• 동의생리병리학회지
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• 제23권5호
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• pp.942-949
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• 2009

We in this paper propose the method for diagnosis patients through the reasoning based on the diagnosis ontology in oriental medicine. In prior studies, it is simply diagnosed with the information of main symptoms, optional symptoms, and tongue / pulse. In addition, ontology itself has subjective opinions of oriental medical doctors for patients in form of axioms. There is a problem in latter case that it is difficult for other oriental medical doctors to change knowledge within the ontology. In order to solve these problems, we have constructed the diagnosis ontology and the reasoning algorithm as followings: First, in order to raise the diagnosis accuracy, we constructed the diagnosis ontology with pattern identifications, main symptoms, optional symptoms, and tongue / pulse. We also utilize the diagnosis points described in the pathology textbook, which has been studied in all of domestic oriental medical colleges. This information is represented as OWL instances in ontology, not OWL axioms so that it can be easily updated. Second, we suggest the algorithms for diagnosis reasoning and learning method based on the ontology. We have implemented the reasoning and learning system according to the diagnosis algorithm. In future study, we will construct the diagnosis ontology with all of pattern identifications and symptoms within the pathology textbook.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제16권1호
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• pp.175-182
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• 2011

본 연구에서는 환자의 중증도 분류 및 인체 주요 장기의 상태 예측을 위하여 APACHE II(Acute Physiology And Chronic Health Evaluation) 기반 CDSS 도구인 CAOPI(Computer Aided Organ Prediction Index) 시스템을 제안한다. 기존 ICU 환자의 중증도 평가방법은 APACHE II를 이용하여 특정 시점의 중환자 위험도를 특정한 시점 데이터를 이용하여 산출하는 방식이었으나, 실시간으로 변화하는 환자의 상태에 맞춰 조치를 취하는데는 한계가 있다. CAOPI 시스템은 중환자실에 입실하는 환자들의 질병 중증도를 정확히 분류하고, 환자의 사망예측 뿐만 아니라장기 상태를 시각화 하여 위험도를 수치화 하였다. 또한 위험도를 특정 장기별로 구분하여 담당의 사가 환자의 상태에 맞는 맞춤형 응급조치를 취할 수 있도록 설계 및 개발 하였다.

• 동의생리병리학회지
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• 제29권5호
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• pp.386-393
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• 2015

Bian-zheng(辨證) of Korean Medicine(KM) is based on four examinations(四診) of Korean medical doctor. The interrogation or questioning(問診) provides the most information of four examinations. The symptom obtained from the interrogation or questioning is the main basis of the Bian-zheng. KM is understood in the whole state of the body of a specified time without seeing the disease exist. So the observable symptom is disease itself. Symptom in KM is used as an important basis for the diagnosis. But if the interview when memories are not sure of the correct answer does not get much easier to find exactly the symptoms. So when recording original symptom(素證) and daily subjective symptom can be helpful for care. In this paper, we propose daily living symptom record system as a method that can be applied to the health care according to the importance of collecting the symptom in the KM. Daily living symptom record system can record the symptom in the individual to awaken daily. The system stores the symptom in structure and provides an open shared services. So it can be used as a symptom of other systems, such as PHR, EMR, CDSS. In addition, Doctor may be able to help in the treatment determined by reference to shared symptom.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권12호
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• pp.2030-2035
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• 2016

Bacillus cereus causes food-borne illness through contaminated foods; therefore, its pathogenicity and genome sequences have been analyzed in several studies. We sequenced and analyzed B. cereus strain FORC_021 isolated from a sashimi restaurant. The genome sequence consists of 5,373,294 bp with 35.36% GC contents, 5,350 predicted CDSs, 42 rRNA genes, and 107 tRNA genes. Based on in silico DNA-DNA hybridization values, B. cereus ATCC $14579^T$ was closest to FORC_021 among the complete genome-sequenced strains. Three major enterotoxins were detected in FORC_021. Comparative genomic analysis of FORC_021 with ATCC $14579^T$ revealed that FORC_021 harbored an additional genomic region encoding virulence factors, such as putative ADP-ribosylating toxin, spore germination protein, internalin, and sortase. Furthermore, in vitro cytotoxicity testing showed that FORC_021 exhibited a high level of cytotoxicity toward INT-407 human epithelial cells. This genomic information of FORC_021 will help us to understand its pathogenesis and assist in managing food contamination.

• 한국융합학회논문지
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• 제10권11호
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• pp.117-124
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• 2019

최근 의료IT 분야 솔루션들이 분산 환경 기반으로 제공되고 있는 추세이다. 국내에서도 분산 환경에서 의료정보를 공유할 수 있는 임상의사결정지원시스템 개발의 필요성이 인식되어 연구되고 있다. 기존 임상의사결정지원시스템은 병원 내의 자체적인 의료정보만을 사용하여 구축되고 있다. 이로 인해 기존의 시스템은 의사결정지원의 효율성 및 정확성 측면에서 좋은 결과를 얻기 어렵다. 이러한 한계점을 해결하기 위해 이 논문에서는 의료분야의 공통 데이터 모델을 기반으로 하는 임상의사결정지원시스템 모델을 설계하고 구축방안을 제시한다. 제안 모델의 적용 과정을 설명하기 위해 대장암 진단을 위한 임상의사결정지원시스템의 개발 시나리오를 기술한다. 또한 성공적인 임상의사결정지원시스템 개발을 위한 필수 요구사항을 제시한다. 이를 통해 여러 병원에서 공통으로 사용이 가능하고 시스템의 효율성과 정확성을 높일 수 있는 임상의사결정지원시스템 개발이 가능할 것으로 기대한다.

• 생물정신의학
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• 제28권2호
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• pp.70-77
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• 2021

Objectives Our study aimed to present the distinctive correlates of formal thought disorder in patients with schizophrenia, using the Clinical Language Disorder Rating Scale (CLANG). Methods We compared clinical characteristics between schizophrenia patients with (n = 84) and without (n = 82) formal thought disorder. Psychometric scales including the CLANG, the Brief Psychiatric Rating Scale (BPRS), the Young Mania Rating Scale (YMRS), the Calgery Depression Scale for Schizophrenia (CDSS) and the Word Fluency Test (WFT) were used. Results After adjusting the effects of age, sex and total scores on the BPRS, YMRS and WFT, the subjects with disorganized speech presented significantly higher score on the abnormal syntax (p = 0.009), lack of semantic association (p = 0.005), discourse failure (p < 0.0001), pragmatics disorder (p = 0.001), dysarthria (p < 0.0001), and paraphasic error (p = 0.005) items than those without formal thought disorder. With defining the mentioned item scores as covariates, binary logistic regression model predicted that discourse failure (adjusted odds ratio [aOR] = 5.88, p < 0.0001) and pragmatics disorder (aOR = 2.17, p = 0.04) were distinctive correlates of formal thought disorder in patients with schizophrenia. Conclusions This study conducted Clinician Rated Dimensions of Psychosis Symptom Severity (CRDPSS) and CLANG scales on 166 hospitalized schizophrenia patients to explore the sub-items of the CLANG scale independently related to formal thought disorders in schizophrenia patients. Discourse failure and pragmatics disorder might be used as the distinctive indexes for formal thought disorder in patients with schizophrenia.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제21권12호
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• pp.13-22
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• 2021

임상의사결정시스템은 누적된 의료 데이터를 활용하여 머신러닝으로 학습된 AI 모델을 환자의 진단 및 진료 예측에 적용한다. 그러나 기존의 블랙박스 기반의 AI 응용은 시스템이 예측한 결과에 대해 타당한 이유를 제시하지 못하여 설명성이 부족한 한계점이 존재한다. 이와 같은 문제점을 보완하기 위해 이 논문에서는 임상의사결정시스템의 개발 단계에서 설명이 가능한 XAI를 적용하는 시스템 모델을 제안한다. 제안 모델은 기존의 AI모델에 설명성이 가능한 특정 XAI 기술을 추가로 적용시켜 블랙박스의 한계점을 보완할 수 있다. 제안 모델의 적용을 보이기 위해 LIME과 SHAP을 활용한 XAI 적용 사례를 제시한다. 테스트를 통해 데이터들이 모델의 예측 결과에 어떤 영향을 미치는지 다양한 관점에서 설명할 수 있다. 제안된 모델은 사용자에게 구체적인 이유를 제시함으로써 사용자의 신뢰를 높일 수 있는 장점을 가진다. 아울러 XAI의 적극적인 활용을 통해 기존 임상의사결정시스템의 한계를 극복하고 더 나은 진단 및 의사결정 지원을 가능하게 할 것으로 기대한다.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2020년도 춘계학술발표대회
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• pp.487-489
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• 2020

인공지능 기술을 도입한 의료분야에서 진단 및 예측과 연계한 임상의사결정지원 시스템(CDSS)에 관련된 연구가 활발하게 진행되고 있다. 특히, 인공지능 기술 적용에 가장 많은 이슈를 일으키고 있는 의료영상기반의 질환진단연구가 다양한 제품으로 출시되고 있는 실정이다. 그러나 의료영상 데이터는 일관되지 않은 데이터들로 이루어져 있으며, 그것을 정제하여 연구에 사용하기 위해서는 상당한 시간이 필요한 것이 현실이다. 본 논문에서는 익명화된 데이터를 정제하여 인공지능 연구에 사용할 수 있는 표준화된 데이터 셋을 만들고, 그 데이터를 기반으로 인공지능 알고리즘 개발 연구를 지원하기 위한 원스톱 인공지능학습 플랫폼에 대하여 기술한다. 이를 위해 전체 인공지능 연구프로세스를 보이고 이에 따라 학습을 위한 데이터셋 생성과 인공지능 학습학습용 플랫폼에서 수행되는 수행 과정을 결과로 보인다 제안한 플랫폼을 통해 다양한 영상기반 인공지능 연구에 활용될 것으로 기대하고 있다.

• 한국지반공학회논문집
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• 제40권3호
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• pp.65-75
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• 2024

본 연구에서는 여러 영향 인자들이 사질토의 액상화로 인한 침하에 미치는 영향을 확인하기 위해 변형률 제어조건 하에서 반복단순직접전단시험을 수행하였다. 누적 전단 변형률, 상대밀도, 반복 하중의 형태, 시료 준비 방법 등의 다양한 인자들을 선정하였으며, 지진 하중이 발생하였을 때 인자들이 지반 침하에 미치는 영향을 분석하였다. 시험 결과, 누적 전단 변형률이 낮고 상대밀도가 높은 시료에서 더 작은 부피 변형이 발생하였다. 추가적으로 반복하중의 진폭은 부피 변형에 영향을 미쳤으나, 주파수는 시료의 부피 변형에 영향을 미치지 않는다는 사실을 확인할 수 있었다. 시료 준비 방법에 따라서도 액상화에 따른 침하가 다른 양상을 보인다는 사실을 확인하였으며, 이와 같은 결과들은 향후 액상화로 인한 침하 예측을 수행할 때 기초 연구로써 의미가 있을 것으로 기대된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제66권2호
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• pp.438-441
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• 2024

The Enterococcus faecium (E. faecium) strain AK_C_05 was isolated from cheonggukjang, the Korean traditional food, collected from a local market in South Korea. In this report, we presented the complete genome sequence of E. faecium strain AK_C_05. The genome of E. faecium strain AK_C_05 genome consisted of one circular chromosome (2,691,319 bp) with a guanine + cytosine (GC) content of 38.3% and one circular plasmid (177,732 bp) with a GC content of 35.48%. The Annotation results revealed 2,827 protein-coding sequences (CDSs), 18 rRNAs, and 68 tRNA genes. It possesses genes, which encodes enzymes such as alpha-galactosidase (EC 3.2.1.22), beta-glucosidase (EC 3.2.1.21) and alpha-L-arabinofuranosidase (EC 3.2.1.55) enabling efficient utilization of carbohydrates. Based on Clusters of Orthologous Groups analysis, E. faecium strain AK_C_05 showed specialization in carbohydrate transport and metabolism indicating the ability to generate energy using a variety of carbohydrates.