• 제목/요약/키워드: C-N hydrolase

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Cloning and Expression of a Yeast Cell Wall Hydrolase Gene (ycl) from Alkalophilic Bacillus alcalophilus subsp. YB380

  • Ohk, Seung-Ho;Yeo, Ik-Hyun;Yu, Yun-Jung;Kim, Byong-Ki;Bai, Dong-Hoon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제11권3호
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    • pp.508-514
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    • 2001
  • A stuructural gene (ycl) encoding novel yeast cell wall hydrolase, YCL, was cloned from alkalophilic Bacillus alcalophilus subsp. YB380 by PCR, and transformed into E. coli JM83. Based on the N-terminal and internal amino acid sequences of the enzyme, primers were designed for PCr. The positive clone that harbors 1.8 kb of the yeast cell wall hydrolase gene was selected by the colony hybridization method with a PCR fragment as a probe. According to the computer analysis, this gene contained a 400-base-paired N-terminal domain of the enzyme. Based on nucletide homology of the cloned gene, a 850 bp fragment was amplified and the C-terminal domain of the enzyme was sequenced. With a combination of the two sequences, a full nucleotide sequence for YCL was obtained. This gene, ycl, consisted of 1,297 nucleotides with 27 nucleotides with 27 amino acids of signal sequence, 83 redundant amino acids of prosequence, and 265 amino acids of the mature protein. This gene was then cloned into the pJH27 shuttle vector and transformed into the Bacillus subtilis DB104 to express the enzyme. It was confirmed that the expressed cell wall hydrolase that was produced by Bacillus subtilis DB104 was the same as that of the donor strain, by Western blot using polyclonal antibody (IgY) prepared from White Leghorn hen. Purified yeast cell wall hydrolase and expressed recombinant protein showed a single band at the same position in the Western blot analysis.

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Isolation of Novel Alkalophilic Bacillus alcalophilus subsp. YB380 and the Characteristics of Its Yeast Cell Wall Hydrolase

  • Yeo, Ik-Hyun;Han, Suk-Kyun;Yu, Ju-Hyun;Bai, Dong-Hoon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제8권5호
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    • pp.501-508
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    • 1998
  • An alkalophilic mi.croorganism (strain YB380), which produces yeast cell wall hydrolase extracellulary, was isolated from Korean soil. The rod-shaped cells were 0.3~0.4 by 2~4${\mu}{\textrm}{m}$ long, motile, aerobic, gram-positive, and spore-forming. The color of the colony was light yellow. The temperature range for growth at pH 9.0 was 25 to $45{\circ}C, with optimum growth at $35{\circ}C. The pH range for growth at $35{\circ}C was 8 to 11 with an optimum pH of 9.0. Therefore, the strain YB380 is an obligate alkalophile. The 16S rRNA of strain YB380 has a 99% sequence similarity with that of Bacillus alcalophilus. On the basis of physiological properties, cell wall fatty acid composition, and phylogenetic analysis, we propose that the isolated strain is Bacillus alcalophilus. The yeast cell wall hydrolase from Bacillus alcalophilus subsp. YB380 has been purified and partially characterized. The molecular weight was estimated to be 27,000 daltons with an optimum temperature and pH of $60{\circ}C and 9.0, respectively. The N-terminal amino acid sequence of the enzyme was analyzed as Gln- Thr- Val- Pro- Trp- Gly- Ile- Asn- Arg- Val.

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Schizosaccharomyces pombe에서의 유비퀴틴 C-말단 가수분해효소의 활성산소종 의존성 하향조절 (Reactive oxygen species-dependent down-regulation of ubiquitin C-terminal hydrolase in Schizosaccharomyces pombe)

  • 조한나;임혜원;권희석;임창진;박광학;진창덕;김경훈
    • 미생물학회지
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    • 제52권2호
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    • pp.236-241
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    • 2016
  • 탈유비퀴틴 효소 중 PPPDE 상과에 속하는 Schizosaccharomyces pombe의 $sdu1^+$ 유전자가 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성을 갖는 단백질을 인코딩하고, 산화적 및 일산화질소 스트레스 방어에 관여함이 이전에 밝혀진 바 있다. 예비적인 본 연구는 정상적인 및 과잉발현의 조건에서 S. pombe 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성의 활성산소종 의존성 조절에 초점을 맞추었다. 과산화수소, 수퍼옥사이드 라디칼 생성하는 메나디온 및 일산화질소 생성하는 sodium nitroprusside (SNP)에 노출시킨 S. pombe 세포에서 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성이 감소되었다. 환원형 글루타치온과 그 전구체인 N-acetylcysteine은 과산화수소의 존재 유무에 상관없이 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성을 현저하게 증강시켰다. 그러나, 과산화수소의 부재 시 혹은 존재 시 활성산소종에 미치는 글루타치온과 N-acetylcysteine의 영향은 같은 조건 하에서의 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성 패턴과 상반되었다. 과잉발현의 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성을 보이는 재조합 플라즈미드 pYSTP를 보유하는 S. pombe 세포에서 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성도 과산화수소, 메나디온 및 SNP에의 노출되는 조건에서 감소되었지만, 벡터 대조 세포에서 보다는 높게 유지되었다. 요약하면, S. pombe 유비퀴틴 C-말단 가수분해 효소 활성은 활성산소종에 의하여 하향조절 되지만, 그 의의는 현재로썬 알려지고 있지 않은 상태이다.

Pseudomonas oleovorans의 pyrimidine nucleotide N-ribosidase의 생성 최적조건 (Optimization of Culture Conditions for the Production of Pyrimidine Nucleotide N-Ribosidase from Pseudomonas oleovorans)

  • Yu, Tae-Shick
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.608-613
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    • 2004
  • Pyrimidine nucleoade N-ribosidase (pyrimidine 5'-nucleotide phosphoribo (deoxyribo) hydrolase/ pyrimidine 5'-nucleotide nucleosidase, EC 3.2.2.10)는 CMP와 UMP를 직접 분해하여 cytosine과 uracil를 생성하는 가수분해효소이다. 본 연구에서는 Pseudomonas oleovorans ATCC 8062의 생육과 pyrimidine nu-cleotide N-ribosidase생성에 미치는 탄소원과 질소원의 영향 및 생육인자 등에 대하여 검토했다. 효소생성의 최적배양조건은 2% fumarate, 1.5% peptone, 5% corn steep liquor (CSL)과 1% ammonium chloride의 배지조성(초기 pH 7.0)으로 $28^{\circ}C$, 48시간 진탕 배양이 양호했다. 효소의 활성은 생육이 최대에 도달하는 정지기 후기에 최대에 도달하며, 그 이후부터 급속히 불활성화 되었다. P. oleovorans의 pyrimidine nucleocde N-ribosidase는 UMP에 의하여 유도 생성되지 않으므로 구성효소이며, 내생효소였다.

Indole, Indole-3-calbinol 및 Benzofuran이 간장 microsome과 cytosol의 약물대사 효소 활성도에 미치는 영향 (Differential Effects of Indole, Indole-3-carbinol and Benzofuran on Several Microsomal and Cytosolic Enzyme Activities in Mouse Liver)

  • 차영남;;;정진호
    • 대한약리학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.1-11
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    • 1985
  • 이물질(xenobiotics) 대사에 관여하는 간장 microsome과 cytosol 효소 활성에 indole, indole-3-carbinol 및 benzofuran이 미치는 영향을 검색하기위하여 마우스에 이들 약물을 각각 5 mmole/kg씩 10일간 투여하여 다음 몇 가지의 성적을 얻었다. Benzofuran은 microsome 효소인 aniline hydroxylase, 7-ethoxycoumarin O-deethylase, p-nitrophenol UDPGA-transferase, epoxide hydrolase와 cytosol 효소인 glutathione S-tranferase, NADH : quinone reductase, UDP-glucose dehydrogenase의 활성도를 증가시켰다. 그러나 benzofuran과는 구조적으로 furan ring내의 N원소가 O원소로 치환되었을 뿐 주된 구조가 유사한 indole과 indole-3-carbinol 투여로는 UDPGA-transferase와 NADH: quinone reductase의 활성도 증가를 볼 수 없었으며, 특히 indole은 NADPH : cytochrome C reductase만을 증가시킨데 비하여 구조상 indole에 carbinol (methanol)기가 붙은 indole-3-carbinol은 수종의 mixed function oxidase와 아울러 특히 epoxide hydrolase의 활성도 역시 증가시켰다. 이러한 결과는 benzofuran과 indole-3-carbinol에 의한 epoxide hydrolase 활성도 증가의 기전의 일부를 설명할 수 있을 것으로 생각된다.

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Interaction of the Lysophospholipase PNPLA7 with Lipid Droplets through the Catalytic Region

  • Chang, Pingan;Sun, Tengteng;Heier, Christoph;Gao, Hao;Xu, Hongmei;Huang, Feifei
    • Molecules and Cells
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    • 제43권3호
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    • pp.286-297
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    • 2020
  • Mammalian patatin-like phospholipase domain containing proteins (PNPLAs) play critical roles in triglyceride hydrolysis, phospholipids metabolism, and lipid droplet (LD) homeostasis. PNPLA7 is a lysophosphatidylcholine hydrolase anchored on the endoplasmic reticulum which associates with LDs through its catalytic region (PNPLA7-C) in response to increased cyclic nucleotide levels. However, the interaction of PNPLA7 with LDs through its catalytic region is unknown. Herein, we demonstrate that PNPLA7-C localizes to the mature LDs ex vivo and also colocalizes with pre-existing LDs. Localization of PNPLA7-C with LDs induces LDs clustering via non-enzymatic intermolecular associations, while PNPLA7 alone does not induce LD clustering. Residues 742-1016 contains four putative transmembrane domains which act as a LD targeting motif and are required for the localization of PNPLA7-C to LDs. Furthermore, the N-terminal flanking region of the LD targeting motif, residues 681-741, contributes to the LD targeting, whereas the C-terminal flanking region (1169-1326) has an anti-LD targeting effect. Interestingly, the LD targeting motif does not exhibit lysophosphatidylcholine hydrolase activity even though it associates with LDs phospholipid membranes. These findings characterize the specific functional domains of PNPLA7 mediating subcellular positioning and interactions with LDs, as wells as providing critical insights into the structure of this evolutionarily conserved phospholipid-metabolizing enzyme family.

Porcine Leukocyte Lysosomal Hydrolase의 정제에 관(關)한 연구(硏究) (Purification of Porcine Leukocyte Lysosomal Hydrolases)

  • 조무제
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제20권1호
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    • pp.136-141
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    • 1977
  • 돼지 백혈구(白血球) Iysosome의 n-butanol 추출물(抽出物)로 부터 DEAE-cellulose, Sephadex c-200 column chromatography 및 Polyacrylamide gel electrophoresis 로서 acid phosphatase, aryl sulfatase, ${\beta}-glucuronidase$로서 및 cathepsin D를 분리(分離)정제하고 그 성질을 조사하였다.

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INDUCTION OF MICROSOMAL EPOXIDE HYDROLASE BY SULFUR AMINO ACID-DEPRIVATION VIA THE PATHWAY OF C-JUN N-TERMINAL KINASE AND ITS EXTRACELLULAR EXPOSURE DURING CELL DEATH

  • Kang, Keon-Wook;Lee, Chang-Ho;Kim, Sang-Geon
    • 한국독성학회:학술대회논문집
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    • 한국독성학회 2002년도 Current Trends in Toxicological Sciences
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    • pp.78-78
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    • 2002
  • Microsomal epoxide hydrolase (mEH), an epoxide detoxifying enzyme and putative cell surface autoantigen, is inducible by xenobiotics and by certain pathophysiological conditions. The present study was designed to determine mEH expression in H4IIE cells during cell death initiated by sulfur amino acid deprivation (SAAD) and to identify the signaling pathway for the enzyme induction.(omitted)

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Acanthamoebaculbertsoni와 A. royreba의 가수분해 효소 활성도의 비교 연구 (A Comparative Study on Hydrolase Activities in Acanthamoeba culbeytconi and A. roureba)

  • 김용규;김태우
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제26권2호
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    • pp.95-106
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    • 1988
  • 아메바의 cytolytic process가 주로 가수분해 효소 환성과 관계 깊다는 연구들이 70년대 후반부터 병원성 Entamoeba sp.와 Naegleria sp.에서 보고되었지만 Acanthamoeba sp.에서는 가수분해 효소 환성에 관한 연구는 찾아볼 수 없다. 본 연구에서는 병원성이 없는 것으로 알려진 Acanthamoeba royreba를 대조로 하여 병원성이 있는 A. culbertsonl이 가수분해 효소 활성도를 측정하고 이들을 비교하고자 하였다. A. culbertsoni를 마우스에 감염시켰더니 15일내에 마우스 모두가 사망하였으며, 평균 생존기간은 8.5일이었고, 아베바성 수막뇌염으로 사망했음을 알 수 있었다. 반면에 A. royreba를 감염시킨 마우스에서는 수막뇌염이 발생되지 않았다. CGV배지에서 두 종(種) 아메바를 배양하여 아메바 추출물 및 배양액에서 가수분해 효소의 환성을 측정한 결과 A. rcyreba에 비해 A. culbertsoni 세포의 추출물 및 배양액에서 현저히 활성도가 높은 가수분해 효소는 acid phosphatase, p-N-acetyl galactosaminidase, β-N-acetyl glucosaminidase, α-mannosidase, neutral proteinase, acid proteinase였다. 표적 세포인 CHO 세포에 혼합한 A. culbertsoni는 대조군에 비해 강한 세포독성을 나타내었고 CHO 세포와의 혼합후 48시간 후 80%, 72시간후 95% 이상의 CHO 세포가 사멸하는 것을 알 수 있었다. 반면에 A. royreba를 혼합하였을 때는 별다른 세포독성을 나타나지 않았다. CHO 세포에 혼합한 A. tulbgrtsoni이 가수분해 효소 활성도를 경과 시간별로 측정하였던 바 CGV 배지에서 배 양시간이 지남에 따라 아메바내보다 그 배양액에서 더 높은 효소 활성도를 나타내었던 acid phosphatase, β-N·acetyl galactosaminidase, β-N·acetyl glucosaminidase, α-mannosidase, acid proteinase는 혼합 120시간 동안 아메바내에서 더 높은 효소 활성도를 나타내었으며, neutral proteinase의 활성도는 경과시간이 지남에 따라 아메바내에서는 일정하였지만 그 배양액인 EBSS용액내에서는 점점 높아짐을 알 수 있었다. 이상의 성적으로 보아 마우스에서 수막뇌염을 일으키는 A. cuzbertsoni는 비 병원성인 A. reyreba와 비교할 때 여러 종류 가수분해 효소들의 활성도에 현저한 차이를 나타내고 있음을 알 수 있었다. 또한 표적세포인 CHO세포에 대한 A. cuzbertsoni의 세포독성은 강함을 알 수 있었고, 이 때 몇 종류 가수분해 효소들의 환성도도 높게 나타났으며, 이러한 소견이 A. culbertsoni의 병원성과 관련이 있을 것으로 추측되었다.

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어류 기생성 선충 Anisakis simplex sensu stricto와 Anisakis pegreffii 유충의 excretory-secretory products 및 somatic extracts의 가수분해효소 활성 비교 (A comparison of the hydrolase activities of excretory-secretory products and somatic extracts from fish parasitic nematodes, Anisakis simplex sensu stricto and Anisakis pegreffii larvae)

  • 전찬혁;위성;김정호
    • 한국어병학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.25-33
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    • 2014
  • Anisakis simplex sensu stricto와 A. pegreffii의 3기 유충과 4기 유충에서 얻은 excretory-secretory (ES) products 및 somatic extracts의 가수분해효소 활성을 API ZYM kit를 이용하여 비교하였다. Esterase 그룹의 가수분해효소 중 acid phosphatase는 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두에서 높은 활성을 나타냈으며, esterase (C 4)의 경우 somatic extracts에서만 가수분해효소 활성이 나타났는데 A. simplex (s.s.)가 A. pegreffii와 비교하여 3기와 4기 유충 모두에서 2배 가량 높은 활성을 나타냈다. alkaline phosphatase, acid phosphatase 그리고 naphthol-AS-BI-phosphohydrolase의 경우 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두 3기 유충보다 4기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. Aminopeptidase 그룹의 가수분해효소 활성은 leucine arylamidase에서 관찰되었는데, somatic extracts의 경우 A. pegreffii 보다 A. simplex (s.s.)에서 가수분해 효소 활성이 두 배 가량 높게 확인되었으며, 대부분의 다른 효소들에서는 활성이 거의 나타나지 않았다. Glycosidase 그룹의 가수분해효소 활성은 N-acetyl-${\beta}$-glucosaminidase, ${\alpha}$-mannosidase 그리고 ${\alpha}$-fucosidase에서 확인되었는데, A. simplex (s.s.) 보다 A. pegreffii에서 높은 가수분해효소 활성을 확인할 수 있었으며, 대부분 4기 유충보다 3기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. 이러한 아니사키스속 선충의 종과 유충단계에 따른 가수분해 효소의 활성 차이는 선충의 성장, 탈피, 소화, 섭이 등의 대사과정의 차이에 기인한 것으로 생각된다.