• 제목/요약/키워드: Clone

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하드웨어 유전자 알고리즘을 이용한 무어 머신의 복제 (The clone of Moore machine using Hardware genetic algorithm)

  • 권혁수;박세현;이정환;노석호;서기성
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국해양정보통신학회 2002년도 춘계종합학술대회
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    • pp.466-468
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    • 2002
  • 본 논문은 새로운 무어 머신을 복제하는 진화 하드웨어를 제안하였다. 제안된 진화 하드웨어는 FPGA 상에서 효과적인 파이프라인, 병렬처리와 Handshaking을 구현했다. 유전자 알고리즘은 다양한 응용 분야의 NP 문제를 해결하는 방법으로 알려져 있으나 긴 계산 시간이 요구되기 때문에 하드웨어 유전자 알고리즘이 최근 관심사가 되고 있다. 기존의 하드웨어 유전자 알고리즘은 고정 길이의 염색체를 사용하지만 제안된 진화 하드웨어는 가변 길이의 염색체를 사용한다. 실험 결과는 제안된 진화 하드웨어가 무어 머신을 복제하는데 있어 적합함을 알 수 있다.

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Fruit Characteristics and Variation of Phenolic Compounds in the Fruit of Hawthorn (Crataegus pinnatifida Bunge) Selected from Korea and Chinese Cultivars

  • Park, Young-Ki;Hwang, Suk-In;Lee, Moon-Ho;Jang, Yong-Seok
    • 한국자원식물학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.223-227
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    • 2010
  • In order to select superior tree from Korea, five major phenolic compounds including (-)-epicatechin(EC), chlorogenic acid (ChA), hyperoside (HP), isoquercitrin (IQ), and procyanidin B2 (PC-$B_2$) in hawthorn fruit were evaluated. We also compared these hawthorn fruits of five clones with Chinese hawthorn cultivars. HPLC with a diode-array detector was used to determine the contents of the individual compounds. Hawthorn fruits of five clones (selected from different area of Korea), and four Chinese hawthorn cultivars grown in the Korea Forest Research Institute (Suwon) were utilized. With their high functional components, Jungsun is the clone including the highest contents of EC (11.26 mg/g) and PC-$B_2$ (24.46 mg/g). The clone of Chuncheon 15 had highest HP (0.53 mg/g) and IQ (0.41 mg/g). From the results, the clone of Jungsun and Chuncheon 15 can be evaluated to be selected breeding material for cultivar development.

하드웨어 유전자 알고리즘을 이용한 무어 머신의 복제 (The clone of Moore machine using hardware genetic algorithm)

  • 서기성;박세현;권혁수;이정환;노석호
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제6권5호
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    • pp.718-723
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    • 2002
  • 본 논문은 무어 머신을 복제하는 새로운 진화 하드웨어를 제안하였다. 제안된 진화 하드웨어는 FPGA 상에서 효과적인 파이프라인, 병렬처리와 Handshaking을 구현했다. 유전자 알고리즘은 다양한 응용 분야의 NP 문제를 해결하는 방법으로 알려져 있으나 긴 계산 시간이 요구되기 때문에 하드웨어 유전자 알고리즘이 최근 관심사가 되고 있다. 기존의 하드웨어 유전자 알고리즘은 고정 길이의 염색체를 사용하지만 제안된 진화 하드웨어는 가변 길이의 염색체를 사용한다. 실험 결과는 제안된 진화 하드웨어가 무어 머신을 복제하는데 있어 적합함을 알 수 있다.

새삼, 실새삼 및 갯실새삼 추출물이 Clone M-3 세포주의 Melanin 생합성 및 Tyrosinase 활성에 미치는 영향과 세포독성 및 항산화효과 (Inhibitory Effects on Melanin Biosynthesis and Tyrosinase Activity; Cytotoxicity in Clone M-3 and Antioxidant Activity by Cuscuta japonica, C. australis, and C, chinensis Extracts)

  • 장수진;석귀덕
    • 약학회지
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    • 제50권6호
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    • pp.421-428
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    • 2006
  • Water extracts, ethanol extracts, and juice of Cusuta japonica, C, australis, and C. chinensis were prepared, and their cytotoxicity, antioxidant activity and inhibitory effects on tyrosinase activitiy and melanin biosynthesis were estimated by using melanoma Clone M-3. From this study; the following conclusions were attained. Extracts of Cuscuta japonica, C. australis, and C. chinensis showed noticeable cytotoxicity except ethanol extracts from the stem of C. australis. A maximual cytotoxicity was observed with tile ethanol extract from the seed of C, australis (87.39%). While the ethanol extract from the seed of C. japonica (91.88%) showed the most pronounced inhibitory effect on melanin biosynthesis, the water extract from the stem of C. japonica (1.05%) possessed very little inhibitory effect. The most inhibitory effect on tyrosinase activity was observed with the water extract from the stem of C. australis (76.67%). Howeverr the water extract from the stem of C. japonica showed a very poor effect on the inhibition of tyrosinase activity All the preparations, except extracts from the seed of C. australis were able to remove reactive oxygen species (ROS) in a dose-dependent manner. The juice of C. japonica demonstrated the strongest activity (59.02%).

Antimicrobial active clones from soil metagenomic library

  • H. K. Lim;Lee, E. H;Kim, J.C.;Park, G. J.;K S. Jang;Park, Y. H.;K Y. Cho;S, W. Lee
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.108.1-108
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    • 2003
  • Soil metagenome is untapped total microbial genome including that of the majority of unculturable bacteria present in soil. We constructed soil metagenomic library in Escherichia coli using DNA directly extracted from two different soils, pine tree rhizosphere soil and forest topsoil. Metagenomic libraries constructed from pine tree rhizosphere soil and forest topsoil consisted of approximately 33,700 clones and 112,000 clones with average insert DNA size of 35-kb, respectively. Subsequently, we screened the libraries to select clones with antimicrobial activities against Saccharomyces cerevisiae and Agrobacterium tumefaciens using double agar layer method. So far, we have a clone active against S. cerevisiae and a clone active against A. tumefaciens from the forest topsoil library. In vitro mutagenesis and DNA sequence analysis of the antifungal clone revealed the genes involved in the biosynthesis of antimicrobial secondary metabolite. Metagenomic libraries constructed in this study would be subject to search for diverse genetic resources related with useful microbial products.

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소프트 콘택트렌즈용 다목적용액(MPS)의 Clone 1-5C-4 세포주에 대한 세포독성 및 가토 각막에 미치는 영향 (Cytotoxicity of Clone 1-5C-4 Cell Lines and Effect on Rabbit Cornea by Soft Contact Lens Multi-Purpose Solution (MPS))

  • 고은경;나명석;이종빈
    • 한국안광학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.19-25
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    • 2007
  • 현재 시중에서 유통되고 있는 소프트 콘택트렌즈 관리용액인 다목적용액(Multi Purpose Solution, MPS)이 결막세포주(Clone 1-5C-4 cell line)에 미치는 증식저해정도와 가토안의 각막상피 및 내피조직에 미치는 손상정도를 비교 관찰하고자 시행하였다. MPS는 $ReNu^{(R)}$ (Baush & Lomb, USA), Opti-free $express^{(R)}$ (Alcon, USA), Free-sol $plus^{(R)}$ (Hanamedicon, Korea)를 사용하였다. 세포증식 저해율은 결막세포주를 배양 한 후 MTT assay로 검정하였고, 형태학적으로는 광학현미경으로 Hematoxylin & Eosin staining 표본을 제작하여 관찰하였다. In vivo 실험은 백색 가토 9마리(18안)를 3군으로 분류하여 실험군인 좌안(9안)에는 각 MPS제품을, 대조군인 우안(9안)에는 보존제가 포함되지 않은 멸균생리식염수를 접안하였다. 일정기간 접안 후, 가토안의 각막표변을 Rose bengal로 염색하여 관찰하였고 각막상피 및 내피조직의 변화는 주사전자현미경(Scanning Electron Microscopy, SEM)으로 비교 관찰하였다.

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양다래X다래 클론 118의 엽조직 캘러스를 이용한 세포 현탁배양으로부터 식물체 유도 (Plant Regeneration from Cell Suspension Culture Using Leaf Callus in Actinidia deliciosa X A. arguta Clone 118)

  • 김용욱;문흥규
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제32권4호
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    • pp.287-292
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    • 2005
  • Actinidia deliciosa ${\times}$ A. arguta clone 118의 엽조직을 0.5 mg/L 2,4-D, 0.1 mg/L NAA 및 0.05 mg/L BA가 첨가된 MS 배지에서 8주간, 광조건하에서 배양하여 캘러스를 유기시켰다. 유도된 캘러스는 현탁배양을 위해 0.5 mg/L 2,4-D, 0.1 mg/L NAA 및 0.05 mg/L BA가 첨가된 액체 MS배지로 접종시켰다. 현탁배양세포의 대수생장기 혹은 생장 정체기 시기는 세포배양 5-11일, 12일경에 각각 관찰되었다. 현탁세포로부터 유도된 캘러스의 생중량은 생장조절물질 조합에 따라서 차이를 보이지 않았다. 가장 높은 신초유도율 (88.3%)은 2.0 mg/L zeatin의 첨가구였으며 TDZ과 BA 혹은 zeatin이 혼합처리된 처리구에서 또한 신초유도에 효과가 있는 것으로 나타났다. 유도된 신초를 MS +0.2 mg/L zeatin으로 옮겨 더욱 신초생장을 유도하였으며 발근유도를 위해 1.0 gm/L IBA가 첨가된 St배지로 옮겼다. Actinidia deliciosa ${\times}$ A. arguta clone 118의 세포배양으로부터 식물체 재분화까지 가능하였다.

Subtraction 기법을 이용한 한우 성장 단계 특이 발현 유전자 탐색 (Identification of the Differentially Expressed Genes of Hanwoo During the Growth Stage by Subtractive cDNA Hybridization)

  • 장요순;김태헌;윤두학;박응우;정일정;조진기
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권1호
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    • pp.13-22
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    • 2002
  • 한우의 성장단계 특이발현 유전자를 탐색하기 위하여, 본 연구에서는 유전자의 발현 유무 및 발현정도의 차이를 나타내는 유전자를 분리하는데 있어 가장 강력한 수단으로 알려진 subtractive cDNA hybridization 기법을 이용하여 한우 등심조직으로부터 12개월령 및 24개월령 특이적인 subtractive cDNA library를 제작하였다. 성장단계 특이적인 유전자를 탐색하기 위하여, 6, 12 및 24개월령 cDNA를 사용하여 reverse northern blot 분석을 실시하였으며, 6개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타낸 3개의 clone은 EPV 20, Ca2+ ATPase, 및 TCTP 유전자와 유사성을 나타내었다. 12개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타낸 9개의 cDNA clone은 각각 VCP, HSP 70, aldolase A, MSSK1, GM-2 activator protein, ryanodine receptor, acidic ribosomal phosphoprotein p1, ADP/ATP translocase T1 및 UCP 2 유전자와 높은 homology를 가지고 있었다. 또한 2개의 clone이 각각 12개월령 및 24개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타내었는데, 12개월령 cDNA probe에 대해서만 signal을 나타낸 clone은 ferrochelatase 유전자와 유사하였으며, 24개월령 probe에 대해서만 signal을 나타낸 clone은 ADRP 유전자와 유사하였다. 이상에서와 같이, 본 연구에서 제작한 성장단계 특이적인 subtractive cDNA library를 분석하여 14종의 유전자를 한우 성장단계 특이 발현 후보 유전자로 선정하여 염기서열을 분석하였으며, 이외에도 성장단계에 있어 특이적으로 발현될 것으로 추정되는 cDNA 클론의 염기서열을 분석하였다.

연초에서 발생하는 복숭아혹진딧물(Myzus persicae)형태형 2종의 Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD)을 이용한 유전적 유연관계 분석 (Genetic Relationahips of the Two Morphorogical Types of Myzus persicae(Homoptera:Aphididae) Collected from Tobacco Plants Based on Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD))

  • 채순용;이기원;김상석;장영덕
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.31-37
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    • 1998
  • 연초에 채집하여 Blackman(1987)의 기주선호성과 형태적인 특징을 이용하여 분류한 방법에 의해 두가지 타입을 (M. persicae Sulzer와 M. nicotianae Blackman)으로 구분된 무시성충 복숭아 혹진딧물 8 클론의 유전적 특성을 분석을 위하여 RAPD-PCR방법을 이용하였다. 사용된 random primer(10-mer) 100개 중에서 20개의 primer을 선발하였는데 GC content가 70, 80, 90%인 primer에서 각각 26.9%, 50.5% 및 66.^%로 GC content가 높아질수록 PCR결과 band의 양상이 좋게 나타났다. simple matching coefficient를 구하여 matrix를 작성해 본 결과 유사계수(similarity coefficient)의 범위는 0.414~0.808사이이었다. 복숭아혹진딧물 clone 간에 유사계수가 가장 높은 것은 PG2와 PG3 클론으로 0.808로 나타났으며, DBR클론을 기준으로 하여 볼 때 PG2 클론간의 유사계수를 0.414로 유사도가 가장 낮았다. 유사계수를 이용하여 8가지 클론의 진딧물들에 대한 유전적 근연관RP를 살펴보면 M. persicae typer에 속하는 PG1, PG2, PG3 클론들과 M. nicotianae type에 속하는 RED 클론이 유사도 0.643에서 한그룹, M. nicotianae type에 속하는 GR1, GR2, BRN크론들이 유사도 0.636에서 유연관계가 있었으며 그리고 M. persicae type에 the하는 DBR클론 등 세 개의 그룹으로 구분되었다. 따라서 연초에서 발생한 복숭아혹진딧물 형태형 2종 (M. persicae와 M. nicotianae)에 대하여 RAPD 기법을 이용하여 분석해본 결과 뚜렷한 유전적 유연관계는 발견하지 못하였다.

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Cloning and sequence analysis of Wild Argali short palate, lung and nasal epithelium clone 1 cDNA

  • Shen, Wen;Chen, Kaili;Sun, Yanming;Guo, Haiying;Chen, Dongmei;Cao, Yang
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권5호
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    • pp.736-742
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    • 2017
  • Objective: Experiments were conducted to clone the sequence of Wild Argali short palate, lung and nasal epithelium clone 1 (SPLUNC1) cDNA, and to lay the foundation for further study the biological function of Wild Argali SPLUNC1. Methods: The complete sequence of Wild Argali SPLUNC1 cDNA was generated by rapid amplification of cDNA ends. The entire coding sequence was inserted into the pPIC9K vector and expressed in Pichia pastoris (P. pastoris) GS115. The recombinant SPLUNC1 protein was detected by Western blot and purified by $Ni^{2+}$ chelate affinity chromatography. The test of effect of the protein on Mycoplasma ovipneumoniae (MO) was performed with real-time polymerase chain reaction. Results: The Wild Argali SPLUNC1 cDNA was 1,076 bp with an open reading frame of 768 bp, which encoded a 26.49 kDa protein composed of 255 amino acids. Its amino acid sequence shared 98.4%, 96.9%, 94.5%, 90.2%, 80.8%, 78.4%, 78.3%, 72.5%, 72.3%, 68.8% identity with those of SPLUNC1 cDNA from Ovis aries (accession no. NP_001288334.1), Capra hircus (accession no. XP_005688516.1), Pantholops hodgsonii (accession no. XP_005979709.1), Bos taurus (accession no. NP_776851.1), Felis catus (accession no. XP_006929910.1), Homo sapiens (accession no. NP_001230122.1), Sus scrofa (accession no. NP_001005727.1), Chinchilla lanigera (accession no. NP_001269294.1), Mus musculus (accession no. NP_035256.2), and Rattus norvegicus (accession no. NP_742028.1), respectively. The recombinant protein corresponded to the expected molecular mass of 25.47 kDa as judged by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis, and it was detected in the supernatant of P. pastoris, and it could be purified. The results from the test of inhibition effect of argali recombinant SPLUNC1 protein on MO showed that the product could inhibit MO very well (p<0.01). Conclusion: The amino acid sequence of Wild Argali SPLUNC1 was different from other organisms. The recombinant SPLUNC1 protein has good biological activity.