결과 완전한 폐양액 살균을 위해서는 오존 살균과 더불어 균사체 덩어리 또는 이병 잔재물을 제거할 수 있는 필터 방식과의 병행이 바람직하다.

소나무류 육종에 있어 임의 증폭 다형 디엔에이(RAPD)지표를 이용한 우량 임목의 조기 선발 (Application of RAPD Markers to Early Selection of Elite Individuals of Pinus Species for a Clonal Forest Tree Breeding Program)

  • 이재선;정은주;문홍규;글렌 데일;로버트 티즈데일
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제11권1호
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    • pp.81-101
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    • 1995
  • 지표-형질의 상관은 우량 개체 선발과 유전획득량의 증대를 위해 임목 육종에서 해결되어야 할 중요한 과제 중의 하나로 최근 분자유전학적 수준에서의 임의 증폭 다형 디엔에이 (RAPD) 기술의 발달로 이의 해결이 눈 앞에 다가왔다. 호주 퀸즈랜드산림청과 퀸즈랜드대 임목생물공학연구소가 공동 연구하고 있는 슬래쉬소나무, 카리비아소나무 및 그 교잡종에 있어 이 기술을 이용한 수피 두께에 대한 연구 및 육종 계획 전략을 소개한다. 1대 잡종에서 186개의 지표를 포함한 총 길이 1641cM의 16개 연관군의 유전적 지도가 작성되었고, 이 연관군 지도에 수피 두께를 지배하는 6개의 유전자좌가 추정되었다. 또한, 유전적 지표를 이용한 조기 선발을 위해 먼저 중요 형질을 지배하는 유전자들에 대한 종 특성 유전적 지표를 결정하고, 다음 여러가지 대립유전자형에 대한 지표-대립유전자 상관을 구명하는 2단계 전략이 제시되었다. 소나무류는 발아시 양료로 쓰이는 자성배우체는 모수에서 유래하나, 접합자인 배는 양친수로부터 유래하므로 이러한 이질적 유전 조성을 갖인 종자의 발달을 이용한 RAPD 지표와 형질의 상관 연구는 배 단계에서도 우량 개체의 선발을 가능하게 하여 소나무류 육종의 장래를 밝게 하고 있다.

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