인간 췌장 유래 pro-carboxypeptidase B(CPB) 유전자를 클로닝한 후 GAL10 promoter 하류에 Saccharomyces cerevisiae mating factor alpha-1 secretion signal $(MF{\alpha}-1)$과 연결하여 $MF{\alpha}1$-pro-CPB를 구축하였다. 구축된 plasmid $pY{\alpha}$-hproCPB(7.72 kb)를 S. cerevisiae 2805에 형질 전환시켰다. 재조합 인간 proCPB(hproCPB)는 galactose 유도로 S. cerevisiae에서 성공적으로 발현되었고, 배양상등액으로 분비되었다. SDS-PAGE와 western blot 분석에 의해, 정제된 hproCPB 단백질이 약 45.9kDa임을 확인하였다 S. cerevisiae $2805/pY{\alpha}$-hproCPB의 발효조 회분배양 시 trypsin 처리에 의해 pro영역을 제거한 후 hCPB의 세포외 활성은 60시간째에 10.16 unit/mL이었다. 또한 재조합 hCPB의 Km 값은 약 0.43 mM 이었다.
상온에서 카르복시펩티다제 A에 의한 에스테르 기질의 가수분해 반응을 여러가지 외부 시약의 존재하에 행하였다. 산무수물 형태의 아실-효소중간체가 외부시약에 의해 공격받는다면 아실 부분에 포획된 생성물이나 효소부분에 포획된 생성물이 형성될 것이다. 반응생성물의 분광도와 효소활성도의 변화를 조사한 결과 포획반응의 생성물은 검출되지 않았다. 또한, O-(o-hydroxyphenylacetyl)-L-${\beta}$-phenyllactate가수분해에 대한 효소 반응속도변수를 측정하였다. 이 기질의 o-히드록시기가 분자내 포획기로서 작용하여 산무수물형태의 아실-효소중간체를 공격하여 20coumaranone이 형성되었나를 조사하였으나 분자내 포획반응이 일어났다는 증거는 얻지 못하였다. 이러한 중간체 포획반응의 실패는 포획용 시약이 아실-효소 중간체의 무수산기에 접근할때 입체적 방해를 받거나 중간체의 가수분해 단계도 효소에 의해 촉매되기 때문이라고 생각된다.
Zn의 생화학적 역할을 연구하기 위하여, 간단한 모델시스템을 설정하였다. 즉, Zn가 리간드인 $OH_2나 NH_3$와 배위결합을 이루거나 carboxypeptidase A (CPA)의 기질에 해당하는 펩티드의 O=C-와 배위결합을 할 때, 그 기하학적 구조 및 net atomic charge의 변화를 조사하였다. Double Zeta basis set를 사용한 ab initio HF-SCF 계산에 의하면, Zn는 이들 리간드의 O-H, N-H, O=C-를 매우 polar하게 만든다. 특히, 펩티드의 탄소는 친전자성이 매우 증가하여, nucleophile의 공격을 용이하게 받을 수 있을 것으로 예측되었다. 또한, CPA에서 Zn 주위에 있는 리간드의 분자배위 상태를 조사하기 위하여, CPA+glycyltyrosine complex에 관한 molecular mechanics방법을 적용하였다. 이 결과를 X-ray 결과와 비교하였을 때, Zn는 4배위 결합 이외에 물분자도 관여할 것으로 예측된다.
다양한 금속이온의 첨가에 따른 CPase Taq의 효소활성의 개선에 관한 연구를 행하였다. 1 mA의 코발트이온의 첨가에 의해 효소활성이 4배 이상 증가했고, 1 mA의 칼슘이온의 첨가에 의해서는 효소활성이 거의 3배 정도로 증가했다. 하지만 활성중심에 존재하는 아연이온은 효소활성에 영향을 주지 않았다. 활성중심의 금속 이온이 효소활성에 영향을 주는지를 알아보기 위해 활성중심을 차지하고 있는 아연이온을 본 효소를 효과적으로 활성화시키는 코발트이온으로 치환하였다. 그 결과, 코발트이온으로의 치환이 CPase Taq의 효소활성에 영향을 주지 않으므로, 코발트이온은 본 효소의 활성중심의 금속이온인 아연이온을 대신하여 CPase Taq가 효소활성을 가지는데 있어서 동일한 역할을 할 수 있는 금속이온이라 사료된다.
Choi, Jeong-Hwa;Yates, Zoe;Martin, Charlotte;Boyd, Lyndell;Ng, Xiaowei;Skinner, Virginia;Wai, Ron;Kim, Jeongseon;Woo, Hae Dong;Veysey, Martin;Lucock, Mark
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제16권10호
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pp.4383-4386
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2015
Background: The C1561T variant of the glutamate carboxypeptidase II (GCPII) gene is critical for natural methylfolylpolyglutamte (methylfolate) absorption, and has been associated with perturbations in folate metabolism and disease susceptibility. However, little is known on C1561T-GCPII as a risk factor for colorectal cancer. Therefore, this study examined whether C1561T-GCPII influences folate metabolism and adenomatous polyp occurrence. Materials and Methods: 164 controls and 38 adenomatous polyp cases were analysed to determine blood folate and plasma homocysteine (Hcy) level, dietary intake of natural methylfolate, synthetic pteroylglutamic acid (PteGlu), vitamin C and C1561T-GCPII genotype. Results: In controls and cases, 7.3 and 18.4 percent of subjects respectively, were found to have the CT genotype, increasing the risk for adenomatous polyp occurrence 2.86 times (95% CI:1.37-8.0, p=0.035). Total dietary folate, methylfolate and PteGlu intake and the level of erythrocyte folate and plasma Hcy did not predict the occurrence of an adenomatous polyp. However, dietary natural vitamin C intake was associated with adenomatous polyp risk within C1561T-GCPII CT genotype subjects (p=0.037). Conclusions: The findings suggest that C1561T-GCPII variation may be associated with risk for adenomatous polyp, and vitamin C may modify risk by interacting with the variant gene, its expression product and/or folate substrates.
B. subtilis cx1이 생산하는 박테리오신(BSCX1)을 부분 정제하고 특성을 규명하였다. BSCX1은 pH 안정성 실험에서 pH 2.5~9.5 구간에서도 안정되게 항균활성을 유지하였다. 각종 효소에 대한 안정성 실험에서는 protease, trypsin, proteinase K, 그리고 carboxypeptidase로 처리하였을 때는 완전히 항균활성이 사라졌고, $\alpha$-amylase, lipase, aminopeptidase는 항균활성에 영향을 미치지 못하였다. 이상의 결과로 본 항균물질이 단백질계열의 물질이며 당이나 지질 결합은 항균활성에 큰 영향을 미치지 않는 것으로 추정되었다. 그러나 열에는 불안정하여 $60^{\circ}C$이상에서는 15분 안에 완전히 그 항균활성을 상실하였으며 $50^{\circ}C$ 에서는 15분만에 역가의 50%가 실활 되었다. 이에 반하여 저온에서는 무척 안정하여 $-20^{\circ}C$와 $-70^{\circ}C$에서 수개월간 보관하여도 여전히 항균활성을 그대로 유지하였다. Tricin-SDS-PAGE를 통하여 BSCX1의 분자량은 약 9,500 dalton으로 확인되었ekl. BSCX1은 pH2.5에서 9.5에 이르는 넓은 pH 영역에서 그 활성을 유지하므로, 기존에 개발된 nisin이나 유산균 유래의 항균물질이 pH 안정성이 떨어진다는 단점을 보완할 수 있는 생물학적 식품보존제로서의 개발 가능성을 높이 시사하였다.
Leaves are the major biomass-producing organs in herbaceous plants and mainly develop during vegetative stage by activities of shoot apical meristem. There is a strong correlation between leaf number and bolting, a characteristic phenotype during the transition to reproductive phase in Arabidopsis thaliana. In order to study interactions between leaf number and bolting, we isolated a Landsberg erecta-derived mutant named multifolial (mfo1) that produces increased number of leaves and bolts at the same time as the wild type. Through positional cloning and allelism test, mfo1 was found to be an allele of a previously reported mutant, altered meristem program1-1 (amp1-1) that is defective in a glutamate carboxypeptidase and bolts earlier than its wild type, Columbia ecotype, with the increased number of leaves. The bolting time differences between mfo1 and amp1, despite the same phenotype of many leaves, suggest the existence of genetic factor(s) differently function in each ecotype in the presence of mfo1/amp1 mutation.
Over half of all biologically active peptide and peptide hormones are $\alpha$-amidated at their C-terminus, which is essential for their full biological activities. Amidation is accomplished through the sequential reaction of the two enzymes encoded by the single bifunctional, peptidyl-glycine $\alpha$-amidating monooxygenase (PAM or an $\alpha$-amidating enzyme). PAM catalyze the forma - tion of a peptide amide from peptide precursors that include a C-terminal glycine, and requires copper molecular oxygen and ascorbate. PAM is the only enzyme that produces peptide amides in vivo. However various strategies utilizing PAM, carboxypeptidase-Y enzymes, and chemical syn-thesis have been developed for producing peptide amides in vitro. The growing need and impor-tance of peptide amide drugs has highlighted the necessity for a efficient in vitro amidating sys-tem for industrial application for the production of peptide hormones, like calcitonin and oxytocin. This review presents the current situation regarding amidation with a special emphasis on the in-dustrial production or peptide hormones.
The aspartame, $\alpha$-L-aspartyl-L-phenylalanine methylester, is an artificial sweetener. Taking advantage of the fact that the aspartame is a derivative of dipeptide, synthesis of aspartame from the artificial polypeptide made by an artificial gene has been attempted. The artificial polypeptide (LAP32), a polymer of tripeptide (aspartyl-phenylalanyl-lysine), was purified from the E. coli cells harboring a recombinant plasmid containing the artificial gene. This polypeptide was then digested with trypsin and carboxypeptidase B to produce dipeptide (Asp-Phe). Using the esterase activity of $\alpha$-chymotrypsin, the dipeptide was directly converted into Asp-Phe methylester in a water-methanol system. When the methanol concentration in reaction mixture was 25%, 50% of dipeptide was converted to the dipeptide methylester without producing any by-products.
Chryseobacterium mulctrae KACC 21234T is a novel species isolated from raw bovine milk. Psychrotrophic bacteria are considered contaminants and are hypothesized to originate from the environment. In this investigation, the C. mulctrae KACC 21234T genome was determined to be 4,868,651 bp long and assembled into four contigs with a G+C ratio of 33.8%. In silico genomic analyses revealed the presence of genes encoding proteases (endopeptidase Clp, oligopeptidase b, carboxypeptidase) and lipases (phospholipase A(2), phospholipase C, acylglycerol lipase) that can catalyze the degradation of the proteins and lipids in milk, causing its quality to deteriorate. Additionally, antimicrobial resistance and putative bacteriocin genes were detected, potentially intensifying the pathogenicity of the strain. The genomic evidence presented highlights the need for improved screening protocols to minimize the potential contamination of milk by proteolytic and lipolytic psychrotrophic bacteria.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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