• 생명과학회지
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• 제20권5호
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• pp.789-793
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• 2010

복잡한 진핵생물에서의 물리적 지도 작성이나 기능해석에 효모인공염색체(YAC)를 이용하기 위해서는 원하는 target region의 인공염색체화 및 single-copy인 YAC의 복제수를 늘이는 것이 요구된다. 본 연구에서는 YAC manipulation system에 복제수 증폭시스템(copy number amplification system)을 도입한 Simultaneous YAC Manipulation-Amplification (SYMA) system을 구축하였다. 식물염색체를 가진 YAC clone의 splitting과 증폭을 위해 conditional centromere와 thymidine kinase (TK) 유전자를 가진 pBGTK plasmid를 구축하였고, splitting fragment의 PCR을 위한 주형으로 사용하였다. 590 kb의 YAC clone은 splitting과 동시에 copy number amplification element를 가진 100 kb YAC와 490 kb YAC로 분리되었고, 100 kb YAC는 유도기질로 3 mg/ml sulfanilamide와 $50\;{\mu}g/ml$ methotrexate (S3/M50)의 첨가에 의해 14.4배로 그 복제수가 증가하였음을 확인할 수 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제50권3호
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• pp.436-440
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• 2022

본 연구에서는 염색체가공기술을 이용하여 xylan으로부터 다양한 대사산물을 생산할 수 있는 유전자를 도입한 효모인 공염색체를 구축하였다. 효율적인 염색체가공기술인 PCS법을 이용하기 위해 염색체 splitting에 필요한 splitting fragment (DNA module)를 각각 제작하였고, xylan 대사에 관여하는 유전자군을 가진 YKY164 균주에 형질전환하였다. 두번의 염색체 splitting에 의해 1,124 kb의 효모 7번염색체는 887 kb-YAC, 45 kb-mini YAC와 198 kb-YAC로 가공되었으며, 총 18개의 염색체를 가진 YKY183 균주를 구축하였다. 염색체가공을 위한 splitting efficiency는 50-78%였으며, 45 kb-mini YAC 상에 있는 외래유전자의 발현 및 효소활성은 염색체가공 전과 비교하여 유의미한 변화 및 저하는 관찰되지 않았다. 또한 생산된 재조합효소에 의한 xylan의 분해산물을 확인하였으며, 160 generation 동안 미니 효모인 공염색체는 염색체의 결실없이 안정적인 mitotic stability를 유지하였다.

• Journal of Photoscience
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• 제12권2호
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• pp.75-82
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• 2005

Rumex acetosa L. is a dioecious flowering plant with well developed sex chromosome system: 2n = 12 + XX in the female plants and 2n = 12 + XY1Y2 in the male plants. To isolate sex-linked DNA, we carried out chromosome micromanipulation, followed by DOP-PCR, AFLP of the PCR products, reverse Southern hybridization and sequence analysis. From 500 AFLP specific clones, 13 X-chromosome and 5 Y-chromosome specific clones were obtained. Except one clone RADAX-239 ($\underline{R}umex\;\underline{a}-\underline{D}OP-PCR-\underline{A}FLP-\underline{Y}-chromosome\;specific$), all clones appear to be R. acetosa plant-specific sequences and non-coding sequences. Southern blot analysis using these clones could not discriminate genomic DNAs either from male or female plants. Results of this study imply that both autosome-origin and degeneration of sex chromosomes are prevalent in plant systems.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
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• 한국어업기술학회 2001년도 추계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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• pp.25-25
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• 2001

Generation of transgenic fish acquiring the ability to express desirable phenotypes offers new possibilities for addressing fundamental biological questions, and can also attribute to enhanced aquaculture productivity. I describe here the recent research progress in my laboratory with particular emphasis on the development of fast-growing autotransgenic fish and its chromosome-set manipulation using our experimental organism, the mud loach, Misgurnus mizolepis. (omitted)

• 생명과학회지
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• 제26권6호
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• pp.646-650
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• 2016

본 연구는 염색체 가공기술(chromosome manipulation technique)을 이용하여 다양한 개수의 염색체를 가진 균주들의 세포 성장속도 및 life span을 비교하여 염색체 수의 증가가 세포 생리에 미치는 영향을 조사하였다. 16개의 염색체를 가지는 숙주세포 FY833 균주와 18개의 염색체를 가지는 YKY18 및 YKY18R 균주, 24개의 염색체를 가지는 YKY24 균주와 30개의 염색체를 가지는 YKY30 균주를 사용하여 specific growth rate를 비교해 본 결과, YKY18 균주와 YKY24 균주는 세포성장의 변화가 거의 없었으나, YKY18R 균주와 YKY30 균주에서는 숙주세포에 비해 각각 25%와 40% 이상 성장이 감소됨을 확인 할 수 있었다. 또한 염색체 수와 노화의 관계를 알아보기 위해 replicative life span을 조사해 본 결과, YKY24균주와 YKY30 균주에서 숙주세포에 비해 약 14%와 45% 정도로 life span이 감소했음을 알 수 있었다. 노화인자로 알려져 있는 telomere의 길이도 인공염색체의 수가 증가될수록 점점 다양해지고 길이가 짧아짐을 확인 할 수 있었다. 따라서 염색체 수의 증가도 새로운 노화원인이 될 수 있다는 가능성을 제시하였고, 본 연구 결과가 다양한 인공염색체를 가진 산업용 균주의 안정적인 개량을 위한 기초 자료로 활용될 수 있을 것이라 기대한다.

• 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
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• 제어로봇시스템학회 2003년도 ICCAS
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• pp.2435-2440
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• 2003

Manipulation of the nano/micro scale object has been a key technology in biology as the sizes of DNA, chromosome, nucleus, cell and embryo are within such order. For instance, for embryo cell manipulation, the cell injection is performed manually. The operator often spends over a year to carry out a cell manipulation project. Since the typical success rate of such operation is extremely low, automation of such biological cell manipulation has been asked. As the operator spends most of his time in finding the position of cell in the Petri dish and in injecting bio-material to the cell from the best orientation. In this paper, we propose a new strategy and a vision system, by which one can find, recognize and track nucleus, polar body, and zona pellucida of the embryo cell for automatic biomanipulation. The deformable template matching algorithm has been used in recognizing the nucleus and polar body of each cell. Result suggests that it outperforms the conventional methods.

• 한국어류학회지
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• 제13권1호
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• pp.85-88
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• 2001

메기 Silurus asotus에서 염색체조작을 효과적으로 하기 위하여, 여러 온도 조건에서의 난할율과 제2, 제3 난할 시간의 평균화에 의한 체세포분열 간격지수 (${\tau}_o$)를 조사하였다. 빠른 난 발생과 비동시적 발생은 고온에서 더욱 뚜렷하게 나타났다. 메기의 체세포분열 간격지수는 $22^{\circ}C$에서 $21.5{\pm}1.4$분, $24^{\circ}C$에서 $18.5{\pm}1.2$분 그리고 $26^{\circ}C$에서 $14.0{\pm}2.1$분이었다. 3가지 수온조건과 ${\tau}_o$ 간에는 Y=-1.85X+21.9 ($R^2=0.9868$, Y는 ${\tau}_o$ 그리고 X는 수온)의 직선회귀가 성립되었다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제16권4호
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• pp.321-327
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• 2012

Korean bullhead (Pseudobagrus fulvidraco) was collected from the Kum River areas of Kangkyung-eup, Nonsan city, Chungcheongnam-do, Korea, from April to June, 2012 and was fertilized in order to observe egg development and temperature-related cleavage rates and mitotic intervals (${\tau}_0$). The fertilized eggs were separative, demersal and light yellowish with $1.5{\pm}0.06mm$ in diameter, and did not contain oil globules. The first cleavage stages were 90 min, 80 min, 60 min and 50 min at $21^{\circ}C$, $24^{\circ}C$, $27^{\circ}C$ and $30^{\circ}C$, respectively. At higher temperatures, eggs developed faster and underwent further identical development. For Korean bullhead, ${\tau}_0$ were $33.4{\pm}2.08$ min at $21^{\circ}C$, $31.5{\pm}3.06$ min at $24^{\circ}C$, $28.1{\pm}2.11$ min at $27^{\circ}C$ and $26.4{\pm}3.35$ min at $30^{\circ}C$. There were strong negative correlations between the $\tau_0$ and water temperatures at all points studied (Y=-1.13X+58.15, $R^2$=0.98, n=30, where Y is ${\tau}_0$ and X is temperature). The results obtained in this work will be helpful for chromosome manipulation by use of cleavage frequency data and ${\tau}_0$ data in Korean bullhead.

• 미생물학회지
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• 제35권1호
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• pp.28-34
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• 1999

본 연구에서는 Yeast Artificial Chromosome을 효율적으로 조작하고 유유전자의 기능을 보다 더 용이하게 분석하기 위해 EMCV 바이러스의 IRES 염기서열과 $\beta$-galactosidase를 포함하는 새로운 bicistronic fragmentation vector를 제조하였다. 이 벡터의 폴리클로닝 site에 네 개의희귀한 제한효소 부위를 도입하여 DNA를 용이하게 클로닝할 수 있게 만들었다. 그러므로 원하는 어떤 YAC도 효모세포에서 쉽게 상동 재조함에 의해 절편할 수 있는 장점이 있다. 이 bicistronic fragmentation vector 시스템을 이용하면하나의 메시지로부터 연구하고자 하는 유전자와 $\beta$-galactosidase를 동시에 한 세포에서 발현할 수 있기 때문에 유전자의 발현양상을 쉽게 분석할 수 있는 새로운 도구로 이용할 수 있다.

• 한국가금학회지
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• 제16권1호
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• pp.1-8
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• 1989

유전물질의 총합체인 염색체의 분리와 분석을 정확히 하여 유전인자의 위치를 밝히고 또한 유전자조작 기술을 이용할 수 있는 방법을 구명하여 닭의 능력개양을 꾀하기 위해서 실시된 본 연구의 결과를 요약하면 아래와 같다. 1. 백혈구 배양을 통하며 염색체를 분리하고 Giemsa banding을 통한 염색체 분석에서 1번 염색체의 경우 20층에 달하는 banding pattern을 발견할 수 있는 정확한 분석으로 1∼9번, 성염색체의 정상 banding pattern을 밝힐 수 있었고 C-banding의 결과 모든 염색체에서 유전자 작용이 없는 constitutive heterochromatin의 위치를 밝힐 수 있었다. 2. 유전자 조작 기술 중 중요한 단계인 genetic vector로서 닭의 원시생식세포(Primodial germ cell, PGC)를 이용하기 위하여 genetic marker로서 3배체의 염색체를 가친 PGC를 정상 host embryo에 이식시켜서 성장중인 host embryo의 성선에서 donor PGC의 genetic marker(3n)가 발견됨으로써 PGC를 이용한 가금의 유전자 조작이 가능함을 밝혔다.