• 제목/요약/키워드: Citrobacter freundii

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여수 연안 및 동중국해의 세균상 2. 분리균의 수평분포 (Bacterial Flora of East China Sea and Yosu Coastal Sea Areas 2. Horizontal Distributions of Bacteria Isolated from The Sea Area)

  • 신석우;정규진
    • 한국수산과학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.17-25
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    • 1996
  • 1992년 8월 6일 부터 8월 14일 까지에 걸쳐 조사한 동중국해와 여수 연안에서 분리한 세균상은 174균주, vibrio spp. 132균주, 대장균군 183균주에 대한 분리 동정 결과는 다음과 같다. 1. 동중국해 세균상은 분리균 74균주중 40균주가 Pseudomonas spp. $(54\%)$였고, 여수 연안에서는 분리균 100균주중 60균주가 Enterobacteriaceae $(60\%)$였다. 2. Vibrio spp.는 동중국해에서 분리된 5균주중 V. alginolyticus가 4균주, V. parahaemolyticus가 1균주 밖에 분리되지 않았고, 여수 연안에서는 127균주중 V. alinolyticus가 54균주로 $42.5\%$를 차지 하였으며, V. parahaemolyticus는 21균주로 $16.5\%$를 차지하여 이들 두 균종이 Vibrio의 우점종이였다. 3. 대장균군은 동중국해에서 분리한 27균주중 E. coli I이 3균주, C. freundii I이 1균주였고 여수 연안에서는 분리균 156균주중 E. coli I이 79균주 $(50.6\%)$였고 C. freundii I, II가 각각 1균주였다. 4. 대장균군의 IMViC system, $44^{\circ}C$의 발육, gelatin 액화 실험에 의해 16균형으로 분별 되었고 비동정균은 $8\~16$균형으로 분리 균 183균주중 99균주로 $54\%$를 차지하였으며 5. $5^{\circ}C$ 가능한 저온성 대장균군은 15균주였다.

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PCR-DGGE를 이용한 막걸리발효에서 미생물 다양성 분석 (Analysis of Microbial Diversity in Makgeolli Fermentation Using PCR-DGGE)

  • 권승직;안태영;손재학
    • 생명과학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.232-238
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    • 2012
  • 금정산성 막걸리$^{(R)}$는 전통적인 수제누룩과 쌀로부터 발효된 한국의 전통적인 술이다. 본 연구에서는 막걸리 발효기간 동안 세균과 진균의 다양성을 특성화하기 위해 16S와 28S rRNA 유전자를 목적으로 하는 PCRDenaturing Gradient Gel Electrophoresis (PCR-DGGE) 분석을 수행하였다. 막걸리 발효기간 동안 PCR-DGGE profile에서 검출된 세균은 16S rRNA 유전자 서열에 기초한 동정결과 Lactobacillus spp. (L. curvatus, L. kisonensis, L. plantarum, L. sakei 및 L. gasseri), Pediococcus spp. (P. acidilactici, P. parvulus, P. agglomerans및 P. pentosaceus), Pantoea spp. (P. agglomerans 및 P. ananatis) 그리고 Citrobacter freundii로 총 12종이었으며, 배양2일 이후 L. curvatus가 주된 우점 종을 형성하였다. 반면 PCR-DGGE profile에서 검출된 진균은 28S rRNA 유전자 서열에 기초한 동정결과 Pichia kudriavzevii, Saccharomyces cerevisiae, Asidia idahoensis, Kluyveromyces marxianus, Saccharomycopsis fibuligera 및 Torulaspora delbrueckii로 6종이었으며 주된 우점 진균은 배양0일에서 2일에 P. kudriavzevii에서 배양 3일에서 6일에 S. cerevisiae로 전환되었다. 결과적으로 PCR-DGGE분석은 막걸리발효기간 동안 미생물의 구조와 다양성을 이해하는 데 유용한 도구임을 보여주었다.

신생아 집중 치료실에 입원한 신생아에서 장내 세균에 의한 장관 집락화와 관련된 위험 인자 (Risk Factors Associated with Gastrointestinal Tract Colonization by Enterobacteriaceae in Neonatal Intensive Care Unit Patients)

  • 김민지;정유진;홍유라;배일권
    • Neonatal Medicine
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    • 제18권2호
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    • pp.272-279
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    • 2011
  • 목적: 최근 신생아 집중 치료실(neonatal intensive care unit, NICU)에 입원한 신생아들의 병원내 감염 중 그람 음성 간균(Gram negative bacilli, GNB)에 의한 패혈증이 증가하고 있다. NICU에서 정기적인 대변의 감시 배양을 통해 GNB에 의한 장관 집락화가 같은 균에 의한 패혈증으로 이행되는 지를 확인하고, 집락화된 GNB 병원균의 종류를 확인하며 집락화에 관여하는 위험인자를 조사하고자 하였다. 방법: 2007년 10월부터 2008년 5월까지 고신대학교 복음병원 신생아 집중치료실에 입원한 86명의 환아를 대상으로 하였다. 모든 환아에게 총 3회의 대변 채집을 계획하였는데, 출생 후 첫 대변과 2주 간격으로 2회 채집을 계획하였다. 장관의 GNB 집락화와 관련된 위험 인자들은 대상 환아들의 의무기록을 열람하거나 연관된 논문의 고찰을 통해 설정하였다. 결과: 86명의 환아 중 22명(25.6%)이 GNB에 의한 장관 집락화가 있었으나 이 환아들을 퇴원까지 추적하였을 때 GNB로 인한 패혈증은 없었다. Pseudomonas aeruginosa, Enterobcter cloacae, Citrobacter freundii가 가장 많이 분리되었다. 분리된 GNB 중 약 89% (32/36)는 amikacin에 감수성이 있었다. GNB 에 의한 장관 집락화의 가능성은 집락화 당시 수유량이 적을 때 증가한 반면, 첫 수유 시기가 지연될 때 그 가능성은 감소하였다. 결론: 저자들은 NICU에 입원한 신생아에서 장관 감시배양을 통해 장관에 집락화된 GNB를 확인하였으나 연구에 포함된 환아에서 GNB에 의한 패혈증이 발생하지 않았으므로 집락화가 패혈증으로 이행되는 지를 확인할 수는 없었다. 집락화시 적은 수유량(feeding volume at colonization day)이 집락화의 위험요인이었으므로 장관 영양의 진행이 원활하지 않을 경우 장관의 GNB 집락화 가능성을 고려해야 한다.

부산시내 약수터의 세균학적 수질 (Bacteriological quality of ground water in Pusan area)

  • 김용관
    • 한국수산과학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.31-36
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    • 1983
  • 부산시내에 산재하고 있는 70여개소의 약수터중 11개소를 선정하여 이들의 수질관리에 필요한 기초자료를 얻고자 1981년 10월부터 1982년 9월까지 132개 시료를 취하여 대장균군, 분편계대장균, 일반생균수 및 대장균군의 조성을 시험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 11개소의 대장균군 최확수의 중앙치는 구포가 93/100ml로 제일 높았고, 수영, 연산동, 성지곡이 68/100ml 우동과 대신동이 59/100ml, 전포동, 망미동은 43/100ml 영도, 동래가 33/100ml그리고 감만동이 13.3/100ml로 제일 낮았으며 이들 중 6개소가 50/100ml 이상이었다. 2. 분편계대장균 최확수의 중앙치는 영도가 12.1/100ml으로 제일 불결하였고, 수영을 비롯한 8개소는 9.1/100ml, 우동은 6.4/100ml이었으며 감만동이 제일 깨끗하였다. 3. IMViC 반응에 의한 대장균군의 조성은 Escherichia coli group이 $7.64\%$, Klebsiella aerogenes group이 $16.78\%$, Citrobacter freundii group이 $42.86\%$, 기타가 $32.72\%$로 나타났었다. 4. 일반생균수의 중앙치는 $48{\sim}4.4{\times10}^2/ml$의 넓은 분포로서 보사부(1963)의 수질기준에 절반 지역이 초과되었다.

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식물역병균 Phytophthora spp.에 특이 길항균인 YNB54 균주의 분류 (Taxonomy of a Soil Bacteria YNB54 Strain Which Shows Specific Antagonistic Activities against Plant Pathogenic Phytophthora spp.)

  • 김삼선;권순우;이선영;김수진;구본성;원항연;김병용;여윤수;임융호;윤상홍
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.101-108
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    • 2006
  • Phytophthora sp.의 균사성장을 특이적으로 저해하는 토양 미생물인 YNB54 균주의 정확한 분류적 위치를 밝히기 위해 Biolog GN2, API 20E와 같은 상업적 생화학 kit, 16S rDNA, DAN-DNA hybridization, GC함량, MIDI 등의 분석을 수행하였다. 다양한 생화학적 kit를 사용한 동정 결과는 이 균주가 다른 어떤 종보다 Enterobacter cloacae와 E. cancerogenus에 보다 더 가까움을 보여주었다. 또한 DAN-DNA hybridization, GC함량, MIDI 분석의 결과들 역시 다른 속 (Citerobacter, Klebsiella, Leclercia)보다 Enterobacter 속에 더 유사함을 암시해 주었다. 그러나 16S rDNA분석에서 이 균주는 Citrobacter freundii(99.4%)와 동일 그룹으로 구분되었지만 Enterobacter, Leclecia, Klebsiella 속 등과도 98%이상의 상동성을 보여주는 polyphyletic 특성을 보였다. 결론적으로 YNB54의 분류 동정을 위한 우리의 조사들은 이 균주가 유전적으로 다양하고 지금까지 아는 것보다 분류학적으로 더 복잡함을 암시해줌에도 불구하고 Enterobacter속임이 가장 유력하다는 것을 보여 주었다.

상수도계통에서의 세균 분포 및 변화 (Bacterial Distribution and Variation in Water Supply Systems)

  • 박성주;조재창;김상종
    • 미생물학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.245-254
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    • 1993
  • 1991년 9월부터 1992년 9월까지 23회에 걸쳐 서울시 구의정수장의 상수도계통 즉 원수와 정수 및 이곳에서 공급되는 단일 배급수계통의 3개 수돗물에서 종속영양세균(heterotrophic plate count : HPC) 과 장내세균(Enterobacteriaceae : total coliforms) 의 분포를 조사하였다. $R_{2}A$ 한천배지에서의 종속영양세균수는 원수 $1.22{\times}10^{3}~3.05{\times}10^{5}$ 정수 $1.50{\times}10^{1}~4.29{\times}10^{3}$, 수돗물 $2~5.41{\times}10^{3}$ cfu/100ml, 수돗물 0-47.5 cfu/100 ml 의 범위였으며, m-T7 한천배지에서의 손상된장내세균을 포함하는 장내세균수는 전수 0-27, 수돗물 0-35 cfu/100 ml/의 범위였다. 이러한 결과로부터 정수장에서 공급된 물이 배급수관을 통하여 공급되면서 종속영양세균 및 장내세균의 개체수가 증가하는 세균재생장 현상이 발생한다는 것을 확인하였다. 종속영양세균의 동정결과 원수, 정수, 수돗물을 포함하는 상수도계통의 물에서는 Peudomonas 와 Acinetobacter 가 우점하였으나, 원수에서는 Pseudomonas 의 비율이, 그리고 정수와 수돗물에서는 Acinetobacter 의 비율이 상대적으로 높은 것으로 나타났다. 장내세균은 Enterobacter agglomerans 가 우점종이었으며, 수돗물에서는 정수에서 검출되지 않았던 Citrobacter freundii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Shigella dysenteriae 등의 기회성 및 병원성 장내세균도 검출되었다.

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식수에서 분리한 대장균군의 생화학적 성상에 의한 균종별 분포 (Biochemical Classification of Coliforms Isolated from Drinking Water)

  • 함희진;안미진;박석기
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.227-232
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    • 1999
  • 세균오염지표인 대장균군의 균종별 분포를 조사함으로써 세균학적 의미를 조사하고자 본 실험을 실시하였다. 1997년 6-7월에 서울시 보건환경 연구원에 의뢰된 옹달샘 시료와 지하수 시료를 실험에 사용하였고, 옹달샘 유래 대장균군 112주와 지하수 유래 대장균군 24주를 IMViC test와 API 20E kit(BioMeriux)를 사용하여 균 분리 동정한 후 합계 136균주를 대상으로 실험하였다. 대장균군을 분리 동정한 결과 23균종이 분리되었으며, 균종별로는 Esherichia 속균 39주(28.6%), Klebsiella 속균 32주(23.5%), Enterobacter 속균 30주(22.1%), Serratia 속균 19주(14.0%), Citrobacter 속균 6주(4.4%), Kluyvera 속균 4주*3.0%) 그리고 기타 6주 (4.4%)로 나타났다. 분리 균주들의 EMB agar상의 집락 색상은 녹색 금속 광택 50.7%, 분홍색 44.2%, 자주색 5.1%로 나타났고, 형태는 smooth colony 64.7%, mucoid colony 34.6%, rough colony 0.7%로 각각 나타났다. 생화학적 시험결과 lactose broth 에서는 가스를 생성하였으나 KIA에서는 gas를 생성치 않은 균종이 Ent. intermedium, Ser. liquefaciencs, Ser. marcescenes 그리고 Sal. arizoae이었고, H2S를 생성한 대장균군으로는 Kleb. pneumoniae, Kleb. oxytoca, Kleb. ornithinolytica, Ent. sakasakii, Ent. cloacae, Ser. Liquefaciens, Ser. ficaria, Cit. freundii 그리고 Sal. arizoae이었다. 이상의 결과 대장균군 정성시험 양성을 나타내는 대장균군은 대부분이 E. coli, Klebsilla 속균 그리고 Enterobacter 속균이었다. 또한 향후 대장균군 정성시험 시 EMB agar 상에서 녹색 금석성 광택 집락 외에도 분홍색 집락이 주의시되어지며, rough colony는 대장균군 분리에서 제외되는 것이 좋을 것으로 사료된다. 한편, 생화학적 성상 검토 결과 새로운 형태의 대장균군 출현 가능성이 있을 것으로 전망된다.

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고등소채류에 대한 세균학적 연구 (BACTERIOLOGICAL STUDY ON CULTURED VEGETABLES)

  • 장동석;김영만;김용관
    • 한국수산과학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.261-266
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    • 1979
  • 부산 근교에서 생산되는 고등 소채류에 대한 세균오염상태를 파악하고 세척, blanching등 처리방법에 따른 세균 제거율과 IMViC system에 의한 대장균군 동정시험 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 엽채류는 과채류에 비하여 분편소대장균의 오염도가 높았다. 2. 수도수로 세척했을 때 생균수 제거율에 있어서는 약 $70\%$, 엽채류에 있어서는 약 $20\%$ 있다. 3. 엽채류를 시판 서첵제로 세척했을 때 생균수 제거율을 약 $80\%$ 수도수로 세척했을때보다 $3\~4$배의 세척 효과가 없었다. 4. 2배의 끊는물에서 1분간 blanching했을 때 생균수 잔재율은 $0.1\%$ 이하있다. 5. 대장균군의 조성은 Eschrichia colr group $18\%$ Citrobacter freundii group $22\%$, Klebsiella aerogenes group $60\%$였으며 이중 Escherichia coli type I 이 $16\%$를 차지하였다. 6. 대장균군 확정시험 배지인 BGLB의 신선성은 약 $80\%$ 였다.

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Triclosan Resistant Bacteria from Sewage Water: Culture Based Diversity Assessments and Co-Resistance Profiling to Other Antibiotics

  • Salman, Muhmmad;Ul Bashar, Noor;Kiran, Uzma;Shafiq, Zuhra;Khan, Fareesa;Khan, Raees;Hussain, Farrukh;Bangash, Sudhair Abbas;Ahmad, Yasin;Ahmad, Shabir
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.89-94
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    • 2022
  • Triclosan (TCS) is an antimicrobial agent used in various human personal care products against both gram-positive and gram-negative bacteria. The purpose of this study was to evaluate the presence of TCS-resistant bacteria in sewage water in Peshawar, Khyber Pakhtunkhwa (KPK), Pakistan, for the first time. TCS-supplemented Luria Bertani (LB) agar was used to isolate TCS-tolerant bacteria. A total of 17 TCS-resistant isolates were randomly selected from a large pool of bacteria that showed growth on TCS-supplemented LB agar. Based on gram staining and physiochemical characteristics, the isolated strains were identified as Salmonella typhi (n = 6), Escherichia coli (n = 4), Citrobacter freundii (n = 4), Proteus mirabilis (n = 1), Enterobacter cloacae (n = 1), and Pseudomonas aeruginosa (n = 1). The Triclosan mean minimum inhibitory concentrations (MICs) for the isolates of Salmonella typhi, Escherichia coli, Citrobacter freundii, Proteus mirabilis, Enterobacter cloacae, and Pseudomonas aeruginosa were 23.66 ㎍ ml-1, 18.75 ㎍ ml-1, 42 ㎍ ml-1, 32 ㎍ ml-1, 64 ㎍ ml-1, and 128 ㎍ ml-1, respectively. The antibiogram revealed that all isolates were resistant to penicillin G (100%) and linezolid (100%), followed by ampicillin (94%), tetracycline (76%), tazobactam (76%), sulbactam/cefoperazone (64%), polymyxin PB (58%), amikacin (29.41%), aztreonam (29.41%), imipenem (5%), and gentamicin (5%). This is the first known study regarding the isolation of TCS-tolerant bacteria from sewage water in Peshawar, KPK, Pakistan. It was concluded that all the TCS-resistant isolates were multidrug resistant (MDR) gram-negative rod-shaped bacteria, mostly belonging to the Enterobacteriaceae family.

생물막형성 장내세균의 Curli 및 Cellulose 세포외 바탕질 분석 (Biofilm Forming Ability and Production of Curli and Cellulose in Clinical Isolates of Enterobacteriaceae)

  • 최예환;이희우;김성민;이제철;이유철;설성용;조동택;김정민
    • 미생물학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.335-341
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    • 2011
  • 본 연구에서는 병원 감염의 주요 원인균으로 생물막 관련 감염증에서 흔히 분리되고 있는 Citrobacter, Enterobacter 및 Serratia 등의 임상분리 장내세균 22주를 대상으로 생물막 형성능을 조사하고, 생물막의 세포외 바탕질의 구성 성분을 알아보기 위하여 Congo-red 한천배지상의 집락 형상과 calcofluor 염색을 시행하였다. 또한 curli 생성 오페론인 csgBA(C) 유전자의 유무 확인과 csgA 유전자의 염기서열을 규명하였다. $37^{\circ}C$에서 24시간 배양 후 생물막 형성능 분석에서는 2주의 S. marcescens를 제외한 나머지 20주는 모두 생물막 형성능이 있는 것으로, $28^{\circ}C$에서 48시간 배양 후 분석에서는 22주 모두 생물막 형성능이 있는 것으로 확인되었다. Congo-red 한천배지에서의 균집락 형상을 조사한 결과 균속에 따라서 균 집락의 표현형상이 다르게 나타났으며, 동일 균속내에서도 균 집락의 표현형상과 색 농도의 차이가 관찰되어 세포외 바탕질의 주요 성분 및 생성량의 차이가 있음을 시사하였다. 1주의 C. freundii와 4주의 E. cloacae에서 csgBA(C) 유전자 양성을 나타내었다. 염기서열 분석결과, E. cloacae의 csgA는 E. coli의 csgA와 80.9%, E. sakazakii의 csgA와 75.7%, 그리고 C. freundii의 csgA와 67.8%의 상동성이 있는 것으로 나타났다. E. cloacae의 경우 Congo-red 염색의 결과와 curli 유전자 검색 결과가 일치하였을 뿐만 아니라, csgA 유전자를 보유하지 않은 균주의 생물막 형성능이 csgA 유전자를 보유한 균주에 비해 현저하게 낮은 것으로 나타나, curli가 E. cloacae의 생물막 세포외 바탕질 구성성분의 주요 요소일 것으로 추정되었다.