Cochlodinium polykrikoides is a red-tide forming dinoflagellate that causes significant worldwide impacts on aquaculture industries and the marine ecosystem. There have been extensive studies on managing and preventing C. polykrikoides blooms, but it has been difficult to identify an effective method to control the bloom development. There is also limited genome information on the molecular mechanisms involved in its various ecophysiology and metabolism processes. Thus, comprehensive genome information is required to better understand harmful algal blooms caused by C. polykrikoides. We estimated the C. polykrikoides genome size using flow cytometry, with detection of the fluorescence of DNA stained with propidium iodide (PI). The nuclear genome size of C. polykrikoides was 100.97 Gb, as calculated by comparing its mean fluorescence intensity (MFI) to the MFI of Mus musculus, which is 2.8 Gb. The exceptionally large genome size of C. polykrikoides might indicate its complex physiological and metabolic characteristics. Our optimized protocol for estimating the nuclear genome size of a dinoflagellate using flow cytometry with PI can be applied in studies of other marine organisms.
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
/
v.20
no.2
/
pp.92-101
/
2015
We investigated cause of non-outbreak of Cochlodinium polykrikoides blooms in the western coast of Jaran Bay during summer, 2013, based on the species competition among C. polykrikoides and Skeletonema sp. using a mathematical model. As a result of the model simulation where the nutrient conditions in Jaran Bay was applied during summer, the cell density of Skeletonema sp. was higher than that of C. polykrikoides. In the sensitivity analyses by doubling and halving the parameters, any parameter had little effect on the cell density of C. polykrikoides. The cell density of Skeletonema sp. was significantly affected by changes in the parameter values. These results indicated that the growth of C. polykrikoides could be unaffected by rapidly changing environments. However, the growth of Skeletonema sp. may have been promoted by the changing nutrient supply of coast environments. Therefore, C. polykrikoides might have been suppressed by diatom blooms, such as Skeletonema sp., in changing nutrient supply condition of Jaran Bay.
Three species of fish such as yellow tail (Seriola quinqueradiata), bastard halibut (Paralichthys olivaceus) and black rockfish (Sebastes schlegeli) were exposed to the dinoflagellate, Cochlodinium polykrikoides, and quality changes of fish after death were investigated during the extended storage. The volatile basic nitrogen (VBN) and aerobic plate counts (APC) were determined in the muscles of fish, arid organoleptic change was evaluated in the kills, skins and muscles. APC in all the fish species did not change in 6 hours of storage, but increased gradually thereafter. VBN contents in the muscles continuously increased throughout the storage of fish. Slightly higher levels of APC and VBN were observed in the tested fish than control fish, which had been exposed to air until died and stored in seawater without treating C. polykrikoides. After 12 hours of storage, APC and VBN contents in the muscles did not exceed the initial spoilage limit, 10$^{5}$ CFU/g fur APC and 30 mg/100 g for VBN, in all of the fish including control fish. Organoleptic change in fish treated with C. polykrikoides did not greatly differ from the control fish. After 8 hours of storage, distinctive deterioration of muscle was detected organoleptically in the treated fish and the control fish. The compiled result indicated that moribund fish exposed to C. polykrikoides bloom should be handled properly in 6 hours of storage after death of fish.
During the period of the Cochlodinium polykrikoides red tide occurrence in the southern coast of Korea in 1997, we obseved the vertical migration of red tide organisms in situ, along with environmental factors such as water temperature, dissolved oxygen, pH, chlorophyll $\alpha$ and nutrients for practical application of loess suspension techniques ot diminish fisheries damage. To cope with serious outbreaks of red tide of C. polykrikoides, the finfish culturists resorted with loess suspension to disperse the bloom watermass by turning around it with fishing boats in full speed. Peak in afternoon the cell numbers were diminished in the surface layer after sunset red tide organisms settled down in the middle and bottom layer progressively again after sunrise. Chlorophyll $\alpha$ and dissolved oxygen showed the same trends of variation with the cell number. In the course of controlling the red tide with loess suspension we could not find any severs oxygen deficiency to kill the culture species.
Ground seawater quality was investigated, and the algal growth potential (AGP) tests were performed along the Tongyeong coast to examine the inflow of materials, which is needed for the red tide species Cochlodinium polykrikoides to grow. The study was conducted to determine the mechanism for C. polykrikoidesred tides. Water temperature, salinity, pH, and dissolved oxygen (DO) ranged from 16.05 to $20.74^{\circ}C$, 18.20 to 32.11 psu, 6.00 to 7.61, and 3.41 to 7.91 mg/L (41.4-96.1%), respectively. No seasonal variation was observed in water temperature. The salinity, pH, and DO saturations at most stations were lower than those of coastal seawater at Tongyeong. The ${NH_4}^+$-N, ${NO_{2+3}}^-$-N, ${PO_4}^{3-}$-P concentrations ranged from 0.43 to 16.00 ${\mu}M$, 1.50 to 132.38 ${\mu}M$, and 1.30 to 6.29 ${\mu}M$, respectively; the values at some stations were much higher than observed in Tongyeong coast seawater. Using seawater from station B, C. polykrikoides grew consistently, with a high growth rate, similar to the red tide in nature. This seawater appeared to contain materials needed by C. polykrikoides to grow. Therefore, C. polykrikoides red tides seem to occur wherever the ground sea water contains materials that are needed for its growth.
The nucleotide sequence for a nuclear-encoded small subunit rDNA (SSU rDNA) was determined for 43 species of the class Dinophyceae, including harmful algae Cochlodinium polykrikoides and Gyrodinium aureolum. These sequences and data analyses were performed by parsimony, distances and maximum likelihood methods in PHYLIP (Phylogenetic Inference Package) version 3.573c. The species Noctiluca scintillans, Gonyaulax spinifern and Crypthecodinium cohnii occupied a basal position within the Dino- phyceae in our analyses. The genera Alexandrium and Symbiodinium were monophyletic (supported by a bootstrap value of >70%), whereas the genera Gymnedinium and Gyrodinium formed polyphyletic nodes, for which bootstrap support was strong (>70%) in the neighbor-joining and maximum likelihood methods except for the PHYLIP parsimony analysis (=59%). The sequence divergence between G. aureolum and G. dorsum/ G. galathenum was the largest at 7.4% (45 bp), whereas G. aureolum and G. mikimotoi showed an extremely low value of genetic divergence of 0.9% (5 bp). The genetic divergence between C. polykrikoides and G. aureolum was a low value of 5.2% (31 bp). In the phylogenetic analysis, the placement of G. aureolum and C. polykrikoides was closer to the genus Gymnodinium than to the genus Gyrodinium, which was supported by a moderate bootstrap value.
This study is the first attempt to understand the feeding physiology of a sea-urchin larva on a red-tide dinoflagellate. Fifteen day old larvae of S. intermedius capture C. polykrikoides cells by localized reversal of ciliary beats. No failure to transporte the algal cells from theciliated band to mouth and no rejection at the mouth suggest that C. polykrikoides has no feeding deterrence to S. intermedius larvae. The trend obtained for the clearance rate of S. intermedius larvae is similar to that of other sea urchin larvae. Thus, the clearance rate decreased as the algal concentration increased. Maximum clearance rate of S. intermedius on C. polykrikoides was 17.7 $\mu l$/larva/hr. Ingestion rate rapidly increased at lower algal concentrations and saturated at higher concentrations. There was no inhibition in ingestion rate at the highest prey concentration of ca. 3000 cells/ml. Maximum ingestion rate of S. intermedius on C. polykrikoides was 131 ngC/larva/d, which is higher than that reported for the larvae of the mussel Mytilus gal-lotrovincialis, but lower than that of the ciliate Strombidinopsis sp. The grazing rate, calculated by combining the field data on algal abundances with experimental data on ingestion rate, suggests that due to its low abundance, sea urchin Iarva has no significant grazing impact on C. polykrikoides population.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
/
v.16
no.4
/
pp.2971-2977
/
2015
This study aimed to understand the changes in microbial community after algicide dosing to control the fish-killing dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides in 10L microcosm. Based on our microcosm experiments, the algicidal activity for C. polykrikoides of yellow clay at the concentrations of 4g and 10g per 10 L was < 20%. At $0.8{\mu}M$ concentration of thiazolidinedione(TD49), the population of C. polykrikoides was controlled to be > 85%. In microbial community, a significant increase in heterotrophic bacterial (HB) abundance was observed at day 1 in the TD49 and yellow clay treatments including control. The HB remained high for 2 days and then gradually decreased. In contrast, the abundance of heterotrophic nanoflagellates (HNFs) increased significantly on days 3 and 5 in the TD49 treatments, indicating that the decline in HB was probably a result of predation by the high density of HNFs. In addition, fluctuations in the aloricate ciliate Uronema sp., which feed on bacteria, was clearly correlated with fluctuations in HB abundance, with a lag period of 1-3 days. Therefore, the short-term responses of the HNF and Uronema sp. may have been a result of the rapidly increasing of HB abundance, which is related to degradation of the dense C. polykrikoides bloom, particularly in the TD49 treatment. In addition, large aloricate ciliate Euplotes sp. was significantly increased after reproduction of HNFs and Uronema sp. Consequently, the algicide TD49 had positive effect on the microbial communities, which indicates that the microbial loop was temporarily enhanced in the microcosm by energy flow from HB through HNFs to ciliate.
Journal of the Korean Society for Marine Environment & Energy
/
v.12
no.4
/
pp.235-247
/
2009
In order to elucidate the cause of Cochlodinium polykrikoides blooms in the Korea southern coastal water, we investigated observational data of water temperatures and salinities in summer and winter, obtained from the stoppage of ship by NFRDI (National Fisheries Research and Development Institute) as well as composite images by NOAA from 1995 to 2008. Cochlodinium polykrikoides blooms occurred when water temperature was approximately $25.0{\sim}26.0^{\circ}C$ and salinity was 31.00 psu on average in Narodo neighboring seas. Different thermohaline fronts were observed between the Korea southern coastal water and the open sea water in summer and winter, respectively. That is, in winter four fronts were observed between the Korea southern coastal water with low temperature and low salinity, intermediate water originated from Tsushima Warm Current, Tsushima Warm Current with high temperature and high salinity, and the China coastal water with low temperature and low salinity. In contrast, in summer two fronts were observed between the Korea southern coastal water with low temperature and high salinity, Tsushima Warm Current with high temperature and low salinity, and the China coastal water with high temperature and high salinity. These thermohaline fronts also proved to be formed by two water masses with a different physical property, in terms of T-S diagrams. Consequently, we noticed that C. polykrikoides blooms occurring in Narodo neighboring seas in summer had a close relationship with thermohaline fronts observed between the Korea southern coastal water and Tsushima Warm Current.
Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
/
2002.10a
/
pp.80-81
/
2002
근년 Cochlodinium polykrikoides 적조는 막대한 경제적 피해를 입히고 있으며, 이의 방제를 위하여 우리나라에서는 황토살포와 살조세균 등에 관한 연구가 진행되어 왔으나 이 적조 발생시 양식어 폐사 등 수산업의 피해는 여전히 반복되고 있다. 우리나라에서 C. polykrikodes 적조로 인하여 양식어가 폐사하였을 때에는 전량 폐기하고 있어 수산자원의 효율적 이용이라는 측면에서 큰 손실이라 아니할 수 없다. (중략)
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.