• Molecules and Cells
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• 제20권3호
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• pp.442-445
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• 2005

HP0894 (SwissProt/TrEMBL ID O25554) is an 88-residue conserved hypothetical protein from Helicobacter pylori strain 26695 with a calculated pI of 8.5 and a molecular weight of 10.38 kDa. Proteins with sequence similarity to HP0894 exist in Vibrio choierae, Enterococcus faecalis, Campylobacter jejuni, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli O157, etc. Here we report the sequence-specific backbone resonance assignments of HP0894. About 97.5% (418/429) of the HN, N, CO, $C{\alpha}$, $C{\beta}$ resonances of the 88 residues of HP0894 were assigned. On the basis of these assignments, three helical regions and four strand regions were identified using the CSI program. This study is a prerequisite for calculating the solution structure of HP0894, and studying its interaction with its substrates, if any, and/or with other proteins.

• 미생물학회지
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• 제43권3호
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• pp.186-192
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• 2007

제주도를 포함한 전국규모로 15개 시 도에 위치한 도계장에서 직접 수거한 도계육에 대하여 미생물 오염도 조사로서 총세균수, 대장균군수 및 포도상구균수에 대해서 조사를 하였다. 특히 주요 인수공통 병원성 세균들인 Salmonella 속균과 Campylobacter jejuni, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, 그리고 E. coli O157:H7 균에 대해서도 함께 조사를 하였다. 그리고 도계장에서 보다 안전하고 위생적인 처리를 위해서 가장 흔히 사용되는 방법인 염소(20mg/L포함)를 첨가한 염소수로서 수세한 처리계육과 그렇지 않은 비처리 도계육 상호간에 대해서도 Salmonella 속균의 분리율과 기타 균종의 억제효과에 대해서도 비교조사를 수행하였다. 먼저 예비조사로서 강원지역을 비롯한 전국 6개 시 도의 도계장 유래 계육에 대해서 세균오염도의 비교조사에서는 포도상구균수, 대장균군수 및 총세균수의 순서로 오염도를 나타내었다. 이 성적은 시판계육의 미생물 오염도 수준보다는 $10{\sim}100$배 이상 낮은 오염도 성적이었다. 그리고 동일계육에 대한 Salmonella 속균의 분리율은 63.3%(19/30)였고, S. enteritidix (33.3%)가 가장 지배적인 혈청형이었으며, 동시에 S. typhimurium (3.3%), S. muenchen (30.0%)도 분리되었다. 하편, 염소수로 세척한 도계육은 총세균수와 대장균군수의 비교조사에서 비처리 계육보다도 약 100배정도로 균수의 억제효과를 보였다. 반면에 포도상구균수에서는 양자간에 뚜렷한 차이를 보이지 알았다. 또한 Salmonella 속균에 대한 억제효과의 비교조사에서도 20 ppm의 염소처리로서는 포도상구균과 마찬가지로 Salmonella 속균에 대해서도 뚜렷한 억제효과를 발휘하지 못한 것으로 확인되었다. 한편 보다 확대된 규모의 조사결과에서 제주도를 포함한 부산, 경남, 대구, 경북, 전남, 광주, 전북, 충남, 대전, 충북, 강원, 서울, 인천 및 경기지역을 포함하여 총 15개 시 도의 도계장 수거계육에서 Salmonella속균은 58.3%(67/115)에서 분리되었고, S. muenchen (57.3%)과 S. enteritidis (22.7%)가 대부분을 차지하였고, 인수공통병원균 중에서는 L. monocytogenes(43.5%), C. jejuni(37.4%), S. aureus(30.4%)의 순서로 분리되었으나, E. coli O157:H7은 국내 계육에서 전혀 분리되지 않았다. 결과적으로 도계육이 위생적이며 안전하게 시판되기 위해서는 최종적인 도계공정 이후 다양한 유통과정에서 발생될 수 있는교차 및 추가오염의 기회를 줄이기 위한 보다 철저한 위생관리 대책과 보완대책이 필요하다는 사실을 이 성적을 통하여 비로소 확인할 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권6호
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• pp.778-783
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• 1999

Campylobacter is a pathogen for both humans and animals that can be transferred from animals to humans. Four isolates, which grew under 5-10% $CO_2$ and had small and translucent colonies, were obtained from swine gastric mucosa and characterized using various methods. These bacteria were gram negative, spirally shaped with round ends. One or two non-sheathed polar flagella were observed under electron microscopy. A PCR with species-specific protein (SSP) primers for 16S rRNA gene in Campylobacter produced a typical 462 bp fragment. The isolates had various biochemical and molecular characteristics which differentiated them from other Campylobacters. The isolates were catalase and oxidase positive, urease (rapid) negative, nitrate reduction positive, indoxyl acetate hydrolysis positive, y-glutamyl transpeptidase negative, and alkaline phosphatase negative. All four isolates showed growth at $37^{\circ}C{\;}and{\;}42^{\circ}C{\;}but{\;}not{\;}at{\;}25^{\circ}C$, were resistant to cephalotin and cefoperazone, and susceptible to carbenicillin. The isolates showed various results in the reduction of chloride to triphenyl tetrazolium (TTC) and a susceptibility to nalidixic acid. Western blot analysis of these isolates with antiserum raised against one isolate showed different patterns from those of reference strains. A dendrogram drawn with the RAPD results showed that these isolates belonged to a new Campylobacter spp. group different from those of C. jejuni, C. doylei, C. lari, and C. coli.

• 한국동물위생학회지
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• 제45권2호
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• pp.101-110
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• 2022

This study was performed to investigate infectious gastrointestinal diseases in 115 Korean cats (83 indoors and 32 outdoors) with digestive signs such as diarrhea, anorexia or abdominal distention. Detection of infectious pathogens was analyzed using real-time PCR. As a result, 85 of 115 Korean cats were detected with feline corona virus (FCoV), feline parvo virus, Group A rotavirus, Clostridium perfringens (C. perfringens), Campylobacter coli (C. coli), Campylobacter jejuni, enterotoxigenic Escherichia coli, enteropathogenic Escherichia coli, Salmonella spp., Tritrichomonas foetus, Cyclospora cayetanensis, and Giardia lamblia. The most frequently detected pathogen was C. perfringens (52 cats, 61.2%), followed by FCoV (43 cats, 50.6%) and C. coli (16 cats, 18.8%). Also, single infection was the most common (43 cats), followed by double infection in 31 cats, triple infection in 7 cats, and quadruple infection in 4 cats. There was no significant relationship between pathogen detection and age, gender, living environment, weather, and diarrhea. However, there was a significant difference between the age group under 1 year and the age group 1~7 (P value<0.05). In this study, cats with suspected gastrointestinal infection were randomly evaluated, and other factors that could affect pathogen detection were insufficiently considered. For this reason, additional epidemiological investigations with a larger number of cats and sufficient consideration of the causes that may affect the results are needed. Nevertheless, it is thought that this study can also provide valuable information on gastrointestinal pathogens in Korean cats.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제30권10호
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• pp.1516-1524
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• 2020

Climate change is expected to affect not only availability and quality of water, the valuable resource of human life on Earth, but also ultimately public health issue. A six-year monitoring (total 20 times) of Escherichia coli O157, Salmonella enterica, Legionella pneumophila, Shigella sonnei, Campylobacter jejuni, and Vibrio cholerae was conducted at five raw water sampling sites including two lakes, Hyundo region (Geum River) and two locations near Water Intake Plants of Han River (Guui region) and Nakdong River (Moolgeum region). A total 100 samples of 40 L water were tested. Most of the targeted bacteria were found in 77% of the samples and at least one of the target bacteria was detected (65%). Among all the detected bacteria, E. coli O157 were the most prevalent with a detection frequency of 22%, while S. sonnei was the least prevalent with a detection frequency of 2%. Nearly all the bacteria (except for S. sonnei) were present in samples from Lake Soyang, Lake Juam, and the Moolgeum region in Nakdong River, while C. jejuni was detected in those from the Guui region in Han River. During the six-year sampling period, individual targeted noxious bacteria in water samples exhibited seasonal patterns in their occurrence that were different from the indicator bacteria levels in the water samples. The fact that they were detected in the five Korea's representative water environments make it necessary to establish the chemical and biological analysis for noxious bacteria and sophisticated management systems in response to climate change.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제33권2호
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• pp.94-101
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• 2018

본 연구에서는 김치 제조시 철저한 재료 세척의 필요성을 확인하고, 더불어 비가열 식품인 김치의 위생 안전성 실태를 파악하여 효율적 미생물 저감화 방안을 마련하고자 국내에서 유통되는 김치 원 부재료 200건의 세척 전과 후의 비교분석과 시판 김치 100건에 대하여 미생물 분석을 실시하였다. 김치 원 부재료 및 완제품에 대하여 일반세균수, 대장균 및 대장균군을 모니터링 하였으며, 병원성 미생물 9종(Bacillus cereus, Clostridium perfringens 정성 정량, Staphylococcus aureus, Enterohemorrhagic Escherichia coli, Campylobacter jejuni/coli, Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Vibrio parahaemolyticus, Listeria monocytogenes 정성)을 분석 하였다. 모니터링 결과, 김치 원 부재료 및 완제품에서 일반세균은 1.4~9.0 log CFU/g 수준으로 확인되었으며, 원 부재료 중 생강에서 8.8 log CFU/g, 완제품 중 총각김치에서 9.0 log CFU/g으로 일반세균이 가장 높게 나타났다. 대장균군은 0.5~7.3 log CFU/g으로 확인되었으며, 생강에서 7.3 log CFU/g으로 가장 높게 나타났고, 병원성 미생물 9종의 분석결과, Bacillus cereus를 제외한 나머지 8종의 식중독균은 모든 시료에서 검출되지 않았다. 김치 제조 시 사용되는 김치 원 부재료들의 세척공정 후 미생물 수는 일반세균수 0.2~3.2 log CFU/g, 대장균군 0.3~2.7 log CFU/g, Bacillus cereus 1.0~3.9 log CFU/g 감소하였다. 따라서, 김치 원 부재료의 세척 공정으로 미생물 오염도를 감소 시켰으며, 이 결과를 통하여 김치 완제품의 위생 및 저장성 증진에 기여 할 수 있을 것으로 확인되었다.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제24권4호
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• pp.316-322
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• 2001

Arylsulfate sulfotransferase (ASST) transfers a sulfate group from a phenolic sulfate ester to a phenolic acceptor substrate. In the present study, the gene encoding ASST was cloned from a genomic library copy of Citrobacter freundii, subcloned into the vector pGEM3Zf(-) and sequenced. Sequencing revealed two contiguous open reading frames (ORF1 and ORF2) on the same strand and based on amino acid sequence homologyl they were designated as astA and dsbA, respectively. The amino acid sequence of astA deduced from C. freundii was highly similar to that of the Salmonella typhimurium, Enterobacter amnigenus, Klebsiella, Pseudomonas putida, and Campylobacter jejuni, encoded by the astA genes. However, the ASST activity assay revealed different acceptor specificities. Using p-nitrophenyl sulfate (PNS) as a donor substrate, $\alpha$-naphthol was found to be the best acceptor substrate, followed by phenol, resorcinol, p-acetaminophen, tyramine and tyrosine.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제21권1호
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• pp.41-46
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• 2006

최근 생식제품에 대한 국민 선호도가 높아지고 판매량이 증가됨에 따라 안전하고 위생적인 생식의 유통을 유도하고, 위생 강화를 위한 미생물 규격 제정의 기초연구를 위하여 시판 생식 및 원재료에 대한 식중독균 분포실태를 조사하였다. 2002년부터 2004년까지 서울, 인천, 부산 등 전국 대도시를 중심으로 대형마트 및 통신판매에서 시판 중인 생식제품 191건을 구입하여 주요 식중 독균인 E. coli, Salmonella, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Clostridium perfringens, Listeria monocytogenes, Campylobactey jejuni, Yersinia enterocolitica, E. coli O157:H7, Vibrio parahaemolyticus를 검사하였다. 그 결과 B. cereus는 29건(15.2%), C. perfringens는 21건(11.0%), E. coli는 1건(0.5%)에서 검출되었으나 그 외 식중독균은 검출되지 않았다. 정량적 평가 결과 일반세균수는 $1.2X10^3cfu/g{\sim}1.6X10^9cfu/g$, B. cereus는 100 cfu/g 이하${\sim}11X10^3cfu/g$, C. perfringens는 100 cfu/g 이하${\sim}2.2x10^3cfu/g$의 분포를 보였다. 생식의 미생물 오염원을 파악하기 위하여 9개 생식제조공장에서 사용되고 있는 현미, 당근, 율무, 옥수수 등 53건의 원재료에 대한 미생물 분포도를 조사하였다. 그 결과 일반세균수는 $1.0X10^3cfu/g{\sim}1.5X10^8cfu/g$의 분포를 보였고, B. cereus는 13건(24.5%)에서 검출되었는데 11건(84.6%)이 100 cfu/g 이하이었다. C. perfringens는 2건(3.8%)에서 검출되었는데 모두 100 cfu/g 이하의 낮은 균수를 보였다. 생식 완제품과 같이 E. coli, Salmonella, S. aureus 등 8종의 식중독균은 검출되지 않았다. 본 실험 결과 유통 생식은 일반적으로 식중독균에 의한 위해 가능성이 적은 것으로 추정되었다. 그러나 제조과정 및 유통과정 중 부적절한 보관 및 유통에서 기인될 수 있는 오염균의 증식이나 교차오염 예방을 위한 철저한 관리는 필요한 것으로 판단되었다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제27권1호
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• pp.87-95
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• 2012

본 연구에서는 울산지역의 재래시장 및 대형할인점에서 판매되는 즉석 반찬류의 미생물학적 안전성을 평가하여 이들 반찬류의 위생상의 문제점을 파악하고 이를 개선하기 위한 기초자료로 삼고자 재래시장(2곳), 대형할인점(2곳) 총 4곳에서 구입한 반찬류 4종 20품목 200건에 대해 위생지표세균인 일반세균, 대장균군, 대장균과 식중독 원인균인 $Salmonella$ spp., $Shigella$ spp., $Staphylococcus$ $aureus$, $Listeria$ $monocytogenes$, $Vibrio$ $parahaemolyticus$, $Yersinia$ $enterocolitica$, $Bacillus$ $cereus$, $Clostridium$ $perfringens$, $Camphylobacter$ $jejuni$, Pathogenic $E.$ $coli$를 조사하였다. 일반세균의 평균 검출량 (범위)는 재래시장이 4.75 log CFU/g (1.60~6.92 log CFU/g), 대형할인점이 4.62 log CFU/g(2.00~6.46 log CFU/g) 수준으로 구입 장소에 따른 유의적인 차이는 없었다. 대장균군의 검출건수(검출률)는 재래시장이 총 64건(64%) 으로, 젓갈류와 절임류가 각각 20건(80%), 조림류 13건(52%), 생채류 11건(44%)의 순을 나타내었다. 대형할인점은 66건(66%)이 검출되었고, 젓갈류와 조림류 19건(76%), 절임류 18건(72%), 생채류 10건(40%)의 순을 보여 재래시장과 마찬가지로 생채류가 낮은 검출을 나타내었다. 그리고 평균 검출량은 재래시장과 대형할인점 모두 생채류가 대체적으로 낮은 경향을 보였다. 대장균은 재래시장에서 오징어젓갈 (젓갈류) 1건, 된장콩잎 (절임류) 2건, 깻잎장아찌 (절임류) 1건 등 4건(4%)에서 검출되었고, 생채류와 조림류에서는 검출되지 않았다. 그리고 대형할인점은 생마늘쫑 (생채류) 1건, 고들빼기 (절임류) 1건, 된장콩잎 (절임류) 2건, 깻잎장아찌 (절임류) 2건 등 6건(6%)에서 검출되었고, 젓갈류와 조림류에서는 검출되지 않았다. 식중독균 검사결과, $B.$ $cereus$와 $L.$ $monocytogenes$는 재래시장에서 각각 1건(생채류 1건, 젓갈류 1건)이, $B.$ $cereus$는 대형할인점에서 4건(생채류 1건, 절임류 1건, 조림류 2건)이 확인되었으며 $Salmonella$ spp., $Shigella$ spp., $Vibrio$ $parahaemolyticus$, $Y.$ $enterocolitica$, Pathogenic $E.$ $coli$, $C.$ $jejuni$ 등 나머지 식중독균은 검출되지 않았다. 결론적으로 반찬류의 안전성은 위생지표세균 측면에서는 절임류, 젓갈류, 조림류가 (특히 절임류), 식중독균 측면에서는 생채류와 젓갈류가, 그리고 대형할인점이 재래시장에 비해 상대적으로 취약하여 이에 대한 위생관리가 필요하다고 판단된다. 따라서 시판 반찬류의 미생물적 안전성 확보를 위해 제조단계, 유통단계, 판매단계에 이르기까지 안전을 위한 총체적인 관리방안의 수립과 체계적인 관리가 요구된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권6호
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• pp.862-868
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• 2014

Certain Escherichia coli (E. coli) strains have the ability to cause diarrheal disease. Five types of diarrheagenic E. coli have been identified, including EHEC, ETEC, EPEC, EAEC, and EIEC. To detect these five diarrheagenic types rapidly, we developed a one-step multiplex PCR (MP-PCR) assay using nine primer pairs to amplify nine virulence genes specific to the different virotypes, with each group being represented (i.e., stx1 and stx2 for EHEC, lt, sth, and stp for ETEC, eaeA and bfpA for EPEC, aggR for EAEC, and ipaH for EIEC). The PCR primers were constructed using MultAlin. The sensitivity and specificity of the constructed multiplex PCR primers were measured using DNA isolated from diarrheagenic E. coli strains representing each group. The limits of detection were as follows: $5{\times}10^1CFU/ml$ for EHEC, $5{\times}10^3CFU/ml$ for ETEC expressing lt and sth, $5{\times}10^4CFU/ml$ for ETEC expressing stp, $5{\times}10^2CFU/ml$ for EPEC, $5{\times}10^4CFU/ml$ for EAEC, and $5{\times}10^2CFU/ml$ for EIEC. To confirm the specificity, C. jejuni, C. perfringens, S. Typhimurium, V. parahaemolyticus, L. monocytogenes, Y. enterocolitica, B. cereus, and S. aureus were used as negative controls, and no amplification was obtained for these. Moreover, this kit was validated using 100 fecal samples from patients with diarrhea and 150 diarrheagenic E. coli strains isolated in Korea. In conclusion, the multiplex PCR assay developed in this study is very useful for the rapid and specific detection of five diarrheagenic E. coli types. This single-step assay will be useful as a rapid and economical method, as it reduces the cost and time required for the identification of diarrheagenic E. coli.