• 제목/요약/키워드: Br interference

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RNA Interference 및 T-DNA Integration 방법에 의한 배추 기능유전자 Silencing 효과 비교 (Comparison of RNA Interference-mediated Gene Silencing and T-DNA Integration Techniques for Gene Function Analysis in Chinese Cabbage)

  • 유재경;이기호;박영두
    • 원예과학기술지
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    • 제30권6호
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    • pp.734-742
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    • 2012
  • 본 연구는 배추의 유전자 기능분석을 위한 RNAi 유전자 침묵 기법과 T-DNA 삽입 기법을 비교하기 위해 수행하였다. 두 종류의 형질전환 계통이 이용되었으며 BrSAMS-knockout(KO) 계통은 T-DNA 삽입으로 한 개의 Brassica rapa S-adenosylmethionine synthetase(BrSAMS) 유전자가 기능을 상실한 계통이었으며 BrSAMS-knockdown(KD) 계통은 RNAi 방법을 통해 BrSAMS 유전자들의 발현이 억제된 계통이었다. KO 계통과 KD 계통의 microarray 분석 결과에서는 SAMS 유전자와 관련된 sterol, 자당, homogalacturonan 생합성 및 glutaredoxin-related protein, serine/threonine protein kinase, 그리고 gibberellin-responsive protein 유전자들의 발현 수준이 뚜렷한 차이를 보여 주었다. 그러나 KO 계통의 유전자 발현 양상은 하나의 BrSAMS 유전자가 기능을 상실하였음에도 불구하고 대조 계통과 비교하여 RNAi기법을 적용한 KD 계통에 비해 큰 차이를 보여주지 못했다. 또한 직접적으로 SAMS 유전자와 관련된 폴리아민과 에틸렌 합성 유전자들의 발현 변화도 KD 계통에서 더 잘 나타났다. 본 연구에서 microarray 결과를 이용한 KO 계통의 BrSAMS 기능분석은 배추과식물의 게놈 triplication 발생으로 인하여 다수로 존재하는 SAMS 유전자들 때문에 명확한 결론을 얻을 수 없었다. 결론적으로 배추와 같은 배수체 작물의 유전자 기능 분석은 RNAi silencing에 의한 유전자 knock-down 기법이 T-DNA 삽입에 의한 knock-out 기법보다 더욱 효율적인 것으로 나타났다.

복사전달모델을 이용한 GEMS 일산화브로민 산출 민감도 시험 (GEMS BrO Retrieval Sensitivity Test Using a Radiative Transfer Model)

  • 정희성;김준;정욱교;박상서;홍재민;안다현;차혜지;이원진;이혜정
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제37권6_1호
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    • pp.1491-1506
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    • 2021
  • GEMS의 복사 실측 자료로부터 일산화브로민(BrO) 전량 농도를 산출하기에 앞서, 복사전달모델로부터 생성된 모의자료를 이용하여 민감도 시험을 수행하였다. 산출 오차가 갖는 월간 및 일내 변동성을 고려하기 위해, 2013년 7월-2014년 6월 기간 매달 첫째 날의 00-07 UTC에 대해 한 시간 간격의 모의자료를 구성하였다. 최적추정법을 통해 계산된 산출물의 해답 오차는 대기질량인자 증가에 따라 감소하는 반비례 경향을 주로 보였지만, 대기질량인자 값이 5 이상으로 크게 나타나는 범위에서는 비례 경향을 보였다. BrO와 포름알데히드(HCHO) 흡수선 간의 중첩으로 인해 발생하는 BrO 산출물의 간섭 오차는 BrO의 대기질량인자가 작을수록 크게 나타났다. 해답 오차와 간섭 오차의 추정치를 결합하여 계산한 산출물 최종 오차의 평균값은 모든 데이터 샘플에 대해 26.74±30.18%로, 80° 이상의 태양천정각을 갖는 샘플에 대해 60.39±133.78%로 나타났다. 본 연구에서 고려되지 않은 간섭 스펙트럼 및 복사 측정의 오차로 인해, 실제 GEMS의 BrO 산출물이 갖게 될 오차는 추정치와 절대값의 차이를 나타낼 가능성이 있다. 그러나 본 연구에서 제시한 오차 요소들의 변동 특성들은 실제 산출물에서도 나타날 것이다.

ORC ICPMS에서의 곡류중의 셀레늄 분석-수학적 보정을 이용한 Br의 간섭제거 (Analysis of Selenium in Grain with ORC Collision-Removal of Br Interference using Mathematical Calibration)

  • 조헌홍;박용남
    • 대한화학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.472-477
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    • 2011
  • 팔중극자 반응셀 유도결합플라즈마 질량분석법(ORC ICPMS; Octapole Reaction Cell Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry)에서 동위원소 희석법을 이용하여 곡류 중의 셀레늄을 정확히 분석하였다. 충돌기체는 헬륨보다 수소가 더 효율적이었고 최적 흐름속도는 4.0 mL $min^{-1}$ 이었다. ORC는 다원소 이온화학종들의 간섭을 충분히 제거하였으나 시료매트릭스에 브롬이 존재하는 경우, 충돌기체인 $H_2$에 의해 $BrH^+$가 생성되어 m/z 80, 82에 방해를 주었다. 브롬의 화학적 제거는 매우 어려웠으며 $^{82}Se$의 신호세기에 대한 수학적 보정을 사용하고 동위원소 희석법을 적용하였다. 정확도를 검증하기 위하여 표준검정 물질(NIST SRM 1566, 1567)을 분석한 결과, 좋은 일치도를 얻었고, 이를 바탕으로 실제시료인 곡류 중의 셀레늄을 분석하여 계산한 결과, 백미 $0.034{\pm}0.001\;{\mu}g\;g^{-1}$, 현미 $0.059{\pm}0.002_5\;{\mu}g\;g^{-1}$, 흑미 $0.029{\pm}0.001_4\;{\mu}g\;g^{-1}$ 그리고 보리 $0.034{\pm}0.002{\mu}g\;g^{-1}$를 얻었다. 셀레늄 분석에 대한 검출한계($3\sigma$)는 $0.012\;ng\;g^{-1}$ 이었다.

VEGF siRNA Delivery by a Cancer-Specific Cell-Penetrating Peptide

  • Lee, Young Woong;Hwang, Young Eun;Lee, Ju Young;Sohn, Jung-Hoon;Sung, Bong Hyun;Kim, Sun Chang
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권3호
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    • pp.367-374
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    • 2018
  • RNA interference provides an effective tool for developing antitumor therapies. Cell-penetrating peptides (CPPs) are delivery vectors widely used to efficiently transport small-interfering RNA (siRNA) to intracellular targets. In this study, we investigated the efficacy of the cancer-specific CPP carrier BR2 to specifically transport siRNA to cancer-target cells. Our results showed that BR2 formed a complex with anti-vascular endothelial growth factor siRNA (siVEGF) that exhibited the appropriate size and surface charge for in vivo treatment. Additionally, the BR2-VEGF siRNA complex exhibited significant serum stability and high levels of gene-silencing effects in vitro. Moreover, the transfection efficiency of the complex into a cancer cell line was higher than that observed in non-cancer cell lines, resulting in downregulated intracellular VEGF levels in HeLa cells and comprehensively improved antitumor efficacy in the absence of significant toxicity. These results indicated that BR2 has significant potential for the safe, efficient, and specific delivery of siRNA for diverse applications.

중성자방사화분석법을 이용한 성인여성 혈청중의 무기 원소 분석 (Determination of Inorganic Elements in Women Blood Serum using Instrumental Neutron Activation Analysis)

  • 문종화;정용삼;이옥희
    • 분석과학
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    • 제15권6호
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    • pp.509-513
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    • 2002
  • 본 연구는 우리나라 성인여성의 혈청 내 미량 무기 원소의 농도를 조사하기 위해 중성자 방사화 분석법을 적용하였다. 혈청시료중의 나트륨과 염소의 높은 농도가 분석에 제헌을 주었으며 이들의 간섭을 최소화시킨 분석조건에서 Br, Ca, Cl, Co, Cr, Cs, Fe, K, Na, Rb, Se, Zn 와 같은 12종 원소의 분석이 가능하였다. 63명의 성인여성으로부터 채취한 혈청시료를 분석시료를 분석하여 각 원소의 농도수준과 범위 등을 결정하였으며 미국표준연구소의 표준물질들을 혈청시료와 동시에 분석하여 분석품질관리에 사용하였다. 혈청시료중의 무기질원소들의 평균값은 Na 과 Cl은 약 3000 mg/L, Ca은 약 100 mg/L, K은 200 mg/L, Br, Se 및 Zn은 각각 6.0, 0.1, 1.0 mg/L 등의 농도수준을 보였으며 지금까지 보고된 값과 비교한 결과 큰 차이를 보이지 않았다.

Hiwi Knockdown Inhibits the Growth of Lung Cancer in Nude Mice

  • Liang, Dong;Dong, Min;Hu, Lin-Jie;Fang, Ze-Hui;Xu, Xia;Shi, En-Hui;Yang, Yi-Ju
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권2호
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    • pp.1067-1072
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    • 2013
  • Hiwi, a human homologue of the Piwi family, plays an important role in stem cell self-renewal and is overexpressed in various human tumors. This study aimed to determine whether an RNA interference-based strategy to suppress Hiwi expression could inhibit tumor growth in a xenograft mouse model. A rare population of $SSC^{lo}\;Alde^{br}$ cells was isolated and identified as lung cancer stem cells in our previous study. Plasmids containing U6 promoter-driven shRNAs against Hiwi or control plasmids were successfully established. The xenograft tumor model was generated by subcutaneously inoculating with lung cancer stem cell $SSC^{lo}\;Alde^{br}$ cells. After the tumor size reached about 8 mm in diameter, shRNA plasmids were injected into the mice via the tail vein three times a week for two weeks, then xenograft tumor growth was assessed. In nude mice, intravenously delivery of Hiwi shRNA plasmids significantly inhibited tumor growth compared to treatment with control scrambled shRNA plasmids or the vehicle PBS. No mice died during the experiment and no adverse events were observed in mice administered the plasmids. Moreover, delivery of Hiwi shRNA plasmids resulted in a significant suppressed expression of Hiwi and ALDH-1 in xenograft tumor samples, based on immunohistochemical analysis. Thus, shRNA-mediated Hiwi gene silencing in lung cancer stem cells by an effective in vivo gene delivery strategy appeared to be an effective therapeutic approach for lung cancer, and may provide some useful clues for RNAi gene therapy in solid cancers.

Involvement of the Cyclic AMP-Protein Kinase A Pathway in Gap Junctional Communication in Preimplantation Mouse Embryos

  • Haengseok Song;Gye, Myung-Chan;Jun, Jin-Hyun
    • Animal cells and systems
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    • 제2권1호
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    • pp.99-106
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    • 1998
  • In this study, we have examined the role of cAMP in gap junctional communication (GJC) in preimplantation mouse embryos. GJC was monitored by Lucifer Yellow (LY) injected into one blastomere of compacted embryos. The speed of GJC was defined as the time taken for the last blastomere of the embryo to become visibly fluorescent. The median time for 8-cell embrvos (140 sec) was similar to that for 16-cell (135 sec). To determine whether cAMP and cAMP-dependent protein kinase (PKA) are involved in the regulation of GJC, the effects of PKA inhibitor (H8) and cAMP analogues (Rp-cAMP and 8-Br-cAMP) on dye transfer between blastomeres of compacted embryos were examined. Some of the embryos treated with either H8 or Rp-cAMP failed to transfer LY to all blastomeres within 10 min. In contrast, 8-Br-cAMP speeded up fluorescent dye transfer. The median time to fill all blastomeres with LY was 140 sec in untreated controls and 90 sec in siblings treated with 8-Br-cAMP. Inhibition of PKA by H8 or Rp-cAMP induced delay or arrest in embryo development after compaction, but the increase of intracellular cAMP showed no effect. These findings suggest that GJC in preimplantation mouse embryos is regulated by cAMP-PKA pathway and transient interference by PKA inhibitors induces the developmental delay beyond compaction.

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The Investigation of a Novel Indicator System for Trace Determination and Speciation of Selenium in Natural Water Samples by Kinetic Spectrophotometric Detection

  • Gurkan, Ramazan;Ulusoy, Halil Ibrahim
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권7호
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    • pp.1907-1914
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    • 2010
  • A novel catalytic kinetic method is proposed for the determination of Se(IV), Se(VI) and total inorganic selenium in water based on the catalytic effect of Se(IV) on the reduction of bromate by p-nitrophenylhydrazine at pH 3.0. The generated bromine, $Br_2$ or $Cl_2$ plus $Br_2$ in 0.1 M NaCl (or NaBr) environment efficiently decolorized Calmagite and the reaction was monitored spectrophotometrically at 523 nm as a function of time. In this indicator reaction, bromide acted as an activator for the catalysis of selenium (IV) and a reducing agent for selenium (VI) at pH 3.0, which allowed the determination of total selenium. The fixed time method was adopted for the determination and speciation of inorganic selenium. Under the optimum conditions, the calibration graph are linear in the range 1 - 35 ${\mu}gL^{-1}$ of Se(IV) for the fixed time method at $25^{\circ}C$. The detection limit based on statistical $3S_{blank}$/m-criterion was 0.215 ${\mu}gL^{-1}$ for the fixed time method (7 min). All of the variables that affect the sensitivity at 523 nm were investigated, and the optimum conditions were established. The interference effect of various cations and anions on the Se (IV) determination was also studied. The selectivity of the selenium determination was greatly improved with the use of the strongly cation exchange resin such as Amberlite IR120 plus. The proposed kinetic method was validated statistically and through recovery studies in natural water samples. The RSDs for ten replicate measurements of 5, 15 and 25 ${\mu}gL^{-1}$ of Se(IV) and Se(VI) was changed between 2.1 - 4.85%. Analyses of a certified standard reference material (NIST SRM 1643e) for selenium using the fixed-time method showed that the proposed kinetic method has good accuracy. Se(IV), Se(VI) and total inorganic selenium in environmental water samples have been successfully determined by this method after selective reduction of Se(VI) to Se(IV).

스마트 그리드를 위한 전력선 통신 시스템에서의 데이터 전송률 향상 기법 (Data Transmission Rate Improvement Scheme in Power Line Communication System for Smart Grid)

  • 김요철;배정남;김윤현;김진영
    • 한국통신학회논문지
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    • 제35권12B호
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    • pp.1183-1191
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    • 2010
  • 본 논문은 스마트 그리드를 위한 전력선 통신 시스템에서 데이터 전송률을 향상시키는 적응형 OFDM CP 길이 알고리즘에 대해 연구하였다. 본 논문에서 제안한 기법은 수신단의 CP controller에서 수신된 데이터 프레임과 지연된 동일 데이터 프레임을 상관 처리를 취함으로써 채널 지연 정보를 계산한 후, 즉시 그 정보를 송신단에 피드백 한다. 그 다음, 송신단에서는 다음 데이터 프레임에 대한 CP 길이를 조절하게 된다. Impulsive noise 모델로서, Middleton Class A 간섭 모델을 사용하였고, 성능은 패킷 전송률과 누적 패킷 전송률, 비트 오류율 측면에서 평가되었다. 모의실험 결과로부터 패킷 수가 증가할수록 데이터 이득(감소된 비트 양)이 커지지만, branch 수($N_{br}$)가 증가할수록 데이터 이득 폭은 감소한다는 것을 알 수 있었다. $N_{br}$ 이 3, 5, 10인 경우, 적응형 CP 길이 알고리즘과 고정된 CP 길이 기법의 BER 성능은 비슷하였다. 따라서 제안한 기법은 기존의 고정 CP 길이 기법과 비교하여 BER 성능 감소 없이 데이터 전송률 증가를 달성하였음을 확인할 수 있었다.

HG-AAS법에 의한 비소 분석에서 산 및 Pre-Reductant가 분석에 미치는 영향 (Effects of Acid and Pre-Reductant in the Analysis of Arsenic by Hydride Generation-Atomic Absorption Spectrometry)

  • 임헌성;이석근
    • 분석과학
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    • 제13권2호
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    • pp.151-157
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    • 2000
  • 수소화물 발생법-원자흡수 분광계를 이용한 비소의 분석에서 금속이온의 은폐제로 사용되는 L-cysteine, thiourea, KI/ascorbic acid 등의 예비 환원제와 염산, 질산, 황산 및 이들의 1:1 혼산의 종류 및 농도가 비소의 분석에 미치는 영향을 비교 연구하였다. 대부분의 예비 환원제의 경우 3-5M 이상의 고농도 산 용액에서 비소에 대한 높은 흡괌도를 나타냈으나, 0.1M 이하의 낮은 산 용액에서는 L-cysteine을 제외하고는 극히 저조한 흡광도를 나타내었다. 질산 산성용액에서는 흡광도 신호의 불안정성이 심하였다. 방해물질로서 $Cr^{6+}$, $Br^{5+}$ 이온의 방해영향이 크게 관찰되었지만, 이때 예비 환원제는 수소화물 생성을 크게 증가시켰다.

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