본 연구에서는 층상규산염광물 중 삼팔면체 운모족에 속하는 흑운모-1Μ 시료를 대상으로 중성자분말회절분석을 수행하였다. 분말회절분석기의 저온 및 고온 시료장치를 이용하여 -263$^{\circ}C$, 상온, 30$0^{\circ}C$, $600^{\circ}C$, 90$0^{\circ}C$의 온도조건에서 중성자 회절자료를 취득하였으며 Rietveld법으로 구조분석을 실시하였다. 정밀화 지수 $R_{b}$는 5.06%-11.9%, S(Goodness of fitness)는 2.97~3.94로 수렴되었다. -263$^{\circ}C$부터 $600^{\circ}C$까지는 단위포상수 a, b, c가 온도의 증가에 따라서 팽창되는 경향을 뚜렷하게 관찰할 수 있었으며 90$0^{\circ}C$에서는 a와 b의 경우 오히려 감소하는 결과를 보여주었다. -263$^{\circ}C$~$600^{\circ}C$ 온도구간에서 c축의 팽창성은 a, b 축의 팽창성에 비하여 상대적으로 더 크며 이는 단위포의 부피증가가 이 온도 범위에서는 c축의 팽창에 의해 주도됨을 지시한다. 90$0^{\circ}C$에서 보이는 경향의 불일치성은 이 온도에서 탈수산기화-산화반응이 우세하게 발생함으로서 팔면체 구조내 $Fe^{2+}$ 이 $Fe^{3+}$ 로 산화되어 양이온 반경이 변화되었기 때문으로 해석된다. 저온조건(-263$^{\circ}C$)에서 결정된 수소원자의 위치는 O4자리로부터 0.9103$\AA$ 떨어져서 (x/a=0.138, y/b=0.5, z/c=0.305)의 위치에 존재하는 것으로 계산되었다. 각 온도조건에 대하여 사면체회전각($\alpha$*, 팔면체판 두께($t_{oct}$), M-O간 거리는 단위포축 팽창성 결과와 마찬가지로 90$0^{\circ}C$의 고온조건을 제외하고는 일반적으로 온도가 증가함에 따라서 $\alpha$*, $t_{oct}$, M-O간 거리가 증가하는 경향을 보이지만 그경향이 상대적으로 덜 분명하며, 온도변화에 따른 팔면체 형태변화의 경향은 보이지 않았는데, 이는 금운모 등과 달리 M1, M2 팔면체에는 Fe와 Mg가 치환되어 분포하고 있기 때문으로 해석된다.다.
Min Jae Kim;Tae Jin Kim;Yun Ji Kang;Ji Yeon Yoo;Jeong Hwan Kim
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제33권2호
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pp.211-218
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2023
A cryptic plasmid (pTH32) was characterized from Tetragenococcus halophilus 32, an isolate from jeotgal, Korean traditional fermented seafood. pTH32 is 3,198 bp in size with G+C content of 35.84%, and contains 4 open reading frames (ORFs). orf1 and orf2 are 456 bp and 273 bp in size, respectively, and their translation products showed 65.16% and 69.35% similarities with RepB family plasmid replication initiators, respectively, suggesting the rolling-circle replication (RCR) mode of pTH32. orf3 and orf4 encodes putative hypothetical protein of 186 and 76 amino acids, respectively. A novel Tetragenococcus-Escherichia coli shuttle vector, pMJ32E (7.3 kb, Emr), was constructed by ligation of pTH32 with pBluescript II KS(+) and an erythromycin resistance gene (ErmC). pMJ32E successfully replicated in Enterococcus faecalis 29212 and T. halophilus 31 but not in other LAB species. A pepA gene, encoding aminopeptidase A (PepA) from T. halophilus CY54, was successfully expressed in T. halophilus 31 using pMJ32E. The transformant (TF) showed higher PepA activity (49.8 U/mg protein) than T. halophilus 31 cell (control). When T. halophilus 31 TF was subculturd in MRS broth without antibiotic at 48 h intervals, 53.8% of cells retained pMJ32E after 96 h, and only 2.4% of cells retained pMJ32E after 14 days, supporting the RCR mode of pTH32. pMJ32E could be useful for the genetic engineering of Tetragenococcus and Enterococcus species.
B. amyloliquefaciens IUB158-03균주에서 정제된 항진균물질은 극성인 용매에 잘 용해되고, pH 6.0~10.0와 $-70{\sim}121^{\circ}C$에서와 같이 넓은 범위의 온도 및 pH에서 안정성을 보였다. 항진균물질의 FAB-MS, UV 흡수 스펙트럼, 아미노산 조성 등을 분석한 결과 분자량은 1,042 이었고, TLC를 이용하여 분석한 결과 ninhydrin solution에서 보라색으로 발색되었다. UV 스펙트럼은 220 nm, 277 nm에서 ${\lambda}max$를 보였으며, $Asn_3$, $Gln_2$, $Ser_1$$Gly_1$, $Tyr_1$의 아미노산 조성을 갖는 것으로 나타났다. 그리고 $^1H$-NMR spectrum, $^1H$-COSY, HMQC 을 분석한 결과 iturin A계에 속하는 물질로 확인되었다. NIH3T3 섬유아세포에 대해 항진균물질이 세포독성을 나타내지 않는 것은 물론 마우스에 항진균물질을 경구투여하여 장기 내의 변화와 백혈구 수, 생체내의 생리적인 기능면에서 정상 마우스와 차이를 보이지 않았으므로 생체독성이 없는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구를 통하여 B. amyloliquefaciens IUB158-03에서 분리된 항진균물질이 앞으로 고추탄저병의 생물적 방제제로 이용될 수 있는 잠재성을 갖고 있는 것으로 사료된다.
Darwesh, Doaa B.;Al-Awthan, Yahya S.;Elfaki, Imadeldin;Habib, Salem A.;Alnour, Tarig M.;Darwish, Ahmed B.;Youssef, Magdy M.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제32권5호
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pp.551-563
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2022
L-asparaginase (E.C. 3.5.1.1) purified from bacterial cells is widely used in the food industry, as well as in the treatment of childhood acute lymphoblastic leukemia. In the present study, the Burkholderia pseudomallei L-asparaginase gene was cloned into the pGEX-2T DNA plasmid, expressed in E. coli BL21 (DE3) pLysS, and purified to homogeneity using Glutathione Sepharose chromatography with 7.26 purification fold and 16.01% recovery. The purified enzyme exhibited a molecular weight of ~33.6 kDa with SDS-PAGE and showed maximal activity at 50℃ and pH 8.0. It retained 95.1, 89.6%, and 70.2% initial activity after 60 min at 30℃, 40℃, and 50℃, respectively. The enzyme reserved its activity at 30℃ and 37℃ up to 24 h. The enzyme had optimum pH of 8 and reserved 50% activity up to 24 h. The recombinant enzyme showed the highest substrate specificity towards L-asparaginase substrate, while no detectable specificity was observed for L-glutamine, urea, and acrylamide at 10 mM concentration. THP-1, a human leukemia cell line, displayed significant morphological alterations after being treated with recombinant L-asparaginase and the IC50 of the purified enzyme was recorded as 0.8 IU. Furthermore, the purified recombinant Lasparaginase improved cytotoxicity in liver cancer HepG2 and breast cancer MCF-7 cell lines, with IC50 values of 1.53 and 18 IU, respectively.
The crystal structure of (1,3,6,9,11,14-hexaazatricycol[12.2.1.$1^{6,9}$]octadecane)copper(Ⅱ) perchlorate, Cu($C_{12}H_{26}N_6$)$(ClO_4)_2$, has been determined by the X-ray diffraction methods. The crystal data are as follows: Mr=516.9, triclinic, ${\alpha}=8.572\;(2)$, b=8.499 (3), c=15.204 (3) ${\AA}$, ${\alpha}=80.42\;(5),\;{\beta}=73.57\;(3),\;{\gamma}=69.82\;(4)^{\circ},\;V=994.2\;{\AA}^3,\;D_C=1.726\;gcm^{-3}$, space group $P{\tilde{1}},\;Z=2,\;{\mu}=21.27\;cm^{-1}&, F(000)=534 and T=297 K. The structure was solved by direct methods and refined by full-matrix least-squares methods to and R value of 0.081 for 1608 observed reflections measured with graphite-mono-chromated Mo Ka radiation on a diffractometer. There are two independent complexes in the unit cell. The two copper ions lie at the special positions (1/2, 0, 0) and (0, 1/2, 1/2)and each complex possesses crystallographic center of symmetry. Each Cu ion is coordinated to four nitrogen donors if the hexaazamacrotricyclic ligand and weakly interacts with two oxygen atoms of the perchlorate ions to form a tetragonally distorted octahedral coordination geometry. The Cu_N (sec), Cu_N(tert) and Cu_O coordination distances are 1.985 (14), 2.055 (14) and 2.757 (13) ${\AA}$ for the complex A and 1.996 (10), 2.040 (11) and 2.660 (13) ${\AA}$ for the complex B, respectively. The macrocycles in the two independent cations assume a similar conformation with the average r.m.s. deviation of 0.073 ${\AA}$. Two 1,3-diazacyclopentane ring moieties of the hexaazamacrotricyclic ligand are placed oppositely and almost perpendicularly to the square coordination plane of the ruffled 14-membered macrocycle. The secondary N atoms are hydrogen-bonded to the perchlorate O atoms with distances of 3.017 (23) and 3.025 (19) ${\AA}$ for the complexes A and B, respectively.
Background: A co-inhibitory molecule, B7-H4, is believed to negatively regulate T cell immunity by suppressing T cell proliferation and inhibiting cytokine production. However, the mechanism behind B7-H4-mediated tolerance remains unclear. Methods: Balb/c $(H-2^d)$ mice were fed with dendritic cell line, DC2.4 $(H-2^d)$ every day for 10 days. Meantime, mice were hydrodynamically injected with recombinant plasmid expressing B7-H4 fusion protein (B7-H4.hFc) or hFc via tail vein. One day after last feeding, mice were immunized with allogeneic B6 spleen cells. 14 days following immunization, mice were challenged with B6 spleen cells to ear back and the ear swelling was determined the next day. Subsequently, a mixed lymphocyte reaction (MLR) was also performed and cytokines profiles from the reaction were examined by sandwich ELISA. Frequency of immunosuppressive cell population was assayed with flow cytometry and mRNA for FoxP3 was determined by RT-PCR. Results: Tolerant mice given plasmid expressing B7-H4.hFc showed a significant reduction in ear swelling compared to control mice. In addition, T cells from mice given B7-H4.hFc plasmid revealed a significant hyporesponsiveness of T cells against allogeneic spleen cells and showed a significant decrease in Th1 and Th2 cytokines such as IFN-${\gamma}$, IL-5, and TNF-${\alpha}$. Interestingly, flow cytometric analysis showed that the frequency of CD4+CD25+FoxP3+ Tregs in spleen was increased in tolerant mice given recombinant B7-H4.hFc plasmid compared to control group. Conclusion: Our results demonstrate that B7-H4 synergistically potentiates oral tolerance induced by allogeneic cells by increasing the frequency of FoxP3+ CD4+CD25+ Treg and reducing Th1 and Th2 cytokine production.
본 연구에서는 모싯잎 에탄올 추출물이 첨가된 산업용 배지에 유산균(L. plantarum JBLAB0101와 L. rhamnosus GG(LGG)) 발효특성을 확인하였고, 발효물에 대한 항비만 효능 분석을 수행하였다. 유산균 발효기간 중 이화학적특성(pH, 총산도), 생균수, 유기산 및 유리당 함량을 분석하였다. 생균수는 발효 4일 차에 최대치로 8.75-8.85 log CFU/mL로 확인되었으며, 이에 따라 pH는 6.58-6.66에서 3.74-3.79로 감소하였고, 총산도는 0.39-0.40%에서 2.07-2.19%로 증가하였다. Lactic acid는 발효 4일 차에 1,676.03-1,910.12 mg%로 증가하였으며, glucose는 L. plantarum 균주에서 모두 소모되었고, LGG 균주는 348.35 mg% 잔존하였다. 항비만 효능 평가는 pancreatic lipase 저해활성과 3T3-L1 세포주를 이용한 지질분화억제능(지질축적률, 렙틴 생성량 및 PPAR-γ 및 SREBP-1c 유전자의 mRNA 발현량)을 분석하였다. 모싯잎 추출물 첨가 산업용 배지에 접종된 균주의 이름과 배양유무에 따라 비발효물(UFRL), JBLAB0101 발효물(FRLPLA) 및 LGG 발효물(FRLLGG)로 구분하였다. Lipase 저해활성은 UFRL, FRLPLA 및 FRLLGG을 동일농도 0.5 mg/mL에 처리 시 각각 12.19%, 30.10% 및 25.63%로 확인되었다. 3T3-L1 세포주에 FRLPLA를 200 ㎍/mL 처리함에 따라 비처리구에 비해 지질축적률, 렙틴 생성량, PPAR-γ 및 SREBP-1c 유전자의 mRNA 발현량이 각각 37.54%, 54.64%, 24.18% 및 31.32% 감소하였다. 이와 같은 결과로 항비만 효능이 있는 모싯잎 추출물이 첨가된 산업용 배지에 L. plantarum JBLAB0101 균주와 LGG 균주의 유산발효가 항비만 효능 증진 가능성이 기대된다.
Background: NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1 (NQO1) is part of the antioxidant defence system involved in detoxification. This study aimed to analyze the influence of NQO1 (C609T) genetic polymorphism in non small cell lung cancer (NSCLC)as a putative risk factor. Materials and Methods: Present study included 100 cases of NSCLC (adenocarcinoma) patients and 100 age and sex matched healthy controls. NQO1 (C609T) genotyping was performed by allele specific PCR for assessment of putative associations with clinical outcome and genotypes of. The association of the polymorphism with the survival of NSCLC patients' was analyzed by Kaplan-Meier method. Results: In Indian NSCLC (adenocarcinoma) patients increased risk of developing NSCLC was found to be associated with NQO1 609TT genotype [OR 3.68(0.90-14.98), RR 2.04(0.78-5.31)] for CT [OR 2.91(1.58-5.34), RR 1.74(1.23-2.44) p=0.0005 for CT], for CT+TT [ OR 3.26(1.82-5.82), RR 1.87(1.34-2.61) p<0.0001 for CT+TT]. A significant difference (p=0.0009) was observed in genotype distribution among cases and healthy controls. Patients with CT+TT genotype exhibited a significant poor overall survival compared with patients displaying homozygous CC genotype (p=0.03) and when survival independently compared with CC, TT and CT genotype was also found to be significantly associated (p=0.02). Overall median survival times were CT 6.0 months, TT 8.2 months, and CT + TT (6.4 months)]. Conclusions: The present study revealed that NQO1 CT, TT and CT+TT genotypes may be associated with clinical outcome and risk of developing NSCLC in the Indian population.
In order to obtain the fundamental informations on cellulase of Trichoderma viride QM 9414 for its production and utilization, some physico-chemical properties of the enzyme were reviewed. When T. viride QM 9414 was cultured on wheat bran medium, filter paper-disintegrating and carboxymethyl cellulose-saccharifying activity were increased with the cell growth, and thereafter CMC-saccharifying activity was kept on almost the same leved while filter-paper disintegrating activity was decreased sharply. And B-glucosidase was formed maximally on the late stationary phase of growth. The crude cellulase of cell-free extracts was purified by (NH4)2SO4 fractionation, Sephadex-G 200 column chromatography and DEAE Sephadex A-50 column chromatography. Filter paper-disintegrating, CMC-saccharifying and B-glucosidase activity were purified 10-fold, 47-fold and 38-fold, respectively. The crude enzyme was proved to be a complex of three different enzyme proteins which were showing filter paper-disintegrating, CMC-saccharifying and B-glucosidase activity. The optimal pH of the three enzyme components was alike pH 4.0, and the optimal temperature for CMC-saccharifying, filter paper-disintegrating and B-glucosidase activity were 4$0^{\circ}C$, 45$^{\circ}C$ and 5$0^{\circ}C$ respectively. The Km and Vmax values of CMC saccharifying activity for CMC were 0.485% and 3.10, and the Km and Vmax vallues of B-glucosidase for PNPG were 0.944$\times$10-3M and 0.097, respectively. The Km and Vmax values of filter paper-disintegrating activity for Avicel were determined to be 0.09% and 0.178, respectively. B-Glucosidase activity was competitively inhibited by glucose, and the Ki value for this enzyme was 3.54$\times$10-3M, CMC saccharifying activity was found to be greatly inhibited by cellobiose.
Kim H.J.;Chang I.T.;Koak J.Y.;Heo S.J.;Yim S.A.;Jang J.H.
대한치과보철학회지
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제42권3호
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pp.301-306
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2004
Statement of problem. Fibronectin mediates its biological effects by binding to integrins on cell membranes through a consensus site including the Arg-Gly-Asp (RGD) sequence within tenth type III module. Purpose. The purpose of our study was to investigate the adsorption affinity of human recombinant fibronectin peptide (hFNIII 9-10) to titanium and to investigate the effect of the surrounding ionic composition on the adsorption process. Material and methods. As for evaluating the affinity of hFNIII 9-10 to Ti, titanium disks were incubated in 40, 80 and $120{\mu}g/ml$ hFNIII 9-10 solution at $37^{\circ}C$ overnight, repectively. As for evaluating the effect of surrounding ionic concentration, hFNIII 9-10 was dissolved in distilled water, phosphate buffered saline and RPMI 1640. Optical density (O.D.) was measured in ELISA reader. Results. The results were as follows; 1. The adsorption of hFNIII 9-10 showed significantly highest mean optical density (O.D.) value in $80{\mu}g/ml$. 2. The difference of ionic composition in DW, PBS and RPMI did not influence the adsorption amount of hFNIII 9-10.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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