• 제목/요약/키워드: Comet

검색결과 480건 처리시간 0.025초

DNA Strand Breaks in Mitotic Germ Cells of Caenorhabditis elegans Evaluated by Comet Assay

  • Park, Sojin;Choi, Seoyun;Ahn, Byungchan
    • Molecules and Cells
    • /
    • 제39권3호
    • /
    • pp.204-210
    • /
    • 2016
  • DNA damage responses are important for the maintenance of genome stability and the survival of organisms. Such responses are activated in the presence of DNA damage and lead to cell cycle arrest, apoptosis, and DNA repair. In Caenorhabditis elegans, double-strand breaks induced by DNA damaging agents have been detected indirectly by antibodies against DSB recognizing proteins. In this study we used a comet assay to detect DNA strand breaks and to measure the elimination of DNA strand breaks in mitotic germline nuclei of C. elegans. We found that C. elegans brc-1 mutants were more sensitive to ionizing radiation and camptothecin than the N2 wild-type strain and repaired DNA strand breaks less efficiently than N2. This study is the first demonstration of direct measurement of DNA strand breaks in mitotic germline nuclei of C. elegans. This newly developed assay can be applied to detect DNA strand breaks in different C. elegans mutants that are sensitive to DNA damaging agents.

Genetic Toxicity Test of 1,2-Dibromoethane by Ames, Micronucleus, Comet Assays and Microarray Analysis

  • Kim, Ki-Y.;Kim, Ji-H.;Kwon, Kyoung-J.;Go, Seo-Y.;Min, Kyung-N.;Lee, Woo-S.;Park, Sue-N.;Shee, Yhun-Y.
    • Biomolecules & Therapeutics
    • /
    • 제14권4호
    • /
    • pp.246-252
    • /
    • 2006
  • 1,2-Dibromoethane(DBE) has been widely used as a soil fumigant, an additive to leaded gasoline and an industrial solvent. In this study, we have carried out in vitro genetic toxicity test of 1,2-dibromoethane and microarray analysis of differentially expressed genes in response to 1,2-dibromoethane. 1,2-Dibromoethane showed mutations in base substitution strain TA1535 both with and without exogenous metabolic activation. 1,2-Dibromoethane showed mutations in frame shift TA98 both with and without exogenous metabolic activation. 1,2-Dibromoethane showed DNA damage based on single cell gel/comet assay in L5178Y cells both with and without exogenous metabolic activation. 1,2-Dibromoethane increased micronuclei in CRO cells both with and without exogenous metabolic activation. Microarray analysis of gene expression profiles in L5178Y cells in response to 1,2-dibromoethane selected differentially expressed 241 genes that would be candidate biomarkers of genetic toxic action of 1,2-dibromoethane.

T-2 toxin을 투여한 닭에서 Comet assay 방법을 이용한 DNA 손상 평가와 독성 (Assessment of DNA Damage using an Alkaline Single Cell Gel Electrophoresis (SCGE) Comet Assay and Toxic Effects in Chickens by T-2 Toxin Treatment)

  • 하대식;허정호;이국천;조명희;김국헌;김충희;류재두;이승환;김곤섭;김의경;김종수
    • Toxicological Research
    • /
    • 제22권2호
    • /
    • pp.75-85
    • /
    • 2006
  • This study was designed to evaluate the possible DNA damaging effects of T-2 toxin using an alkaline single cell gel electrophoresis (SCGE) comet assay and also to investigate toxic effects in chickens. A total of 20 chickens were used in these experiments. Graded concentrations of dietary T-2 toxin (0, 4, 8, and $16{\mu}g/g$ of diet) were given to groups of 5 broiler chickens. In comet assay, The DNA damage was analysed by the tail extent moment (TEM) and tail length (TL), which were used as markers of DNA strand breaks in SCGE. A significant dose-dependent increase in the extent of DNA migration as well as in the percentage of cells with tails was observed after treatment with T-2 toxin (P<0.05). Treatment with the low T-2 toxin ($4{\mu}/g$ of diet) induced a relatively low level of DNA damage in comparison with the high T-2 toxin ($16{\mu}/g$ of diet) group. The growth rate was significantly reduced by concentrations of 8, and $16{\mu}/g$ of diet (P < 0.05). The feed conversion ratio were significantly affected by any concentrations (P < 0.05). The relative weight of the spleen, and lung was decreased by the growth inhibitory concentrations. The bursa of Fabricius, thymus, and kid- ney were decreased in relative weight by concentrations of $16{\mu}/g$ of diet. The relative weight of the liver and heart were unaffected. The hemoglobin (Hb), hematocrit (HCT), and mean corpuscular hemoglobin (MCH) were decreased at concentration of $16{\mu}/g$ of diet. As compared with control chickens, there was no marked change in serum components except uric acid in T-2 treated chickens. All lymphoid tissues retained atrophic and lymphoid cell depletion throughout the three weeks trial.

Evaluation of Oxidative DNA Damage Using an Alkaline Single Cell Gel Electrophoresis (SCGE) Comet Assay, and the Protective Effects of N-Acetylcysteine Amide on Zearalenone-induced Cytotoxicity in Chang Liver Cells

  • Kang, Changgeun;Lee, Hyungkyoung;Yoo, Yong-San;Hah, Do-Yun;Kim, Chung Hui;Kim, Euikyung;Kim, Jong Shu
    • Toxicological Research
    • /
    • 제29권1호
    • /
    • pp.43-52
    • /
    • 2013
  • Zearalenone (ZEN) is a non-steroidal estrogenic mycotoxin produced by several species of Fusarium that are found in cereals and agricultural products. ZEN has been implicated in mycotoxicosis in farm animals and in humans. The toxic effects of ZEN are well known, but the ability of an alkaline Comet assay to assess ZEN-induced oxidative DNA damage in Chang liver cells has not been established. The first aim of this study was to evaluate the Comet assay for the determination of cytotoxicity and extent of DNA damage induced by ZEN toxin, and the second aim was to investigate the ability of N-acetylcysteine amide (NACA) to protect cells from ZEN-induced toxicity. In the Comet assay, DNA damage was assessed by quantifying the tail extent moment (TEM; arbitrary unit) and tail length (TL; arbitrary unit), which are used as indicators of DNA strand breaks in SCGE. The cytotoxic effects of ZEN in Chang liver cells were mediated by inhibition of cell proliferation and induction of oxidative DNA damage. Increasing the concentration of ZEN increased the extent of DNA damage. The extent of DNA migration, and percentage of cells with tails were significantly increased in a concentration-dependent manner following treatment with ZEN toxin (p < 0.05). Treatment with a low concentration of ZEN toxin (25 ${\mu}M$) induced a relatively low level of DNA damage, compared to treatment of cells with a high concentration of ZEN toxin (250 ${\mu}M$). Oxidative DNA damage appeared to be a key determinant of ZEN-induced toxicity in Chang liver cells. Significant reductions in cytolethality and oxidative DNA damage were observed when cells were pretreated with NACA prior to exposure to any concentration of ZEN. Our data suggest that ZEN induces DNA damage in Chang liver cells, and that the antioxidant activity of NACA may contribute to the reduction of ZEN-induced DNA damage and cytotoxicity via elimination of oxidative stress.

한국산 겨우살이의 산화적 DNA 손상 억제작용 (Inhibitory effect of Korean mistletoes on the oxidative DNA damage)

  • 이소진;이미경;최근표;김나영;노성규;허문영;김종대;이현용;이진하
    • 한국약용작물학회지
    • /
    • 제11권2호
    • /
    • pp.89-96
    • /
    • 2003
  • 기주목(상수리나무, 밤나무, 자작나무, 버드나무)별 겨우살이 ethanol추출물과 5가지 분획물 (hexane fr., chloroform fr., ethyl acetate fr., butanol fr., aqueous fr.)을 이용하여 in vitro에서 DPPH를 이용한 수소전자공여능, DNA에 대한 산화적 손상 및 손상억제 효과 등에 미치는 영향을 연구하기 위하여 comet assay를 실시하였다. 4종의 한국산 겨우살이의 ethanol추출물과 분획물 중 ethyl acetate fr.들이 높은 수소전자공여능을 보였다. Comet assay분석에서 head DNA의 형태를 유지하거나 또는 tail DNA의 생성을 억제하는 겨우살이 fr.들이 DNA에 대하여 항산화적 기능이 있음을 보여 주었다. 또는 comet assay 유용한 parameter인 $tail\;length({\mu}m)$는 positiye control인 $H_2O_2\;(10^{-3}M)$로 40min동안 세포에 처리하여 산화적 손상을 준 결과, $149{\mu}m$의 tail length를 보였으며 , 상수리나무 겨우살이의 ethyl acetate fr.(0.1mg/ml)을 $H_2O_2\;(10^{-3}M)$와 동시 처리에는 $110{\mu}m$, 자작나무 겨우살이 ethyl acetate fr.은 $104{\mu}m$, 상수리나무 겨우살이 butanol fr.은 $123{\mu}m$, 자작나무 겨우살이 butanol fr.은 $118{\mu}m$로 tail length가 감소하는 것으로 보아 겨우살이가 산화적 DNA손상을 방어한다는 것을 알 수 있었다. 이상의 결과로 볼 때 한국산 겨우살이는 산화적 stress를 일으키는 활성 산소 자유라디칼의 생성에 대해 보호활성을 나타내어 유용한 chemopreventive agent의 기능이 기대된다.

혜성의 특성을 모티브로 한 인터랙티브 미디어 아트 제작 (Production of an Interactive Media Artwork with motif of Characteristics of comets)

  • 이오정;김형기
    • 디지털콘텐츠학회 논문지
    • /
    • 제18권8호
    • /
    • pp.1529-1535
    • /
    • 2017
  • 혜성은 그 특유의 조형성과 신비로움으로 인하여 다양한 창작 분야에 영감을 주는 주요한 모티브로서 작용하고 있다. 현대 과학 기술의 발전과 그 맥락을 함께하며 계속해서 변화, 확장되는 미디어 아트는 테크놀로지의 활용을 통해 혜성의 구조와 같은 고유 특성까지 작품 내에 모티브로서 표현하는 형태를 보이고 있다. 본 연구는 혜성의 특성을 모티브로 하여 관객이 작품에 근접하면 상호작용이 일어나 관객에게 혜성의 꼬리를 만드는 주체가 되는 경험을 제공하는 거리 인식 기반 인터랙티브 미디어 아트 작품 "Near by"를 제작하는 과정을 기술한 연구이다. 본 작품은 관객이 가까이 다가온 것이 인식되면 혜성의 핵을 표현한 LED 구조물에 색 변화가 일어남과 동시에 구조물의 뒤로 꼬리를 표현한 영상이 프로젝션 되는 구조로 이루어져 있으며, 이러한 상호 작용 과정을 통해 관객들로 하여금 혜성에 대한 인식을 새롭게 하고 작품과 감성적으로 교감할 수 있도록 하고자 하였다. 단순히 혜성의 조형적 특성 뿐 아니라 혜성의 형성 과정까지 작품의 모티브로서 담아내고자 시도하였으며, 이러한 복합적인 모티브 표현 방법을 제안함을 통해 향후 미디어 아트 분야에 있어 자연 현상 모티브의 표현 범위를 확장시킬 수 있는 가능성을 제시하고자 한다.

미세술기를 이용한 정계정맥류절제술이 정자 핵 내 DNA Integrity에 미치는 효과 (Effect of Microsurgical Varicocelectomy on Human Sperm Nucleus DNA Integrity)

  • 김기영;이재석;지희준;김종현
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
    • /
    • 제37권3호
    • /
    • pp.245-251
    • /
    • 2010
  • 목 적: 인간 정자 핵 내의 DNA integrity는 배아의 발달 및 임신 유지에 중요한 역할을 하여 DNA integrity가 손상된 경우 불임과 유산의 원인이 된다고 하며, 정계정맥류는 DNA 손상을 일으키는 대표적인 원인 중 하나이다. 본 연구에서는 미세술기를 이용한 정계정맥류절제술로 정계정맥류를 교정을 하였을 때 정자 핵 내 DNA integrity가 어떠한 영향을 받는지에 대하여 알아보았다. 연구방법: 2006년 4월부터 2007년 4월까지 불임을 주소로 미세술기를 이용한 정계정맥류절제술을 받았던 18명의 환자에서 수술 전 후에 정액검사의 다른 지표들과 함께 정자 핵 내 DNA integrity가 어떻게 변화하였는지 조사하였다. 정자 핵 내 DNA integrity를 측정하는 방법으로 comet assay를 시행하였고, comet assay를 통한 DNA 손상 정도는 DNA fragmentation index (DFI)로 나타내었다. 결 과: 수술 후 4개월에 모든 환자에서 재발의 소견은 보이지 않았으며, DNA 손상 정도를 나타내는 평균 DFI는 수술 전에 19.3%, 수술 후에 13.7%로 유의한 변화를 보였다. 수술 전 DFI가 10 이상으로 비정상인 14명의 환자들 중 12명 (85%)에서 개선 소견을 보였으나, 수술 전 DFI가 10 미만인 정상 환자 4명에서는 1명 (25%)만이 개선 소견을 보였다. 수술 후 정자의 밀도, 운동성, 생존성에서 호전 양상을 보였으나 유의한 차이는 없었다. 결 론: 미세술기를 이용한 정계정맥류절제술을 통한 수술적 교정은 정액검사상의 다른 지표의 개선 뿐 아니라, 정자 핵 내 DNA 손상을 감소시킬 수 있다. 이상에서 정계정맥류의 수술적 교정으로 정자 핵 내 DNA integrity의 개선을 기대할 수 있으며, 이는 보다 양호한 정자를 많이 얻을 수 있어 자연임신이나 보조 생식술의 성공 가능성을 높일 수 있다는 점을 제시한다.

Comet assay에 의한 한국산 겨우살이(Viscum album coloratum)의 항유전독성 규명 (Investigation of in vitro Antigenotoxic Effect of Korean Mistletoe(Viscum album coloratum) Using Comet Assay)

  • 박종흠;지승택;현창기;진구복;신현길
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제32권2호
    • /
    • pp.461-468
    • /
    • 2000
  • 본 연구에서는 Comet assay를 이용해서 차 및 전통 약재로 사용하고 있는 한국산 겨우살이의 항유전독성을 측정하고자 하였다. 겨우살이 조추출물을 분자량에 따라 14,000 이상 분획(I), $8,000{\sim}14,000$의 분획(II), $3,500{\sim}8,000$ 분획(III) 그리고 3,500 이하 분획(IV)으로 분리하였다. 이중 분획 IV만이 비종양성 3T3 세포에서 농도에 따른 MNNG에 의한 DNA 손상을 감소시켰으며 겨우살이 lectin과 viscotoxin이 포함된 분획 I, III은 활성을 전혀 나타내지 않았다. 열처리에 의해서도 분획 IV는 시간이 지남에 따라서 활성이 약간 감소됨을 나타내었으나 여전히 유의적인 효과를 지니고 있었다. 겨우살이 분획 IV로부터 얻어진 유기용매 분획의 항유전독성 평가결과, 분획 IV의 항유전독성은 주로 수용성 물질에 의해 나타나는 것임을 알 수 있었다. Sephadex G-25 gel filtration chromatography에서, 겨우살이 분획 IV의 항유전독성에 기여하는 성분은 분자량 1,000 미만의 수용성 물질이었으며 이 저분자량 물질을 분리해내어 암 예방을 위한 기능성 식품소재로써 이용할 수 있는 가능성을 확인할 수 있었다.

  • PDF