• 식물병연구
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• 제23권2호
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• pp.193-201
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• 2017

국내의 토마토에서 발생하는 주요 바이러스는 Tomato chlorosis virus (ToCV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Cucumber mosaic virus (CMV), Pepper mottle virus (PepMoV), Tomato mosaic virus (ToMV)이다. 이들 바이러스를 진단하기 위해 프라이머 세트와 반응액을 포함하는 역전사중합반응(RT-PCR)법의 조건을 조사하였다. 공시한 바이러스에 특이적인 염기서열로부터 모두 46개 프라이머 세트를 설계하고, 이를 이용해 주형을 넣지 않은 RT-PCR에서 비특이 반응을 조사하였다. 이들 가운데 16개 조합을 건전한 토마토 RNA에 적용한 결과 프라이머 세트와 RT-PCR 반응액 간의 친화성이 비특이 반응 감소에 영향을 주었다. cDNA 합성과 관련된 인자와 RT-PCR 반응액 사이의 조합을 근거로 ToCV 진단을 위한 두 종류의 반응액을 선발하였다. ToCV 진단 시 수립된 조건을 나머지 바이러스 진단에 적용했을 때, 특이성이 높은 프라이머 세트 C029 (ToCV), C072 (TSWV), C070 (CMV), C048 (PepMoV), C065 (ToMV)를 선발할 수 있었다. 이들 프라이머 세트는 공시한 바이러스를 특이적으로 진단하는 데 유용할 것으로 판단된다.

• 생명과학회지
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• 제31권6호
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• pp.574-580
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• 2021

본 연구는 강원도지역에서 분리된 전염성조혈기괴사증 바이러스(Infectious Hematopoietic Necrosis Virus: IHNV) 변이주들의 유전자형에 따른 병원성의 분석에 대한 연구이다. JRt-Shizuoka linage와 JRt-Nagano lineage에 속하는 IHNV 변이주들을 무지개송어 치어에 실험적으로 감염시켜 각 변이주들에 감염된 무지개송어의 폐사율을 비교하고, 병리조직을 관찰하며, 혈청형을 분석하였다. 그 분석의 결과, 고역가로 접종하였을 때 Sizuoka linage에 속하는 RtPc0314c와 RtPc0314g 변이주와 JRt-Nagano lineage에 속하는 RtPc0816g 변이주 모두 100% 누적 폐사율을 보였고, JRt-Shizuoka linage에 속하는 RtPc0314c와 RtPc0314g 변이주에 감염된 무지개송어에서 더 빠른 폐사가 관찰되었다. 저역가로 접종하였을 때에는 실험종료시까지 100% 폐사율을 보이지 않았지만, JRt-Nagano lineage에 속하는 변이주 보다 JRt-Shizuoka linage에 속하는 변이주에 감염된 무지개송어에서 더 높은 폐사율을 보였다. 또한 병리조직 분석 결과 RtPc0314c와 RtPc0314g 변이주에 감염된 무지개 송어의 신장과 비장 조직에서는 감염 증상이 확인되었지만, RtPc0816g 변이주에 감염된 무지개송어에서는 감염 증상이 확인되지 않았다. 하지만 이들 변이주들간의 구조 단백질, 혈청형에서는 차이가 없었다. 이러한 결과로 볼 때 강원도 지역에서 분리된 IHNV는 비록 구조 단백질과 혈청형의 차이는 나타나지 않았지만, JRt-Shizuoka lineage에 속하는 변이주들의 병원성이 더 높음을 확인할 수 있었다.

• 약학회지
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• 제39권6호
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• pp.636-644
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• 1995

Comparison of bioavailabflity (BA) of three brands of ranitidine (RT) tablets has been studied m rats. The purpose of this study was to characterize the pharniacolunetics of RT tablets in the rat and to coinpare phannacolunetic parameters of three brands of RT tablets. In addition, it was investigated whether plasma RT concentrations m humans can be predicted from pharmacokinetic parameters obtained in rats. RT was administered intravenously in dose of RT.HCI 10mg/kg and orally in dose of RT.HCI 50mg/kg as solution or crushed sample of thablets. Plasma RT concentrations were determned by HPLC. Plasma RT concentrations as a function of time were fitted to two compartment model. Plasma RT concentrations declined with a terminal half life ($t_{{1}/2{\betha}}$) of 40.9 min. The plasma RT concentration-time curve showed two peak plasma concentrations following an oral administration of solution or crushed sample in rats like humans. No significant difference among pharmacokinetic parameters was observed except $T_{max2}$ (p<0.05). The BA for crushed sample A, B and C were found to be 54.6 40.7 and 40.0%, respectively. Equivalence of $C_{max1}$ and $T_{max2}$ were guaranteed in this study. However, it was concluded that three brands of RT tablets are bioequivalent, taking the following characteristics of RT into consideration;(1) rapid onset of the effect is not required, (2) $C_{max1}$ and $T_{max2}$ do not seem to influence the effectiveness of the drug during a long-term treatment by the usual administration of twice a day. Results from this study were combined with plarmacokinetic data for RT in dogs and humans to develop a basis for interspecies scale-up of the disposition characteristics of the drug. there were similarities in the general disposition of the drug. Allometric relationships were sought between pharmacokinetic parameters nd species body weight. Significant interspecies correlations were found for total body clearance($Cl_{t}$) and steady state volume of distribution ($Bd_{ss}$). Thus, plasma RT concentrations in humans can be predicted from pharmacokinetic parameters obtained in rats.

• 식물조직배양학회지
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• 제25권6호
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• pp.519-524
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• 1998

한국산 수박 녹반 모자이크 바이러스(CGMMV-WK)를 TR-PCR 기술에 의해서 간편하고 확실한 진단방법을 구명하고 아울러 CGMMV의 외피단백질 유전자를 클로닝 하였다. 바이러스의 추출은 Lee등 (1996)의 간이 조즙액추출법을 변형하여 정제된 핵산 추출액을 사용하여도 RT-PCR이 양호하였으며, 20 pmol의 primer, reverse transcriptase (30 unit), Rnasin (5unit)이 첨가된 PCR 반응액에서 one step reaction으로 RT-PCR이 가능하였다. CGMMV의 진단을 위한 RT-PCR 조건으로 42$^{\circ}C$에서 45분간 cDNA를 합성하고 있어서 95$^{\circ}C$ 에서 2분간 per-denaturation하고 96$^{\circ}C$ 에서 30초, 6$0^{\circ}C$ 에서 30초 그리고 72$^{\circ}C$에서 1분간으로 36 cycle을 반응을 수행함으로서 간편하고 확실하게 CGMMV를 진단할 수 있었다. 또한 추출된 CGMMV의 외피단백질의 염기서열분석 한 결과 CGMMV-W와는 98.77%, CGMMV-SH와는 99.38%의 상동성을 가지고 있었으며 아미노산 서열은 모두 100%의 상동성을 가지고 있었다.

• Radiation Oncology Journal
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• 제13권2호
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• pp.181-189
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• 1995

목적: 국소적으로 진행된 자궁경부암의 치료는 방사선 단독요법이 주 치료였으나 근래에는 좀 더 완치율을 높이기위해 약물치료와 병행하여 방사선치료가 시행되고 있다. 저자들은 45명의 방사선 단독요법과 77명의 항암화학과 방사선의 병용요법의 치료성적을 후향적으로 분석하였다. 방법: 1985년 1월부터 1991년 12원까지 한양대학병원 치료방사선과에서 외부방사선 및 강내방사선치료를 받은 환자 122명을 대상으로 후향적으로 분석하였다. 34명은 ICR 1회, 77명은 ICR 2회, 11명은 고선량 강내근접 방사선치료를 받았다. 연령분포는 29세부터 81세였고, 중앙연령은 58세였다. 추적기간은 5개월에서 117개월(5명이 34개원 미만)로 중앙값은 60개월이었다. 조직병리상 111명이 squamous cell ca, 5명이 large cell ca, 4명이 adenoca, 2명이 adenosquamous cell ca였다. FIGO 병기로 IB $6명(4.9\%),$ IIA 11명$(9.0\%),$ IIB 37명$(30.3\%),$ IIIA 3명$(2.5\%),$ IIIB 63명$(51.6\%),$ IVA 2명$(1.6\%)$이었다. 항암화학요법을 병용한 환자 77명중 36명은 VBP, 39명은 cispiatin 과 5-FU, 2명은 5-FU 제제로 치료받았다. 결과: 외부방사선조사량 3900 cGy에서 5500 cGy를 받은환자에서 61명$(50\%)$이 육안적으로 완전관해를보였다. 5년 및 9년 생존율은 전체환자에서 각각 $57.8\%,\;53.9\%$였고 방사선 단독요법의 5년 생존율이 $63.1\%,$ 방사선과 항암화학복합요법의 5년 생존율은 $55.9\%$였다. 항암제 VBP(vinblastin, bleomycin, cisplatinum)로 치료받은 환자에서 5년 생존율이 $63\%$이고 cisplatin으로 치료받은 환자는 $50\%$이나 통계적인 유의성은 없었다. ICR 회수에따른 5년 생존율은 1회 ICR에서 $36.5\%,$ 2회 ICR에서 $67\%$였다. 방사선단독요법으로 치료받은 환자중 A point에 8000 cGy이상 받은 환자에서 5년 생존율이 $91.4\%$이었고 8000 cGy 미만 환자는 $27.2\%$로 통계적으로 유의한 생존율의 향상을 보였다(p<0.01). 항암화학요법으로 치료받은 환자는 A point의 dose에 따른 생존율의 차이를 보dl지 않았으며(<8000 cGy $55.6\%\;vs\;<=8000\;cGy\;55.7\%)$ 1회의 ICR 과 2회의 ICR의 5년 생존율에도 큰 차이가 없었다$(50\%\;vs\;56.8\%).$ 병변크기가 3cm 이상인 환자에서 방사선 단독치료법과 항암화학치료법과의 5년 생존율의 차이가 없었다$(48.9\%\;vs\;48.7\%).$ 초기 병변에서 항암화학치료를 받지않은 군과 받은 관의 5년 생존율은 $60\%$와 $78\%$이나 숫자가 매우적어 의미가 없었고 진행된병기에서 5년 생존율은 방사선 단독군이 조금 좋았으나 통계적 유의성은 없었다$(62.6\%\;vs\;53.6\%)$ (p>0.05). 결론: 본 연구결과 방사선치료에 항암화학 병용은 생존율향상을 시키지 못하였다. 방사선단 독요법이 국소적으로 진행된 환자에 치료방법이며 A point에 8000 cGy이상 받은환자에서 생존율이 높았고 항암화학 병용요법 치료에서는 A point의 방사선양이 생존율에 영향을 미치지 않았다.

• 대한수의학회지
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• 제38권1호
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• pp.85-89
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• 1998

본 연구에서는 돼지 로타바이러스의 혈청형 A, B 및 C를 동시에 진단할 수 있는 RT-PCR 기법을 개발하였다. 각각의 혈청형에 특이적인 primer를 이용하여 RT-PCR 기법으로 분변시료에서 직접 바이러스 동정을 실시한 결과, 23건의 로타바이러스 감염 분변 시료에서 13건이 혈청형 A, 3건이 혈청형 B, 2건이 혈청형 C로 나타나 국내에서도 A, B 및 C형의 돼지 로타바이러스가 공히 발생하고 있음을 확인하였으며, 발생분포는 외국의 예와 유사하였다. 이 RT-PCR기법은 돼지 로타바이러스의 주요 혈청형인 A, B 및 C형의 동시감별진단법으로 이용될 수 있을 것으로 판단된다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제5권2호
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• pp.83-86
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• 2003

A reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) protocol was developed using two specific 22-mer primers located in coat protein gene of SPFMV. A 411 bp PCR-product was detected in virus infected plants as well as tissue culture raised sweet potato but not in healthy plants. For optimization of RT-PCR protocol, the optimum crude nucleic acid concentration, annealing temperature, primer concentration and numbers of PCR-cycle for maximum sensitivity and specificity were determined. The optimum condition for RT-PCR was as follows: RT-PCR reaction mixture was one-step mixture, containing 50 pmol of primer, 30 units of reverse transcriptase, 5 units of RNasin, and the crude nucleic acid extracts (200 ng). In RT-PCR, cDNA was synthesized at $42^{\circ}C$ for 45 min before a quick incubation on ice after pre-denaturation at $95^{\circ}C$ for 5 min. The PCR reaction was carried out for 40 cycles at $96^{\circ}C$ for 30 see, $63^{\circ}C$ for 30 sec, $72^{\circ}C$ for 1 min, and finally at $72^{\circ}C$ for 10 min. The viral origin of the amplified product was confirmed by sequencing, with the sequence obtained having $95-98\%$ homology with published sequence data for SPFMV. The benefits of this RT-PCR based detection of SPFMV would be simple, rapid and specific.

• Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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• 제26권5호
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• pp.526-529
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• 2002

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제30권3호
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• pp.459-468
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• 2020

This study established a new polymerase spiral reaction (PSR) that combines with reverse transcription reactions for HCV detection targeting 5'UTR gene. To avoid cross-contamination of aerosols, an isothermal amplification tube (IAT), as a separate containment control, was used to judge the result. After optimizing the RT-PSR reaction system, its effectiveness and specificity were tested against 15 different virus strains which included 8 that were HCV positive and 7 as non-HCV controls. The results showed that the RT-PSR assay effectively detected all 8 HCV strains, and no false positives were found among the 7 non-HCV strains. The detection limit of our RT-PSR assay is comparable to the real-time RT-PCR, but is more sensitive than the RT-LAMP. The established RT-PSR assay was further evaluated for detection of HCV in clinical blood samples, and the resulting 80.25% detection rate demonstrated better or similar effectiveness compared to the RT-LAMP (79.63%) and real-time RT-PCR (80.25%). Overall, the results showed that the RT-PSR assay offers high specificity and sensitivity for HCV detection with great potential for screening HCV in clinical blood samples.

• 환경생물
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• 제22권2호
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• pp.329-335
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• 2004

To develop a biomarker for the monitoring of the contamination of estrogenic endocrine disrupters in the aquatic environment, reverse transcription -polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis of vitellogenin (Vg) mRNA expression was optimized in Bombina orientalis, a Korean red bellied toad species. Based on partial cDNA sequences of both Vg and beta actin genes of B. orientalis, specific primers for RT-PCR of Vg and beta actin mRNAs were developed. Semiquantitative RT-PCR of the Vg mRNA in liver was optimized using a beta actin mRNA as an internal control in both sexes. In female RT-PCR using $1\;\mu{g}$ of the liver cDNA resulted in a linear increment in the PCR product of Vg from 18 to 34 cycles of amplification. In male, on the contrary, the RT- PCR product was first detected at 30 cycles of amplification and a linear increment was observed from 30 to 40 cycles of amplification, suggesting that male B. orientalis expresses minute amount of Vg mRNA which is a $2^{-12}$ equivalent of female. In conclusion, the optimized protocol for semiquantitative RT-PCR analysis of Vg mRNA level in B. orientalis male liver will be useful for the environmental monitoring the xenoestrogen contamination in the freshwater environment in Korea.