A CAB cDNA clone(pKGCAB) encoding the light harvesting chlorophyll a/b binding protein of the semi-shade plant, Korean ginseng(Panax ginseng C. A. Meyer) was isolated by the one-way path random sequencing of ginseng cDNA library clones and transgenic tobacco plants(Nicotiana tabacum NC82) were produced by the transformation of this ginseng CAB gene in use of Agrobacterium tumefaciens LBA4404. The CAB gene showed type 1 structure of LHCP-II, 84% similarity in nucleotide sequence and 92% in amino acid sequence to that of Nicotiana tabacum CAB40, respectively. Seed germination and initial growth of the transgenic tobacco plants transformed with the cDNA fragment were accelerated under low light intensity compared with those of normal tobacco plant, that may result from the higher light sensitivity of the transgenic plants than that of the normal.
담배 식물체에서 Arabidopsis thaliana에 존재하는 3가지 다른 엽록소 a/b 결합 단백질 (cab) 유전자 promoter들의 발현을 조사하였다. 이들 promoter의 활성은 이들 promoter에 결합된 reporter gene의 식물인 CAT (chloramphenicol acetyltransfer-ase)의 활성으로 측정하였다. 담배엽에서 cab promoter의 활성은 cab1, cab2, cab3의 순이었고, 이들 잎에서 유도한 callus나 shoot에서도 동일한 양상을 보였다. 이들 3가지 promoter의 발현은 상부엽에서 하부엽보다 높은 활성은 보였으며 개체간의 높은 변이폭은 뿌리내리기를 통하여 무성증식된 식물체를 사용하여 줄일 수 있었다. 이들은 또한 기관 특이성을 보여 줄기 보다 잎에서의 활성이 높았고 뿌리에서는 거의 발현되지 않았다. 그러나 cab1 promoter의 경우, 다른 두 cab promoter들과는 다르게, 잎에 대한 줄기에서의 상대적인 활성이 높았으며, CAT 활성을 단위 단백질당을 표시하는 대신 단위 엽록소당 활성으로 나타내었을 때 줄기와 잎에서 활성의 차이가 관찰되지 않았다. 즉 cab2와 cab3는 광합성 기관 특이성을 보이는 반면 cab1의 경우는 이러한 특이성을 나타내지 않았다. 이러한 현상은 잎에서 유도한 shoot가 줄기와 잎으로 분화되는 과정에서도 관찰되었다.
CAB 유전자로 형질전환된 담배 2세대 식물체의 도입된 CAB 유전자 존재여부를 genomic PCR 방법으로 각계통에서 확인하였다. CAB유전자로 형질전환된 2세대 식물체를 자연 광 조건과 90% 차광된 온실에서 각각 생육시킨 결과 형질전환 식물체의 광합성능 정도는 정상 식물체와 유사하거나 약간 높은 경향이었으며, 광포화점은 형질전환 담배 식물체나 정상 식물체 모두 500$\mu$mol m$^{-2}$ s$^{-1}$로 차이가 없었다. 조사한 7계통 중 C7, C11, C14 계통의 광합성 정도가 조사된 모든 광량에서 정상 담배 식물체보다 높게 나타났다. 차광된 조건에서 생육한 담배 식물체의 광합성능 정도는 조사된 7계통 중 C2, C11, C14 계통이 90% 차광된 온실조건에서도 광합성 능이 우수하게 나타났다. 형질전환 담배 식물체의 chlorophyll 함량은 정상 NC82와 차이가 없었으며, 양지에서 생육한 조건과 90% 차광된 조건 모두에서 차이점이 없었으며 광합성능과 chlorophyll 함량과의 유의성은 없었다. 형질전환 담배 식물체 수확엽의 건물률은 정상 식물체와 비교하여 차이점이 나타나지 않았으며, 내용성분도 nicotine, 전당, 전질소에서 차이가 없었다.
In Gram(+) bacteria and organelles in higher eukarotes, $Gln-tRNA^{Gln}$ utilized for protein biosynthesis is formed by a tRNA-dependent amino acid transformation using mischarged $Gln-tRNA^{Gln}$ as the intermediate. In this study, the gatCAB gene encoding $Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase (Glu-AdT) of Staphylococcus aureus was cloned and its nucleotide sequence wa determined. The S. aureus gatCAB gene was organized in an operon structure consisting of three open reading frames (gatC, gatA, and gatB), similar to that of Bacillus subtilis. The gene sequences for the A and B subunits of$Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase showed significant homology (77 and 87% homology with amino acid sequence) with the gatA and gatB genes of B. subtilis, yet the C subunit (gatC) showed a relatively lowe homology with the B. subtilis gatC gene and other orthologues. The cloned S. aureus <$Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase gene was highly expressed in Escherichia coli, and the resulting crude enzyme could convert misacylated <$Gln-tRNA^{Gln}$ into $Gln-tRNA^{Gln}$ in vitro.
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum은 배추를 포함한 대부분의 채소작물에 강한 병원성을 나타낸다. 포장 방제 효과 검정을 통하여 배추 무름병 억제인자로 선발된 CAB12243-2 균주는 16S rRNA gene의 염기서열 상동성 분석으로 Bacillus toyonensis로 확인되었다. B. toyonensis CAB12243-2 균주는 무름병균의 펙틴분해 작용을 억제하였고 탄소원으로 glucose와 trehalose를 이용하였다. 또한 이 균주는 '노랑봄' 품종으로 봄배추 재배 시 73%, '불암3호' 품종으로 가을배추 재배 시 68.9%의 포장 방제 효과를 보였다. 이러한 결과로 B. toyonensis CAB12243-2 균주는 채소류의 무름병에 대한 효과적인 생물적 방제제로 활용이 가능한 것을 확인할 수 있었다.
Colletotrichum acutatum에 의해 발생하는 고추탄저병을 방제하기 위해 토양 근권으로부터 분리한 미생물 중 길항효과가 있는 미생물을 선발하여 주요 작물병원균에 대한 항균활성 효과와 포장에서의 방제효과를 검정하였다. 기내 대치배양법을 이용한 길항력을 검정하였을 때, CAB13001 균주는 고추 탄저병을 일으키는 Colletotrichum acutatum을 포함한 식물 병원균 Sclerotinia cepivorum, Sclerotinia sclerotium, Botrytis cinerea에 대한 뛰어난 항균활성 효과를 보였다. 또한 풋고추를 이용한 생체 검정에서 선발균주는 고추 탄저병의 병반진전 억제효과가 우수하였으며, 포장에서의 방제가 역시 무처리 대비 82.4%로 매우 우수하였다. 이러한 결과로 볼 때 CAB13001 균주는 공기 전염을 하는 고추 탄저병의 생물적 방제제로 매우 유용할 것으로 판단된다. 한편, 본 연구에 사용된 길항미생물 CAB13001 균주는 16s rRNA gene의 계통학적 위치를 분석한 결과 Burkholderia lata로 동정하였다.
광계II(PSII)는 고등식물의 chloroplast에서 두 개의 광합성 반응중심 중의 하나이다. Chlorophyll a/b 광수확 복합체는 광계II를 위한 안테나 역할을 수행한다. 본 연구에서는 인삼의 잎조직을 제작한 cDNA library로부터 chlorophyll a/b-binding protein (Cab) 유전자를 분리하였다. 인삼 Cab유전자는 935 bp의 염기와 265개의 아미노산 잔기(pI 5.63)로 구성된 한 개의 ORF를 포함하고 있으며, 단백질의 분자량은 28.6 kDa으로 추정되었다. 인삼에서 분리한 Cab 유전자는 기존에 식물에서 보고된 유전자들과 유사성을 나타내었으며, 유사도는 $68-92\%$로 나타났다. 아미노산 서열을 비교하여 유연관계를 분석한 결과 인삼의 Cab 유전자는 비교된 P. persica (AAC34983), A.thaliana (AAD28771), G. hirsutum (CAA38025), G. max (AAL29886), V. radiata (AAF89205) 등과 동일한 그룹으로 분리되었다.
Sclerotium cepivorum에 의한 흑색썩음균핵병은 마늘에 큰 피해를 주는 중요한 토양병이다. 충남 서산 및 태안의 마늘 재배농가 포장을 중심으로 2009년부터 3년간 조사한 결과, 흑색썩음균핵병은 4월 하순부터 발생을 시작하고, 5월 중순에 발병이 급격히 증가하여 5월 하순에는 최고 발병률을 나타내었다. 본 시험에 사용된 길항미생물 CAB008106-4 균주는 16S rRNA gene의 염기서열 분석결과 Burkholderia pyrrocinia로 확인되었다. B. pyrrocinia CAB08106-4 균주는 흑색썩음균핵병에 대하여 69.6%의 포장방제효과를 보였다. 이러한 결과로 B. pyrrocinia CAB08106-4는 마늘에 발생하는 흑색썩음균핵병에 대하여 효과적인 생물적 방제제로 활용이 가능함을 확인할 수 있었다.
Expression of light-harvesting chlorophyll a/b-binding protein gene(cab) is repressed in the dark and activited by light. However, the detail of its regulatory mechanism is not characterized so far. To identify the interactions of cis-acting elements and trans-acting factors involvedin this regulation, nuclear extracts from the light-grown and dark-adapted Arabidopsis thaliana leaves were anlayzed for mobility shift assay against 134bp fragments had two retarded bands and one retardation band, respectively, both in light-grown and dark-adapted bands in the dark-adapted tissues. A new retardation the cab 3 expression in the dark. Several light regulatory motifs are scattered in the 146 bp region of cab 3 promoter. One of the light-regulatory motifs could be the binding site for the negative regulatory factor.
The binding ability of leaf nuclear extracts to the lighbresponsive elements (LREs) of cab promoters of Arabidopsis thaliana has been investigated. The cab promoters were fragmented with restr ction endonucleases into LRE that were identified by Mitra et al. [Plant Mol. Biol. 12, 169179 ( 1989)] and other small fragments. After end labeling with Klenow fragment, the fragments were assayed for binding with the leaf nuclear proteins that were prepared by solubilizing the purified nuclei with 0.5 M ammonium sulfate. The binding ability was assayed by mobility shift assay. To perform successful mobility shift assay, several factors affecting the interaction of protein with DNA were optimized before performing the assay. The LREs had several retardation bands. However, the other promoter fragments from the transcription start site to the far upstream region of the promoters had also retardation bands. No particular relationships could be found between the retardation band distributions and the loci of LRE. It is likely that the light-regulation of cab gene expression may be controlled by the multiple interactions of the regulatory protein factors with DNA motifs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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